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INTRODUCCIÓN AL DISEÑO RACIONAL DE
DROGAS
UNIVERSIDAD DEL ZULIA
FACULTAD DE HUMANIDADES Y EDUCACIÓN
MAESTRÍA EN LA ENSEÑANZA DE LA QUÍMICA
ELECTIVA: INTRODUCCIÓN A LA QUÍMICA MEDICINAL.
Prof. Rosa E. Ferrer.
El modelaje molecular es el estudio de las propiedades
y geometría de las moléculas con la asistencia del
computador. Es un área de constante crecimiento.
•Visualizar moléculas
•Estudiar la estructura de las moléculas
•Comparar la estructura y propiedades de
las moléculas
•Estudiar interacciones entre las moléculas
•Estudiar mecanismos de reacción
•Predecir la estructura y propiedades de las
moléculas
•Predecir mecanismos de reacción
Por medio de esta técnica el químico debe ser capaz de:
En general los programas utilizados para el modelaje
Molecular constan de lo siguiente:
EDITOR
COMPUTACIÓN
VISUALIZADOR
El editor nos permite construir las moléculas en el
Computador y ajustarlas a una geometría lo mas
parecida posible a lo que seria su estructura real,
muchas veces implica un proceso de cálculos para
obtener una geometría correcta de acuerdo al número
y tipo de enlaces presentes en la molécula.
¿De donde provienen los datos para el Modelaje de
una determinada molecula utilizando el Editor?
Cuando visualizamos una molécula utilizando técnicas
de Modelaje Molecular debemos hacerlo sobre una
base real, los principales métodos utilizados son:
1. Se construyen las moléculas sobre la base de
geometrías estándar, por ejemplo, la distancia
promedio de los enlaces y ángulos de enlace entre
diferentes átomos, obtenidas de estructuras
cristalinas.
2. Utilizando fragmentos de geometría conocida
determinada por métodos como cristalografía de
rayos X, deducida de datos de resonancia
magnética nuclear (RMN)
COMPUTACION (MODULO DE CALCULOS):
•MECANICA MOLECULAR
•DINAMICA MOLECULAR
•MECANICA CUANTICA
•TABULADOR
VISUALIZACIÓN:
Es una técnica básica en modelaje molecular y puede
variar desde la simple visualización de una estructura
hasta estructuras complejas que incluyen la
visualización de ciertas propiedades. Normalmente
Las moléculas se representan en dos dimensiones, sin
embargo debido la mejor forma de representarlas es
en tres dimensiones.
Visualizador
Densidad Electrónica Potencial Electrostático
POSIBLE RELACION ENTRE LA ESTRUCTURA
MOLECULAR DE UNA DROGA Y SU ACTIVIDAD
BIOLOGICA:
Estructura molecular
Características de reactividad
Reconocimiento por el receptor
Interacción droga-receptor
Activación del receptor
RESPUESTA
El Modelaje Molecular además de tener un papel muy
importante en la fase de investigación, puede ayudar en la
etapa de desarrollo de nuevos farmacos :
•Añadiendo racionalidad al proceso en forma general
•Ayudando a los investigadores a alcanzar una preformulación
rápida para los organismos oficiales encargados de su
aprobación.
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aditivos sobre la droga activa
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  • 1. INTRODUCCIÓN AL DISEÑO RACIONAL DE DROGAS UNIVERSIDAD DEL ZULIA FACULTAD DE HUMANIDADES Y EDUCACIÓN MAESTRÍA EN LA ENSEÑANZA DE LA QUÍMICA ELECTIVA: INTRODUCCIÓN A LA QUÍMICA MEDICINAL. Prof. Rosa E. Ferrer.
  • 2. El modelaje molecular es el estudio de las propiedades y geometría de las moléculas con la asistencia del computador. Es un área de constante crecimiento.
  • 3. •Visualizar moléculas •Estudiar la estructura de las moléculas •Comparar la estructura y propiedades de las moléculas •Estudiar interacciones entre las moléculas •Estudiar mecanismos de reacción •Predecir la estructura y propiedades de las moléculas •Predecir mecanismos de reacción Por medio de esta técnica el químico debe ser capaz de:
  • 4. En general los programas utilizados para el modelaje Molecular constan de lo siguiente: EDITOR COMPUTACIÓN VISUALIZADOR
  • 5. El editor nos permite construir las moléculas en el Computador y ajustarlas a una geometría lo mas parecida posible a lo que seria su estructura real, muchas veces implica un proceso de cálculos para obtener una geometría correcta de acuerdo al número y tipo de enlaces presentes en la molécula.
  • 6. ¿De donde provienen los datos para el Modelaje de una determinada molecula utilizando el Editor? Cuando visualizamos una molécula utilizando técnicas de Modelaje Molecular debemos hacerlo sobre una base real, los principales métodos utilizados son: 1. Se construyen las moléculas sobre la base de geometrías estándar, por ejemplo, la distancia promedio de los enlaces y ángulos de enlace entre diferentes átomos, obtenidas de estructuras cristalinas. 2. Utilizando fragmentos de geometría conocida determinada por métodos como cristalografía de rayos X, deducida de datos de resonancia magnética nuclear (RMN)
  • 7. COMPUTACION (MODULO DE CALCULOS): •MECANICA MOLECULAR •DINAMICA MOLECULAR •MECANICA CUANTICA •TABULADOR
  • 8. VISUALIZACIÓN: Es una técnica básica en modelaje molecular y puede variar desde la simple visualización de una estructura hasta estructuras complejas que incluyen la visualización de ciertas propiedades. Normalmente Las moléculas se representan en dos dimensiones, sin embargo debido la mejor forma de representarlas es en tres dimensiones.
  • 10. POSIBLE RELACION ENTRE LA ESTRUCTURA MOLECULAR DE UNA DROGA Y SU ACTIVIDAD BIOLOGICA: Estructura molecular Características de reactividad Reconocimiento por el receptor Interacción droga-receptor Activación del receptor RESPUESTA
  • 11. El Modelaje Molecular además de tener un papel muy importante en la fase de investigación, puede ayudar en la etapa de desarrollo de nuevos farmacos : •Añadiendo racionalidad al proceso en forma general •Ayudando a los investigadores a alcanzar una preformulación rápida para los organismos oficiales encargados de su aprobación. •Protegiendo la patente al identificar un mayor número de Polimorfos •Permitiendo a los investigadores modelar los efectos de los aditivos sobre la droga activa •Determinando la estructrura cristalina de datos de difracción de polvo.