La etapa intermedia del proceso penal es la segunda etapa dirigida por el Juez de Investigación Preparatoria. Tiene los objetivos de controlar la acusación fiscal y preparar un juicio oral eficiente. Esto incluye fijar los términos de la imputación, determinar la pertinencia de las pruebas y decidir si el caso merece ir a juicio o ser sobreseído. La etapa culmina con una audiencia preliminar donde el juez evalúa la acusación y toma una decisión que puede ser emitir un auto de enjuiciamiento