FACTORES
     DE
TRANSCRIPCIÓN
 EN PLANTAS
 Izaro Fernández de Landa
Índice:
   Factores de transcripción:
     Definición
     Mecanismo    de actuación
     Estructura

   Factores de transcripción mejor estudiados que
    afectan a la manifestación fenotípca
     Desarrollo órganos florales
     Desarrollo acoplado a señales ambientales
Factores externos que influyen a la
manifestación fenotípica.
   Patógenos
   Luz
   Temperatura
   Sequía
   Exceso / Deficiencia
    de nutrientes
Factor de Transcripción
   Proteínas de localización nuclear
   Se unen a secuencias de DNA. Reconocen el
    promotor
   Proteína diferente de la RNA polimerasa
   Modulan la expresión de los genes: regulan la
    transcripción del DNA
Eucariotas vs Procariotas
Promotor:
   La transcripción del RNA comienza en sitios
    concretos de la secuencia de DNA
    (promotores) .
   Dirigen la transcripción de los segmentos
    adyacentes del DNA que codifican los genes
Factor de transcripción: Dominios
   3 funciones localizadas en diferentes partes de
    la proteína:
     Dominio   de unión al DNA: Reconoce las secuencias
      específicas del DNA. Muy conservados:
      Homeodominios, cremalleras de leucina…
     Dominio de activación: Interacciona con la RNA
      polimerasa o proteínas asociadas
     Dominio de regulación: Impide la unión del DNA en
      algunos casos, Presente en algunos F.T
Control combinatorio
   Las diferentes
    combinaciones
    posibles de los
    factores de
    transcripción les
    permite regular a
    diferentes genes
Arabidopsis taliana
   Empleada por un gran número de Biólogos en el mundo
    como modelo de comparación
   Equivale al ratón como modelo para el estudio de
    mamíferos.
   Se eligió como modelo:
       Tamaño reducido
       Ciclo de vida corto
       Fácil manipulación genética
       Año 2000 se conoce su mapa genético
       Genoma pequeño: 125 millones pb
       26000 genes (muchos repetidos) 15000 genes únicos
       complejidad similar a C.elegans o Drosophila
FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN
MEJOR ESTUDIADOS

   Homeodominios:
     Hbox
     Mad   Box


   Hd-ZIP ( Cremallera de leucina)
HOMEODOMINIOS
   60 aminoácidos
   Codificados por
    secuencias del DNA de
    180 pb denominados
    Homebox
   3 hélices-α
    La hélice 3 realiza el
    contacto con la molécula
    de DNA (surco mayor) y
    las otras estabilizan la
    interacción. Hélice 1
    (surco menor)
Genes Homeóticos: Drosophila
   Los genes que codifican estas proteínas fueron
    descritos por primera vez en mutantes de Drosophila
   Función: Dónde deben desarrollarse estructuras
    específicas
   Mutantes: Una parte del cuerpo estaba situada en otra
MAD box
 En plantas se han identificado los genes
  MADbox y son comparables a genes
  homebox en animales.
 La región conservada del DNA mad box
  codifica el gen mad
 55 aminoácidos
 Los genes MAD no pueden actúar en
  animales.
MAD box: Arabidopsis Thaliana
   Genes que codifican órganos florales, determinados por
    comparación de mutantes florales
   Esquema angioesperma: Órganos que surgen a partir
    de los meristemos florales
Modelo de floración ABC
   Genes tipo A:
    Identidad de sépalos
    y petalos
   Genes de tipo B:
    Identidad de pétalos
    y estambres
   Genes de tipo C:
    Identidad de
    estambres y
    carpelos
Mutantes
              Mutantes en gen A:
               Carece de sépalos y
               petalos
              Mutantes de tipo B:
               Carecen de petalos y
               estambres
              Mutantes tipo C:
               Carecen de
               estambres y carpelos.
WT vs Mutante tipo A




  NO   tiene sépalos ni pétalos
WT vs Mutante tipo B




  No   tiene ni pétalos ni estambres
WT vs Mutante tipo C




    No tiene carpelos ni estambres
Factores HD-ZIP
   Estructura dimérica
    formada por dos
    hélices-α
   Estabilizadas por
    interacciones
    hidrofóbicas entre
    residuos de Leucina
   Las regiones de unión
    a DNA tienen carácter
    básico
Factores HD-ZIP
   Plantas superiores
   acoplamiento del desarrollo a señales
    ambientales como luz, estrés…
   sobreexpresión de este gen produce
    alteraciones en el desarrollo y en la velocidad de
    crecimiento
   Las plantas transgénicas son más altas y se
    desarrollan más rápidamente, tienen menos
    hojas y de menor tamaño
Biología vegetal
   En desventaja con la
    biología animal
   Grupos de
    investigación
   Manejo genético de
    plantas: Innumerables
    ventajas
Gracias por vuestra atención

Factores de transcripción en plantas

  • 1.
    FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN EN PLANTAS Izaro Fernández de Landa
  • 2.
    Índice:  Factores de transcripción:  Definición  Mecanismo de actuación  Estructura  Factores de transcripción mejor estudiados que afectan a la manifestación fenotípca  Desarrollo órganos florales  Desarrollo acoplado a señales ambientales
  • 3.
    Factores externos queinfluyen a la manifestación fenotípica.  Patógenos  Luz  Temperatura  Sequía  Exceso / Deficiencia de nutrientes
  • 4.
    Factor de Transcripción  Proteínas de localización nuclear  Se unen a secuencias de DNA. Reconocen el promotor  Proteína diferente de la RNA polimerasa  Modulan la expresión de los genes: regulan la transcripción del DNA
  • 5.
  • 6.
    Promotor:  La transcripción del RNA comienza en sitios concretos de la secuencia de DNA (promotores) .  Dirigen la transcripción de los segmentos adyacentes del DNA que codifican los genes
  • 8.
    Factor de transcripción:Dominios  3 funciones localizadas en diferentes partes de la proteína:  Dominio de unión al DNA: Reconoce las secuencias específicas del DNA. Muy conservados: Homeodominios, cremalleras de leucina…  Dominio de activación: Interacciona con la RNA polimerasa o proteínas asociadas  Dominio de regulación: Impide la unión del DNA en algunos casos, Presente en algunos F.T
  • 9.
    Control combinatorio  Las diferentes combinaciones posibles de los factores de transcripción les permite regular a diferentes genes
  • 10.
    Arabidopsis taliana  Empleada por un gran número de Biólogos en el mundo como modelo de comparación  Equivale al ratón como modelo para el estudio de mamíferos.  Se eligió como modelo:  Tamaño reducido  Ciclo de vida corto  Fácil manipulación genética  Año 2000 se conoce su mapa genético  Genoma pequeño: 125 millones pb  26000 genes (muchos repetidos) 15000 genes únicos  complejidad similar a C.elegans o Drosophila
  • 12.
    FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN MEJORESTUDIADOS  Homeodominios:  Hbox  Mad Box  Hd-ZIP ( Cremallera de leucina)
  • 13.
    HOMEODOMINIOS  60 aminoácidos  Codificados por secuencias del DNA de 180 pb denominados Homebox  3 hélices-α  La hélice 3 realiza el contacto con la molécula de DNA (surco mayor) y las otras estabilizan la interacción. Hélice 1 (surco menor)
  • 16.
    Genes Homeóticos: Drosophila  Los genes que codifican estas proteínas fueron descritos por primera vez en mutantes de Drosophila  Función: Dónde deben desarrollarse estructuras específicas  Mutantes: Una parte del cuerpo estaba situada en otra
  • 17.
    MAD box  Enplantas se han identificado los genes MADbox y son comparables a genes homebox en animales.  La región conservada del DNA mad box codifica el gen mad  55 aminoácidos  Los genes MAD no pueden actúar en animales.
  • 18.
    MAD box: ArabidopsisThaliana  Genes que codifican órganos florales, determinados por comparación de mutantes florales  Esquema angioesperma: Órganos que surgen a partir de los meristemos florales
  • 19.
    Modelo de floraciónABC  Genes tipo A: Identidad de sépalos y petalos  Genes de tipo B: Identidad de pétalos y estambres  Genes de tipo C: Identidad de estambres y carpelos
  • 20.
    Mutantes  Mutantes en gen A: Carece de sépalos y petalos  Mutantes de tipo B: Carecen de petalos y estambres  Mutantes tipo C: Carecen de estambres y carpelos.
  • 21.
    WT vs Mutantetipo A  NO tiene sépalos ni pétalos
  • 22.
    WT vs Mutantetipo B  No tiene ni pétalos ni estambres
  • 23.
    WT vs Mutantetipo C  No tiene carpelos ni estambres
  • 24.
    Factores HD-ZIP  Estructura dimérica formada por dos hélices-α  Estabilizadas por interacciones hidrofóbicas entre residuos de Leucina  Las regiones de unión a DNA tienen carácter básico
  • 25.
    Factores HD-ZIP  Plantas superiores  acoplamiento del desarrollo a señales ambientales como luz, estrés…  sobreexpresión de este gen produce alteraciones en el desarrollo y en la velocidad de crecimiento  Las plantas transgénicas son más altas y se desarrollan más rápidamente, tienen menos hojas y de menor tamaño
  • 26.
    Biología vegetal  En desventaja con la biología animal  Grupos de investigación  Manejo genético de plantas: Innumerables ventajas
  • 27.