Durante el gobierno del Virrey Agustín de Jáuregui se sublevó José Gabriel Condorcanqui. La Real Audiencia tenía competencia jurídica y podía recibir apelaciones de las disposiciones del Virrey, aunque sólo el Consejo de Indias podía revisar sus fallos. La primera forma de administración política española en las colonias fueron las Capitanías.