Los tres organismos principales que evalúan las carreras de las universidades en Ecuador son:
1) El Consejo Nacional de Evaluación y Acreditación (CONEA), que dirige el Sistema Nacional de Evaluación y Acreditación de la Educación Superior.
2) La Contraloría General del Estado, que supervisa la rendición financiera de cuentas de las universidades.
3) El Secretaría de Educación Superior, Ciencia, Tecnología e Innovación (SEESCYT), que es el organismo rector del sistema de educación superior en Ecuador.