La bioquímica estudia la composición química de los seres vivos, especialmente moléculas como proteínas, carbohidratos, lípidos y ácidos nucleicos. Examina las reacciones químicas de estos compuestos, como el metabolismo, que permite a los organismos obtener energía y generar biomoléculas.
1. Que es bioquímica
La bioquímica es una ciencia que estudia la composición química de los seres vivos,
especialmente las proteínas, carbohidratos, lípidos y ácidos nucleicos, además de otras
pequeñas moléculas presentes en las células y las reacciones químicas que sufren estos
compuestos (metabolismo) que les permiten obtener energía (catabolismo) y generar
biomoléculas propias (anabolismo).
La ciencia: es el conjunto de conocimientos sistemáticamente estructurados, y susceptibles
de ser articulados unos con otros. La ciencia surge de la obtención del conocimiento mediante
la observación de patrones regulares, de razonamientos y de experimentación en ámbitos
específicos, a partir de los cuales se generan preguntas, se construyen hipótesis, se
deducen principios y se elaboran leyes generales y sistemas metódicamente organizados.
La biología:
Es la ciencia que tiene como objeto de estudio a los seres vivos y, más específicamente,
su origen su evolución y sus propiedades: nutrición, morfogénesis, reproducción, patogenia,
etc. Se ocupa tanto de la descripción de las características y los comportamientos de los
organismos individuales como de las especies en su conjunto, así como de la reproducción de
los seres vivos y de las interacciones entre ellos y el entorno. De este modo, trata de estudiar la
estructura y la dinámica funcional comunes a todos los seres vivos, con el fin de establecer las
leyes generales que rigen la vida orgánica y los principios explicativos fundamentales de ésta.
Un aminoácido es una molécula orgánica con un grupo amino (-NH2) y un grupo carboxilo
(-COOH) unidos a un carbono central. Los aminoácidos más frecuentes y de mayor interés son
aquellos que forman parte de las proteínas.
Las proteínas: desempeñan un papel fundamental para la vida y son las biomoléculas más
versátiles y más diversas. Son imprescindibles para el crecimiento del organismo. Realizan una
enorme cantidad de funciones diferentes, entre las que destacan:
Estructural. Esta es la función más importante de una proteína (Ej: colágeno),
Inmunológica (anticuerpos),
Enzimática (Ej: sacarasa y pepsina),
Contráctil (actina y miosina).
Homeostática: colaboran en el mantenimiento del pH (ya que actúan como un tampón
químico),
Transducción de señales (Ej: rodopsina)
Protectora o defensiva (Ej: trombina y fibrinógeno)
Un ácido: Es considerado tradicionalmente como cualquier compuesto químico que, cuando
se disuelve en agua, produce una solución con una actividad de catión hidronio mayor que el
agua pura, esto es, un pH menor que 7. Esto se aproxima a la definición moderna de Johannes
Nicolaus Brønsted y Thomas Martin Lowry, quienes definieron independientemente un ácido
+
como un compuesto que dona un catión hidrógeno (H ) a otro compuesto (denominado base).
A las sustancias químicas que tienen la propiedad de un ácido se les denomina ácidas.
2. Una base: es, en primera aproximación (según Arrhenius), cualquier sustancia que
−
en disolución acuosa aporta iones OH al medio. Un ejemplo claro es el hidróxido potásico, de
− +
fórmula KOH: KOH → OH + K (en disolución acuosa)
El pH: Es una medida de acidez o alcalinidad de una disolución. El pH indica la concentración
+
de iones hidronio [H3O ] presentes en determinadas sustancias. La sigla significa "potencial
de hidrógeno.
La escala de pH: típicamente va de 0 a 14 en disolución acuosa, siendo ácidas las
disoluciones con pH menores a 7 (el valor del exponente de la concentración es mayor, porque
hay más iones en la disolución), y alcalinas las que tienen pH mayores a 7. El pH = 7 indica la
neutralidad de la disolución (cuando el disolvente es agua).
Las enzimas: son moléculas de naturaleza proteica que catalizan reacciones químicas,
siempre que sean termodinámicamente posibles: Una enzima hace que una reacción química
que es energéticamente posible (ver Energía libre de Gibbs), pero que transcurre a una
velocidad muy baja, sea cinéticamente favorable, es decir, transcurra a mayor velocidad que
sin la presencia de la enzima.
Las coenzimas: son cofactores orgánicos no proteicos, termoestables, que unidos a
una apoenzima constituyen la holoenzima o forma catalíticamente activa de la enzima. Tienen
en general baja masa molecular (al menos comparada con la apoenzima) y son claves en el
mecanismo de catálisis, por ejemplo, aceptando o donando electrones o grupos funcionales,
que transportan de un enzima a otro.
Catalizadores
Substancia capaz de favorecer o acelerar una reacción química sin intervenir directamente en
ella; al final de la reacción el catalizador permanece inalterado. Los catalizadores más usados
son los constituidos por platino, paladio y vanadio o por óxidos de cobre y de níquel. La
substancia catali-zadora necesita un soporte, constituido generalmente por materias inertes. Se
hace mucho uso de los catalizadores en el campo de las pinturas acrílicas y de los plásticos,
para acelerar el proceso de polimerización, o en los silenciadores denominados precisamente
catalíticos, para reducir lacontaminación. El empleo de un catalizador en una pintura permite
su endurecimiento en poco tiempo, pero exige también una técnica especial de pulverización.
sustrato
En bioquímica, un sustrato es una molécula sobre la que actúa una enzima
Las enzimas catalizan reacciones químicas que involucran al sustrato o los sustratos. El
sustrato se une al sitio activo de la enzima, y se forma un complejo enzima-sustrato. El sustrato
por acción de la enzima es transformado en producto y es liberado del sitio activo, quedando
libre para recibir otro sustrato.
El sitio o centro activo: es la zona de la enzima a la que se une el sustrato para ser
catalizado.
La reacción específica que una enzima controla depende de un área de su estructura terciaria.
Dicha área se llama el sitio activo y en ella ocurren las actividades con otras moléculas.
Debido a esto, el sitio activo puede sostener solamente ciertas moléculas. Las moléculas
del sustrato se unen al sitio activo, donde tiene lugar la catálisis. La estructura tridimensional de
éste es lo que determina la especificidad de las enzimas. En el sitio activo sólo puede entrar un
determinado sustrato (ni siquiera sus isómeros). El acoplamiento es tal que E. Fisher (1894)
3. enunció: "el sustrato se adapta al centro activo o catalítico de una enzima como una llave a una
cerradura".
Un grupo prostético es el segundo tipo de coenzima y es el componente no aminoacídico o
que no es proteico que forma parte de la estructura de algunas proteínas y que se halla
fuertemente unido a la enzima durante el resto de la reacción catalizada por enzimas. Las
proteínas con grupo prostético reciben el nombre de heteroproteínas (o proteínas conjugadas).
Muchas proteínas requieren el grupo prostético para ser funcionales. En algunos casos, el
grupo prostético se une en forma covalente a su apoenzima. El grupo prostético debe regresar
a su forma original durante cada evento catalítico total, de lo contrario la holoenzima no seguirá
siendo cataliticamente activa.
Las isoenzimas o isozimas son enzimas que difieren en la secuencia de aminoácidos,
pero que catalizan la misma reacción química. Estas enzimas suelen mostrar diferentes
parámetros cinéticos (i.e.diferentes valores de KM), o propiedades de regulación diferentes. La
existencia de las isoenzimas permite el ajuste del metabolismo para satisfacer las necesidades
particulares de un determinado tejido o etapa del desarrollo. En bioquímica, las isoenzimas
son isoformas (variantes estrechamente relacionadas) de las enzimas. En muchos casos, son
codificadas por genes homólogos que han divergido con el tiempo. Aunque de forma estricta,
las aloenzimas representan enzimas de diferentes alelos de un mismo gen y las isoenzimas
representan enzimas de diferentes genes cuyos productos catalizan la misma reacción, los dos
términos se suelen usar indistintamente.
El metabolismo: es el conjunto de reacciones bioquímicas y procesos físico-químicos que
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ocurren en una célula y en el organismo. Estos complejos procesos interrelacionados son la
base de la vida a escala molecular, y permiten las diversas actividades de las
células: crecer, reproducirse, mantener sus estructuras, responder a estímulos, etc.
La metabolización es el proceso por el cual el organismo consigue que sustancias activas se
transformen en no activas.
Los nucleótidos son moléculas orgánicas formadas por la unión covalente de
un monosacárido de cinco carbonos (pentosa), una base nitrogenada y un grupo fosfato.
El nucleósido es la parte del nucleótido formado únicamente por la base nitrogenada y
la pentosa.
Son los monómeros de los ácidos nucleicos (ADN y ARN) en los cuales forman cadenas
lineales de miles o millones de nucleótidos, pero también realizan funciones importantes como
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moléculas libres (por ejemplo, el ATP o el GTP).
Analogos
Del griego "analogos" (similar, semejante), el término se utiliza en general como sinónimo de
similar. En filosofía fue utilizado por la escolástica tomista para designar al predicado que se
puede aplicar a muchos sujetos de modo que tenga un significado común a todos ellos y, al
mismo tiempo, tenga otro diferente para cada sujeto. De este modo, el término análogo se aleja
tanto del unívoco (que tiene sólo un significado) como del equívoco (que tiene varios
significados).
.
4. La biosíntesis de proteínas es el proceso anabólico mediante el cual se forman
las proteínas. El proceso consta de dos etapas, la traducción del ARN mensajero, mediante el
cual los aminoácidos del polipéptido son ordenados de manera precisa a partir de la
información contenida en la secuencia de nucleótidos del ADN, y las modificaciones
postraducción que sufren los polipéptidos así formados hasta alcanzar su estado funcional.
Dado que la traducción es la fase más importante la biosíntesis de proteínas a menudo se
considera sinónimo de traducción.
El catabolismo es la parte del metabolismo que consiste en la transformación
de biomoléculas complejas en moléculas sencillas y en el almacenamiento adecuado de la
energía química desprendida en forma de enlaces de alta energía en moléculas de adenosín
trifosfato. Las reacciones catabólicas son en su mayoría reacciones de reducción-oxidación. El
catabolismo es el proceso inverso del anabolismo, aunque no es simplemente la inversa de las
reacciones catabólicas.
El anabolismo (del griego ana, "hacia arriba", ballein y "lanzar") son los procesos
del metabolismo que tienen como resultado la síntesis de componentes celulares a partir de
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precursores de baja masa molecular, por lo que recibe también el nombre de biosíntesis. Es
una de las dos partes en que suele dividirse el metabolismo, encargada de la síntesis
de moléculas orgánicas (biomoléculas) más complejas a partir de otras más sencillas,
orgánicas o inorgánicas, con requerimiento de energía (reacciones endergónicas) y de poder
reductor, al contrario que el catabolismo. Aunque anabolismo y catabolismo son dos procesos
contrarios, los dos funcionan coordinada y armónicamente, y constituyen una unidad difícil de
separar.
Los carbohidratos, también conocidos como glúcidos, hidratos de carbono y sacáridos son
aquellas moléculas orgánicas compuestas por carbono, hidrógeno y oxígeno que resultan ser
la forma biológica primaria de almacenamiento y consumo de energía.
De acuerdo a la cantidad de moléculas que intervienen en su formación nos encontramos con
diferentes tipos de carbohidratos, los monosacáridos (una sola molécula), los disacáridos (dos
moléculas), los oligosacáridos (de tres a nueve moléculas) y los polisacáridos (cadenas
ramificadas de más diez moléculas).
La nutrición es principalmente el aprovechamiento de los nutrientes, manteniendo el
equilibrio homeostático del organismo a nivel molecular y macro-sistémico, y por tanto
garantizando que todos los eventos fisiológicos se efectúen de manera correcta, logrando una
salud adecuada y previniendo enfermedades.
Los procesos macrosistémicos están relacionados a la
absorción, digestión, metabolismo y eliminación.
Los procesos moleculares o microsistémicos están relacionados al equilibrio de elementos
como enzimas, vitaminas, minerales, aminoácidos, glucosa, transportadores químicos,
mediadores bioquímicos, hormonas, etc.
La nutrición también es la ciencia que estudia la relación que existe entre los alimentos y
la salud, especialmente en la determinación de una dieta.
La digestión es el proceso de transformación de los alimentos, previamente ingeridos, en
sustancias más sencillas para ser absorbidos. La digestión ocurre tanto en los organismos
pluricelulares como en las células, (ver digestión intracelular). En este proceso participan
diferentes tipos de enzimas.
5. Absorción: es la operación unitaria que consiste en la separación de uno o más componentes
de una mezcla gaseosa con la ayuda de un solvente líquido con el, cual
forma solución (un soluto A, o varios solutos, se absorben de la fase gaseosa y pasan a la
líquida). Este proceso implica una difusión molecular turbulenta o una transferencia de masa
del soluto A a través del gas B, que no se difunde y está en reposo, hacia un líquido C, también
en reposo. Un ejemplo es la absorción de amoníaco A del aire B por medio de agua líquida C.
Al proceso inverso de la absorción se le llama empobrecimiento o desabsorción; cuando el gas
es aire puro y el líquido es agua pura, el proceso se llama deshumidificación, la
deshumidificación significa extracción de vapor de agua del aire.
Macronutrientes: En nutrición, los macronutrientes son aquellos nutrientes que suministran la
mayor parte de la energía metabólica del organismo. Los principales son glúcidos, proteínas,
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y lípidos. Otros incluyen alcohol yácidos orgánicos. Se diferencian de los micronutrientes como
las vitaminas y minerales en que estos son necesarios en pequeñas cantidades para mantener
la salud pero no para producir energía.
La vida es sostenida por los alimentos, y las sustancias contenidas en los alimentos de las
Micronutrientes: Se conocen como 'micronutrientes a las' a las sustancias que el
organismo de los seres vivos necesitan en pequeñas dosis. Son indispensables para los
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diferentes procesos metabólicos de los organismos vivos y sin ellos morirían. Desempeñan
importantes funciones catalizadoras en el metabolismo como cofactores enzimáticos, al formar
parte de la estructura de numerosas enzimas (grupos prostéticos) o al acompañarlas
(coenzimas). En los animales engloba las vitaminas y minerales y estos últimos se dividen
en minerales y oligoelementos. Estos últimos se necesitan en una dosis aún menor.
Las vitaminas son compuestos heterogéneos imprescindibles para la vida, que al ingerirlos
de forma equilibrada y en dosis esenciales promueven el correcto funcionamiento fisiológico.
La mayoría de las vitaminas esenciales no pueden ser sintetizadas (elaboradas) por el
organismo, por lo que éste no puede obtenerlas más que a través de la ingesta equilibrada de
vitaminas contenidas en los alimentos naturales. Las vitaminas son nutrientes que junto con
otros elementos nutricionales actúan como catalizadoras de todos los procesos fisiológicos
(directa e indirectamente).
Acetil coenzimas a:
La enzima acetil coenzima A (acetil-CoA) es un compuesto intermediario clave en
el metabolismo, que consta de un grupo acetilo, de dos carbonos, unido de manera covalente a
la coenzima A.
Los glúcidos: carbohidratos, hidratos de carbono o sacáridos
Son biomoléculas compuestas por carbono,hidrógeno y oxígeno. La glucosa, el glucógeno y
el almidón son las formas biológicas primarias de almacenamiento y consumo de energía;
lacelulosa forma la pared celular de las células vegetales y la quitina es el principal
constituyente del exoesqueleto de los artrópodos.