SlideShare una empresa de Scribd logo
1 de 137
AUTOMATIZACION EN
MICROBIOLOGIA
Marco
Terencio V
116-27 a.C.
Insectos
Vectores de
enfermedades
Avicena
981-1037
Describe
síntomas y
tratamiento
de gusanos
Hipócrates
460 -377 a.C.
Enfermedad
no es mágica
Enfermedad
alt. Fluido
Vital y miasma
Girolano
Fracastoro
1478-1553
Transmisibilidad
de las enfermedades
Poema sobre la sífilis
HISTORIA : MICROBIOLOGIA
ZACARIAS JANSSEN
1590-1608
Construyo Sistema de
Lentes compuestos
GALILEO GALILEI
1564-1609
Construyo primer
Microscopio simple
ANTONY VAN
LEEUWENHOEK
1632 – 1723
1676,observa y
Dibuja bacterias
de la saliva
Carta 39,
17 Sept.
1683
EDWARD JENNER
1749 – 1823
Padre de la
Imunología
1798: Preparó la
vacuna contra la
viruela humana.
Realizó inoculaciones
a humanos utilizando
pústulas de viruela
vacuna y comprobó
que esta práctica
protegía frente a la
viruela humana.
26 de Octubre 1979 la
O.M.S. da por
erradicada esta
enfermedad del mundo
LOUIS PASTEUR
1822 – 1895
Padre de la
Bacteriología
1856: Fermentación por
levaduras
1857: Fermentación
láctica
1861: Culmino con la
teoría de Generación
espontánea
1866: Pasteurización
1880: Identificó agente
del Cólera en la gallina.
1881: Inmuniza ovejas
contra el Carbunco
1885: Vacuna contra la
Rabia
ROBERTO KOCH
1843 – 1910
Nóbel Fis. y Med. (1905)
Las enf. infecciosas son
provocadas por
microorganismos y elaboro
técnicas para identificar y
aislar bacterias
1876: Demuestra la etiología
del Carbunco o Ántrax,
Bacillus anthracis
1882: “Myco. Tuberculosis”
1881: Estudio esporas y
diferencias de los bacilos
1881: técnicas de laboratorio:
medios de cultivo sólidos
1883: descubre el Vibrión
colérico en Egipto
JOSEPH LISTER (1827 – 1912)
1867: Las bases de la desinfección y antisepsia en
cirugía, utilizando fenol y bicloruro de mercurio en
en el lavado del instrumental quirúrgico, manos y
heridas de pacientes
Frederich Loeffler (1852-1915)-Klebs:descubre bacilo diftérico
Karl Joseph Ebert (1835-1926): el agente causal de la fiebre
tifoidea
Armauer Hansen (1841-1912), Lepra
Albert Neisser (1855-1916), aísla el Gonococo
Arthur Nicolaier ,descubre el bacilo tetanico
Kitasato y Yersin ,descubren el bacilo de la peste
Descubrimiento de la Penicilina (1929)
 Fleming, Sir Alexander.Fleming, Sir Alexander.
Observó que un moho que contaminaba
una de sus placas de cultivo, había
destruido la bacteria cultivada en ella,
llamado Penicillium notatun.
Descubrimiento de la Estreptomicina (1944)
Schatz y Waksman: Descubren la
estreptomicina. Producida por hongo
Streptomyces griseus
HANS C. J. GRAM (1853 – 1938)
1884, Coloración GRAM
TyndallTyndall (1820-1893) ,1877 Evidencia la presencia de(1820-1893) ,1877 Evidencia la presencia de
formas microbianas resistentes al calor (esporasformas microbianas resistentes al calor (esporas
bacterianas).bacterianas).
Schaudinn y Hoffmann 1906 ; Descubren que
Treponema pallidum , causa la Sífilis
Paul Ehrlich ( 1854-1919 ) ,1910 desarrolla
quimioterapéutico
(Salvarsán) frente a la Sífilis
ROBERTO GALLO ( U.S.A. )
JEAN LUC MONTANIER ( FRANCIA )
1984: Descubren el VIH
1915-1917 , Descubren los virus
bacterianos “Bacteriófagos”
D’Herrelle y Twort
Schönlein (1839) :Schönlein (1839) : Describe asociación de HONGOSDescribe asociación de HONGOS
concon
la Tiña (infección en piel)la Tiña (infección en piel)
1910: Comienza la era de la Biología Molecular
1979: Se sintetiza la insulina por técnicas de ADN.
1982: Se desarrolla la vacuna contra la Hepatitis B.
Watson y Crick :1953 , Proponen la
estructura de la doble hélice para el ADN.
1933 el primer Microscopio Electrónico de
Transmisión.
1980 el primer Microscopio Electrónico de
Barrido
El dinámico desarrollo de la
microbiología en el siglo XX-XXI
Descubrimientode
Agentesinfecciosos
Eradela
Antibioticoterapia
Prevención
vacunas
Epidemias
B-lactamicos
Aminoglucosidos
Macrolidos
Quinolonas
Genética
Microbiología
Bioquímica
Revolucióndel
Laboratorio
Biología Básica
Ac. nucleicos
Código genético
Mecanismo de síntesis proteica
Automatización
Microbiología
En Procedimientos
Uso ordenadores de
gestión Microbiología
En diagnostico
Hibridomas
Ac. monoclonales
específicos
PCR
¿PORQUE LLEGAR A LA AUTOMATIZACION?
Primer Método utilizado (1966), Estandarizado 0.5 Escala Mc
Farland (Turbidez-inoculo)
Criterios de Interpretación (R, I, y S)
Los escatogramas o scatterplots
Para la interpretación de CIM y disco difusión .
•Los aislamientos son analizados con los métodos estándar de
difusión por disco y CIM del NCCLS. La CIM y su correspondiente
diámetro de zona son delineados para cada aislamiento.
Panel de microdilucion
en Caldo - CIM
La prueba de microdilucion en caldo -
CIM se realiza en placas de poliestireno
(0.1 ml) .
Una placa contiene de 7 a 8 diluciones
de 12 diferentes antibióticos
Una celdilla es control (+)
(caldo+inoculo)
Control (-) (solo caldo)
Placas para Gram negativos y Gram (+)
Caldo Muller Hinton recomendable
Hay paneles específicos
Caldo contiene Cationes Ca ++ y Mg ++
Cada lote examinado PH después de
preparado (7.2 a 7.4) y Tº 25ºc
Para neumococo suplementar 2-5%
sangre caballo lisado
Colocar standares de control de calidad
Grupo N acilo
Anillo Tiazolidinico
Posición aminoacídica
39 42 104 164 237 238 240 265
TEM-1 Ala Glu Arg Ala Gly Glu Thr
TEM-2
TEM-3 Lys Ser
TEM-4 Lys Ser Met
TEM-5 Ser Thr Lys
TEM-6 Lys His
TEM-7 Lys Ser
TEM-8 Lys Lys Ser Ser
TEM-9 Lys Ser Met
TEM-10 Ser Lys
TEM-11 Lys His
TEM-12 Ser
TEM-13 Lys Met
TEM-14 Lys Lys Ser Met
TEM-15 Lys Ser
Posición aminoacídica
69 165 244 275 276
TEM-1 Met Trp Arg Arg Asn
TEM-31 (IRT-1) Cys
TEM-30 (IRT-2) Ser
TEM-32 (IRT-3) Ile
TEM-35 (IRT-4) Leu Asp
TEM-33 (IRT-5) Leu
TEM-34 (IRT-6) Val
TEM-36 (IRT-7) Val Asp
TEM-37 (IRT-8) Ile Asp
TEM-38 (IRT-9) Val Leu
TEM-39 (IRT-10) Leu Arg Asp
TEM-40 (IRT-I67) Ile
TEM-41 Thr
TEM-45 (IRT-14) Leu Gln
Posición aminoacídica
35 179 205 238 240
SHV-1 Leu Asp Arg Gly Glu
SHV-2 Ser
SHV-2a Gly Ser
SHV-3 Leu Ser
SHV-4 Leu Ser Lys
SHV-5 Ser Lys
SHV-7 Ser Lys
SHV-8 Asn
SHV-11 Gln
SHV-12 Gln Ser
BLEE B- Lactamasa
relacionada
País de origen En especies
detectadas
TEM TEM1 Y TEM2 FRANCIA Enterobacterias
SHV SHV 1 / LEN ALEMANIA P. Aeruginosa /
BGNNF
CTX-M
cefotaxaminasas
KLUA Kluyvera Alemania/Argentin E. coli, Salmonella
OXA OXA 10 Turquía/Francia P- aeruginosa
PER FRANCIA P.- aeruginosa
VEB PER Vietnam/Tailandia E. Coli
TLA CME-1 MEXICO E. Coli
GES/IBC Guayana/ Sudafr. K. Pneumoniae y
Pseudomona
BES Y. Enterocolitica Brasil S. marcescens
SFO AmpA S. fonticola Japon E. cloacae
1 Antibiótico en sangre
2 Bacterias sensibles a los
antibióticos
3 Bacteria no sensible a los
antibióticos
4 Bacterias muertas por
antibióticos
6 Bacteria con resistencia creciente
a antibióticos
7 Bacterias muertas por
antibióticos
8 Población bacteriana con
resistencia creciente al antibiótico
GENES DE RESISTENCIA BACTERIANA:
1 Plásmido
2 Antibiótico expulsado
3 Genes de resistencia antibiótica
4 Enzima que degrada al antibiotico
5 Antibiótico que ingresa
6 Antibiótico que ingresa
7 Enzima que altera el antibiótico
8 Antibiótico que ingresa
9 Cromosoma
MRSA O SARM O SUPERBUG
STAFILOCOCO AUREUS RESISTENTE A
LA METICILINA
•E.U. 300,000 contraen infecciones en hospitalizacion /año
•CDC ,número de muertes 12,000 por año
•UCI ,aislamiento llega a 50% (R) a Meticilina, Penicilina,
Tetraciclina y Eritromicina
•Factores de riesgo: prolongada hospitalización, uso múltiple
de antibióticos previos,etc.
•En la comunidad niños ,ancianos y portadores enf. crónicas
•Endémico en Hospitales ,Neumonía ,Infecc. qx, bacteriemias.
En el Perú : UCI ,Unidad de Quemados, Oncologia y Cirugía,
Resistencia del 58% (500 cepas aisladas-1995)
En la actualidad brotes epidémico relacionado a la colonización
Del personal de salud (MINSA)
VISA – Resistencia Intermedia a la
Vancomicina (GISA)
Susceptibilidad intermedia a la Vancomicina, CIM 8-16 ug /ml
y completamente Resistentes a CIM >= 32 ug /ml
VISA debido al engrosamiento de la pared celular que contiene
precursores capaces de ligar Vancomicina extracelularmente.
La mayoría contiene mecA ,las MIC de 4 ug /ml reportadas se
consideraran VISA potenciales y se recomienda repetir
pruebas
Descrito 1996 en Japón
En EU. en pacientes con MRSA, que reciben Vancomicina por tiempo
prolongado, en diálisis.
VRSA : STAPHYLOCOCCUS AUREUS RESISTENTE A VANCOMICINA ,
2002 EN EE.UU.
HOSPITAL BASE VALDIVIA
2007
RESISTENCIA DEL
ESTAFILOCOCO AUREUS
RESISTENCIA INDUCIBLE A
CLINDAMICINA

bacterias poseen gen de B- Lactamasa
y se exponen un agente B-Lactàmico.
Esta acción antimicrobiana en la pared
celular activa mecanismo genético en
cascada que inicia la producción de
B-Lactamasa.
la producción cesa en ausencia de
antimicrobianos en la pared
B-Lactamasa AmpC
Panorama actual
 La aparición cada vez más frecuente y diversa de los
mecanismos de resistencia microbiana, sobre todo en
bacterias patógenas facultativas y oportunistas, ha traído
consecuencias importantes en términos de morbilidad y
mortalidad y millonarias pérdidas humanas y económicas
 Resistencia incrementada en caso de staphilococcus,
streptococcus y enterococcus y bacilos Gram negativos
(enterobacterias y no fermentadores)
 Dificultad para predecir los patrones de resistencia en
pacientes críticos
 El uso de la Terapia de amplio espectro de alto costo y
numerosos efectos secundarios o adversos que se
presentan
Panorama actual
 La necesidad de
entrega de resultados
oportunos ,evita que la
terapia inicial se
prolonga
innecesariamente
 Mortalidad :
Resultado > 72 hrs. da
como consecuencia el
aumento de mortalidad
en pacientes críticos y
sobrevida disminuye
30% por cada día de
retardo a entrega de
resultados
VIGILANCIA DE LA RESISTENCIA A LOS
ANTIMICROBIANOS Perú 2007 -INS
HOSPITAL Aislados E. Pediátricas
( R )
Aislados H. Unanue
(R)
ANTIBIOT.
Cefazolina
Clindamicina 28 53.6 % 46 87
Eritromicina 29 69 46 91.3
Gentamicina 27 59.3 38 81.6
Oxacilina 29 58.6 43 90.7
Vancomicina 29 0 36 0
STAPHYLOCOCCUS AUREUS
VIGILANCIA DE LA RESISTENCIA A LOS
ANTIMICROBIANOS Perú 2007 -INS
Escherichia coli-Resistencia
Hospital aislado H. Unanue aislado I.M.P aislado E. Pediátricas
Antibiot
Amicacina 84 2.4 % 106 8.5 % 82 4.9 %
Amox.Cl 227 63.9 83 18.1 79 55.7
Cefotaxima 69 31.9 66 27.3 78 32.1
Ceftriaxona 180 30.5 115 34.8 82 32.9
Cefuroxima 71 23.9
Ciprofloxac 74 65.4 116 30.4 45 33.3
ESBL 53 98.1 31 71 82 32.9
Nitrofurant 190 7.9 102 8.4 69 1.4
Trimet- Sulf 220 65.9 95 80 80
TEM-1 de E. coli
1.8 A de resolución
ANTIMICROBIANOS Perú 2007 – INS
Pseudomonas aeruginosa
Hospital aislado 2 de Mayo aislado H. Unanue
Antibiótico
Amicacina 72 37.5% 73 47.9%
Aztreonam 75 33.3 71 80.3%
Ciprofloxacina 73 46.6% 80 65
Gentamicina 76 46.1 72 65.3%
Imipenem 64 43.8
Meropenem 52 50%
ANTIMICROBIANOS Perú 2007 – INS
Klebsiella pneumoniae
Hospital aislado IMP aislado H. Unanue aislado S. Bernales
Antibiótico
Amicacina 56 60.7% 42 11.9 31 19.4
Amp. Clav 48 22.9 75 77.3 31(A-S) 41.9 (A-S)
Aztreonam 36 80.6
B-lactamasa 42 95.2
Cefalotina 75 76
Cefazolina 31 93.5 31 58.1
Cefotaxima 36 77.8 31 45.2
Ceftriaxona 63 81.1 31 45.2
Cefuroxima 31 51.6
Ciprofloxacin 52 21.2 66 45.5 31 25.8
Factores de riesgo de adquirir infecciones
por cepas productoras de BLEE
Desnutrición
Bajo peso al nacer
Gravedad de la infección
Duración de la estadía en el
hospital y en UCI
Procedimientos invasivos
Receptores oncológicos
Reservorios y vectores
Termómetros
Cánulas de oxígeno
Mascaras y tubos de ventiladores mecánicos
Jabón líquido
Insectos
Gel para ecografías
Trabajadores de la salud
Papel de la Automatización
 Los sistemas automatizados acortan los
tiempos porque mejoran la sensibilidad
analítica de los métodos
 Capaces de detectar el desarrollo bacteriano
en una suspensión con y sin
antimicrobianos antes que el laboratorista
detecte turbidez (fundamento de los sistemas
automatizados)
 Metodología: colorimetría – turbidimetria
-fluorometria etc.
ventajas Especificación
Impacto clínico Rapidez en el resultado
de 3 a 10 horas.
Inicio o cambio precoz del
antimicrobiano
costos hospitalización y
análisis de laboratorio ,de
usos de antibióticos
Estandarización y control
de calidad
de la reproductibilidad
intra e ínter laboratorio
Disminución de la carga
de trabajo
Requieren manos
personal en métodos del
MIC
CONDICIONES SOBRE SU UTILIZACION
ventajas Especificación
Disminución de errores
post analíticos
Evita la transcripción
errónea de resultados
por el uso de programas
Utilización de sistemas
de expertos
Permite actualizar
anualmente las guias de
NCCLS que permite el
informe selectivo de los
antimicrobianos.
Monitorizar resultados
inconsistentes
ventajas Especificación
Patrones fenotipitos de
resistencia
Permite sospechar la
presencia de B
lactamasas de espectro
extendido y
cefalosporinas
Facilita las estadísticas Almacenar y procesar
información para una
análisis de tendencias
anuales de
susceptibilidad
Facilita el control en el
uso de antimicrobianos
Informe de resultados
en línea con el comité
farmacológico
desventajas Especificaciones
Alto costo (3 veces mayor
Que los manuales)
El equipamiento y los
insumos (paneles o
tarjetas) - “tarifas
diferenciadas o “uso para
hospitalización y críticos”
Requieren método de
respaldo
Frente a cualquier falla se
necesita un back up o
metodología manual de
respaldo
No existen normas
NCCLS para sistemas
automatizados, no
aplicables a todas las
bacterias
Sin embargo se deben
considerar los métodos
empleados (puntos de
corte o MIC)
desventajas Especificaciones
Poca flexibilidad en los
antimicrobianos
ensayados
Paneles o tarjetas están
determinadas por el
fabricante.
Existen tarjetas
especiales pero requiere
consumo mínimo
desventajas Especificaciones
Discrepancia con
métodos convencionales
de referencia
Problemas:
Haemophilus Influenza
Neumococos, Gram (-)
no fermentadores, y
Anaerobios .
Cefepime y Pseudomonas
Vancomicina (I) en el caso
de Enterococcus
Imipenem ,falsa (R) o (S)
con Pseudomona y
Acinetobacter baumanii .
desventajas Especificaciones
Discrepancia con
métodos convencionales
de referencia
Problemas:
B lactamasa en algunos
Gram negativos requieren
prolongada incubación
para expresar ( R )
FDA recomienda para
errores mayores (sistema
informe R siendo (S) ,la
tasa no > 1.5% ,la
concordancia sea 90% ,
fallas de crecimiento =<
10%
SISTEMAS AUTOMATIZADOS
 Diferentes grados de automatización
 Métodos Calorimétricos,
Turbidimetricos , Fluorescencia
 Lectura a tiempos determinados
 Lectores muy sensibles al
crecimiento aumentan la velocidad de
entrega de los resultados
Componentes Tecnológicos
 Panel o tarjeta de Trabajo
 Software
Microbiológico
Control de Calidad Cepas ATCC
Motor de Base de Datos
Estadístico y Epidemiológico
Normas de la CLSI (antes
NCCLS)
Comunicación (Interfaz)
Biomeriux
Vitek
Siemens
MicroScan
Becton Dickinson
BDPhoenix
Panel o Tarjeta de Trabajo
Biomeriux
Vitek Siemens
MicroScan
Becton Dickinson
BDPhoenix
Caracteristicas de Paneles
MICRO Scan
Identificación solamente
Sensibilidad solamente
(BP o MIC)
Combo (ID+ATB)
Tecnología del Panel
 Paneles Convencionales – Colorimetrica y Turbidez
– Gram Negativo / Gram Positivo
 Paneles Cromogénicos – Colorimetrica Enzimatica
 Identificación en 4 hrs
– ID de Levaduras
– HNID (Haemophilus, Neisseria, Moraxella y Gardnerella)
– ID de Anaerobios
 Paneles Rápidos Fluorescentes - Fluorescencia
– Gram Negativo
– Gram Positivo
 Synergies Plus Panels – Fluorescencia y Turbidez
– Gram Negativo
– Gram Positivo
 Paneles Especializados – Turbidez
– MicroStrep Plus
– ESBL confirmatorio
Colorimetrica y
Turbidez
Colorimetrica
Enzimatica
Fluorescente Fluorescente y
Turbidez
 MIC
(Concentración
Mínima Inhibitoria)
 Concentración del
antibiótico in vitro
por método
cuantitativo.
 4 – 5 diluciones
por antibiótico
 17 – 27 ATB /panel
 BP (Breakpoint)
 Susceptibilidad in
vitro cualitativa (S,
I, ó R)
 Concentración de
antibiótico
equivalente a las
reglas CLSI -
breakpoints
 1-2 diluciones por
droga - 29-33 ATB
por panel
ANTIBIOGRAMA
PANEL ESβL plus
 Confirmar la producción de Beta Lactamasas de Espectro Extendido
en E. coli, Klebsiella oxytoca y Klebsiella pneumoniae.
 La inoculación con la técnica de turbidimetría o de prompt. Incubar
20-24 hrs. A 35 ± 1°C sin CO2 en incubadora externa.
 Determinación cualitativa con lectura manual de crecimiento en
pocillos como turbidez o nebulosidad en todo el pocillo.
 Interpretación del resultado (disminución 3 diluciones en Caz y
Caz/CA ó Cft y Cft/CA):
ESBL positivo ESBL negativo
Se ingresa al software
manualmente el
resultado en el apartado
de ESBL para confirmar
el resultado si es
positivo o negativo.
ESBL panel (B1027-101)
PANEL MICro STREP plus
 Determinar la sensibilidad de antimicrobianos para estreptococos
aerobios no enterococos (incluidos St. pneumoniae).
 Inoculación del panel (turbidimetría con tubo 0.5 de Mc Farland).
TSA con 5% de sangre de
carnero
25 ml de LHB (B1015-25)
0.5 McFarland =
0.08 ± 0.02
turbidímetro
Incubar 20-24
hrs. a 35 ± 1 °C
en una
incubadora
externa.
Se ingresa al software
manualmente el resultado
donde el crecimiento se
presenta como turbidez.
Cualquier cambio de color
en el medio no se
considera crecimiento.
Salina (B1015-12)
4-5 colonias
100 mcl
Inoculador
2 veces
MICro STREP panel
(B1027-201)
PANELES Synergies Plus
 Organismos Gram Negativos
Gram Positivos
 Tipos de Panel Combo, MIC sólamente, ID
 Medio de cultivo Agar Sangre para Gram Negativos
 Identificación 138 Gram negativos
 Antibióticos 31 para Gram negativos
 Tiempo de Lectura 2.5 hrs ID con base en la fluorescencia
 MIC 4.5-16 hrs, Read-When-Ready
 80% MIC en 6.5 hrs
 Método de Lectura Sistema WalkAway®
 Almacenamiento Temperatura Ambiente
 Vida de Anaquel Un año
 Reactivos Ninguno
ANTIBIÓTICOS EN PANELES
SYNERGIES PLUS
 Antibióticos que se liberarán
en cuanto estén listos
 Amikacina
 Ampicillina
 Ampicillina/Sulbactam*
 Ceftazidima
 Ceftriaxona
 Cefuroxima
 Ciprofloxacina
 Gatifloxacina
 Gentamicina
 Imipenem
 Levofloxacina
 Meropenem
 Moxifloxacina
 Nitrofurantoina*
 Norfloxacina
 Piperacillina/Tazobactam*
 Piperacillina*
 Tobramicina
 Trimetoprim/Sulfametoxazol
Antibióticos de incubación convencional
Amoxicillina/Clavulanato
Aztreonam
Cefazolina
Cefepime
Cefotaxime
Cefotetan
Cefoxitin
Cefalotina
Cloramfenicol
Tetraciclina
Ticarcillina
Ticarcillina/Clavulanato
* Antibióticos de incubación
convencional en algunos paneles.
INOCULACIÓN DE PANELES
1-Desembolsar
el Panel
2- Imprimir y pegar el
código de barras al
panel
3- Tomar la colonia 4- Un prompt para ID y
sensibilidad.
5- Vaciar suspensión
bacteriana al
inoculador
6- Preparar una
placa de pureza
7- Usar el Renok para
inocular panel
8- Cargar el panel en el
WA
Colorimetría, mide color de
soluciones.
Fluorometría, mide fluorescencia y
luz dispersa y reemitida en varias
direcciones.
Turbidimetría, mide luz no dispersa
a través de una solución turbia.
Dual combinacion de dos
tecnologias a la vez
Lectura
Visual sin equipo
Equipo AS-4
Equipo WA 40/96 SI
Siemens
MicroScan
Centro de Comando LabPro
Muestra lista de
códigos de barra de
nuevas ordenes del LIS
Paneles
completados
Paneles recién
cargados
Cargar Paneles
Probabilidad del organismo
Interpretaciones CLSI
Resultados suprimidos
del reporte
Texto de
Alerta
ordenado
por prioridadInformaciones necesárias para tomar decisiones
aparecen en la misma pantalla
Click +
para exibir texto
de instrucciones
de alertas
Código de
colores para
resultados
“Fuera de
Control”
Sumário y Edición de Resultados QC
Entrada &
información
acción correctiva &
manutención de
archivos w/QC;
apoya guias del CAP
LabPro: Epidemiologia
Excluir drogas no-formulário
Reporte
ordenado
por
organismo
Critério de
aislados
duplicados
definidos
por el
usuário
Reportes
de
Incidencia
Bacteriana
 Sistema
– Elaborado por el usuario
– Automatizado programado día y hora
 Interfaz
– Unidireccional y/o bidireccional
– Labpro – Labpro
– Labpro – Sistema del Hospital
– Labpro - Whonet
Control de Calidad MicroScan
Nacional : MINSA – INS
Internacional m: NCCLS - USA
Streptococcus pneumoniae
Resistente a Penicilina: Evaluación Cuantitativo
≥2,0 µg/ml
RR
<0,12 µg/ml
SS II
0,12 - 1,0 µg/ml
 Hansman & Bullen, 1967, en Australia.
 Appelbaum et al., 1977; Jacobs et al., 1978; Koornhof et al.,
1978, en África del Sur. CIM≥2,0 mg/ml de penicilina
 Resistencia se incrementa a nivel mundial, España, Africa del
Sur, Sudeste Asiático y Estados Unidos
VRE – Enterococo Resistente a
Vancomicina
 Resistencia intrínseca
 Resistencia a las Cefalosporinas
 “National Nosocomial Infections
Surveillance System” (1999)
– 2º en bactiremias
– 2º en infecciones urinarias
EQUIPOS DE APOYO
El Eddy Jet para realizar las siembras en espiral.
El uso de una micro-jeringa desechable de gran
precisión, evita la contaminación cruzada.
Instrumento óptico que utilizado con un ordenador WXp
o Vista se convierte en un potente contador de colonias.
Con un software opcional se puede utilizar para un
número ilimitado de nuevas aplicaciones.
EQUIPOS DE APOYO
El Spin Air es el instrumento para el muestreo
microbiológico del aire.
El diseño especial de los orificios combinado con
la lenta rotación de la cápsula permite el uso del
100% de la superficie comparado con el 5% de
la misma que emplean los aparatos fijos.
Para realizar diluciones volumétricas 1 a 10ml para
muestras microbiológicas.
También pueden realizar diluciones gravimétricas
utilizando una balanza externa. reducen la mano
de obra, ahorran tiempo y aseguran esterilidad y
precisión.
Coloración GRAM
Poly Stainer : automático para la
tinción de Gram.
totalmente programable
Almacena diez programas
diferentes, para definir el baño, el
tiempo de inmersión y la agitación.
Phoenix
 Sistema automatizado de identificación y sensibilidad
 Comunicación con el equipo por iconos.
 Capacidad de incubación de 100 paneles
 Sistema de fácil inoculación
 Control y calibración interna, no requiere mantenimiento.
 Lectura : convencional, fluoro génico y cromogénico.
 Medidas cinéticas de las reacciones: cada 20 min.
 Funcionamiento autónomo, incluyendo el sistema experto
BDXper.
 Conexión al sistema Epicenter
 Conexión al Sistema de Gestión de Laboratorio
Phoenix: Pantalla
Phoenix: Insumos
 Panel y sellador: bandeja de
poliestireno, moldeada sellada
y autoinoculante. 136 pozos:
51 ID y 85 en AST.
 Caldo Phoenix ID y AST
 Indicador Azul de Alamar
 Estación de Inoculación
 Recipiente para paneles
 Nefelómetro Crystal Spec o
BD Phoenix Spec.
 Pipeta 25 ul con micropuntas.
Phoenix: Insumos
 Identificación: 45 substratos:
convencionales, fluorogénicos y
cromogénicos, Carbohidratos,
fuentes de carbón o Esculina.
 Sin adición de reactivos
 5 bases de datos
 Resultados a 2,3,4, 6 y 12 hrs.
 Información de valores de
confianza y reacciones de los
substratos.
 B-Lact en la parte ID para los
paneles G+
Phoenix: Insumos
 Paneles para ID/AST Combo
o solo AST para 1x25:
• Gram negativos: NMIC/ID
• Gram positivos PMIC/ID
• Streptococcus SMIC/ID
• Panel de formato único:
NID,PID,PMIC,NMIC,SMIC.
 Temp. almacenamiento de
reactivos: ambiente.
 Bioseguridad: Cierre hermético
 Resultados rápidos: 80% de
los resultados de AST
completo en < de 10h.
Phoenix: Insumos
Sensibilidad:
 Caldo AST/AST-S 8 ml, Azul de
Alamar.
 20 a 22 antibióticos por panel.
 > de 3 diluciones por Antibiótico
 Doble diluciones
 ESBL incluido en cada panel G-
con 2 métodos de detección
 NMIC/ID, NMIC, PMIC/ID,
PMIC, SMIC/ID, SMIC.
Phoenix: Medios de Obtenci n de Inoculoó
Phoenix: Inoculaci nó
 Colonias puras, 18-
24 hr de incubación.
 Hacer escala de
McFarland 0.5 o
0.25.
 Añadir una gota del
indicador azul de
Alamar.
Phoenix: Inoculaci nó
 Transferir 25 ul o 50 ul
de inoculo ID al caldo
AST.
 Servir ambas
soluciones en el panel
según corresponde ID o
AST.
 Cierre el panel:
hermético.
Phoenix: Incubaci nó
1. Escanear el
código de barras.
2. Teclear o escanear el
numero de muestra.
3. Introducir el panel en el
Phoenix.
Phoenix: Control de Calidad
 Lectura de lotes
automática
 Cepas ATCC
variadas
Phoenix: M todo de Identificaci né ó
 Substratos: convencionales. Cromogenicos, fluoro
génicos, Esculina H.C.
 Base de datos después de 2,3,4,6, y 12 hrs. de
incubación.
Phoenix: M todo de an lisisé á
 Sensibilidad: Diluciones seriadas con MIC real
doble dilución: mínimo 3 dil por antibiótico.
 Lectura basada en:
– Indicador de actividad metabólica: redox
– Cambios de turbidez
 Medición cinética cada 20 min. 6 – 16 hr.
 .
Phoenix: Marcador de Resistencia
 Marcadores de Resistencia: tests específicos (ESBL) o
Características fenotípicas
 No se requiere de Test de confirmación adicional
 BDXpert utiliza estos marcadores para tomar acción
apropiada o hacer recomendaciones.
 Los marcadores son:
– ß-Lactamasa de Staphylococcus (Nitrocefinasa)
– MRSA (basado en Interpretacion de Oxacilina y
Cefoxitin.)
– VRE (basado en MIC Vancomicina).
– Sinergia con aminoglicosidos en Enterococcus
(Gentamicin500mcg/ml y Streptomycin1000mcg/ml)
– ESBL
Epi Center
Inter-conexión de Microbiología
EpiCenter: Informe Cl nicoí
EpiCenter: Estad stica y Epidemiolog aí í
EpiCenter: Graficos
EpiCenter: Cubo Dinamico.
DESARROLLADO PARA LA INVESTIGACIÓN ESPACIAL
TARJEDAS PEQUEÑAS-SE INCOCULA CON UN SISTEMA
DE VACÍO- ENTRE 4 Y 10 HORAS (JORNADA LABORAL)
LECTURA CADA 60 MINUTOS
Tecnología – Tarjeta
Trazabilidad
Unión electrónica
Por código de
Barras
Seguridad
Unidades
Selladas
Rendimiento
64 pocillos
Simplicidad
Inóculo único
1 Preparación de la
Muestra
2 Entrada
código barras
3 Carga del sistema
123 especies 159 especies 52 especies
Aumento de la productividad
Completo menú ID
98% de la rutina ID realizable
en una plataforma
Menú de antibióticos FLEXIBLE
~ 20 antibióticos por tarjeta +
Rango MIC EXPANDIDO +
Antibióticos deducidos
Manejo de ICONOS - Árbol de navegación
1 Entrada
cassette
2 tarjetas 3 Muestra
Resultados para el médico
los resultados e Identificaciones precisas
API referenciaAPI referencia
Equipado Sistema de Expertos™
Reporte correcto de Interpretación
Alerta de mecanismos
de resistencia
Tiempo respuesta - 80% aislamientos
95% de la rutina bacteriana en 6 horas
Soporte a las decisiones terapéuticas
Resultados rápidos - ID
E. coli 5
K. pneumoniae 5
P. aeruginosa 6
P. mirabilis 4
E. faecalis 4
S. aureus 5
S. pneumoniae 5
S. epidermidis 6
Método
tradicional
6 hrs Enterobacteriaceae
18-24hrs Todos los
Microorganismos
9 hrs No-fermentadores
< 5 hrs Staph Oxa R
3 Resultados en el dia - Sensibilidad
Detección rápida de la resistencia Bacteriana
 Rápido ajuste y rotación del tratamiento
 Rápido aislamiento del paciente
La automatización en el aislamiento
primario :Hemocultivos
Desinfección adecuada de la zona , tiempo de espera de acción
desinfectante,punción tradicional desinfección final del septum de la botella.
Espera
2 min.
Desinfectar
septum
BACTERIEMIA Y FUNGEMIA
“Presencia de Bacterias y/o levaduras y/o hongos
en sangre indicando la falla del sistema inmune
del huésped para localizar la infección en su foco
primario o la falla del médico remover, drenar y/o
esterilizar aquel foco.”
“... La tasa de mortalidad está entre 20% al 50% ”
HEMOCULTIVOS
Síntomas de sospecha de bacteremia :
 Fiebre de origen desconocido (>
38°C) o hipotermia (<36°C)
 shock, escalofríos
 Infecciones severas (meningitis,
endocarditis, neumonia, pielonefritis,
Absceso abdominal…).
 Frecuencia cardíaca acelerada
 Alta o baja presión sanguínea
 Aumento de la frecuencia
respiratoria
Hemocultivos: importancia del volumen
WEINSTEIN,M.REV INF
DIS,1983
Nº DE EPISODIOS= 282
3 MUESTRAS DE 15 ml
CADA UNA
 1º= 91% POSITIV
 2º= >99% POSITIV
WASHINGTON, J.MAYO
CLIN PROC. 1975
Nº DE EPISODIOS= 80
3 MUESTRAS DE 20 ml
CADA UNA
 1º= 80% POSITIV.
 2º= 88% POSITIV
 3º= 99% POSITIV
Criterios de interpretación
MICROORGANISMOS QUE SIEMPRE
REPRESENTAN BACTERIEMA
S.pneumoniae, H.influenzae, N.meningitidis,
S.agalactiae, Brucella spp, M.tuberculosis,
Bacteroides spp, Fusobacterium spp,
H.capsulatum, C.neoformans, Leptospira.
MICROORGANISMOS QUE GENERALMENTE
REPRESENTAN BACTERIEMIA
S.aureus, enterobacterias, P.aeruginosa,
S.pyogenes, C.albicans
Criterios de interpretación
MICROORGANISMOS QUE PUEDEN SER
CONTAMINANTES O REPRESENTAR
BACTERIEMIAS VERDADERAS:
Estreptococos grupo viridans, Clostridium
spp, C.tropicalis.
MICROORGANISMOS QUE GENERALMENTE
REPRESENTAN CONTAMINACION:
SCN, Bacillus spp, Corynebacterium spp,
P.acnes, bacilos gram negativos no
fermentadores (excluyendo a P.aeruginosa)
Dia 1 al 15Dia 1 al 15
Paso 2Paso 2
24 – 48 hrs24 – 48 hrs
Paso 3Paso 3
24 – 72 hrs24 – 72 hrs..
Método tradicional
Se requiere un máximo de 15 días
para descartar un negativo
Subcultivo Identificación y
antibiograma
Tecnología Colorimétrica
• Utilización de un sensor
liquido tipo plasma.
• Membrana de silicona
impregnada al plasma de
sensibilidad
• Cambio sensitivo de CO2
diluido
• Generación de color
permanente.
Unidades de reflectancia
2
Uso para hemocultivos, fluídos corporales y micobacterias.
La curva de crecimiento es automáticamente
GRABADA
ANALIZADA
GUARDADA
0 1 2 3 4 5 6 7
6000
5000
4000
3000
2000
1000
0
Days t est ed
Reflect ance Unit s
1 Sust ained accelerat ion
2 Rate
3 I nitial t hreshold
1
3
2
• Algoritmos
– Independientes al tipo
de medio
monitoreado.
– Immediata
notificación de
positivos.
– Algoritmo de alto
valor inicial. (ventaja
en la entrada de
botellas demoradas).
Tecnología Colorimétrica
Bourbeau PP et al. Routine incubation of BacT/ALERT FA and FN
blood culture bottles for more than 3 days may not be necessary. J
Clin Microbiol. 2005;43:2506-2509
Importancia de la automatizacion
Tiempo de recuperación
 74% en Día 1
 20% en Día 2
 4% en Día 3
 2% en Día 4
 1% en Día 5
Estos resultados demuestran que el 98% de los aislamientos
clínicamente significativos fueron recuperados en los 3 primeros días
de incubación y el 94% dentro de los 2 días de incubación.
1.Cockerill FR III, Wilson J.W., Vetter E.A., et al. Optimal testing
parameters for blood cultures. Clin Infect Dis. 2004 ;38 :1724-1730
Importancia de la automatizacion
Tiempo de recuperación
Estos datos sugieren que períodos de incubación extendidos
previamente recomendados para la detección de
microorganismos fastidiosos que a veces causan endocarditis,
incluyendo Brucella, Capnocytophaga y Campylobacter spp., y el
grupo HACEK (Haemophilus, Actinobacillus, Cardiobacterium,
Eikenella y Kingella spp.) no son necesarios
CUANDO SE UTILIZA SISTEMAS DE HEMOCULTIVOS
AUTOMATIZADOS DE MONITORIZACIÓN CONTINUA
99.5% de la infecciones de sistema circulatorio (no
endocarditis) y 100% de los episodios de endocarditis
fueron detectados con 5 días de incubación.
Impacto de la contaminación
Un hemocultivos falso positivo puede conducir a un
tratamiento antibiótico innecesario, mayor tiempo de
hospitalización y mayores costos.
Se ha estimado que cada hemocultivo contaminado
puede llevar a un aumento en:
 estadía del paciente - en 6 días en promedio,
 el tiempo de terapia antibiótica – en 3 días,
 el costo de la administración de antibióticos puede ser
de hasta US$ 4400
Barenfanger et al. Clinical and Financial Benefits of Rapid Bacterial Identification and
Antimicrobial Susceptibility Testing J. Clin. Micr, May 1999 p1415-1418
BACTEC 9050BACTEC 9050
Tecnología de monitoreo contínuo de la
serie BACTEC ® 9000
Sistema no invasivo
Capacidad de 50 viales
Interfase gráfica de fácil uso:
Pantalla de cristal líquido
Teclado sencillo
Lector de código de barras fijo
ajuste de la intensidad de la
alarma
formato de fecha/hora
El material del sensor es
una sustancia sensible a
la concentración de CO2
El sensor genera una
señal fluorescente, la cual
es detectada por el
analizador.
La fluorescencia aumenta
a medida que aumenta la
concentración de CO2
Filtro de
Detección
SENSOR
Filtro de
Excitación
LED
Photodiode
LED
CO2
Fotodiodo
FELIZ NAVIDAD Y PROSPERO
AÑO NUEVO
COSTOS DE UCI-HSR
 HOSPITALIZACION 106.00 / día
 OXIGENO 53.00 / día
 DESCARTABLE 20.00 (sondas , mascaras)
 MEDICAMENTOS 100.00 (Imipenem – asociados)
 Materiales de asepsia 40.00
 total 319.00 gasto por día
 Promedio de estancia 5 días
 Total = 1595.00
 Sin considerar análisis de control y Rx (15.00)si amerita
 Gases arteriales : 25.00 + hemograma 12.00 +
coagulación 25.00 + bioquímica 18.00
(glucosa,urea,creatinina) +hemocultivo 45.00 + otros 17
=142.00
Importancia de la automatización
Conclusiones
 Tratamiento inicial acertadoTratamiento inicial acertado
– Beneficios clínicosBeneficios clínicos
– Menor morbi-mortalidadMenor morbi-mortalidad
– Menor tiempo de internaciónMenor tiempo de internación
– Menor toxicidadMenor toxicidad
– Reducción de costosReducción de costos
– Beneficios epidemiológicosBeneficios epidemiológicos
 Disminuir presión de selección de cepas RDisminuir presión de selección de cepas R
Estudio de resistencia los antibacterianos en
el Centro Medico Naval -2000
 Escherichia coli ( R) 60% Penicilinas ,B lactamicos, ,
Cefalosporinas
 Recomendamos estudiar con detalles la resistencia de
Estafilococo aureus y tomar las medidas necesarias para
evitar su desiminacion : (R) Penicilinas y Céfalosporinas:
70%
 Necesario que el Dep. de Microbiologia realice una vigilancia
permanente de la resistencia a los antimicrobianos y la
aparición de cepas multiresistentes
 Farmacia debe realizar estudios de utilización de antibióticos
 El personal de enfermería alerta ante el problema de
resistencia y establezca medidas para evitar la diseminación
 Comité de Infecciones y la vigilancia Epidemiológica
 Uso racional de antibióticos
 Programa de Evaluación Externa del
Desempeño (PEED)
 Vigilancia de la Resistencia Antimicrobiana
 de bacterias patógenas asociadas a
 Enfermedades Diarreicas Agudas, Infecciones
Respiratorias Agudas e Infecciones
Intrahospitalarias
 INS - CNSP
 LRN Enteropatógenos
 LRN IRAs E IIH
GRACIAS
POR NO DORMIR

Más contenido relacionado

La actualidad más candente

Familia Streptococcaceae
Familia StreptococcaceaeFamilia Streptococcaceae
Familia StreptococcaceaeLuz Mery Mendez
 
10 antígenos de micobacterias
10   antígenos de micobacterias10   antígenos de micobacterias
10 antígenos de micobacteriasSergio Morales
 
Streptococcus y Enterococcus
Streptococcus y EnterococcusStreptococcus y Enterococcus
Streptococcus y EnterococcusIPN
 
Enterococcus Generalidades Virulencia y Resistencia Antibiotica
Enterococcus Generalidades Virulencia y Resistencia AntibioticaEnterococcus Generalidades Virulencia y Resistencia Antibiotica
Enterococcus Generalidades Virulencia y Resistencia AntibioticaCitrin Longin
 
Diapositivas Tema 18. Bacilos Gram Negativos No Fermentadores. Seminario 5
Diapositivas Tema 18.  Bacilos Gram Negativos No Fermentadores. Seminario 5Diapositivas Tema 18.  Bacilos Gram Negativos No Fermentadores. Seminario 5
Diapositivas Tema 18. Bacilos Gram Negativos No Fermentadores. Seminario 5darwin velez
 
Atlas de hematología
Atlas de hematologíaAtlas de hematología
Atlas de hematologíaKenny Correa
 
Atlas bacteriologico.a
Atlas bacteriologico.aAtlas bacteriologico.a
Atlas bacteriologico.aCasiMedi.com
 
Streptococcus agalactiae
Streptococcus agalactiaeStreptococcus agalactiae
Streptococcus agalactiaeJonathan Islas
 
Bacilos gram negativo no fermentadores
Bacilos gram negativo no fermentadoresBacilos gram negativo no fermentadores
Bacilos gram negativo no fermentadoresTPorta
 
Resistencia bacteriana
Resistencia bacterianaResistencia bacteriana
Resistencia bacterianaMaira Castaño
 
DIAGNÓSTICO DE MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS HOMINIS
DIAGNÓSTICO DE MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS HOMINISDIAGNÓSTICO DE MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS HOMINIS
DIAGNÓSTICO DE MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS HOMINISRicardo Carrillo
 
Determinación de grupo sanguíneo abo y rh
Determinación de grupo sanguíneo abo y rhDeterminación de grupo sanguíneo abo y rh
Determinación de grupo sanguíneo abo y rhJosue Rivera
 

La actualidad más candente (20)

Familia Streptococcaceae
Familia StreptococcaceaeFamilia Streptococcaceae
Familia Streptococcaceae
 
Proteus
ProteusProteus
Proteus
 
10 antígenos de micobacterias
10   antígenos de micobacterias10   antígenos de micobacterias
10 antígenos de micobacterias
 
Streptococcus y Enterococcus
Streptococcus y EnterococcusStreptococcus y Enterococcus
Streptococcus y Enterococcus
 
Enterococcus Generalidades Virulencia y Resistencia Antibiotica
Enterococcus Generalidades Virulencia y Resistencia AntibioticaEnterococcus Generalidades Virulencia y Resistencia Antibiotica
Enterococcus Generalidades Virulencia y Resistencia Antibiotica
 
Antibiograma
AntibiogramaAntibiograma
Antibiograma
 
Diapositivas Tema 18. Bacilos Gram Negativos No Fermentadores. Seminario 5
Diapositivas Tema 18.  Bacilos Gram Negativos No Fermentadores. Seminario 5Diapositivas Tema 18.  Bacilos Gram Negativos No Fermentadores. Seminario 5
Diapositivas Tema 18. Bacilos Gram Negativos No Fermentadores. Seminario 5
 
Estreptococos
EstreptococosEstreptococos
Estreptococos
 
Atlas de hematología
Atlas de hematologíaAtlas de hematología
Atlas de hematología
 
Atlas bacteriologico.a
Atlas bacteriologico.aAtlas bacteriologico.a
Atlas bacteriologico.a
 
Streptococcus agalactiae
Streptococcus agalactiaeStreptococcus agalactiae
Streptococcus agalactiae
 
Bacilos gram negativo no fermentadores
Bacilos gram negativo no fermentadoresBacilos gram negativo no fermentadores
Bacilos gram negativo no fermentadores
 
Urocultivo
UrocultivoUrocultivo
Urocultivo
 
Corynebacterium
CorynebacteriumCorynebacterium
Corynebacterium
 
Resistencia bacteriana
Resistencia bacterianaResistencia bacteriana
Resistencia bacteriana
 
DIAGNÓSTICO DE MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS HOMINIS
DIAGNÓSTICO DE MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS HOMINISDIAGNÓSTICO DE MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS HOMINIS
DIAGNÓSTICO DE MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS HOMINIS
 
Determinación de grupo sanguíneo abo y rh
Determinación de grupo sanguíneo abo y rhDeterminación de grupo sanguíneo abo y rh
Determinación de grupo sanguíneo abo y rh
 
Staphylococcus
Staphylococcus Staphylococcus
Staphylococcus
 
Pruebas bioquimicas
Pruebas bioquimicasPruebas bioquimicas
Pruebas bioquimicas
 
Bacilos No fermentadores
Bacilos No fermentadoresBacilos No fermentadores
Bacilos No fermentadores
 

Similar a Automatizacion en microbiologia

Tuberculosis07
Tuberculosis07Tuberculosis07
Tuberculosis07quequita
 
Bacilos grampositivos esporulados exposicion
Bacilos grampositivos esporulados exposicionBacilos grampositivos esporulados exposicion
Bacilos grampositivos esporulados exposicionRRT Ruth Chong
 
ricketssiosis erlichiosis enf_lyme
ricketssiosis erlichiosis enf_lymericketssiosis erlichiosis enf_lyme
ricketssiosis erlichiosis enf_lymeJessy Reyes
 
HISTORIA DE LA INMUNOLOGIA 2022.pdf
HISTORIA DE LA INMUNOLOGIA 2022.pdfHISTORIA DE LA INMUNOLOGIA 2022.pdf
HISTORIA DE LA INMUNOLOGIA 2022.pdfNeisserNovoaLopez1
 
Control de calidad de vacunas de uso en animales de producción
Control de calidad de vacunas de uso en animales de producciónControl de calidad de vacunas de uso en animales de producción
Control de calidad de vacunas de uso en animales de producciónJuan Manuel Urse Fernández
 
Infección respiratorias por Klebsiella pneumoniae
Infección respiratorias por Klebsiella pneumoniaeInfección respiratorias por Klebsiella pneumoniae
Infección respiratorias por Klebsiella pneumoniaeFrancisco Fanjul Losa
 
Antibióticos Dr. Laube
Antibióticos Dr. LaubeAntibióticos Dr. Laube
Antibióticos Dr. LaubeDaniel Borba
 
Tuberculosis pulmonar COLOMBIA
Tuberculosis  pulmonar COLOMBIATuberculosis  pulmonar COLOMBIA
Tuberculosis pulmonar COLOMBIALeonardo Jurado
 
MM. Enterobacterias I - 2023.pptx
MM. Enterobacterias I - 2023.pptxMM. Enterobacterias I - 2023.pptx
MM. Enterobacterias I - 2023.pptxsantirojas2001
 
Fagos como alternativa a los antibióticos. Yachay Tech Seminars
Fagos como alternativa a los antibióticos. Yachay Tech SeminarsFagos como alternativa a los antibióticos. Yachay Tech Seminars
Fagos como alternativa a los antibióticos. Yachay Tech SeminarsEsteban Fernández Moreira
 
Resumen Bacillus anthracis (carbunco o ántrax) - Microbiología
Resumen Bacillus anthracis (carbunco o ántrax) - MicrobiologíaResumen Bacillus anthracis (carbunco o ántrax) - Microbiología
Resumen Bacillus anthracis (carbunco o ántrax) - MicrobiologíaGustavo Delgado Lopez
 
Bacter magaly
Bacter magalyBacter magaly
Bacter magalyEmearon
 
Bacilos gram no ferm.
Bacilos gram  no ferm.Bacilos gram  no ferm.
Bacilos gram no ferm.CFUK 22
 

Similar a Automatizacion en microbiologia (20)

Tuberculosis07
Tuberculosis07Tuberculosis07
Tuberculosis07
 
14. seminario de tbc i
14.  seminario de tbc i14.  seminario de tbc i
14. seminario de tbc i
 
Tuberculosis07
Tuberculosis07Tuberculosis07
Tuberculosis07
 
Bacilos grampositivos esporulados exposicion
Bacilos grampositivos esporulados exposicionBacilos grampositivos esporulados exposicion
Bacilos grampositivos esporulados exposicion
 
Tb
TbTb
Tb
 
ricketssiosis erlichiosis enf_lyme
ricketssiosis erlichiosis enf_lymericketssiosis erlichiosis enf_lyme
ricketssiosis erlichiosis enf_lyme
 
Tuberculosis curso III.ppt
Tuberculosis  curso III.pptTuberculosis  curso III.ppt
Tuberculosis curso III.ppt
 
Micro expo
Micro expoMicro expo
Micro expo
 
Staphylococcus
StaphylococcusStaphylococcus
Staphylococcus
 
Staphylococcus
StaphylococcusStaphylococcus
Staphylococcus
 
HISTORIA DE LA INMUNOLOGIA 2022.pdf
HISTORIA DE LA INMUNOLOGIA 2022.pdfHISTORIA DE LA INMUNOLOGIA 2022.pdf
HISTORIA DE LA INMUNOLOGIA 2022.pdf
 
Control de calidad de vacunas de uso en animales de producción
Control de calidad de vacunas de uso en animales de producciónControl de calidad de vacunas de uso en animales de producción
Control de calidad de vacunas de uso en animales de producción
 
Infección respiratorias por Klebsiella pneumoniae
Infección respiratorias por Klebsiella pneumoniaeInfección respiratorias por Klebsiella pneumoniae
Infección respiratorias por Klebsiella pneumoniae
 
Antibióticos Dr. Laube
Antibióticos Dr. LaubeAntibióticos Dr. Laube
Antibióticos Dr. Laube
 
Tuberculosis pulmonar COLOMBIA
Tuberculosis  pulmonar COLOMBIATuberculosis  pulmonar COLOMBIA
Tuberculosis pulmonar COLOMBIA
 
MM. Enterobacterias I - 2023.pptx
MM. Enterobacterias I - 2023.pptxMM. Enterobacterias I - 2023.pptx
MM. Enterobacterias I - 2023.pptx
 
Fagos como alternativa a los antibióticos. Yachay Tech Seminars
Fagos como alternativa a los antibióticos. Yachay Tech SeminarsFagos como alternativa a los antibióticos. Yachay Tech Seminars
Fagos como alternativa a los antibióticos. Yachay Tech Seminars
 
Resumen Bacillus anthracis (carbunco o ántrax) - Microbiología
Resumen Bacillus anthracis (carbunco o ántrax) - MicrobiologíaResumen Bacillus anthracis (carbunco o ántrax) - Microbiología
Resumen Bacillus anthracis (carbunco o ántrax) - Microbiología
 
Bacter magaly
Bacter magalyBacter magaly
Bacter magaly
 
Bacilos gram no ferm.
Bacilos gram  no ferm.Bacilos gram  no ferm.
Bacilos gram no ferm.
 

Automatizacion en microbiologia

  • 2. Marco Terencio V 116-27 a.C. Insectos Vectores de enfermedades Avicena 981-1037 Describe síntomas y tratamiento de gusanos Hipócrates 460 -377 a.C. Enfermedad no es mágica Enfermedad alt. Fluido Vital y miasma Girolano Fracastoro 1478-1553 Transmisibilidad de las enfermedades Poema sobre la sífilis HISTORIA : MICROBIOLOGIA ZACARIAS JANSSEN 1590-1608 Construyo Sistema de Lentes compuestos GALILEO GALILEI 1564-1609 Construyo primer Microscopio simple ANTONY VAN LEEUWENHOEK 1632 – 1723 1676,observa y Dibuja bacterias de la saliva Carta 39, 17 Sept. 1683
  • 3. EDWARD JENNER 1749 – 1823 Padre de la Imunología 1798: Preparó la vacuna contra la viruela humana. Realizó inoculaciones a humanos utilizando pústulas de viruela vacuna y comprobó que esta práctica protegía frente a la viruela humana. 26 de Octubre 1979 la O.M.S. da por erradicada esta enfermedad del mundo LOUIS PASTEUR 1822 – 1895 Padre de la Bacteriología 1856: Fermentación por levaduras 1857: Fermentación láctica 1861: Culmino con la teoría de Generación espontánea 1866: Pasteurización 1880: Identificó agente del Cólera en la gallina. 1881: Inmuniza ovejas contra el Carbunco 1885: Vacuna contra la Rabia ROBERTO KOCH 1843 – 1910 Nóbel Fis. y Med. (1905) Las enf. infecciosas son provocadas por microorganismos y elaboro técnicas para identificar y aislar bacterias 1876: Demuestra la etiología del Carbunco o Ántrax, Bacillus anthracis 1882: “Myco. Tuberculosis” 1881: Estudio esporas y diferencias de los bacilos 1881: técnicas de laboratorio: medios de cultivo sólidos 1883: descubre el Vibrión colérico en Egipto
  • 4. JOSEPH LISTER (1827 – 1912) 1867: Las bases de la desinfección y antisepsia en cirugía, utilizando fenol y bicloruro de mercurio en en el lavado del instrumental quirúrgico, manos y heridas de pacientes Frederich Loeffler (1852-1915)-Klebs:descubre bacilo diftérico Karl Joseph Ebert (1835-1926): el agente causal de la fiebre tifoidea Armauer Hansen (1841-1912), Lepra Albert Neisser (1855-1916), aísla el Gonococo Arthur Nicolaier ,descubre el bacilo tetanico Kitasato y Yersin ,descubren el bacilo de la peste
  • 5. Descubrimiento de la Penicilina (1929)  Fleming, Sir Alexander.Fleming, Sir Alexander. Observó que un moho que contaminaba una de sus placas de cultivo, había destruido la bacteria cultivada en ella, llamado Penicillium notatun. Descubrimiento de la Estreptomicina (1944) Schatz y Waksman: Descubren la estreptomicina. Producida por hongo Streptomyces griseus
  • 6. HANS C. J. GRAM (1853 – 1938) 1884, Coloración GRAM TyndallTyndall (1820-1893) ,1877 Evidencia la presencia de(1820-1893) ,1877 Evidencia la presencia de formas microbianas resistentes al calor (esporasformas microbianas resistentes al calor (esporas bacterianas).bacterianas). Schaudinn y Hoffmann 1906 ; Descubren que Treponema pallidum , causa la Sífilis Paul Ehrlich ( 1854-1919 ) ,1910 desarrolla quimioterapéutico (Salvarsán) frente a la Sífilis
  • 7. ROBERTO GALLO ( U.S.A. ) JEAN LUC MONTANIER ( FRANCIA ) 1984: Descubren el VIH 1915-1917 , Descubren los virus bacterianos “Bacteriófagos” D’Herrelle y Twort Schönlein (1839) :Schönlein (1839) : Describe asociación de HONGOSDescribe asociación de HONGOS concon la Tiña (infección en piel)la Tiña (infección en piel)
  • 8. 1910: Comienza la era de la Biología Molecular 1979: Se sintetiza la insulina por técnicas de ADN. 1982: Se desarrolla la vacuna contra la Hepatitis B. Watson y Crick :1953 , Proponen la estructura de la doble hélice para el ADN. 1933 el primer Microscopio Electrónico de Transmisión. 1980 el primer Microscopio Electrónico de Barrido
  • 9. El dinámico desarrollo de la microbiología en el siglo XX-XXI Descubrimientode Agentesinfecciosos Eradela Antibioticoterapia Prevención vacunas Epidemias B-lactamicos Aminoglucosidos Macrolidos Quinolonas Genética Microbiología Bioquímica Revolucióndel Laboratorio Biología Básica Ac. nucleicos Código genético Mecanismo de síntesis proteica Automatización Microbiología En Procedimientos Uso ordenadores de gestión Microbiología En diagnostico Hibridomas Ac. monoclonales específicos PCR
  • 10.
  • 11. ¿PORQUE LLEGAR A LA AUTOMATIZACION?
  • 12.
  • 13. Primer Método utilizado (1966), Estandarizado 0.5 Escala Mc Farland (Turbidez-inoculo)
  • 14. Criterios de Interpretación (R, I, y S) Los escatogramas o scatterplots Para la interpretación de CIM y disco difusión . •Los aislamientos son analizados con los métodos estándar de difusión por disco y CIM del NCCLS. La CIM y su correspondiente diámetro de zona son delineados para cada aislamiento.
  • 15. Panel de microdilucion en Caldo - CIM La prueba de microdilucion en caldo - CIM se realiza en placas de poliestireno (0.1 ml) . Una placa contiene de 7 a 8 diluciones de 12 diferentes antibióticos Una celdilla es control (+) (caldo+inoculo) Control (-) (solo caldo) Placas para Gram negativos y Gram (+) Caldo Muller Hinton recomendable Hay paneles específicos Caldo contiene Cationes Ca ++ y Mg ++ Cada lote examinado PH después de preparado (7.2 a 7.4) y Tº 25ºc Para neumococo suplementar 2-5% sangre caballo lisado Colocar standares de control de calidad
  • 16. Grupo N acilo Anillo Tiazolidinico Posición aminoacídica 39 42 104 164 237 238 240 265 TEM-1 Ala Glu Arg Ala Gly Glu Thr TEM-2 TEM-3 Lys Ser TEM-4 Lys Ser Met TEM-5 Ser Thr Lys TEM-6 Lys His TEM-7 Lys Ser TEM-8 Lys Lys Ser Ser TEM-9 Lys Ser Met TEM-10 Ser Lys TEM-11 Lys His TEM-12 Ser TEM-13 Lys Met TEM-14 Lys Lys Ser Met TEM-15 Lys Ser Posición aminoacídica 69 165 244 275 276 TEM-1 Met Trp Arg Arg Asn TEM-31 (IRT-1) Cys TEM-30 (IRT-2) Ser TEM-32 (IRT-3) Ile TEM-35 (IRT-4) Leu Asp TEM-33 (IRT-5) Leu TEM-34 (IRT-6) Val TEM-36 (IRT-7) Val Asp TEM-37 (IRT-8) Ile Asp TEM-38 (IRT-9) Val Leu TEM-39 (IRT-10) Leu Arg Asp TEM-40 (IRT-I67) Ile TEM-41 Thr TEM-45 (IRT-14) Leu Gln Posición aminoacídica 35 179 205 238 240 SHV-1 Leu Asp Arg Gly Glu SHV-2 Ser SHV-2a Gly Ser SHV-3 Leu Ser SHV-4 Leu Ser Lys SHV-5 Ser Lys SHV-7 Ser Lys SHV-8 Asn SHV-11 Gln SHV-12 Gln Ser
  • 17. BLEE B- Lactamasa relacionada País de origen En especies detectadas TEM TEM1 Y TEM2 FRANCIA Enterobacterias SHV SHV 1 / LEN ALEMANIA P. Aeruginosa / BGNNF CTX-M cefotaxaminasas KLUA Kluyvera Alemania/Argentin E. coli, Salmonella OXA OXA 10 Turquía/Francia P- aeruginosa PER FRANCIA P.- aeruginosa VEB PER Vietnam/Tailandia E. Coli TLA CME-1 MEXICO E. Coli GES/IBC Guayana/ Sudafr. K. Pneumoniae y Pseudomona BES Y. Enterocolitica Brasil S. marcescens SFO AmpA S. fonticola Japon E. cloacae
  • 18. 1 Antibiótico en sangre 2 Bacterias sensibles a los antibióticos 3 Bacteria no sensible a los antibióticos 4 Bacterias muertas por antibióticos 6 Bacteria con resistencia creciente a antibióticos 7 Bacterias muertas por antibióticos 8 Población bacteriana con resistencia creciente al antibiótico
  • 19. GENES DE RESISTENCIA BACTERIANA: 1 Plásmido 2 Antibiótico expulsado 3 Genes de resistencia antibiótica 4 Enzima que degrada al antibiotico 5 Antibiótico que ingresa 6 Antibiótico que ingresa 7 Enzima que altera el antibiótico 8 Antibiótico que ingresa 9 Cromosoma
  • 20.
  • 21. MRSA O SARM O SUPERBUG STAFILOCOCO AUREUS RESISTENTE A LA METICILINA •E.U. 300,000 contraen infecciones en hospitalizacion /año •CDC ,número de muertes 12,000 por año •UCI ,aislamiento llega a 50% (R) a Meticilina, Penicilina, Tetraciclina y Eritromicina •Factores de riesgo: prolongada hospitalización, uso múltiple de antibióticos previos,etc. •En la comunidad niños ,ancianos y portadores enf. crónicas •Endémico en Hospitales ,Neumonía ,Infecc. qx, bacteriemias. En el Perú : UCI ,Unidad de Quemados, Oncologia y Cirugía, Resistencia del 58% (500 cepas aisladas-1995) En la actualidad brotes epidémico relacionado a la colonización Del personal de salud (MINSA)
  • 22. VISA – Resistencia Intermedia a la Vancomicina (GISA) Susceptibilidad intermedia a la Vancomicina, CIM 8-16 ug /ml y completamente Resistentes a CIM >= 32 ug /ml VISA debido al engrosamiento de la pared celular que contiene precursores capaces de ligar Vancomicina extracelularmente. La mayoría contiene mecA ,las MIC de 4 ug /ml reportadas se consideraran VISA potenciales y se recomienda repetir pruebas Descrito 1996 en Japón En EU. en pacientes con MRSA, que reciben Vancomicina por tiempo prolongado, en diálisis. VRSA : STAPHYLOCOCCUS AUREUS RESISTENTE A VANCOMICINA , 2002 EN EE.UU.
  • 23. HOSPITAL BASE VALDIVIA 2007 RESISTENCIA DEL ESTAFILOCOCO AUREUS
  • 24. RESISTENCIA INDUCIBLE A CLINDAMICINA  bacterias poseen gen de B- Lactamasa y se exponen un agente B-Lactàmico. Esta acción antimicrobiana en la pared celular activa mecanismo genético en cascada que inicia la producción de B-Lactamasa. la producción cesa en ausencia de antimicrobianos en la pared
  • 25.
  • 26.
  • 28. Panorama actual  La aparición cada vez más frecuente y diversa de los mecanismos de resistencia microbiana, sobre todo en bacterias patógenas facultativas y oportunistas, ha traído consecuencias importantes en términos de morbilidad y mortalidad y millonarias pérdidas humanas y económicas  Resistencia incrementada en caso de staphilococcus, streptococcus y enterococcus y bacilos Gram negativos (enterobacterias y no fermentadores)  Dificultad para predecir los patrones de resistencia en pacientes críticos  El uso de la Terapia de amplio espectro de alto costo y numerosos efectos secundarios o adversos que se presentan
  • 29. Panorama actual  La necesidad de entrega de resultados oportunos ,evita que la terapia inicial se prolonga innecesariamente  Mortalidad : Resultado > 72 hrs. da como consecuencia el aumento de mortalidad en pacientes críticos y sobrevida disminuye 30% por cada día de retardo a entrega de resultados
  • 30.
  • 31. VIGILANCIA DE LA RESISTENCIA A LOS ANTIMICROBIANOS Perú 2007 -INS HOSPITAL Aislados E. Pediátricas ( R ) Aislados H. Unanue (R) ANTIBIOT. Cefazolina Clindamicina 28 53.6 % 46 87 Eritromicina 29 69 46 91.3 Gentamicina 27 59.3 38 81.6 Oxacilina 29 58.6 43 90.7 Vancomicina 29 0 36 0 STAPHYLOCOCCUS AUREUS
  • 32. VIGILANCIA DE LA RESISTENCIA A LOS ANTIMICROBIANOS Perú 2007 -INS Escherichia coli-Resistencia Hospital aislado H. Unanue aislado I.M.P aislado E. Pediátricas Antibiot Amicacina 84 2.4 % 106 8.5 % 82 4.9 % Amox.Cl 227 63.9 83 18.1 79 55.7 Cefotaxima 69 31.9 66 27.3 78 32.1 Ceftriaxona 180 30.5 115 34.8 82 32.9 Cefuroxima 71 23.9 Ciprofloxac 74 65.4 116 30.4 45 33.3 ESBL 53 98.1 31 71 82 32.9 Nitrofurant 190 7.9 102 8.4 69 1.4 Trimet- Sulf 220 65.9 95 80 80 TEM-1 de E. coli 1.8 A de resolución
  • 33. ANTIMICROBIANOS Perú 2007 – INS Pseudomonas aeruginosa Hospital aislado 2 de Mayo aislado H. Unanue Antibiótico Amicacina 72 37.5% 73 47.9% Aztreonam 75 33.3 71 80.3% Ciprofloxacina 73 46.6% 80 65 Gentamicina 76 46.1 72 65.3% Imipenem 64 43.8 Meropenem 52 50%
  • 34. ANTIMICROBIANOS Perú 2007 – INS Klebsiella pneumoniae Hospital aislado IMP aislado H. Unanue aislado S. Bernales Antibiótico Amicacina 56 60.7% 42 11.9 31 19.4 Amp. Clav 48 22.9 75 77.3 31(A-S) 41.9 (A-S) Aztreonam 36 80.6 B-lactamasa 42 95.2 Cefalotina 75 76 Cefazolina 31 93.5 31 58.1 Cefotaxima 36 77.8 31 45.2 Ceftriaxona 63 81.1 31 45.2 Cefuroxima 31 51.6 Ciprofloxacin 52 21.2 66 45.5 31 25.8
  • 35.
  • 36.
  • 37.
  • 38.
  • 39.
  • 40.
  • 41.
  • 42.
  • 43. Factores de riesgo de adquirir infecciones por cepas productoras de BLEE Desnutrición Bajo peso al nacer Gravedad de la infección Duración de la estadía en el hospital y en UCI Procedimientos invasivos Receptores oncológicos
  • 44. Reservorios y vectores Termómetros Cánulas de oxígeno Mascaras y tubos de ventiladores mecánicos Jabón líquido Insectos Gel para ecografías Trabajadores de la salud
  • 45.
  • 46. Papel de la Automatización  Los sistemas automatizados acortan los tiempos porque mejoran la sensibilidad analítica de los métodos  Capaces de detectar el desarrollo bacteriano en una suspensión con y sin antimicrobianos antes que el laboratorista detecte turbidez (fundamento de los sistemas automatizados)  Metodología: colorimetría – turbidimetria -fluorometria etc.
  • 47. ventajas Especificación Impacto clínico Rapidez en el resultado de 3 a 10 horas. Inicio o cambio precoz del antimicrobiano costos hospitalización y análisis de laboratorio ,de usos de antibióticos Estandarización y control de calidad de la reproductibilidad intra e ínter laboratorio Disminución de la carga de trabajo Requieren manos personal en métodos del MIC CONDICIONES SOBRE SU UTILIZACION
  • 48. ventajas Especificación Disminución de errores post analíticos Evita la transcripción errónea de resultados por el uso de programas Utilización de sistemas de expertos Permite actualizar anualmente las guias de NCCLS que permite el informe selectivo de los antimicrobianos. Monitorizar resultados inconsistentes
  • 49. ventajas Especificación Patrones fenotipitos de resistencia Permite sospechar la presencia de B lactamasas de espectro extendido y cefalosporinas Facilita las estadísticas Almacenar y procesar información para una análisis de tendencias anuales de susceptibilidad Facilita el control en el uso de antimicrobianos Informe de resultados en línea con el comité farmacológico
  • 50. desventajas Especificaciones Alto costo (3 veces mayor Que los manuales) El equipamiento y los insumos (paneles o tarjetas) - “tarifas diferenciadas o “uso para hospitalización y críticos” Requieren método de respaldo Frente a cualquier falla se necesita un back up o metodología manual de respaldo No existen normas NCCLS para sistemas automatizados, no aplicables a todas las bacterias Sin embargo se deben considerar los métodos empleados (puntos de corte o MIC)
  • 51. desventajas Especificaciones Poca flexibilidad en los antimicrobianos ensayados Paneles o tarjetas están determinadas por el fabricante. Existen tarjetas especiales pero requiere consumo mínimo
  • 52. desventajas Especificaciones Discrepancia con métodos convencionales de referencia Problemas: Haemophilus Influenza Neumococos, Gram (-) no fermentadores, y Anaerobios . Cefepime y Pseudomonas Vancomicina (I) en el caso de Enterococcus Imipenem ,falsa (R) o (S) con Pseudomona y Acinetobacter baumanii .
  • 53. desventajas Especificaciones Discrepancia con métodos convencionales de referencia Problemas: B lactamasa en algunos Gram negativos requieren prolongada incubación para expresar ( R ) FDA recomienda para errores mayores (sistema informe R siendo (S) ,la tasa no > 1.5% ,la concordancia sea 90% , fallas de crecimiento =< 10%
  • 54. SISTEMAS AUTOMATIZADOS  Diferentes grados de automatización  Métodos Calorimétricos, Turbidimetricos , Fluorescencia  Lectura a tiempos determinados  Lectores muy sensibles al crecimiento aumentan la velocidad de entrega de los resultados
  • 55. Componentes Tecnológicos  Panel o tarjeta de Trabajo  Software Microbiológico Control de Calidad Cepas ATCC Motor de Base de Datos Estadístico y Epidemiológico Normas de la CLSI (antes NCCLS) Comunicación (Interfaz)
  • 57. Panel o Tarjeta de Trabajo Biomeriux Vitek Siemens MicroScan Becton Dickinson BDPhoenix
  • 58. Caracteristicas de Paneles MICRO Scan Identificación solamente Sensibilidad solamente (BP o MIC) Combo (ID+ATB)
  • 59. Tecnología del Panel  Paneles Convencionales – Colorimetrica y Turbidez – Gram Negativo / Gram Positivo  Paneles Cromogénicos – Colorimetrica Enzimatica  Identificación en 4 hrs – ID de Levaduras – HNID (Haemophilus, Neisseria, Moraxella y Gardnerella) – ID de Anaerobios  Paneles Rápidos Fluorescentes - Fluorescencia – Gram Negativo – Gram Positivo  Synergies Plus Panels – Fluorescencia y Turbidez – Gram Negativo – Gram Positivo  Paneles Especializados – Turbidez – MicroStrep Plus – ESBL confirmatorio
  • 61.  MIC (Concentración Mínima Inhibitoria)  Concentración del antibiótico in vitro por método cuantitativo.  4 – 5 diluciones por antibiótico  17 – 27 ATB /panel  BP (Breakpoint)  Susceptibilidad in vitro cualitativa (S, I, ó R)  Concentración de antibiótico equivalente a las reglas CLSI - breakpoints  1-2 diluciones por droga - 29-33 ATB por panel ANTIBIOGRAMA
  • 62. PANEL ESβL plus  Confirmar la producción de Beta Lactamasas de Espectro Extendido en E. coli, Klebsiella oxytoca y Klebsiella pneumoniae.  La inoculación con la técnica de turbidimetría o de prompt. Incubar 20-24 hrs. A 35 ± 1°C sin CO2 en incubadora externa.  Determinación cualitativa con lectura manual de crecimiento en pocillos como turbidez o nebulosidad en todo el pocillo.  Interpretación del resultado (disminución 3 diluciones en Caz y Caz/CA ó Cft y Cft/CA): ESBL positivo ESBL negativo Se ingresa al software manualmente el resultado en el apartado de ESBL para confirmar el resultado si es positivo o negativo. ESBL panel (B1027-101)
  • 63. PANEL MICro STREP plus  Determinar la sensibilidad de antimicrobianos para estreptococos aerobios no enterococos (incluidos St. pneumoniae).  Inoculación del panel (turbidimetría con tubo 0.5 de Mc Farland). TSA con 5% de sangre de carnero 25 ml de LHB (B1015-25) 0.5 McFarland = 0.08 ± 0.02 turbidímetro Incubar 20-24 hrs. a 35 ± 1 °C en una incubadora externa. Se ingresa al software manualmente el resultado donde el crecimiento se presenta como turbidez. Cualquier cambio de color en el medio no se considera crecimiento. Salina (B1015-12) 4-5 colonias 100 mcl Inoculador 2 veces MICro STREP panel (B1027-201)
  • 64. PANELES Synergies Plus  Organismos Gram Negativos Gram Positivos  Tipos de Panel Combo, MIC sólamente, ID  Medio de cultivo Agar Sangre para Gram Negativos  Identificación 138 Gram negativos  Antibióticos 31 para Gram negativos  Tiempo de Lectura 2.5 hrs ID con base en la fluorescencia  MIC 4.5-16 hrs, Read-When-Ready  80% MIC en 6.5 hrs  Método de Lectura Sistema WalkAway®  Almacenamiento Temperatura Ambiente  Vida de Anaquel Un año  Reactivos Ninguno
  • 65. ANTIBIÓTICOS EN PANELES SYNERGIES PLUS  Antibióticos que se liberarán en cuanto estén listos  Amikacina  Ampicillina  Ampicillina/Sulbactam*  Ceftazidima  Ceftriaxona  Cefuroxima  Ciprofloxacina  Gatifloxacina  Gentamicina  Imipenem  Levofloxacina  Meropenem  Moxifloxacina  Nitrofurantoina*  Norfloxacina  Piperacillina/Tazobactam*  Piperacillina*  Tobramicina  Trimetoprim/Sulfametoxazol Antibióticos de incubación convencional Amoxicillina/Clavulanato Aztreonam Cefazolina Cefepime Cefotaxime Cefotetan Cefoxitin Cefalotina Cloramfenicol Tetraciclina Ticarcillina Ticarcillina/Clavulanato * Antibióticos de incubación convencional en algunos paneles.
  • 66. INOCULACIÓN DE PANELES 1-Desembolsar el Panel 2- Imprimir y pegar el código de barras al panel 3- Tomar la colonia 4- Un prompt para ID y sensibilidad. 5- Vaciar suspensión bacteriana al inoculador 6- Preparar una placa de pureza 7- Usar el Renok para inocular panel 8- Cargar el panel en el WA
  • 67. Colorimetría, mide color de soluciones. Fluorometría, mide fluorescencia y luz dispersa y reemitida en varias direcciones. Turbidimetría, mide luz no dispersa a través de una solución turbia. Dual combinacion de dos tecnologias a la vez Lectura Visual sin equipo Equipo AS-4 Equipo WA 40/96 SI Siemens MicroScan
  • 68.
  • 69.
  • 70. Centro de Comando LabPro Muestra lista de códigos de barra de nuevas ordenes del LIS
  • 72. Interpretaciones CLSI Resultados suprimidos del reporte Texto de Alerta ordenado por prioridadInformaciones necesárias para tomar decisiones aparecen en la misma pantalla
  • 73. Click + para exibir texto de instrucciones de alertas
  • 74. Código de colores para resultados “Fuera de Control” Sumário y Edición de Resultados QC Entrada & información acción correctiva & manutención de archivos w/QC; apoya guias del CAP
  • 75. LabPro: Epidemiologia Excluir drogas no-formulário Reporte ordenado por organismo Critério de aislados duplicados definidos por el usuário Reportes de Incidencia Bacteriana
  • 76.  Sistema – Elaborado por el usuario – Automatizado programado día y hora  Interfaz – Unidireccional y/o bidireccional – Labpro – Labpro – Labpro – Sistema del Hospital – Labpro - Whonet Control de Calidad MicroScan Nacional : MINSA – INS Internacional m: NCCLS - USA
  • 77. Streptococcus pneumoniae Resistente a Penicilina: Evaluación Cuantitativo ≥2,0 µg/ml RR <0,12 µg/ml SS II 0,12 - 1,0 µg/ml  Hansman & Bullen, 1967, en Australia.  Appelbaum et al., 1977; Jacobs et al., 1978; Koornhof et al., 1978, en África del Sur. CIM≥2,0 mg/ml de penicilina  Resistencia se incrementa a nivel mundial, España, Africa del Sur, Sudeste Asiático y Estados Unidos
  • 78. VRE – Enterococo Resistente a Vancomicina  Resistencia intrínseca  Resistencia a las Cefalosporinas  “National Nosocomial Infections Surveillance System” (1999) – 2º en bactiremias – 2º en infecciones urinarias
  • 79. EQUIPOS DE APOYO El Eddy Jet para realizar las siembras en espiral. El uso de una micro-jeringa desechable de gran precisión, evita la contaminación cruzada. Instrumento óptico que utilizado con un ordenador WXp o Vista se convierte en un potente contador de colonias. Con un software opcional se puede utilizar para un número ilimitado de nuevas aplicaciones.
  • 80. EQUIPOS DE APOYO El Spin Air es el instrumento para el muestreo microbiológico del aire. El diseño especial de los orificios combinado con la lenta rotación de la cápsula permite el uso del 100% de la superficie comparado con el 5% de la misma que emplean los aparatos fijos. Para realizar diluciones volumétricas 1 a 10ml para muestras microbiológicas. También pueden realizar diluciones gravimétricas utilizando una balanza externa. reducen la mano de obra, ahorran tiempo y aseguran esterilidad y precisión.
  • 81. Coloración GRAM Poly Stainer : automático para la tinción de Gram. totalmente programable Almacena diez programas diferentes, para definir el baño, el tiempo de inmersión y la agitación.
  • 82.
  • 83.
  • 84. Phoenix  Sistema automatizado de identificación y sensibilidad  Comunicación con el equipo por iconos.  Capacidad de incubación de 100 paneles  Sistema de fácil inoculación  Control y calibración interna, no requiere mantenimiento.  Lectura : convencional, fluoro génico y cromogénico.  Medidas cinéticas de las reacciones: cada 20 min.  Funcionamiento autónomo, incluyendo el sistema experto BDXper.  Conexión al sistema Epicenter  Conexión al Sistema de Gestión de Laboratorio
  • 86. Phoenix: Insumos  Panel y sellador: bandeja de poliestireno, moldeada sellada y autoinoculante. 136 pozos: 51 ID y 85 en AST.  Caldo Phoenix ID y AST  Indicador Azul de Alamar  Estación de Inoculación  Recipiente para paneles  Nefelómetro Crystal Spec o BD Phoenix Spec.  Pipeta 25 ul con micropuntas.
  • 87. Phoenix: Insumos  Identificación: 45 substratos: convencionales, fluorogénicos y cromogénicos, Carbohidratos, fuentes de carbón o Esculina.  Sin adición de reactivos  5 bases de datos  Resultados a 2,3,4, 6 y 12 hrs.  Información de valores de confianza y reacciones de los substratos.  B-Lact en la parte ID para los paneles G+
  • 88. Phoenix: Insumos  Paneles para ID/AST Combo o solo AST para 1x25: • Gram negativos: NMIC/ID • Gram positivos PMIC/ID • Streptococcus SMIC/ID • Panel de formato único: NID,PID,PMIC,NMIC,SMIC.  Temp. almacenamiento de reactivos: ambiente.  Bioseguridad: Cierre hermético  Resultados rápidos: 80% de los resultados de AST completo en < de 10h.
  • 89. Phoenix: Insumos Sensibilidad:  Caldo AST/AST-S 8 ml, Azul de Alamar.  20 a 22 antibióticos por panel.  > de 3 diluciones por Antibiótico  Doble diluciones  ESBL incluido en cada panel G- con 2 métodos de detección  NMIC/ID, NMIC, PMIC/ID, PMIC, SMIC/ID, SMIC.
  • 90. Phoenix: Medios de Obtenci n de Inoculoó
  • 91. Phoenix: Inoculaci nó  Colonias puras, 18- 24 hr de incubación.  Hacer escala de McFarland 0.5 o 0.25.  Añadir una gota del indicador azul de Alamar.
  • 92. Phoenix: Inoculaci nó  Transferir 25 ul o 50 ul de inoculo ID al caldo AST.  Servir ambas soluciones en el panel según corresponde ID o AST.  Cierre el panel: hermético.
  • 93. Phoenix: Incubaci nó 1. Escanear el código de barras. 2. Teclear o escanear el numero de muestra. 3. Introducir el panel en el Phoenix.
  • 94. Phoenix: Control de Calidad  Lectura de lotes automática  Cepas ATCC variadas
  • 95. Phoenix: M todo de Identificaci né ó  Substratos: convencionales. Cromogenicos, fluoro génicos, Esculina H.C.  Base de datos después de 2,3,4,6, y 12 hrs. de incubación.
  • 96. Phoenix: M todo de an lisisé á  Sensibilidad: Diluciones seriadas con MIC real doble dilución: mínimo 3 dil por antibiótico.  Lectura basada en: – Indicador de actividad metabólica: redox – Cambios de turbidez  Medición cinética cada 20 min. 6 – 16 hr.  .
  • 97. Phoenix: Marcador de Resistencia  Marcadores de Resistencia: tests específicos (ESBL) o Características fenotípicas  No se requiere de Test de confirmación adicional  BDXpert utiliza estos marcadores para tomar acción apropiada o hacer recomendaciones.  Los marcadores son: – ß-Lactamasa de Staphylococcus (Nitrocefinasa) – MRSA (basado en Interpretacion de Oxacilina y Cefoxitin.) – VRE (basado en MIC Vancomicina). – Sinergia con aminoglicosidos en Enterococcus (Gentamicin500mcg/ml y Streptomycin1000mcg/ml) – ESBL
  • 98.
  • 101. EpiCenter: Estad stica y Epidemiolog aí í
  • 104. DESARROLLADO PARA LA INVESTIGACIÓN ESPACIAL TARJEDAS PEQUEÑAS-SE INCOCULA CON UN SISTEMA DE VACÍO- ENTRE 4 Y 10 HORAS (JORNADA LABORAL) LECTURA CADA 60 MINUTOS
  • 105. Tecnología – Tarjeta Trazabilidad Unión electrónica Por código de Barras Seguridad Unidades Selladas Rendimiento 64 pocillos Simplicidad Inóculo único
  • 106. 1 Preparación de la Muestra 2 Entrada código barras 3 Carga del sistema
  • 107. 123 especies 159 especies 52 especies Aumento de la productividad Completo menú ID 98% de la rutina ID realizable en una plataforma
  • 108. Menú de antibióticos FLEXIBLE ~ 20 antibióticos por tarjeta + Rango MIC EXPANDIDO + Antibióticos deducidos
  • 109. Manejo de ICONOS - Árbol de navegación
  • 110. 1 Entrada cassette 2 tarjetas 3 Muestra Resultados para el médico
  • 111. los resultados e Identificaciones precisas API referenciaAPI referencia
  • 112. Equipado Sistema de Expertos™ Reporte correcto de Interpretación Alerta de mecanismos de resistencia
  • 113. Tiempo respuesta - 80% aislamientos 95% de la rutina bacteriana en 6 horas Soporte a las decisiones terapéuticas Resultados rápidos - ID E. coli 5 K. pneumoniae 5 P. aeruginosa 6 P. mirabilis 4 E. faecalis 4 S. aureus 5 S. pneumoniae 5 S. epidermidis 6
  • 114. Método tradicional 6 hrs Enterobacteriaceae 18-24hrs Todos los Microorganismos 9 hrs No-fermentadores < 5 hrs Staph Oxa R 3 Resultados en el dia - Sensibilidad Detección rápida de la resistencia Bacteriana  Rápido ajuste y rotación del tratamiento  Rápido aislamiento del paciente
  • 115. La automatización en el aislamiento primario :Hemocultivos Desinfección adecuada de la zona , tiempo de espera de acción desinfectante,punción tradicional desinfección final del septum de la botella. Espera 2 min. Desinfectar septum
  • 116. BACTERIEMIA Y FUNGEMIA “Presencia de Bacterias y/o levaduras y/o hongos en sangre indicando la falla del sistema inmune del huésped para localizar la infección en su foco primario o la falla del médico remover, drenar y/o esterilizar aquel foco.” “... La tasa de mortalidad está entre 20% al 50% ”
  • 117. HEMOCULTIVOS Síntomas de sospecha de bacteremia :  Fiebre de origen desconocido (> 38°C) o hipotermia (<36°C)  shock, escalofríos  Infecciones severas (meningitis, endocarditis, neumonia, pielonefritis, Absceso abdominal…).  Frecuencia cardíaca acelerada  Alta o baja presión sanguínea  Aumento de la frecuencia respiratoria
  • 118. Hemocultivos: importancia del volumen WEINSTEIN,M.REV INF DIS,1983 Nº DE EPISODIOS= 282 3 MUESTRAS DE 15 ml CADA UNA  1º= 91% POSITIV  2º= >99% POSITIV WASHINGTON, J.MAYO CLIN PROC. 1975 Nº DE EPISODIOS= 80 3 MUESTRAS DE 20 ml CADA UNA  1º= 80% POSITIV.  2º= 88% POSITIV  3º= 99% POSITIV
  • 119. Criterios de interpretación MICROORGANISMOS QUE SIEMPRE REPRESENTAN BACTERIEMA S.pneumoniae, H.influenzae, N.meningitidis, S.agalactiae, Brucella spp, M.tuberculosis, Bacteroides spp, Fusobacterium spp, H.capsulatum, C.neoformans, Leptospira. MICROORGANISMOS QUE GENERALMENTE REPRESENTAN BACTERIEMIA S.aureus, enterobacterias, P.aeruginosa, S.pyogenes, C.albicans
  • 120. Criterios de interpretación MICROORGANISMOS QUE PUEDEN SER CONTAMINANTES O REPRESENTAR BACTERIEMIAS VERDADERAS: Estreptococos grupo viridans, Clostridium spp, C.tropicalis. MICROORGANISMOS QUE GENERALMENTE REPRESENTAN CONTAMINACION: SCN, Bacillus spp, Corynebacterium spp, P.acnes, bacilos gram negativos no fermentadores (excluyendo a P.aeruginosa)
  • 121. Dia 1 al 15Dia 1 al 15 Paso 2Paso 2 24 – 48 hrs24 – 48 hrs Paso 3Paso 3 24 – 72 hrs24 – 72 hrs.. Método tradicional Se requiere un máximo de 15 días para descartar un negativo Subcultivo Identificación y antibiograma
  • 122. Tecnología Colorimétrica • Utilización de un sensor liquido tipo plasma. • Membrana de silicona impregnada al plasma de sensibilidad • Cambio sensitivo de CO2 diluido • Generación de color permanente.
  • 123. Unidades de reflectancia 2 Uso para hemocultivos, fluídos corporales y micobacterias. La curva de crecimiento es automáticamente GRABADA ANALIZADA GUARDADA 0 1 2 3 4 5 6 7 6000 5000 4000 3000 2000 1000 0 Days t est ed Reflect ance Unit s 1 Sust ained accelerat ion 2 Rate 3 I nitial t hreshold 1 3 2 • Algoritmos – Independientes al tipo de medio monitoreado. – Immediata notificación de positivos. – Algoritmo de alto valor inicial. (ventaja en la entrada de botellas demoradas). Tecnología Colorimétrica
  • 124. Bourbeau PP et al. Routine incubation of BacT/ALERT FA and FN blood culture bottles for more than 3 days may not be necessary. J Clin Microbiol. 2005;43:2506-2509 Importancia de la automatizacion Tiempo de recuperación  74% en Día 1  20% en Día 2  4% en Día 3  2% en Día 4  1% en Día 5 Estos resultados demuestran que el 98% de los aislamientos clínicamente significativos fueron recuperados en los 3 primeros días de incubación y el 94% dentro de los 2 días de incubación.
  • 125. 1.Cockerill FR III, Wilson J.W., Vetter E.A., et al. Optimal testing parameters for blood cultures. Clin Infect Dis. 2004 ;38 :1724-1730 Importancia de la automatizacion Tiempo de recuperación Estos datos sugieren que períodos de incubación extendidos previamente recomendados para la detección de microorganismos fastidiosos que a veces causan endocarditis, incluyendo Brucella, Capnocytophaga y Campylobacter spp., y el grupo HACEK (Haemophilus, Actinobacillus, Cardiobacterium, Eikenella y Kingella spp.) no son necesarios CUANDO SE UTILIZA SISTEMAS DE HEMOCULTIVOS AUTOMATIZADOS DE MONITORIZACIÓN CONTINUA 99.5% de la infecciones de sistema circulatorio (no endocarditis) y 100% de los episodios de endocarditis fueron detectados con 5 días de incubación.
  • 126. Impacto de la contaminación Un hemocultivos falso positivo puede conducir a un tratamiento antibiótico innecesario, mayor tiempo de hospitalización y mayores costos. Se ha estimado que cada hemocultivo contaminado puede llevar a un aumento en:  estadía del paciente - en 6 días en promedio,  el tiempo de terapia antibiótica – en 3 días,  el costo de la administración de antibióticos puede ser de hasta US$ 4400 Barenfanger et al. Clinical and Financial Benefits of Rapid Bacterial Identification and Antimicrobial Susceptibility Testing J. Clin. Micr, May 1999 p1415-1418
  • 127. BACTEC 9050BACTEC 9050 Tecnología de monitoreo contínuo de la serie BACTEC ® 9000 Sistema no invasivo Capacidad de 50 viales Interfase gráfica de fácil uso: Pantalla de cristal líquido Teclado sencillo Lector de código de barras fijo ajuste de la intensidad de la alarma formato de fecha/hora
  • 128. El material del sensor es una sustancia sensible a la concentración de CO2 El sensor genera una señal fluorescente, la cual es detectada por el analizador. La fluorescencia aumenta a medida que aumenta la concentración de CO2 Filtro de Detección SENSOR Filtro de Excitación LED Photodiode LED CO2 Fotodiodo
  • 129. FELIZ NAVIDAD Y PROSPERO AÑO NUEVO
  • 130. COSTOS DE UCI-HSR  HOSPITALIZACION 106.00 / día  OXIGENO 53.00 / día  DESCARTABLE 20.00 (sondas , mascaras)  MEDICAMENTOS 100.00 (Imipenem – asociados)  Materiales de asepsia 40.00  total 319.00 gasto por día  Promedio de estancia 5 días  Total = 1595.00  Sin considerar análisis de control y Rx (15.00)si amerita  Gases arteriales : 25.00 + hemograma 12.00 + coagulación 25.00 + bioquímica 18.00 (glucosa,urea,creatinina) +hemocultivo 45.00 + otros 17 =142.00
  • 131. Importancia de la automatización Conclusiones  Tratamiento inicial acertadoTratamiento inicial acertado – Beneficios clínicosBeneficios clínicos – Menor morbi-mortalidadMenor morbi-mortalidad – Menor tiempo de internaciónMenor tiempo de internación – Menor toxicidadMenor toxicidad – Reducción de costosReducción de costos – Beneficios epidemiológicosBeneficios epidemiológicos  Disminuir presión de selección de cepas RDisminuir presión de selección de cepas R
  • 132.
  • 133. Estudio de resistencia los antibacterianos en el Centro Medico Naval -2000  Escherichia coli ( R) 60% Penicilinas ,B lactamicos, , Cefalosporinas  Recomendamos estudiar con detalles la resistencia de Estafilococo aureus y tomar las medidas necesarias para evitar su desiminacion : (R) Penicilinas y Céfalosporinas: 70%  Necesario que el Dep. de Microbiologia realice una vigilancia permanente de la resistencia a los antimicrobianos y la aparición de cepas multiresistentes  Farmacia debe realizar estudios de utilización de antibióticos  El personal de enfermería alerta ante el problema de resistencia y establezca medidas para evitar la diseminación  Comité de Infecciones y la vigilancia Epidemiológica  Uso racional de antibióticos
  • 134.  Programa de Evaluación Externa del Desempeño (PEED)  Vigilancia de la Resistencia Antimicrobiana  de bacterias patógenas asociadas a  Enfermedades Diarreicas Agudas, Infecciones Respiratorias Agudas e Infecciones Intrahospitalarias  INS - CNSP  LRN Enteropatógenos  LRN IRAs E IIH
  • 135.
  • 136.

Notas del editor

  1. Step 1 is selecting New WalkAway Orders from the Command Center.
  2. Get rid of all those Post-It notes stuck to your current instrument or bench! Automate your SOP by customizing follow-up of unusual results – consistent instruction is readily accessible by clicking on the drop down box. This helps support rotating staff that may be less experienced than routine staff.
  3. The system will alert you if something is out of control Pull up the QC isolate and you are immediately directed to the antimicrobic that is out of control
  4. The Duplicate Isolate epidemiology rule is customizable. It allows you to define the number of days between samples that must elapse before the isolate is considered to be a new isolate. You can also tell the system whether it should consider the same organism from different sources as a duplicate. (Defined in Utilities) We’ve expanded the bacterial incidence report so that it can be segmented by most of the coded fields within the system. You are now able to exclude the antimicrobics not on formulary from the % susceptible report and the % inhibited report. Note: In Utilities you set the formulary for the entire system.
  5. Efficiency 3 cards to cover &amp;gt;95% of your routine work Wide data base &amp;gt;330 species claimed
  6. Full process control from the moment cards are prepared. System expects test cards in predefined order in the predefined cassette. Waits up to one hour for cassette. Will not allow other no other Maintain cassette to be entered until this cassette is found:
  7. BACKGROUND World leaders in identification products Transfer of API/id 32 knowledge + new substrates Lead to higher accuracy, faster results and better discrimination between species. More claims
  8. Rapid Result 90% routine bacteria in 6 hrs GP 2-8 hrs GN 2-10 hrs Yeast 18 hrs
  9. Ensuite, le gain de temps se situe également sur les périodes d’incubation, beaucoup plus courtes sur VITEK 2. Pour les antibiogrammes, ces temps sont inférieurs à 5h pour les Staph Oxa R et les Entérobactéries, un peu plus long pour les non fermentants, mais dans tous les cas, beaucoup plus rapides que les méthodes traditionnelles (18h - 24h). Ces délais de réponse sont particulièrement intéressants pour les services chauds en terme d’adaptation des traitements ou de gestion des isolements.
  10. A blood culture is a laboratory test in which blood, taken from the patient, is inoculated into bottles containing culture media to determine whether infection-causing microorganisms (bacteria or fungi) have invaded the patient’s bloodstream.
  11. This study was the most recent and most complete comparison of BacT/ALERT FAN media with BACTEC 9000 Resin media, published in a scientific journal. It compared all four bottles and studied the influence of delayed entry on the sensitivity of the systems. As shown in this table, BacT/ALERT recovered significantly more Enterobacteriaceae and Total organisms. Not shown in this slide, but published in the original article is that BacT/ALERT showed no loss of sensitivity after delayed entry, while the BACTEC did.
  12. These data were presented at the latest General Meeting of the American Society of Microbiology (May 2002, Salt Lake City). A FAN media pair is compared to a Bactec 9000 Resin Aerobic – Lytic Anaerobic combination. Basically, the differences were very small. Nevertheless, we were surprised to see that the difference in yeasts (in favor of BacT/ALERT) was not statistically different.
  13. This study compared the BacT/ALERT and the ESP system (currently sold by Trek Diagnostics). As you can see in this table, BacT/ALERT clearly outperformed ESP.