1. Seminario de Vigilancia Fitosanitaria. Zacapa, Guatemala.
23-27 Octubre
La Epidemiología en la
Fitosanidad
Dr. Gustavo Mora Aguilera
morag@colpos.mx
Zacapa, Guatemala. 23-27 Octubre

2. ¿Qué es la Epidemiología?
La epidemiología es una disciplina de la
fitosanidad

3. ¿Qué posición ocupa en el ámbito
biológico?
POBLACIÓN
EPIDEMIOLOGÍA
ORGANISMO
ETIOLOGÍA
CELULAR
HISTOLOGÍA

4. ¿Qué estudia la Epidemiología?
La epidemiología tiene como
objeto de estudio del sistema
epidemiológico y su resultante:
las epidemias

5. ¿Qué es una epidemia?
¿Es una condición sanitaria?
¿Es el efecto de una plaga?
¿Es la consecuencia de una plaga?
Pero a nivel cultivo
Población
Pero a nivel ambiente
Pero en una dimensión t y e

6. ¿Qué es una epidemia?
Abril 21,94 Incidencia =
Abril 25,94 Incidencia =
Abril 28,94 Incidencia =
Mayo 02,94 Incidencia =
Mayo 05,94 Incidencia =
Mayo 08,94 Incidencia =
k
Mayo 12,94 Incidencia =
Mayo 16,94 Incidencia =
Mayo 19,94 Incidencia =
j

7. Incidencia
¿Qué es una epidemia?
0
3
6
9…….
Tiempo (dias, sem. mes, o un. calor)

8. ¿Por qué ocurre una Epidemia?
PLAGA
Alta
Intensidad
1/1
?
MANEJO
CULTIVO
CLIMA
1/2
Media
Intensidad
¼
Baja
Intensidad

9. ¿Por qué una plaga es exitosa?

10. La epidemiología es una
disciplina de mediciones:
1) Se mide daño y su consecuencia
(impacto)
Manejo protectivo
2) Se mide riesgo
Manejo preventivo

11. ¿Cuándo medir?
1) A partir de la condición sana
Tiempo
Condición sana
<
Condición enferma
2) A partir de la infección y/o colonización inicial
Distancia
Infección/Colonización 1°
<
Infección/Colonización 2°

12. ¿Para que sirve medir?
1) Restablecer
Manejo Protectivo
(Principio = Protección)
1) Prevenir
Manejo Preventivo
(Principio = Exclusión, Erradicación)

13. Aplicación de los principios de control en la fitosanidad
Subpoblación
con daño
Subp. -sana
Subpoblación
sana
t
t+ni
t+ni+nj
Subp. –enferma / daño
Población

14. Los Paradigmas y el Manejo
Paradigma Fundametal Etiológico
Relación
Causa-Efecto
Principio de
Infección/Infes.
Paradigma Epidemiológico
Principio de
Contagio / Col.
Celular y
Subcelular
Tejido
Genética de
la Interacción
Fisiología
del Parasitismo
Planta
Patógeno / Plaga
Etiología e histología
Agrotóxico
Transgénia
-
Resistencia
Reduccionista
Estabilidad
del
Agrosistema
Población
Comunidad
Control Integrado
de plagas
Manejo Integrado
de Cultivo
Manejo ntegrado
de plagas
Manejo Integrado
Regional
Holístico
+

15. ¿Qué se necesitamos para un manejo racional
y sustentable?
2. Un estudio de diagnóstico regional fitosanitario con
énfasis en el efecto de manejo agronómico, clima,
y ambiente suelo en la el estado de la salud del cultivo. Se incluye
Plaga A y otros problemas fitosanitarios, nutrición y fisiología
de planta bajo la premisa de la comprensión integral de los factores
que determinan la calidad de planta.
3. Con esta base se diseñan propuestas de manejo de precisión
(paquetes adaptados por tipología de unidad de producción).
Se pretende así apartarse de la estrategia única de la aplicación
del principio de protección (pe. agroquímicos. Pe Aliette,
Benomyl ). Se incluyen estrategias preventivas (pe. podas de
saneamiento, variedades, etc. ) con evaluación de productos químicos in situ.
4. Diseñar indicadores de sustentabilidad biológica para medir
el impacto de la estrategias adoptadas por medio de investigación
de mediano plazo.

16. Curso de Epidemiología
Aplicada
Análisis Temporal y
Espacial
Instructor:
Gustavo Mora Aguilera
Colegio de Postgraduados
morag@colpos.mx
Coordinadora:
Nora Andrada
Uni. San Luis, Arg

17. Análisis de Epidemias
Recordar que......
1. La epidemiologia es una disciplina de
mediciones.
2. Medimos:
• daño/impacto
• riesgos
3. Medimos para:
• reestablecer condiciones productivas
rentables.
• Prevenir daño…. mantener ‘zonas verdes’.

18. …..Tambien comentamos que medimos
tiempo
Condición
sana
distancia
Condición
daño

19. Es decir….
La epidemiologia tiene dos ambitos de estudio:
N-d
Condición
sana
Condición
daño
N-d
(d1,1, d2,2)

20. La epidemiología cuyo ámbito
de énfasis es el tiempo se llama:
Epidemiología
Temporal

21. Que resulta de estudios temporales?
• Curvas de daño
(curvas epidémicas)
• Fluctuaciones de daño
Progreso temporal

22. Pero….
Únicamente importa el daño?
Recordar que una epidemia
es un proceso que resulta
de un Sistema
Epidemiológico

23. Afirmativo
descriptivo
para
un
objetivo
Negativo para un objeto inferencial
(Pronostico).

24. En el caso inferencial….
Que otros resultados podemos tener en
estudios temporales?
• Dinámica plaga
• Fluctuación climática
• Variaciones por manejo agronómico
• Dinámica fenología
Es decir medimos: Variables del Sistema Epidemiológico

25. El ámbito de la epidemiología
Proceso Temporal
Dispersión
Sobrevivencia
Máximo de daño,
Máximo Poblacional
Infección
Contagio
Multiplicación
Infestación
Hospedante
Proceso Espacial
Intensidad
de Foco
Colonización
foco
7 6 5 4 3 2 1 0 1 2 3 4 5 6 7 8
Distancia

26. El Sistema Epidemiológico y el ambito epidemiologico
Pudricion
Cercospora
Escama
Intensidad de Daño
Cochinilla
Picudo
Marchitez
Manejo
Agronómico
Cultivove
ni
Suelo
Clima
Sistema epidemiólogico:
a). Integracion en el hospedante
b). Multiples plagas
c). Sistema abierto

27. Los procesos biológicos implicitos en una epidemia,
6
5
4
3
2
1
à
N
N
Dispersión y Sobrevivencia
METROS
Mar
Disease severity
ä
Disease severity
Disease severity
6
5
4
3
2
1
J
E
FF
M M A
AM
M
J
Meses
6
5
4
6
5
4
3
2
1
6
5
4
3
2
1
JJ
6
5
4
3
2
1
A
N
á
METROS
METROS
6
5
4
3
2
1
Disease severity
Inoculo primario
J
A
S
Time
6
5
4
3
scab, damage by thrips
METROS
METROS
METROS
Disease severity
0
N
e severity
6
5
4
3
2
1
20
à
Disease severity
Disease severity
un
40
6
5
4
3
2
1
Inóculo
ä
secundario
METROS
6
5
4
3
2
1
60
Disease severity
Disease severity
Disease severity
6
5
4
3
2
1
May
N
á
6
5
4
3
2
1
N
severity
Incidence
80
ETROS
Apr
6
5
4
3
2
1
METROS
Disease severity
100
Disease severity
Multiplicacion

28. ¿Cómo se estudian las epidemias (cambios de estructura)?
En un proceso temporal:
Por medio del cálculo de valores de intensidad
de dano por unidad de tiempo. La información
espacial se pierde.
350
300
Tamaño de la población: pequeña (pe. 3, 10, 20
unidades). No se requiere un espacio continuo
250
Representación gráfica de la epidemia: Curvas o
gráficas de intensidad de dano vs. tiempo
200
150
Análisis cuantitativo: modelos de progreso,
parámetros de localización e integración (p.e. Yo
o ABCPE)
100
50
0
1
2
3
4
5
6
7
8
Variable empleada: Produccion, Severidad,
Incidencia,
número de unidades
enfermas o con daño
Proceso: progreso temporal de enfermedad
Con datos de Federico Lopez, ‘Patagonia’ Arg.

29. Abril 21,94 Incidencia =
Abril 25,94 Incidencia =
Abril 28,94 Incidencia =
Mayo 02,94 Incidencia =
Mayo 05,94 Incidencia =
Mayo 08,94 Incidencia =
k
Mayo 12,94 Incidencia =
Mayo 16,94 Incidencia =
Mayo 19,94 Incidencia =
j

30. Estructura de una epidemia temporal
1
0
0
Inc. o Sev.
Final
f
Tasa de InfecciónY
Aparente
Yb
o
1
5
0
IntesidaeEnfermda(%)
Tiempo a Inicio
de Epidemia
0
Forma de
la Curva
c
To
ip
e
m
Incidencia o
Severidad Inicial
A
B
C
P
E
Area Bajo
la Curva
Y
o
X
o
f
Y
Tiempo Total
de Epidemia
u
c ed t
i
e i
e)
= a di m o
Tró E i(m
tD n p a p
To
ip
e
m

31. ¿Cómo se estudian las epidemias (cambios de estructura)?
En un proceso espacial:
Cercospora / Agave
Por medio de la disposición espacial de valores
de intensidad de dano por unidad poblacional
(p.e. Planta)
Tamaño de la población: Grande (pe. 0.5ha 20ha). Unidades poblacionales en una espacio
continuo y discontinuo
Representacion gráfica de la epidemia: Mapas
o Gradientes
Análisis cuantitativo: Unidimensional, bi y
tridimensional. pe. Indices de dispersión,
autocorrelación, geoestadistica
Variable empleada: Severidad,
Incidencia
número de unidades
enfermas o con daño
Mapa bidimensional campo
Proceso: Progreso espacial de da

32. Mapa interpolado de Numero de hojas con
mancha marginal en vivero de agave-Herradura

33. Tipo de variable respuesta e intervalo de medición empleados en 117 experimentos de
efectividad biológica de fungicidas y nemáticidas en cultivos hortícolas
TIPO DE VARIABLE RESPUESTA1
INCIDENCIA
SEVERIDAD
INDIRECTA
CUALITATIVAS
EJEMPLO
NÚMERO DE PLANTAS ENFERMAS POR
REPETICIÓN
NÚMERO DE HOJAS ENFERMAS POR PLANTA
% TUBÉRCULOS ENFERMOS
% LESIONES EN FRUTO
% LESIONES FOLIARES
% DE LESIONES POR TALLO
% ÁREA TUBÉRCULO INFECTADO
% ÁREA FOLIAR CON PÚSTULAS
% ÁREA DE TALLO INFECTADO
ÁREA BAJO LA CURVA DEL PROGRESO DE LA
ENFERMEDAD (ABCPE)
SEVERIDAD Y/O INCIDENCIA FINAL (Yf)
ESCALAS NOMINALES DE INFECCIÓN (INICIO,
MODERADO Y SEVERO)
CON SÍNTOMAS Y SIN SÍNTOMAS
1
Indirecta significa que variables de incidencia y severidad fueron empleadas para
calcular otro tipo de parámetros previo a ANVA. En el caso de tipo cualitativo se
generaron valores nominales.
Fuente (Mora y Rivas 2001)

34. ESCALA DE SEVERIDAD
• Cualitativa
Carica papaya-Papaya Ringspot potyvirus
1= SANO
2= MOSAICO INICIAL 3= MOSAICO DEFINIDO
4= MOSAICO SEVERO 5= SEVERA REDUCCIÓN DE
LAMINA FOLIAR
Rivas, P. 2000

35. Clase 0
Sano
Clase 3
30-50%
Eje 2o. Muerto
Clase 1
0% RV¹
Clase 4
30-50% RV
Eje 1o. y 2o. Muertos
Clase 2
10-30% RV
Clase 5
Muerto
¹ RV= Reducción de vigor
Figura 18. Escala diagramática nominal para diferentes grados de severidad de Citrus Tristeza
Virus (CTV) en naranjo dulce cv. Valencia/naranjo agrio. Tamaulipas, 2003. GIIC-CP. No
publicado.

36. 75
70
65
60
55
50
45
40
35
30
25
Severidad (%)
20
15
10
5
1
0
1
2
3
Clases
4
5
6

37. Cálculo de una escala logarítmica y representación
gráfica
Osada y Mora, 1996

38. Distribución de clases de severidad en una escala
logarítmica
FRECUENCIA
25
21
20
15
10
10
8
5
0
10
3
0
2
1
2
3
4
5
1
6
CLASES
Selección de unidades
en el rango de daño
Cristobal et al. 2002

39. Validación: dos evaluaciones
23

40. Etapas en la Planeación de un Estudio Epidemiológico
Definición del
Problema
Objetivos
e Hipótesis
Análisis y síntesis
Interdisciplinariedad
Modelo del Sistema
Epidemiológico
Política de Gestión
Matriz
de variables asociadas
a los subsistemas
Investigación
Cientifíca
Investigación
sinóptica o
bibliográfica
Síntesis y
Solución
al Problema
Investigación
Empírica
(no formal)
Sistema de
Información
Transferencia
Tecnológica

41. Integración de información y aplicación de métodos exploratorios,
descriptivos y correlativos
Análisis de Información
Histórica
Datos Históricos y
Experimentales
Evaluaciones
periódicas
Datos Regionales
Diseño de experimentos
ad hoc
Clima, Hospedero
Suelo, Manejo
Matriz Epidemiológica
Exploración de datos
Estadística descriptiva
Gráficas Exploratorias
Mapas Exploratorios
Proc Univariate, Proc Summary,
Proc Chart y Proc Freq, otros.
Proc Plot,
Gráfico MS EXCEL
Inverso de la Distancia al
Cuadrado (IDW) y Krigin
SAS ver 6.12
SAS ver 6.12 y MS EXCEL
ARC MAP ver 9.1 / Surfer ver 8.0
A

42. Integración de información y aplicación de métodos exploratorios, descriptivos y
correlativos (continuación).
A
Análisis Estadístico
Inferencial
Métodos Univariados
Métodos Multivariados
Proc GLM,
Proc Arima
Proc PrinCom, Proc Cluster,
Proc Factor, Proc GenMod
SAS ver 6.12
SAS ver 6.12
Mapa Descriptivo
Mapa de factores de
riesgo
Regionalización de
Inductividad Epidémica
Métodos Simulativos. P.e MC

43. Base Racional
1. El estudio de la planta como eje integrador
de los procesos fitosanitarios. Por tanto la
producción se debe articular a los análisis
de la sanidad.
2. La variabilidad regional inductiva de los
diversos problemas fitosanitarios permite
operar en forma efectiva en planeación
productiva y fitosanitaria.
3. Los métodos analíticos deben seleccionarse
con el fin de optimizar la variabilidad y
establecer relaciones funcionales entre los
componentes productivos, ambientales y
sanitarios.