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Planteamiento del
Problema Estudio de
caso: Roya del Cafeto
Epidemiología Agrícola
FIT-612
Dr. Gustavo Mora
MC. Jorge Flores
MC. Santiago Domínguez
Ing. Gerardo Acevedo
29 Mayo 2013
La roya del cafeto es ocasionada por el
hongo Hemileia vastatrix. Es una de las
enfermedades más comunes y distribuidas en
las principales zonas cafetaleras del mundo.
 Los daños severos se manifiestan como
defoliaciones que pueden disminuir los
rendimientos, cuando se presentan en fases
tempranas de formación o maduración de los
frutos.
 Cuando la enfermedad se presenta en
etapas tardías, se puede reflejar en reducción
en los niveles de amarre del fruto, que se
manifiestan durante el siguiente ciclo.
La roya del cafeto fue observada por primera
vez en áreas cercanas al Lago Victoria en
África Oriental.
La roya del cafeto hizo su aparición en la
cafeticultura mexicana en 1981, en el área
del Soconusco, Chiapas.
En 1970 se registró en Brasil, 1976 en
Nicaragua, 1979 a El Salvador y en 1980
en Honduras.
Variables
Condiciones epidemiológicas
Guatemala Honduras Colombia Brasil
Carga de inoculo Alta Alta Alta Alta
Clima Inductivo Inductivo Inductivo Inductivo
Manejo Bajo Bajo Bajo Bajo
Raza nueva No No No No
Nivel de intensidad de daño Alto Alto Alto Alto
Tres países –Guatemala, Honduras y Costa
Rica– han declarado estado de emergencia a
raíz de la crisis, con el fin de acopiar recursos
extraordinarios para el combate de la plaga,
conocida científicamente como Hemileia
vastatrix. La plaga es un hongo que infecta las
hojas del cafeto, causa la defoliación de la
planta, una maduración anormal, pérdida de
calidad, caída del fruto y debilitamiento.
3%5%
30%
Incremento de
velocidad
Epidemia 1982
a 1984
Incremento
de velocidad
epidemia
Con datos de Méndez, I. 1984
Una curva de daño es variable durante el ciclo(s) del cultivo
Una epidemia tiene variabilidad en su forma y velocidad
Predio 1 (780msnm):
cantidad inicial daño: 3-30%
Cantidad final: 25-100%
Predio 2 (1100msnm):
cantidad inicial daño: 0.05%
Cantidad final: 2.5-4%
Tapachula, Chiapas 1982-84
La roya actualmente presente en
plantaciones en Chiapas y otras
zonas productoras del país, es la
misma raza que ha permanecido en
el país desde hace 30 años.
Las condiciones epidemiológicas
que favorecen el desarrollo de la
enfermedad se presentan de junio
a octubre cuando coinciden el
desarrollo del fruto y presencia de
lluvias.
¿Qué aspectos
biológicos y
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deben considerar para
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YEMA BOTÓN FLOR
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La genética de la planta condiciona la forma
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22 °C, sin radiación solar,
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Periodo Incubación 19 a 26 °C Periodo Generación 17 a 26 °C
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ocurrencia
Germinación 1 - 5 horas Periodo Latencia
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Periodo Incubación 17 – 42 días Periodo Generación 26 – 62 días
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Germinación Hoja nueva (0 – 20 días) Periodo Latencia Hoja madura (30 – 60 días)
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variable debe realizarse
con un método exacto y
preciso
1. Evaluación preliminar de severidad en campo
Reconocer el rango de
severidad representativa de
la enfermedad bajo las
condiciones posibles de
campo y colectar muestras
representativas para
análisis posterior.
Determinar el % de tejido
dañado por muestra
mediante programa
ImageTool
2. Diseño de Escala logarítmica con base en el principio
Weber-Fechner
Severidad
A partir del 50% de daño la relación de agudeza visual se reduce por
efecto de la reducción de tejido sano
75%
Comportamiento Logarítmico
Severidad
máxima
Número de
clases
Propuesta Horsfall y Barratt 1945
Programa 2-LOG (Osada y Mora, 1997).
Requiere evaluación preliminar del rango de severidad
min y max
3. Validación de escala logarítmica
Exacto
Preciso
Reprodu-
cible
Eficiente
Econó-
mico
Elementos de Validación
Programa de Postgrado
en Fitopatología
COLEGIO DE POSTGRADUADOS
Campus Montecillo
Validar-PER graficay ajusta a un modelo de regresiónlineal simple unamatriz de
20 evaluadores y 60 muestras a evaluar con base en una escaladiagramática.
La r2
= estimala precisión;b(pendiente) =estimalaexactitud.
Gustavo MoraAguilera morag@colpos.mx
Gerardo Acevedo Sánchez geraracevedo@gmail.com
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Planteamiento problema roya café 28 may13

  • 1. Planteamiento del Problema Estudio de caso: Roya del Cafeto Epidemiología Agrícola FIT-612 Dr. Gustavo Mora MC. Jorge Flores MC. Santiago Domínguez Ing. Gerardo Acevedo 29 Mayo 2013
  • 2. La roya del cafeto es ocasionada por el hongo Hemileia vastatrix. Es una de las enfermedades más comunes y distribuidas en las principales zonas cafetaleras del mundo.  Los daños severos se manifiestan como defoliaciones que pueden disminuir los rendimientos, cuando se presentan en fases tempranas de formación o maduración de los frutos.  Cuando la enfermedad se presenta en etapas tardías, se puede reflejar en reducción en los niveles de amarre del fruto, que se manifiestan durante el siguiente ciclo.
  • 3. La roya del cafeto fue observada por primera vez en áreas cercanas al Lago Victoria en África Oriental. La roya del cafeto hizo su aparición en la cafeticultura mexicana en 1981, en el área del Soconusco, Chiapas. En 1970 se registró en Brasil, 1976 en Nicaragua, 1979 a El Salvador y en 1980 en Honduras. Variables Condiciones epidemiológicas Guatemala Honduras Colombia Brasil Carga de inoculo Alta Alta Alta Alta Clima Inductivo Inductivo Inductivo Inductivo Manejo Bajo Bajo Bajo Bajo Raza nueva No No No No Nivel de intensidad de daño Alto Alto Alto Alto
  • 4. Tres países –Guatemala, Honduras y Costa Rica– han declarado estado de emergencia a raíz de la crisis, con el fin de acopiar recursos extraordinarios para el combate de la plaga, conocida científicamente como Hemileia vastatrix. La plaga es un hongo que infecta las hojas del cafeto, causa la defoliación de la planta, una maduración anormal, pérdida de calidad, caída del fruto y debilitamiento.
  • 5. 3%5% 30% Incremento de velocidad Epidemia 1982 a 1984 Incremento de velocidad epidemia Con datos de Méndez, I. 1984 Una curva de daño es variable durante el ciclo(s) del cultivo Una epidemia tiene variabilidad en su forma y velocidad Predio 1 (780msnm): cantidad inicial daño: 3-30% Cantidad final: 25-100% Predio 2 (1100msnm): cantidad inicial daño: 0.05% Cantidad final: 2.5-4% Tapachula, Chiapas 1982-84
  • 6. La roya actualmente presente en plantaciones en Chiapas y otras zonas productoras del país, es la misma raza que ha permanecido en el país desde hace 30 años. Las condiciones epidemiológicas que favorecen el desarrollo de la enfermedad se presentan de junio a octubre cuando coinciden el desarrollo del fruto y presencia de lluvias.
  • 7. ¿Qué aspectos biológicos y epidemiológicos se deben considerar para atacar el problema?
  • 8. Evento Fenológico YEMA BOTÓN FLOR FORMACIÓN DE FRUTOS LLENADO DE FRUTOS MADURACIÓN COSECHA FLORACIÓN EMISIÓN DE HOJAS HOJAS MADURAS Meses Enero Febrero Marzo Abril Mayo Junio Julio Agosto Septiembre Octubre Noviembre Diciembre Aspectos Biológicos de implicación epidémica La genética de la planta condiciona la forma
  • 9. Evento Patogénesis Periodo Patogénesis Condiciones Favorables Germinación 22 °C, sin radiación solar, mojado foliar de 7 h Periodo Latencia 17 a 25 °C Periodo Incubación 19 a 26 °C Periodo Generación 17 a 26 °C Tiempo de ocurrencia Germinación 1 - 5 horas Periodo Latencia 26 – 50 días Periodo Incubación 17 – 42 días Periodo Generación 26 – 62 días Hoja Germinación Hoja nueva (0 – 20 días) Periodo Latencia Hoja madura (30 – 60 días) Periodo Incubación Hoja madura (0 – 30 días) Periodo Generación Hoja madura (40 – 80 días) Germinación Colonización Multiplicación Deposición Infección Clorosis Liberación de inóculo Incubación (Pi) Latencia (Pl) Generación (Pg) Penetración 1° Síntoma visual Inicio esporulación Finaliza esporulación Aspectos Biológicos de implicación epidémica
  • 10. Sistema Epidemiológico Una epidemia resulta de la interacción de los factores epidemiológicos
  • 11. ¿Qué variables inductivas de los subsistemas del Sistema Epidemiológico se deben considerar?
  • 12.
  • 13. Métodos de evaluación de las variable deseadas
  • 14. Escala Arbitraria de evaluación de Severidad
  • 15. Escala Aritmética de evaluación de Defoliación
  • 16. Escala Logarítmica de evaluación de Severidad
  • 17. La evaluación de una variable debe realizarse con un método exacto y preciso
  • 18. 1. Evaluación preliminar de severidad en campo Reconocer el rango de severidad representativa de la enfermedad bajo las condiciones posibles de campo y colectar muestras representativas para análisis posterior. Determinar el % de tejido dañado por muestra mediante programa ImageTool
  • 19. 2. Diseño de Escala logarítmica con base en el principio Weber-Fechner Severidad A partir del 50% de daño la relación de agudeza visual se reduce por efecto de la reducción de tejido sano 75% Comportamiento Logarítmico Severidad máxima Número de clases Propuesta Horsfall y Barratt 1945 Programa 2-LOG (Osada y Mora, 1997). Requiere evaluación preliminar del rango de severidad min y max
  • 20. 3. Validación de escala logarítmica Exacto Preciso Reprodu- cible Eficiente Econó- mico Elementos de Validación Programa de Postgrado en Fitopatología COLEGIO DE POSTGRADUADOS Campus Montecillo Validar-PER graficay ajusta a un modelo de regresiónlineal simple unamatriz de 20 evaluadores y 60 muestras a evaluar con base en una escaladiagramática. La r2 = estimala precisión;b(pendiente) =estimalaexactitud. Gustavo MoraAguilera morag@colpos.mx Gerardo Acevedo Sánchez geraracevedo@gmail.com b= 0,5103 SUBESTIMADO b= 1,1775 SOBREESTIMADO r2 = 0,1159 NO ACEPTABLE r2 = 0,8827 MEDIA y = 0,5103x +16,406 R² =0,1159 0,0 10,0 20,0 30,0 40,0 50,0 60,0 70,0 80,0 0 10 20 30 40 50 60 70 Evaluación Reales Evaluador 1 y = 1,1775x - 3,7058 R² =0,8827 -10 0 10 20 30 40 50 60 70 80 0 10 20 30 40 50 60 70 Evaluación Reales Evaluador 2