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BIOLOGIA CELULAR
ESTRUCTURA Y FUNCION DE LAS PROTEINAS
DR. JACOBO
PROTEINAS
Las proteínas
Son grandes moléculas formadas por la unión
 de varios aminoácidos. Las proteínas cumplen
 una función esencial en el organismo de los
 seres vivos, pues están involucradas en todos
 los procesos biológicos que ocurren en el
 cuerpo.
PROTEINAS
Aminoácidos
 Los aminoácidos son moléculas orgánicas

  pequeñas que contienen un grupo carboxilo
  (COOH) y un grupo amino (NH2). El grupo
  carboxilo es ácido débil, mientras que el
  grupo amino es básico débil.
Enlace peptídico
 Unión de dos aminoácidos mediante la

  pérdida de una molécula de agua entre el
  grupo amino de un aminoácido y el grupo
  carboxilo del otro.
ESTRUCTURAS DE LAS
PROTEINAS
   La forma de una proteína es especificada por su
    secuencia de aminoácidos.
   Las proteínas se pliegan en una conformación de
    menor energía.
   Adaptan una gran variedad de formas complejas.
   La hélice a y la lamina B son patrones de
    plegamiento comunes.
   Los hélices se forman fácilmente en las
    estructuras biológicas.
   Las laminas B forman estructuras rígidas
    centrales en muchas proteínas.
ESTRUCTURA DE LAS
PROTEINAS
     Estructura primaria
      La estructura primaria de las proteínas hace
       referencia a la secuencia de aminoácidos que la
       componen, ordenados desde el primer aminoácido
       hasta el último. El primer aminoácido tiene
       siempre libre el grupo amina, por lo que se le da el
       nombre de aminoácido n-terminal.
       El último aminoácido siempre tiene libre el grupo
       carboxilo, por lo que se denomina aminoácido c-
       terminal.
      Para determinar la secuencia no basta con saber
       los aminoácidos que componen la molécula; hay
       que determinar la posición exacta que ocupa cada
       aminoácido.
      La estructura primaria determina las demás
       estructuras de la proteína.
     
ESTRUCTURA SECUNDARIA

Estructura secundaria

La estructura secundaria de una proteína es un
nivel de organización que adquiere la molécula,
dependiendo de cómo sea la secuencia de
aminoácidos que la componen. La rigidez del
enlace peptídico, la capacidad de giro de los
enlaces establecidos con el carbono asimétrico y la
interacción de los radicales de los aminoácidos con
la disolución en la que se encuentra, lleva a plegar
la molécula sobre sí misma. Las conformaciones
resultantes pueden ser la estructura en a-hélice,
la b-laminar



a-hélice

  Es una estructura helicoidal dextrógira, es decir,
que las vueltas de la hélice giran hacia la derecha.
Adquieren esta conformación proteínas que poseen
elevado número de aminoácidos con radicales
grandes o hidrófilos, ya que las cargas interactúan
con las moléculas de agua que la rodean.
ESTRUCTURA SECUNDARIA

    b-laminar
     También se denomina hoja plegada o
      lámina plegada.
     Es una estructura en forma de zig-
      zag, forzada por la rigidez del enlace
      peptídico y la apolaridad de los
      radicales de los aminoácidos que
      componen la molécula. Se estabiliza
      creando puentes de Hidrógeno entre
      distintas zonas de la misma molécula,
      doblando su estructura. De este modo
      adquiere esa forma plegada.
ESTRUCTURA TERCIARIA
     Estructura terciaria.
      Resulta del plegamiento sobre sí misma de la
       estructura secundaria ,de la estructura terciaria
       depende la función de la proteína, por lo que
       cualquier cambio en la disposición de esta
       estructura puede provocar la pérdida de su
       actividad biológica.

        La estructura terciaria es, por tanto, un
         conjunto de plegamientos característicos que
         se originan por la unión entre determinadas
         zonas de la cadena polipeptídica. Estas
         uniones se realizan por medio de enlaces entre
         las cadenas laterales de los aminoácidos.
ESTRUCTURA
CUATERNARIA
         Estructura cuaternaria
         Cuando varias proteínas se

          unen entre sí, forman una
          organización superior,
          denominada estructura
          cuaternaria. Cada proteína
          componente de la asociación,
          conserva su estructura
          terciaria. La unión se realiza
          mediante gran número de
          enlaces débiles, como
FUNCION DE LAS
PROTEINAS
Enzima: catálisis de la ruptura o formación de un enlace
covalente.
Proteínas estructurales: proporcionar soporte
mecánico a las células y tejidos.
Proteinas de transporte: transportar moleculas
pequeñas o iones.
Proteinas motoras: generar movimientos en las células
y tejidos.
Proteinas de deposito: almacenar pequeñas
moléculas o iones.
Proteinas de señalización: transmitir señales de una
célula a la otra.
Proteinas receptoras: detectar señales y transmitirlas
a la maquinaria de respuesta de la célula.
REGULACION DE LA FUNCION
         PROTEICA
Dentro de la célula, la mayor parte de las proteínas y enzimas no
trabajan continuamente, o con la velocidad máxima. Por el
contrario, su actividad esta regulada de modo tal que la célula
puede mantenerse a si misma en un estado de equilibrio, en el
que solo genera aquellas moléculas que requiere para
desarrollarse en forma adecuada bajo las condiciones comunes.
Para alcanzar este equilibrio, las actividades de las proteínas
celulares se controlan de un modo integrado teniendo en cuenta
que reacciones se están produciendo en otras partes de la célula.
Mediante la coordinación de cuando- y energéticamente una
depleción de sus reservas energéticas por la acumulación de
moléculas que no requiere mientras que esta agotando sus
reservas de sustratos críticos.
LAS ACTIVIDADES CATALITICAS DE LAS
     ENZIMAS SE REGULAN A MENUDO POR
     OTRAS MOLECULAS
Regulación por otras moléculas:

El tipo mas común de control se produce cuando otra
    molécula
que no sea un sustrato se una a una enzima en un sitio
regulatorio especial por fuera del sitio activo, lo cual altera la
velocidad en la que la enzima convierte sus sustratos en
productos. En la inhibición por retroalimentación, una
    enzima
que actúa inicialmente en una vía de reacción es inhibida
    por
uno de los productos finales de esta vía.

La inhibición por retroalimentación es una regulación
   negativa:
impide que una enzima actué. Las enzimas también pueden
   estar
sujetas a regulación positiva, en la cual la actividad
   enzimática es
LAS ENZIMAS ALOSTERICAS TIENEN DOS
 SITIOS DE UNION QUE SE INFLUYEN
 RECIPROCAMENTE
Regulación por alosteria:

Cuando esta forma de regulación se descubrió en la década de 1960, se la denomino
alosteria. A medida que se aprendió mas acerca de la inhibición por
    retroalimentación,
los investigadores se dieron cuenta de que muchas enzimas deben tener al menos
    dos
sitios de unión diferentes sobre su superficie: el sitio activo que reconoce a los
    sustratos
y un segundo sitio que reconoce a una molécula reguladora. Estos dos sitios deben
comunicarse de una forma que permita que los procesos catalíticos en el sitio activo
sean influidos por la unión de la molécula reguladora en un sitio separado de la
superficie de la proteína.
Durante la inhibición por retroalimentación, por ejemplo la unión de un inhibidor a un
sitio sobre la proteína lleva a que esta cambie a una conformación en la que su sitio
activo- localizado en otra parte de la molécula- llega a ser menos adaptado a la del
sustrato. Muchas – si no todas- las moléculas proteicas son alostericas: pueden
    adoptar
dos o mas conformaciones ligeramente diferentes, y su actividad es regulada por el
cambio de una a otra forma.
LA FOSFORILACION PUEDE CONTROLAR LA
ACTIVIDAD PROTEICA MEDIANTE LA INDUCCION DE
UN CAMBIO CONFORMACIONAL

Regulación por fosforilación:
Un segundo método utilizado con frecuencia por las células
eucariontes para regular la actividad proteica implica la unión
covalente de un grupo fosfato a una de sus cadenas laterales de
aminoácidos. Puesto que cada grupo fosfato transporta dos
   cargas
negativas, el agregado catalizado por la enzima de un grupo
   fosfato a
una proteína puede causar un cambio conformacional
   fundamental,
por ejemplo, atrayendo a un formacional puede, a su vez, afectar la
unión de ligandos en otro lugar sobre la superficie de la proteína y
modificar con ello la actividad de la proteína. La eliminación del
grupo fosfato por una segunda enzima restablece la conformación
original y repone la actividad inicial de la proteína.
Esta fosforilación proteica reversible controla la actividad de
   muchos
LAS PROTEINAS QUE UNEN GTP TAMBIEN SE
REGULAN POR LA GANANCIA Y PERDIDA CICLICA DE
UN GRUPO FOSFATO
Regulación por ganancia y perdida cíclica de un grupo
fosfato:

Las células eucariotas tienen un segundo modo de regulación de la
   actividad
de una proteína mediante el agregado y eliminación de un grupo fosfato. En
este caso, en lugar de ser transferido enzimáticamente del ATP a la
   proteína, el
fosfato es parte de un nucleótido de guanina- sea la guanosina trifosfato
   (GTP)
o bien la guanosina difosfato (GDP)- que se une estrechamente a la
   proteína.
Estas proteínas fijadoras de GTP están en sus conformaciones activas con
   GTP
unido; la proteína misma hidroliza luego el GTP a GDP- con liberación de un
fosfato- y cambia a una conformación inactiva. Como en el caso de la
fosforilación proteica, este proceso es reversible. La conformación activa
   se
recobra mediante la disociación del GDP, seguida de la unión de una
LA HIDRÓLISIS DE LOS NUCLEOTIDOS PERMITE A LAS
PROTEINAS MOTORAS PRODUCIR GRANDES
MOVIMIENTOS EN LAS CELULAS
Regulación por hidrólisis de nucleótidos:

Como se utilizan los cambios de conformación de las proteínas para
   generar
movimientos ordenados en las células?
Como el movimiento direccional de una proteína hace un trabajo neto,
   las leyes
de la termodinámica demandan que el movimiento utilice energía libre de
   alguna
otra fuente, es decir la hidrólisis del ATP (de otro modo, la proteína
   podría utilizarse
como una maquina de movimiento perpetuo). Por lo tanto, sin una
   entrada de
energía, la molécula proteica solamente puede errar sin propósito.

Como se llevan a cabo entonces los cambios conformacionales
  unidireccionales ?
Para obligar al ciclo entero a orientarse en una dirección a grandes
  distancias, esta
LAS PROTEINAS FORMAN A MENUDO
GRANDES COMPLEJOS QUE FUNCIONAN
COMO MAQUINARIAS PROTEICAS
Regulación por maquinarias proteicas:
Las células construyeron maquinarias proteicas capaces de llevar a cabo la
mayor parte de las reacciones biológicas. Las células emplean maquinarias
proteicas por la misma razón que el hombre invento los aparatos mecánicos y
electrónicos: casi en cualquier tarea, las manipulaciones que están especial y
temporalmente coordinadas mediante procesos ligados son mucho mas
eficientes que con el uso secuencial de herramientas individuales.

En la mayor parte de tales maquinarias proteicas la hidrólisis de nucleosidos
trifosfatos unidos (ATP o GTP) conduce a una serie de cambios
conformacionales ordenados en algunas de las subunidades proteicas, que
permiten el ensamblado de proteínas para moverse coordinamente. De este
modo, las enzimas apropiadas pueden dirigirse hacías las posiciones donde son
necesarias para llevar a cabo reacciones sucesivas en serie, como en la síntesis
de proteínas sobre un ribosoma ,donde un gran complejo multiproteico se
mueve rápidamente a lo largo de este.

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Proteinas biocel

  • 1. BIOLOGIA CELULAR ESTRUCTURA Y FUNCION DE LAS PROTEINAS DR. JACOBO
  • 2. PROTEINAS Las proteínas Son grandes moléculas formadas por la unión de varios aminoácidos. Las proteínas cumplen una función esencial en el organismo de los seres vivos, pues están involucradas en todos los procesos biológicos que ocurren en el cuerpo.
  • 3. PROTEINAS Aminoácidos  Los aminoácidos son moléculas orgánicas pequeñas que contienen un grupo carboxilo (COOH) y un grupo amino (NH2). El grupo carboxilo es ácido débil, mientras que el grupo amino es básico débil. Enlace peptídico  Unión de dos aminoácidos mediante la pérdida de una molécula de agua entre el grupo amino de un aminoácido y el grupo carboxilo del otro.
  • 4. ESTRUCTURAS DE LAS PROTEINAS  La forma de una proteína es especificada por su secuencia de aminoácidos.  Las proteínas se pliegan en una conformación de menor energía.  Adaptan una gran variedad de formas complejas.  La hélice a y la lamina B son patrones de plegamiento comunes.  Los hélices se forman fácilmente en las estructuras biológicas.  Las laminas B forman estructuras rígidas centrales en muchas proteínas.
  • 5. ESTRUCTURA DE LAS PROTEINAS Estructura primaria  La estructura primaria de las proteínas hace referencia a la secuencia de aminoácidos que la componen, ordenados desde el primer aminoácido hasta el último. El primer aminoácido tiene siempre libre el grupo amina, por lo que se le da el nombre de aminoácido n-terminal. El último aminoácido siempre tiene libre el grupo carboxilo, por lo que se denomina aminoácido c- terminal.  Para determinar la secuencia no basta con saber los aminoácidos que componen la molécula; hay que determinar la posición exacta que ocupa cada aminoácido.  La estructura primaria determina las demás estructuras de la proteína. 
  • 6. ESTRUCTURA SECUNDARIA Estructura secundaria La estructura secundaria de una proteína es un nivel de organización que adquiere la molécula, dependiendo de cómo sea la secuencia de aminoácidos que la componen. La rigidez del enlace peptídico, la capacidad de giro de los enlaces establecidos con el carbono asimétrico y la interacción de los radicales de los aminoácidos con la disolución en la que se encuentra, lleva a plegar la molécula sobre sí misma. Las conformaciones resultantes pueden ser la estructura en a-hélice, la b-laminar a-hélice Es una estructura helicoidal dextrógira, es decir, que las vueltas de la hélice giran hacia la derecha. Adquieren esta conformación proteínas que poseen elevado número de aminoácidos con radicales grandes o hidrófilos, ya que las cargas interactúan con las moléculas de agua que la rodean.
  • 7. ESTRUCTURA SECUNDARIA b-laminar  También se denomina hoja plegada o lámina plegada.  Es una estructura en forma de zig- zag, forzada por la rigidez del enlace peptídico y la apolaridad de los radicales de los aminoácidos que componen la molécula. Se estabiliza creando puentes de Hidrógeno entre distintas zonas de la misma molécula, doblando su estructura. De este modo adquiere esa forma plegada.
  • 8. ESTRUCTURA TERCIARIA Estructura terciaria.  Resulta del plegamiento sobre sí misma de la estructura secundaria ,de la estructura terciaria depende la función de la proteína, por lo que cualquier cambio en la disposición de esta estructura puede provocar la pérdida de su actividad biológica.  La estructura terciaria es, por tanto, un conjunto de plegamientos característicos que se originan por la unión entre determinadas zonas de la cadena polipeptídica. Estas uniones se realizan por medio de enlaces entre las cadenas laterales de los aminoácidos.
  • 9. ESTRUCTURA CUATERNARIA Estructura cuaternaria  Cuando varias proteínas se unen entre sí, forman una organización superior, denominada estructura cuaternaria. Cada proteína componente de la asociación, conserva su estructura terciaria. La unión se realiza mediante gran número de enlaces débiles, como
  • 10. FUNCION DE LAS PROTEINAS Enzima: catálisis de la ruptura o formación de un enlace covalente. Proteínas estructurales: proporcionar soporte mecánico a las células y tejidos. Proteinas de transporte: transportar moleculas pequeñas o iones. Proteinas motoras: generar movimientos en las células y tejidos. Proteinas de deposito: almacenar pequeñas moléculas o iones. Proteinas de señalización: transmitir señales de una célula a la otra. Proteinas receptoras: detectar señales y transmitirlas a la maquinaria de respuesta de la célula.
  • 11. REGULACION DE LA FUNCION PROTEICA Dentro de la célula, la mayor parte de las proteínas y enzimas no trabajan continuamente, o con la velocidad máxima. Por el contrario, su actividad esta regulada de modo tal que la célula puede mantenerse a si misma en un estado de equilibrio, en el que solo genera aquellas moléculas que requiere para desarrollarse en forma adecuada bajo las condiciones comunes. Para alcanzar este equilibrio, las actividades de las proteínas celulares se controlan de un modo integrado teniendo en cuenta que reacciones se están produciendo en otras partes de la célula. Mediante la coordinación de cuando- y energéticamente una depleción de sus reservas energéticas por la acumulación de moléculas que no requiere mientras que esta agotando sus reservas de sustratos críticos.
  • 12. LAS ACTIVIDADES CATALITICAS DE LAS ENZIMAS SE REGULAN A MENUDO POR OTRAS MOLECULAS Regulación por otras moléculas: El tipo mas común de control se produce cuando otra molécula que no sea un sustrato se una a una enzima en un sitio regulatorio especial por fuera del sitio activo, lo cual altera la velocidad en la que la enzima convierte sus sustratos en productos. En la inhibición por retroalimentación, una enzima que actúa inicialmente en una vía de reacción es inhibida por uno de los productos finales de esta vía. La inhibición por retroalimentación es una regulación negativa: impide que una enzima actué. Las enzimas también pueden estar sujetas a regulación positiva, en la cual la actividad enzimática es
  • 13. LAS ENZIMAS ALOSTERICAS TIENEN DOS SITIOS DE UNION QUE SE INFLUYEN RECIPROCAMENTE Regulación por alosteria: Cuando esta forma de regulación se descubrió en la década de 1960, se la denomino alosteria. A medida que se aprendió mas acerca de la inhibición por retroalimentación, los investigadores se dieron cuenta de que muchas enzimas deben tener al menos dos sitios de unión diferentes sobre su superficie: el sitio activo que reconoce a los sustratos y un segundo sitio que reconoce a una molécula reguladora. Estos dos sitios deben comunicarse de una forma que permita que los procesos catalíticos en el sitio activo sean influidos por la unión de la molécula reguladora en un sitio separado de la superficie de la proteína. Durante la inhibición por retroalimentación, por ejemplo la unión de un inhibidor a un sitio sobre la proteína lleva a que esta cambie a una conformación en la que su sitio activo- localizado en otra parte de la molécula- llega a ser menos adaptado a la del sustrato. Muchas – si no todas- las moléculas proteicas son alostericas: pueden adoptar dos o mas conformaciones ligeramente diferentes, y su actividad es regulada por el cambio de una a otra forma.
  • 14. LA FOSFORILACION PUEDE CONTROLAR LA ACTIVIDAD PROTEICA MEDIANTE LA INDUCCION DE UN CAMBIO CONFORMACIONAL Regulación por fosforilación: Un segundo método utilizado con frecuencia por las células eucariontes para regular la actividad proteica implica la unión covalente de un grupo fosfato a una de sus cadenas laterales de aminoácidos. Puesto que cada grupo fosfato transporta dos cargas negativas, el agregado catalizado por la enzima de un grupo fosfato a una proteína puede causar un cambio conformacional fundamental, por ejemplo, atrayendo a un formacional puede, a su vez, afectar la unión de ligandos en otro lugar sobre la superficie de la proteína y modificar con ello la actividad de la proteína. La eliminación del grupo fosfato por una segunda enzima restablece la conformación original y repone la actividad inicial de la proteína. Esta fosforilación proteica reversible controla la actividad de muchos
  • 15. LAS PROTEINAS QUE UNEN GTP TAMBIEN SE REGULAN POR LA GANANCIA Y PERDIDA CICLICA DE UN GRUPO FOSFATO Regulación por ganancia y perdida cíclica de un grupo fosfato: Las células eucariotas tienen un segundo modo de regulación de la actividad de una proteína mediante el agregado y eliminación de un grupo fosfato. En este caso, en lugar de ser transferido enzimáticamente del ATP a la proteína, el fosfato es parte de un nucleótido de guanina- sea la guanosina trifosfato (GTP) o bien la guanosina difosfato (GDP)- que se une estrechamente a la proteína. Estas proteínas fijadoras de GTP están en sus conformaciones activas con GTP unido; la proteína misma hidroliza luego el GTP a GDP- con liberación de un fosfato- y cambia a una conformación inactiva. Como en el caso de la fosforilación proteica, este proceso es reversible. La conformación activa se recobra mediante la disociación del GDP, seguida de la unión de una
  • 16. LA HIDRÓLISIS DE LOS NUCLEOTIDOS PERMITE A LAS PROTEINAS MOTORAS PRODUCIR GRANDES MOVIMIENTOS EN LAS CELULAS Regulación por hidrólisis de nucleótidos: Como se utilizan los cambios de conformación de las proteínas para generar movimientos ordenados en las células? Como el movimiento direccional de una proteína hace un trabajo neto, las leyes de la termodinámica demandan que el movimiento utilice energía libre de alguna otra fuente, es decir la hidrólisis del ATP (de otro modo, la proteína podría utilizarse como una maquina de movimiento perpetuo). Por lo tanto, sin una entrada de energía, la molécula proteica solamente puede errar sin propósito. Como se llevan a cabo entonces los cambios conformacionales unidireccionales ? Para obligar al ciclo entero a orientarse en una dirección a grandes distancias, esta
  • 17. LAS PROTEINAS FORMAN A MENUDO GRANDES COMPLEJOS QUE FUNCIONAN COMO MAQUINARIAS PROTEICAS Regulación por maquinarias proteicas: Las células construyeron maquinarias proteicas capaces de llevar a cabo la mayor parte de las reacciones biológicas. Las células emplean maquinarias proteicas por la misma razón que el hombre invento los aparatos mecánicos y electrónicos: casi en cualquier tarea, las manipulaciones que están especial y temporalmente coordinadas mediante procesos ligados son mucho mas eficientes que con el uso secuencial de herramientas individuales. En la mayor parte de tales maquinarias proteicas la hidrólisis de nucleosidos trifosfatos unidos (ATP o GTP) conduce a una serie de cambios conformacionales ordenados en algunas de las subunidades proteicas, que permiten el ensamblado de proteínas para moverse coordinamente. De este modo, las enzimas apropiadas pueden dirigirse hacías las posiciones donde son necesarias para llevar a cabo reacciones sucesivas en serie, como en la síntesis de proteínas sobre un ribosoma ,donde un gran complejo multiproteico se mueve rápidamente a lo largo de este.