bioquimica

1. Enfermedades moleculares
 Cualquier enfermedad provocada por una anormalidad en una sola proteína,
normalmente una enzima. Este componente puede tener una estructura anormal
que lo hace funcionalmente menos eficiente o deletéreo para el organismo, o
puede tener una estructura normal, pero encontrarse en una cantidad reducida.

2. Anemia
 es debido a que su sangre no está transportando suficiente oxígeno al resto de su
cuerpo. La causa más común de anemia es no tener suficiente hierro. El cuerpo
necesita este mineral para producir hemoglobina. La hemoglobina es una proteína
rica en hierro que da a la sangre su color rojo y transporta oxígeno desde los
pulmones al resto del cuerpo.

3. Evolucion e ingeniería de proteinas
 En el "diseño racional" se introducen cambios en ciertos aminoácidos mediante
mutagenesis dirigida, basados en la hipótesis que algunos cambios específicos
causarán el efecto funcional buscado. Existen ocasiones que dichos cambios se
dan combinado dominios o motivos estructurales de distintas proteínas,
generando una proteína híbrida o quimera. Es un método sencillo y barato

4. Enzimas
 Catalizadores por excelencia
 Se unen a ligandos y facilitan la transformación especifica de la molecula

5. lisozima
 Enzima bactericida que impide infecciones y que está presente en numerosas
sustancias segregadas por los seres vivos

6. proteasas
 Las peptidasas o proteasas son enzimas que rompen los enlaces peptídicos de
las proteínas.

7. Serina proteinasa
 Funciones derivadas de la coagulación de la sangre
 Produccion de hormonas
 Digestion
 Fecundacion
 No hay parentescos con sus “hijas” pero se dice que son de un ancestro en
común
 Tripsina importantísima
 La tripsina tiene una hermana adoptiva: subtilisina

8. Cisteina proteinasa
 La serina y cisteína son parientes (al parecer uno es adoptado)
 Papaina y actinidina son las mas estudiadas
 Caspasas: cisteína proteinasas involucradas en la apoptosis

9. Carboxilo proteinasa
 Aspartato o proteínas acidas
 Pepsina gastricina y quimiosina intervienen en la digestión
 Producen cortes en algunas proteínas especificas
 retrovirus

10. Purificacion de proteinas
 Según la especie de proteínas estas pueden ser sintetizadas de manera diferente
 E.Coli produce unas 3,000 a cambio una celula de ser humano sintetizan a cerca
de 20,000

11. Como estudiar las propiedades de una
proteina
 Para estudiar una proteína es necesario purificarla
 Es decir:
 Separarla de las otras proteínas y demás componentes celulares
 Este proceso dura días y hasta semanas para conseguir miligramos de proteína
pura

12. Vida cotidiana
 La baceria E. coli y las levaduras
para panadería (Saccharomyces
cerevisiae) son debido a su alta
producción de biomasa

13. Metodos de obtencion
 Si la proteína se encuentra en el citoplasma su liberación requiere una ruptura de
celula
 En los humanos se utiliza la plasmolisis
 La plasmolisis no funciona con aquellas que poseen pared celular, como las
plantas y bacterias

14. Pureza de una proteina
 es necesario conocer la concentración total de la proteína y la concentración de la
proteína de interés
 La presencia de la proteína en particular es determinada por su función
 Las enzimas miden la velocidad de reactivo transformándolo en otro

15. Proteinas que no son enzimas, hormonas
y toxinas
 Esas se determinan por su efecto
 El cuerpo utiliza anticuerpos que son capaces de reconocer una proteína en
particular

16. En caso de no cuantificar
 La proteína de interés la pureza de la preparación se establece mediante el
numero de proteínas que se observan por electroforesis

17. Precipitacion selectiva

18.  La solubilidad de las proteínas depende de concenracion de sales,PH,
temperatura y polaridad del solvente
 La precipitación selectiva se utiliza de método de purificación

19. proceso
 Al agregar sal hasta una concetracion apenas menor a la necesaria para precipitar
la proteína de interés, muchas otras proteínas se precipitan y pueden eliminarse
por centrifugaion

20. CROMATOGRAFÍA
Proceso de una solución (fase móvil), percolada a través de una matriz porosa
o resina (fase estacionaria), retrasa el proceso móvil dependiendo de cada
cada soluto
• Cromatografía intercambio iónico
• Cromatografía de filtración en gel o exclusión molecular
• Cromatografía de afinidad
• Cromatografía en papel

21. Diálisis
Tipo de filtración en donde las moléculas se separan a través de una membrana
semipermeable ejemplo: Papel celofán

22. importancia
 Adenas de preservar las propiedades de la proteína una vez purificadas, ya que
las proteínas precipitadas por sulfato de amonio pueden permanecer en este
estado por meses y resuspenderse inmediatamente antes de su uso

23. ELECTROFORESIS
Es el proceso mediante el cual las proteínas
migran de acuerdo a su carga en un campo
eléctrico.
Se lleva a cabo en
un gel formado por
un polímero
entrecruzado que
actúa como tamiz,
disminuyendo la
migración de las
proteínas.
La malla es
continua.
Permite determinar
el número de
proteínas diferentes
en una preparación,
así como estimar el
peso molecular o el
PI.
Por lo que la
velocidad con la que
migran las proteínas
en gel disminuye al
aumentar su
tamaño.

24. ELECTROFORESIS EN GELES DE
POLIACRILAMIDA
El gel se coloca
en contacto con
dos
compartimientos
Que contienen
un amortiguador
con un pH más
alto que el PI.
Al aplicar la
corriente
Las proteínas
migran hacia en
ánodo
Y son separadas
por su carga y
masa.

27. ELECTROFORESIS
DESNATURALIZANTE
La solución con proteína
se hierve en presencia
de un colorante (Azul de
bromofenol)
Agentes reductores (β-
mercaptoetanol) .
Detergente SDS
Rompe los puentes
disulfuro
Desnaturaliza
completamente a la
proteína.
Cuando el colorante llega
al fondo del gel, la
corriente eléctrica se
interrumpe, el gen se
desmonta y se identifican
usando colorantes.
Coomasie
En promedio, se fija una
molécula de SDS por cada
dos aminoácidos.

28. ISOELECTROENFOQUE
Es la técnica que se utiliza para
determinar el PI de las proteínas.
El medio es un gel de poliacrilamida
que contiene una gradiente de pH,
formada por anfolitos, ácidos o bases
orgánicos de bajo pes molecular.
El gel contiene anfolitos con una pK
que abarca el intervalo que se desea
estudiar.

29. PRIMERA DIMENSIÓN
• Separa las proteínas
de acuerdo a su carga
(isoelectroenfoque)
SEGUNDA
DIMENSIÓN
• Separa las proteínas
en función del peso
molecular.
Con esta técnica es posible separar proteínas que tienen el
mismo peso molecular pero diferente PI o el mismo Pi,
pero diferente peso molecular.

31. Llevan a cabo la hidrólisis del enlace
peptídico con la ayuda de metales,
generalmente unidos a su sitio activo.
La subtilisina es una endopeptidasa,
cataliza la ruptura de enlaces
peptídicos no terminales.
Carboxipeptidasa
A: aminoácidos
hidrofóbicos
luminosos.
Carboxipeptidasa
B: residuos
básicos.
Carboxipeptidasa
A y B son
expopeptidasas.
Catalizan la
eliminación del
aminoácido situado
en el extremi
COOH del sustrato.

32. Zimógenos o
proenzimas
Tripsinógeno
Quimoitripsinógeno
Proelastasa
Tripsina
Tripsina e inhibidor
de tripsina de
páncreas de
bovino (BPTI).
Ascaris. Parásito
asociado a la
desnutrición que reside
en el intestino de los
seres humanos y cerdos.

33. DEGRADACIÓN Y
ENVEJECIMIENTO DE
PROTEÍNAS

34. El recambio es muy
importante ya que
permite que las células
modifiquen su cantidad
y tipo de proteínas.
La velocidad de síntesis
y degradación
determinan la
concentración y vida de
las proteínas
Degradación de
proteínas In vivo.
Susceptibilidad al
cambio químico.
Enzimas catalasa y la
superoxidación
dismutasa.
La triosafosfato
isomerasa (TPI):
Desaminación de un
par de un par de
asparaginas.

35. Proteínas
mitocondriales y
ribosómicas
Calpaínas
Ubiquitina, está
distribuida
ampliamente en los
eucariontes.

36. Promedio de
vida es de
minutos.
Arg, Lys,
Asp, Leu, o
Phe
Vida media es
mayor de 20
horas.
Met, Ser,
Ala, Thr,
Val o Gly