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Almacenamiento de
 microorganismos
     JUANDO
Métodos de preservación
     Diversidad y evolución, manejo de pacientes,
       investigación epidemiológica, y docencia.

• Corto tiempo=transferencia directa a subcultivos,
  inmersión en aceite, congelación a -20°C, secado,
  agua destilada.

• Largo tiempo= ultra-bajas temperaturas, liofilización.
Cortos periodos
        • Transferencia directa subcultivos=
Se trata de periódicos subcultivos a medios frescos,
                  es el mas usado.

 Laborioso, puede comprometer el perfil
  fenotípico de los m.o.
 Cada subcultivo aumenta la probabilidad de
  mutaciones con cambios en el m.o.
 Las mutaciones dependen frecuencia
  almacenamiento y medio usado (2-3 subcultivos)
Cortos periodos
• Mantenimiento del medio: ↓nutrientes↑ mutaciones ↑
  grado de nutrientes ↑ mayor replicación. (agua dest., trip.
  soya, medios nutritivos)

• Condiciones de almacenamiento: transferir a tubos tapa
  rosca en lugares adecuados sin cambios de temperatura(5-
  8°C) ↓ metabolismo ↑ viabilidad.

• Frecuencia de transferencia: cada laboratorio debe
  estandarizar sus técnicas (5-10 colonias)

• Control de calidad: no es necesario en cada transferencia
  pero debe hacerse periódicamente.
Cortos periodos
                      • Inmersión en aceite=
Método alternativo, añadir aceite mineral debidamente esterilizado al
  m.o. hongos y bacterias pueden durar de 2-3 años. No requiere
       frecuente transferencia. (mutaciones, contaminación)

                     • Congelación a -20°C=
     Pueden ser viables por 2-3 años, formación de cristales de
                  hielo, fluctuación electrolítica.

                           • Secado=
 Mohos y bacterias esporulados pueden ser secados. Suspensión 108
UFC/ml m.o inoculados en papel filtro, que se seca y se pone en viales
                       estériles. 4 años. CC
Largos periodos
Pueden ser costosos, menos laboriosos, menos
espacio, y reducen las chances de mutaciones.

         • Ultra-bajas temperaturas=
    Los m.o pueden mantenerse a -70°C, en
  congeladores electrónicos o con nitrógeno
  liquido. Chequeo y alarma son esenciales.
Largos periodos
• Almacenamiento de los viales: pueden ser usados
  tubos de plástico (poliuretano) o vidrio
  (borosilicato).


• Agentes crio-conservantes: protección durante el
  proceso, almacenamiento y descongelación
  (hongos, virus y bacterias)
a) Intracelular=glicerol, dimetil sulfoxido DMSO
b) Medio externo=skim milk, sorbitol, sacarosa…
Conservación de micobacterias
    M.O             Método       Crio-conservante     Temperatura     Duración
                almacenamiento
                Congelación        Skim milk            -20°C         3-5 años
micobacterias      Ultra-          Skim milk        -70°C ó -196°C    3-5 años
                congelación
                Liofilización      Skim milk             4°C         16-30 años
Largos periodos
• Preparación del m.o para congelación: se inocula en el
  medio adecuado, se incuba hasta la fase estacionaria,
  centrifugar, se retira el pull y se resuspende en 2-5ml caldo,
  añadir el crio-conservante, luego en la superficie del agar,
  con pipeta estéril alicuotar 0,2-0,5 ml.

• Método de congelación: se recomienda congelación lenta,
  1°C por minuto hasta -30°C. en NL congelar los viales -60°C
  1 h antes de introducir el m.o.

• Descongelación: es el puto critico para el daño (-40°C y -
  5°C) baño maría 35°C, transferir inmediatamente al medio
  adecuado, cambios de presión pueden producir explosión.
Largos periodos
                      • Liofilización=
                 método mas efectivo para
bacterias, levaduras, esporulados y virus. Reduce el riesgo
 de cristales intracelulares. Remoción del agua. ↑ gram
      positivos que gram negativos. Hasta 30 años.

  Espacio reducido, puede transportarse a temperatura
             ambiente por largas distancias.

    Combina congelación y deshidratación, primero
congelación (-60°C) y luego secado ↓ PA con aparato de
                         vacío.
• Almacenamiento de viales: se usan viales de vidrio doble o
  vidrio blando previamente esterilizados. Se pone silica gel
  en la parte inferior del vial exterior antes de insertar el vial
  interior y se acolcha con algodón. Puede ser sellado para
  mantener la presión atmosférica.

• Agentes crio-conservadores: los mas usados son skim milk
  (20% v/v) y sacarosa. (24% v/v queda a 12% v/v). Skim milk
  se alícuota en 5 ml y autoclava a 116°C.

• Preparación del m.o para liofilización: se requiere gran
  cantidad en la fase de crecimiento o estacionaria. ATCC 108
  UFC/ml a 1010 UFC/ml.
• Método de congelación-secado: cuando se usa la cámara, los viales con la
   suspensión de m.o son colocados en una capa dentro de un recipiente de
   acero inoxidable. El contenedor se pone en un congelador de bajas
   temperaturas -60°C por 1 hora.
Se transfiere a la cámara que contiene hielo seco y etil solvente celular
(BECTON) y se cubre con sello hermético al vacío, conectado a reservas de
hielo seco y bombas de vacío. (30 µm Hg por 18 horas) contaminación
cruzada 0.8-3.3%

• Almacenamiento: deben etiquetarse y guardarse en orden. No se
  recomienda almacenar a T° Amb, 4°C aceptable, -30 -60°C optimo.

• Reconstitución: se toman los viales de la parte superior, cubren con gaza
  para evitar explosión al ingreso de aire. Se inyectan 0.1-0.4 ml de medio
  enriquecido con pipeta Pasteur o jeringa, se agita y se disuelve, luego
  transferir a el medio de cultivo adecuado.
Nuevas tecnologías
• Tarjetas FTA para almacenamiento de ADN. Largos
  periodos, seguros, baratos y rápidos.




• Se impregna la tarjeta con buffer, radicales libres y proteínas
  desnaturalizadoras que lisan membrana de la cell, atrapan el ADN y
  protegen de la degradación.
• Viales, cristales de cerámica, crio conservación perlas

• http://www.plm-deaci.com/src/prods/18_tarjetas-fta.html
RESUMEN
                  Bacterias

Transferencias simples: algunos meses
Almacenamiento con aceite mineral: 1-2 años
Congelación a -20°C: 1-3 años
Congelación a -70°C: 1-10 años
N liq y liofilización: hasta 30 años
Almacenamiento de microorganismos

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Almacenamiento de microorganismos

  • 2. Métodos de preservación Diversidad y evolución, manejo de pacientes, investigación epidemiológica, y docencia. • Corto tiempo=transferencia directa a subcultivos, inmersión en aceite, congelación a -20°C, secado, agua destilada. • Largo tiempo= ultra-bajas temperaturas, liofilización.
  • 3. Cortos periodos • Transferencia directa subcultivos= Se trata de periódicos subcultivos a medios frescos, es el mas usado.  Laborioso, puede comprometer el perfil fenotípico de los m.o.  Cada subcultivo aumenta la probabilidad de mutaciones con cambios en el m.o.  Las mutaciones dependen frecuencia almacenamiento y medio usado (2-3 subcultivos)
  • 4. Cortos periodos • Mantenimiento del medio: ↓nutrientes↑ mutaciones ↑ grado de nutrientes ↑ mayor replicación. (agua dest., trip. soya, medios nutritivos) • Condiciones de almacenamiento: transferir a tubos tapa rosca en lugares adecuados sin cambios de temperatura(5- 8°C) ↓ metabolismo ↑ viabilidad. • Frecuencia de transferencia: cada laboratorio debe estandarizar sus técnicas (5-10 colonias) • Control de calidad: no es necesario en cada transferencia pero debe hacerse periódicamente.
  • 5. Cortos periodos • Inmersión en aceite= Método alternativo, añadir aceite mineral debidamente esterilizado al m.o. hongos y bacterias pueden durar de 2-3 años. No requiere frecuente transferencia. (mutaciones, contaminación) • Congelación a -20°C= Pueden ser viables por 2-3 años, formación de cristales de hielo, fluctuación electrolítica. • Secado= Mohos y bacterias esporulados pueden ser secados. Suspensión 108 UFC/ml m.o inoculados en papel filtro, que se seca y se pone en viales estériles. 4 años. CC
  • 6. Largos periodos Pueden ser costosos, menos laboriosos, menos espacio, y reducen las chances de mutaciones. • Ultra-bajas temperaturas= Los m.o pueden mantenerse a -70°C, en congeladores electrónicos o con nitrógeno liquido. Chequeo y alarma son esenciales.
  • 7. Largos periodos • Almacenamiento de los viales: pueden ser usados tubos de plástico (poliuretano) o vidrio (borosilicato). • Agentes crio-conservantes: protección durante el proceso, almacenamiento y descongelación (hongos, virus y bacterias) a) Intracelular=glicerol, dimetil sulfoxido DMSO b) Medio externo=skim milk, sorbitol, sacarosa…
  • 8. Conservación de micobacterias M.O Método Crio-conservante Temperatura Duración almacenamiento Congelación Skim milk -20°C 3-5 años micobacterias Ultra- Skim milk -70°C ó -196°C 3-5 años congelación Liofilización Skim milk 4°C 16-30 años
  • 9. Largos periodos • Preparación del m.o para congelación: se inocula en el medio adecuado, se incuba hasta la fase estacionaria, centrifugar, se retira el pull y se resuspende en 2-5ml caldo, añadir el crio-conservante, luego en la superficie del agar, con pipeta estéril alicuotar 0,2-0,5 ml. • Método de congelación: se recomienda congelación lenta, 1°C por minuto hasta -30°C. en NL congelar los viales -60°C 1 h antes de introducir el m.o. • Descongelación: es el puto critico para el daño (-40°C y - 5°C) baño maría 35°C, transferir inmediatamente al medio adecuado, cambios de presión pueden producir explosión.
  • 10. Largos periodos • Liofilización= método mas efectivo para bacterias, levaduras, esporulados y virus. Reduce el riesgo de cristales intracelulares. Remoción del agua. ↑ gram positivos que gram negativos. Hasta 30 años. Espacio reducido, puede transportarse a temperatura ambiente por largas distancias. Combina congelación y deshidratación, primero congelación (-60°C) y luego secado ↓ PA con aparato de vacío.
  • 11. • Almacenamiento de viales: se usan viales de vidrio doble o vidrio blando previamente esterilizados. Se pone silica gel en la parte inferior del vial exterior antes de insertar el vial interior y se acolcha con algodón. Puede ser sellado para mantener la presión atmosférica. • Agentes crio-conservadores: los mas usados son skim milk (20% v/v) y sacarosa. (24% v/v queda a 12% v/v). Skim milk se alícuota en 5 ml y autoclava a 116°C. • Preparación del m.o para liofilización: se requiere gran cantidad en la fase de crecimiento o estacionaria. ATCC 108 UFC/ml a 1010 UFC/ml.
  • 12.
  • 13. • Método de congelación-secado: cuando se usa la cámara, los viales con la suspensión de m.o son colocados en una capa dentro de un recipiente de acero inoxidable. El contenedor se pone en un congelador de bajas temperaturas -60°C por 1 hora. Se transfiere a la cámara que contiene hielo seco y etil solvente celular (BECTON) y se cubre con sello hermético al vacío, conectado a reservas de hielo seco y bombas de vacío. (30 µm Hg por 18 horas) contaminación cruzada 0.8-3.3% • Almacenamiento: deben etiquetarse y guardarse en orden. No se recomienda almacenar a T° Amb, 4°C aceptable, -30 -60°C optimo. • Reconstitución: se toman los viales de la parte superior, cubren con gaza para evitar explosión al ingreso de aire. Se inyectan 0.1-0.4 ml de medio enriquecido con pipeta Pasteur o jeringa, se agita y se disuelve, luego transferir a el medio de cultivo adecuado.
  • 14.
  • 15. Nuevas tecnologías • Tarjetas FTA para almacenamiento de ADN. Largos periodos, seguros, baratos y rápidos. • Se impregna la tarjeta con buffer, radicales libres y proteínas desnaturalizadoras que lisan membrana de la cell, atrapan el ADN y protegen de la degradación. • Viales, cristales de cerámica, crio conservación perlas • http://www.plm-deaci.com/src/prods/18_tarjetas-fta.html
  • 16. RESUMEN Bacterias Transferencias simples: algunos meses Almacenamiento con aceite mineral: 1-2 años Congelación a -20°C: 1-3 años Congelación a -70°C: 1-10 años N liq y liofilización: hasta 30 años