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Revisión de publicaciones
que involucran ACP y
Análisis de Cluster (K-
means)
Milza López
Definición de conceptos
•Análisis de componentes principales (ACP):
Transformación Lineal
Reducción de la dimensión de los datos
Selección de variables
•Análisis de Clúster->K-means
Análisis de conglomerados
Suma de cuadrados
No jerárquico
Número de grupos a Priori
PCA – A Powerful Method for Analyze Ecological Niches
Franc Janžekovič and Tone Novak
University of Maribor, Faculty of Natural Sciences and Mathematics, Department of
Biology, Maribor Sloveni
• Introducción:
-En ecología lidiar con grandes bases de datos
-Condensar datos de un fenómeno
multivariado
-Permite enfoque en características principales
-Uso relativamente fácil con herramientas
computacionales
Concepto de nicho ecológico
1. Hábitat como una presentación
multidimensional de condiciones del lugar
físico
2. Funcionamiento de un organismo en dentro
de su ambiente concreto (interacción: físico
y otros organismos)
3. Variables dentro del rango completo de
distribución del organismo (+ información
organismo-ambiente, nivel global)
Ordenación y ACP
• Ordenación: método de análisis multivariado,
uso en análisis exploratorio (no hay
modelamiento estadístico, suma de
características para mejor entendimiento).
• En ordenación los objetos se “ordenan” en
variables múltiples con valores. Objetos
similares más cerca.
• Técnicas como ACP, Análisis de correspondencia,
escalamiento multidimensional, análisis
canónico, redundancia, etc.
Nicho ambiental de tres especies de
Hymenoptera y 2 especies de arañas
• Variables consideradas: Distancia de la
entrada, distancia a la superficie, peso de
sección transversal, temperatura del aire,
humedad relativa del aire, temperatura del
suelo, humedad del sustrato.
• Variación sometida a ACP, diferencias entre
nichos===ANOVA
Resultados
• 9 variables= 9 Componentes principales
Resultados
Resultados y discusión
• Sólo considerar componentes que implican más del
5% de la varianza
• 92,5% de la varianza explicada
• Correlaciones entre CP y variables
Resultados y discusión
•Círculo de correlaciones
entre variables, pero
•Variables ecológicas no
necesariamente
independientes
•ACP no necesariamente
interpretable
•Ecologistas y biológos
atrapados en la Estadística
•ACP no puede lidiar con
relaciones no lineales
Conclusiones
• PCA: Herramienta poderosa para la
ordenación de variables ambientales en
ecología
• Provee medios para explicar la varianza
• Representa al nicho ecológico
• Salida dependiente de la entrada, nunca
cubrirá todas las dimensiones
• Conocimiento ecológico y biológico para
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Revisión de publicaciones que involucran acp y análisis cluster

  • 1. Revisión de publicaciones que involucran ACP y Análisis de Cluster (K- means) Milza López
  • 2. Definición de conceptos •Análisis de componentes principales (ACP): Transformación Lineal Reducción de la dimensión de los datos Selección de variables •Análisis de Clúster->K-means Análisis de conglomerados Suma de cuadrados No jerárquico Número de grupos a Priori
  • 3. PCA – A Powerful Method for Analyze Ecological Niches Franc Janžekovič and Tone Novak University of Maribor, Faculty of Natural Sciences and Mathematics, Department of Biology, Maribor Sloveni • Introducción: -En ecología lidiar con grandes bases de datos -Condensar datos de un fenómeno multivariado -Permite enfoque en características principales -Uso relativamente fácil con herramientas computacionales
  • 4. Concepto de nicho ecológico 1. Hábitat como una presentación multidimensional de condiciones del lugar físico 2. Funcionamiento de un organismo en dentro de su ambiente concreto (interacción: físico y otros organismos) 3. Variables dentro del rango completo de distribución del organismo (+ información organismo-ambiente, nivel global)
  • 5. Ordenación y ACP • Ordenación: método de análisis multivariado, uso en análisis exploratorio (no hay modelamiento estadístico, suma de características para mejor entendimiento). • En ordenación los objetos se “ordenan” en variables múltiples con valores. Objetos similares más cerca. • Técnicas como ACP, Análisis de correspondencia, escalamiento multidimensional, análisis canónico, redundancia, etc.
  • 6. Nicho ambiental de tres especies de Hymenoptera y 2 especies de arañas • Variables consideradas: Distancia de la entrada, distancia a la superficie, peso de sección transversal, temperatura del aire, humedad relativa del aire, temperatura del suelo, humedad del sustrato. • Variación sometida a ACP, diferencias entre nichos===ANOVA
  • 7. Resultados • 9 variables= 9 Componentes principales
  • 9. Resultados y discusión • Sólo considerar componentes que implican más del 5% de la varianza • 92,5% de la varianza explicada • Correlaciones entre CP y variables
  • 10. Resultados y discusión •Círculo de correlaciones entre variables, pero •Variables ecológicas no necesariamente independientes •ACP no necesariamente interpretable •Ecologistas y biológos atrapados en la Estadística •ACP no puede lidiar con relaciones no lineales
  • 11. Conclusiones • PCA: Herramienta poderosa para la ordenación de variables ambientales en ecología • Provee medios para explicar la varianza • Representa al nicho ecológico • Salida dependiente de la entrada, nunca cubrirá todas las dimensiones • Conocimiento ecológico y biológico para evitar artificios estadísticos