Este documento resume varios artículos que involucran análisis de componentes principales (ACP) y análisis de cluster (K-means). Explica los conceptos de ACP, K-means y nicho ecológico. Luego describe un estudio que usó ACP para analizar las diferencias en los nichos ambientales de cinco especies basándose en siete variables ambientales.
2. Definición de conceptos
•Análisis de componentes principales (ACP):
Transformación Lineal
Reducción de la dimensión de los datos
Selección de variables
•Análisis de Clúster->K-means
Análisis de conglomerados
Suma de cuadrados
No jerárquico
Número de grupos a Priori
3. PCA – A Powerful Method for Analyze Ecological Niches
Franc Janžekovič and Tone Novak
University of Maribor, Faculty of Natural Sciences and Mathematics, Department of
Biology, Maribor Sloveni
• Introducción:
-En ecología lidiar con grandes bases de datos
-Condensar datos de un fenómeno
multivariado
-Permite enfoque en características principales
-Uso relativamente fácil con herramientas
computacionales
4. Concepto de nicho ecológico
1. Hábitat como una presentación
multidimensional de condiciones del lugar
físico
2. Funcionamiento de un organismo en dentro
de su ambiente concreto (interacción: físico
y otros organismos)
3. Variables dentro del rango completo de
distribución del organismo (+ información
organismo-ambiente, nivel global)
5. Ordenación y ACP
• Ordenación: método de análisis multivariado,
uso en análisis exploratorio (no hay
modelamiento estadístico, suma de
características para mejor entendimiento).
• En ordenación los objetos se “ordenan” en
variables múltiples con valores. Objetos
similares más cerca.
• Técnicas como ACP, Análisis de correspondencia,
escalamiento multidimensional, análisis
canónico, redundancia, etc.
6. Nicho ambiental de tres especies de
Hymenoptera y 2 especies de arañas
• Variables consideradas: Distancia de la
entrada, distancia a la superficie, peso de
sección transversal, temperatura del aire,
humedad relativa del aire, temperatura del
suelo, humedad del sustrato.
• Variación sometida a ACP, diferencias entre
nichos===ANOVA
9. Resultados y discusión
• Sólo considerar componentes que implican más del
5% de la varianza
• 92,5% de la varianza explicada
• Correlaciones entre CP y variables
10. Resultados y discusión
•Círculo de correlaciones
entre variables, pero
•Variables ecológicas no
necesariamente
independientes
•ACP no necesariamente
interpretable
•Ecologistas y biológos
atrapados en la Estadística
•ACP no puede lidiar con
relaciones no lineales
11. Conclusiones
• PCA: Herramienta poderosa para la
ordenación de variables ambientales en
ecología
• Provee medios para explicar la varianza
• Representa al nicho ecológico
• Salida dependiente de la entrada, nunca
cubrirá todas las dimensiones
• Conocimiento ecológico y biológico para
evitar artificios estadísticos