La sobreinfección puede ocurrir durante el tratamiento de una infección y es potencialmente peligrosa, causada por la eliminación de la flora normal que inhibe otras infecciones. Se recomienda usar antibióticos específicos de espectro reducido y evitar su uso sin evidencia de infección. El uso incorrecto de antibióticos incluye usarlos para fiebres de origen desconocido, con una dosis incorrecta, sin información bacteriológica adecuada o de forma exclusiva para infecciones que no responden al tratamiento.