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Research Article


      Identification of Candida Species Associated with
Texto adicional Texto adicional
Texto Vulvovaginal Candidiasis by Multiplex PCR
      adicional texto adicional
Texto adicional texto adicional
     Mahnaz Mahmoudi Rad, Ameneh Sh Zafarghandi, Maryam Amel Zabihi,
     Mahkam Tavallaee and Yasaman Mirdamadi.



     Molecular Biology
     Students: Maria Teresa Obando Saenz
             John Sebastián Henao Espinosa
             2012
Introduction


   Vulvovaginal Candidiasis is a common infection. The prevalence of this
Texto adicional Texto adicional
   disease        is increasing because of different consequences like the
Texto adicional texto adicional
Texto adicional texto adicionalof
   extensive utilization            broad- spectrum antibiotics.
   Approximately, half the female population have Candida in the vaginal
   flora .This study is necessary to know the differentiation of diverse species
   of Candida, the improvements in molecular assay technology for
   identifying Candida species has overcome some types of limits during the
   last 2 years.
About Candida

•   The gender         Candida belong to the filum Ascomycota, subfilum
    Ascomycotina, class Ascomycetes, order Saccharomycetales and family
    saccharomycetaceae.
•    It includes average 154 species, where candida albicans is the most
    frequent species.
•   Candida is considerated like a normal part of the human flora.
•   It is the most frequent cause of human mycosis.
•   The gender candida can be found in the leaves, soil, flowers and water.
Vulvovaginal Candidiasis

•   It is the second cause most common of vaginal infection.
•   Higher prevalence in women aged 20-40
•   Risk Factors: Sexual relations, contraception, femenine hygiene products,
    antibiotics
•   Vulvovaginal candidiasis is easily treatable now, even with single-dose, but
    at times the symptoms can be confused with other diseases
PCR
•   Developed by Kary Mullis in the 1980´s.
•   The objective is the amplification of genes or a DNA fragment or indirectly
    through RNA, present in diverse mixtures of different sources

•   It is based on enzymatic in vitro amplification. It is the geometrical increase
    in the number of copies of a particular DNA sequence

•   Principles: - Double-stranded DNA denaturation in order to obtain single
                   strands of the DNA molecule
                 - Specific hybridization with an oligonucleotide ( primer ) of
                   single strands.
                 - Single strand replication by a DNA polymerase starting from
                    the oligonucleotide as a starter.
Relationship between PCR, Candida and Vulvovaginal Candidiasis


• Using techniques like PCR which can identify the nonalbicans species and
can report an exact result is very useful for choosing a specific disease
diagnosis and adecuated treatment
General Objective


•   The aim of this study was to identify different species of vaginal Candida
    isolates in an Iranian patient population by using of some multiplex PCR
    techniques
Materiales y métodos

•   Se hizo el muestreo dentro de la vagina con un hisopo estéril por el
    investigador y fue cultivado en un medio agar dextrosa sabouraud.

•   Participantes del estudio: mujeres con signos y síntomas de Candidiasis
    Vulvovaginal que fueron admitidas en el centro de ginecología del Hospital
    Educacional Mahdieh, Irán

•   Cada paciente fue evaluada solo una vez durante los dos años que duró el
    estudio

•   Los participantes que presentaron los signos menos de 4 veces durante el
    previo año fueron clasificados como no recurrentes.
• Materiales y métodos


• Los participantes que presentaron picazón vaginal y secreciones iguales o
mayor a 4 veces durante el año fueron considerados recurrentes


• La muestra fue recolectada de los 100 primeros pacientes Recurrentes y
de los 100 primeros pacientes No Recurrentes.

• De las 200 personas seleccionadas, fueron excluidas 25                 por
contaminación o porque no se observaba crecimiento de los hongos.

• Los pacientes formularon un cuestionario          con   respecto   a   sus
características demográficas y de comportamiento.
Materiales y métodos



•   Todos firmaron un consentimiento informado sobre el estudio que se iba a
    realizar y se protegió estrictamente la confidencialidad de ellas.

•   Las colonias de especies Candida también fueron identificadas por la
    formación del tubo germinativo en suero, producción de clamidosporas en
    CMA y absorción de carbohidratos usando el kit API 20C-AUX .

•   La extracción del DNA se hizo por medio de un kit para extracción de DNA

•   Se utilizaron varias pruebas PCR mediante la utilización de    un kit de
    mezcla de estas.
Materiales y métodos

•Los primers utilizados en esta reacción se sintetizaron en TAGC
(Berlín, Alemania) incluyendo primers universales (ITS1       [5´-
TCCGTAGGTGAACTTGCGG - 3´] and ITS2 [ 5´- GCTGCGTTCTTCATCGATGC -
3´]  y primers específicos para C. albicans ( CA3         [ 5´-
GGTTTGCTTGAAAGACGGGTAG        -3´]          y    CA4    [   5´-
AGTTTGAAGATATACGTGGTAG 3´] )

• Una porción conservada del DNAr 18s y del 28s fueron amplificadas
usando los primers ITS1 e ITS2

• El proceso de amplificación de PCR se llevó a cabo con un ciclador
térmico Eppendorf bajo las siguientes condiciones:

-Denaturación inicial ( 94°C, 3 min)
- 35 ciclor de denaturación ( 94°C, 1 min)
- Endurecimiento por calor y sucesivo enfriado (60°C, 1min)
- Extensión ( 72°C, 1 min )
Materiales y métodos

• Controles positivos fueron incluidos en cada experimento con PCR
y consitían en un cebador para cada Candida


• Dos bandas de DNA fueron correspondientes para C. albicans
mientras que una sola banda fue correspondiente para las otras
especies de Candida.

• Una evaluación de las diferentes especies de CVVR y NRVC
también se hizo.

• La estadística descriptiva, prueba de chi cuadrado y la correlación
de Spearman se utilizó para analizar los datos.

•Los productos de la PCR fueron analizados por electroforesis a través
de gel de agarosa (2%) que contiene Bromuro de Etidio
Resultados

•   No hubo diferencia significativa
    de edad entre NRVVC y
    RVVC, media de 32,4 años


•    Mujeres mayores tienen
    mayor prevalencia de ser
    infectadas con C. galbrata;
    que las mujeres jóvenes




                                       Correlation of participants’ age range and
                                       isolated C.glabrata.
Resultados


        Multiplex PCR using primers ITS1,
        ITS2, CA3, and CA4.
        -Lane 1: 50-bp DNA ladder.
        -Lane 2: negative control.
        -Lanes 3 to 8, 11 to 13 and 15 to 16:
        eleven clinical isolates.
        -Lane 9: mixed reference strains C.
        krusei     CBS573,      C.  albicans
        ATCC14053, and C. glabrata
        CBS2175
        -Lane 10: reference strain C.
        tropicalis CBS94, and
        -Lane 14: reference strain C.
        parapsilosis CBS2195.
Resultados


•   Infección por una especie de Candida 89.7%

•   Infección por más de una especie de Candida 10.3%

•   Hubo más prevalencia de C. albicans (65.1%) y C. glabrata (13.1%)

•   Infección mixta más frecuente por C. glabrata and C. albicans (5.7%)
Resultados



•   Pacientes con NRVVC tenían una sola especie de Candida (90.2%)

•   Pacientes con RVVC 89.7%

•   Los resultados que presentó la PCR múltiple coincidieron con los resultados
    de la prueba de tubo germinal y la producción clamidosporas en CMA y kit
    de API 20C-AUX.
Discussion
       AUTHOR                        STATEMENT                     YES OR NO
N.   M.     Tarini,   W. The multiplex PCR method is a highly         YES
Mardiastuti, F. Ibrahim, sensitive and specific technique based
A. Yasmon, and S.        on the results of the previous studies
Djauzi.


S. R. Fan, X. P. Liu,   The results of this study showed that         NO
and J. W. Li.           10.3% of participants were infected with
                        more than one species of Candida which
                        is a higher rate compared to the other
                        studies conducted in China
AUTHOR                            STATEMENT                    YES OR NO
S. R. Fan, X. P. Liu,         The first and second most common          YES
and J. W. Li, K. H. Abu-     isolated species in this study were C.
Elteen,       F.       I.    albicans and C. glabratawhich was in
Okungbowa, O. S.                 agreement with similar studies
Isikhuemhen, and A. P.                conducted worldwide
O. Dede.
K. H. Abu-Elteen, F. J.     The prevalence of other species had the     YES
Fleury, R. A. Falleiros      same pattern in our study as seen in
De P´adua, E.                           earlier findings
Guilhermetti, and T. I.
Estivalet Svidzinski.
Conclusions
•   Doctors have to use the best method for the patients, it has to be ethical,
    safe and useful for everybody
•   If PCR exam is useful to identify Candida species this assey is a good
    method to guide the treatment to patients with candidiasis
•   The candidiasis like a sexually transmitted disease can prevent without
    promiscuity
•   The study of other methods to identify Candida species is a possibility to find
    the best way, fast, effective, economic and optimal, this can be PCR
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  • 1. Research Article Identification of Candida Species Associated with Texto adicional Texto adicional Texto Vulvovaginal Candidiasis by Multiplex PCR adicional texto adicional Texto adicional texto adicional Mahnaz Mahmoudi Rad, Ameneh Sh Zafarghandi, Maryam Amel Zabihi, Mahkam Tavallaee and Yasaman Mirdamadi. Molecular Biology Students: Maria Teresa Obando Saenz John Sebastián Henao Espinosa 2012
  • 2. Introduction Vulvovaginal Candidiasis is a common infection. The prevalence of this Texto adicional Texto adicional disease is increasing because of different consequences like the Texto adicional texto adicional Texto adicional texto adicionalof extensive utilization broad- spectrum antibiotics. Approximately, half the female population have Candida in the vaginal flora .This study is necessary to know the differentiation of diverse species of Candida, the improvements in molecular assay technology for identifying Candida species has overcome some types of limits during the last 2 years.
  • 3. About Candida • The gender Candida belong to the filum Ascomycota, subfilum Ascomycotina, class Ascomycetes, order Saccharomycetales and family saccharomycetaceae. • It includes average 154 species, where candida albicans is the most frequent species. • Candida is considerated like a normal part of the human flora. • It is the most frequent cause of human mycosis. • The gender candida can be found in the leaves, soil, flowers and water.
  • 4. Vulvovaginal Candidiasis • It is the second cause most common of vaginal infection. • Higher prevalence in women aged 20-40 • Risk Factors: Sexual relations, contraception, femenine hygiene products, antibiotics • Vulvovaginal candidiasis is easily treatable now, even with single-dose, but at times the symptoms can be confused with other diseases
  • 5. PCR • Developed by Kary Mullis in the 1980´s. • The objective is the amplification of genes or a DNA fragment or indirectly through RNA, present in diverse mixtures of different sources • It is based on enzymatic in vitro amplification. It is the geometrical increase in the number of copies of a particular DNA sequence • Principles: - Double-stranded DNA denaturation in order to obtain single strands of the DNA molecule - Specific hybridization with an oligonucleotide ( primer ) of single strands. - Single strand replication by a DNA polymerase starting from the oligonucleotide as a starter.
  • 6. Relationship between PCR, Candida and Vulvovaginal Candidiasis • Using techniques like PCR which can identify the nonalbicans species and can report an exact result is very useful for choosing a specific disease diagnosis and adecuated treatment
  • 7. General Objective • The aim of this study was to identify different species of vaginal Candida isolates in an Iranian patient population by using of some multiplex PCR techniques
  • 8. Materiales y métodos • Se hizo el muestreo dentro de la vagina con un hisopo estéril por el investigador y fue cultivado en un medio agar dextrosa sabouraud. • Participantes del estudio: mujeres con signos y síntomas de Candidiasis Vulvovaginal que fueron admitidas en el centro de ginecología del Hospital Educacional Mahdieh, Irán • Cada paciente fue evaluada solo una vez durante los dos años que duró el estudio • Los participantes que presentaron los signos menos de 4 veces durante el previo año fueron clasificados como no recurrentes.
  • 9. • Materiales y métodos • Los participantes que presentaron picazón vaginal y secreciones iguales o mayor a 4 veces durante el año fueron considerados recurrentes • La muestra fue recolectada de los 100 primeros pacientes Recurrentes y de los 100 primeros pacientes No Recurrentes. • De las 200 personas seleccionadas, fueron excluidas 25 por contaminación o porque no se observaba crecimiento de los hongos. • Los pacientes formularon un cuestionario con respecto a sus características demográficas y de comportamiento.
  • 10. Materiales y métodos • Todos firmaron un consentimiento informado sobre el estudio que se iba a realizar y se protegió estrictamente la confidencialidad de ellas. • Las colonias de especies Candida también fueron identificadas por la formación del tubo germinativo en suero, producción de clamidosporas en CMA y absorción de carbohidratos usando el kit API 20C-AUX . • La extracción del DNA se hizo por medio de un kit para extracción de DNA • Se utilizaron varias pruebas PCR mediante la utilización de un kit de mezcla de estas.
  • 11. Materiales y métodos •Los primers utilizados en esta reacción se sintetizaron en TAGC (Berlín, Alemania) incluyendo primers universales (ITS1 [5´- TCCGTAGGTGAACTTGCGG - 3´] and ITS2 [ 5´- GCTGCGTTCTTCATCGATGC - 3´] y primers específicos para C. albicans ( CA3 [ 5´- GGTTTGCTTGAAAGACGGGTAG -3´] y CA4 [ 5´- AGTTTGAAGATATACGTGGTAG 3´] ) • Una porción conservada del DNAr 18s y del 28s fueron amplificadas usando los primers ITS1 e ITS2 • El proceso de amplificación de PCR se llevó a cabo con un ciclador térmico Eppendorf bajo las siguientes condiciones: -Denaturación inicial ( 94°C, 3 min) - 35 ciclor de denaturación ( 94°C, 1 min) - Endurecimiento por calor y sucesivo enfriado (60°C, 1min) - Extensión ( 72°C, 1 min )
  • 12. Materiales y métodos • Controles positivos fueron incluidos en cada experimento con PCR y consitían en un cebador para cada Candida • Dos bandas de DNA fueron correspondientes para C. albicans mientras que una sola banda fue correspondiente para las otras especies de Candida. • Una evaluación de las diferentes especies de CVVR y NRVC también se hizo. • La estadística descriptiva, prueba de chi cuadrado y la correlación de Spearman se utilizó para analizar los datos. •Los productos de la PCR fueron analizados por electroforesis a través de gel de agarosa (2%) que contiene Bromuro de Etidio
  • 13. Resultados • No hubo diferencia significativa de edad entre NRVVC y RVVC, media de 32,4 años • Mujeres mayores tienen mayor prevalencia de ser infectadas con C. galbrata; que las mujeres jóvenes Correlation of participants’ age range and isolated C.glabrata.
  • 14. Resultados Multiplex PCR using primers ITS1, ITS2, CA3, and CA4. -Lane 1: 50-bp DNA ladder. -Lane 2: negative control. -Lanes 3 to 8, 11 to 13 and 15 to 16: eleven clinical isolates. -Lane 9: mixed reference strains C. krusei CBS573, C. albicans ATCC14053, and C. glabrata CBS2175 -Lane 10: reference strain C. tropicalis CBS94, and -Lane 14: reference strain C. parapsilosis CBS2195.
  • 15. Resultados • Infección por una especie de Candida 89.7% • Infección por más de una especie de Candida 10.3% • Hubo más prevalencia de C. albicans (65.1%) y C. glabrata (13.1%) • Infección mixta más frecuente por C. glabrata and C. albicans (5.7%)
  • 16. Resultados • Pacientes con NRVVC tenían una sola especie de Candida (90.2%) • Pacientes con RVVC 89.7% • Los resultados que presentó la PCR múltiple coincidieron con los resultados de la prueba de tubo germinal y la producción clamidosporas en CMA y kit de API 20C-AUX.
  • 17. Discussion AUTHOR STATEMENT YES OR NO N. M. Tarini, W. The multiplex PCR method is a highly YES Mardiastuti, F. Ibrahim, sensitive and specific technique based A. Yasmon, and S. on the results of the previous studies Djauzi. S. R. Fan, X. P. Liu, The results of this study showed that NO and J. W. Li. 10.3% of participants were infected with more than one species of Candida which is a higher rate compared to the other studies conducted in China
  • 18. AUTHOR STATEMENT YES OR NO S. R. Fan, X. P. Liu, The first and second most common YES and J. W. Li, K. H. Abu- isolated species in this study were C. Elteen, F. I. albicans and C. glabratawhich was in Okungbowa, O. S. agreement with similar studies Isikhuemhen, and A. P. conducted worldwide O. Dede. K. H. Abu-Elteen, F. J. The prevalence of other species had the YES Fleury, R. A. Falleiros same pattern in our study as seen in De P´adua, E. earlier findings Guilhermetti, and T. I. Estivalet Svidzinski.
  • 19. Conclusions • Doctors have to use the best method for the patients, it has to be ethical, safe and useful for everybody • If PCR exam is useful to identify Candida species this assey is a good method to guide the treatment to patients with candidiasis • The candidiasis like a sexually transmitted disease can prevent without promiscuity • The study of other methods to identify Candida species is a possibility to find the best way, fast, effective, economic and optimal, this can be PCR