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LIGAMIENTO
      Y
RECOMBINACIÓN
TEORÍA CROMOSÓMICA DE LA
     HERENCIA (SUTTON 1903)
• Los genes estan situados en los
  cromosomas
• La ordenación de los mismos es lineal
• Al fenómeno genético de la
  recombinación le corresponde un
  fenómeno citológico de intercambio se
  segmentos cromosómicos
1910 MORGAN POSTULA EL CONCEPTO
        DE GENES LIGADOS


• Localizados en el mismo cromosoma

• Tienden a permanecer juntos y a no
  sufrir segregaciones en las sucesivas
  generaciones
W: estructura de pelo de "alambre", dominante sobre
w: textura de pelo liso
A: pigmentación normal de la piel, dominante sobre
a: falta de pigmentación o albinismo

FENOTIPO         Pelo alambre              Pelo liso
                 pigmentado                 albino

GENOTIPO           WW AA             X      ww aa

GAMETAS             WA                        wa

GENOTIPO F1                     Ww Aa

FENOTIPO F1              Pelo alambre, pigmentado
CRUZAMIENTO DE PRUEBA:

FENOTIPO   Pelo alambre   X   Pelo liso
           pigmentado           albino



GENOTIPO Ww Aa                ww aa
FILIAL 2

  GAMETAS          WA           Wa            wA           wa

      wa          WwAa         Wwaa         wwAa         wwaa

  FENOTIPO       ALAMBRE      ALAMBRE        LISO         LISO
               PIGMENTADO     ALBINO     PIGMENTADO      ALBINO


  PROPORC.         25%          25%          25%          25%



Esto sería en el caso de que W y A se transmitan independientemente
Transmisión independiente
D: BETA HEMOGLOBINA DIFUSA
d: BETA HEMOGLOBINA SIMPLE
C: COLOR SALVAJE
c: ALBINO

FENOTIPO Hb simple y color salvaje X Hb Difusa y albino

GENOTIPO              ddCC                  DDcc

GAMETAS               dC                     Dc

GENOTIPO F1                      DdCc

FENOTIPO F1                  Hemoglobina difusa y
                                   color salvaje
CRUZAMIENTO DE PRUEBA:

FENOTIPO Hb difusa y color salvaje x Hb
                  simple y color albino



GENOTIPO DdCc           x       ddcc
FILIAL 2

GAMETAS           DC           Dc          dC           dc

    dc          DdCc         Ddcc        ddCc         ddcc

FENOTIPO        Difuso        Difuso     Simple       Simple
                salvaje       albino     salvaje       albino


PROPORC.         1/40        22/40       15/40         2/40



Que ocurrió con las proporciones esperadas en la transmisión
independiente planteadas por Mendel?
FILIAL 2

GAMETAS        DC             Dc           dC             dc

   dc         DdCc          Ddcc         ddCc           ddcc

FENOTIPO      Difuso        Difuso       Simple      Simple albino
              salvaje       albino       salvaje


PROPORC.       1/40         22/40        15/40           2/40
           recombinantes   parentales   parentales   recombinantes
SIMPLE SALVAJE       X    DIFUSO ALBINO
     ddCC                     DDcc

      dC                        Dc


      d    C                    D c

                  DdCc

               difuso salvaje
D    c


     d   C

difuso salvaje
D     c


        d    C


D   c       GAMETAS PARENTALES
d   C

d   c       GAMETAS RECOMBINANTES

D   C
GENES LIGADOS EN FASE DE
       REPULSIÓN



        D   c


        d   C
GENES LIGADOS EN FASE DE
     ACOPLAMIENTO



         D   C


         d   c
FILIAL 2

GAMETAS        DC             Dc           dC             dc

   dc         DdCc          Ddcc         ddCc           ddcc

FENOTIPO      Difuso        Difuso       Simple      Simple albino
              salvaje       albino       salvaje


PROPORC.       1/40         22/40        15/40           2/40
           recombinantes   parentales   parentales   recombinantes
FRECUENCIAS Observadas
FRECUENCIA DE RECOMBINACIÓN (p)


FENOTIPOS RECOMBINANTES               3
                                  =
   TOTAL DE FENOTIPOS                 40

  p= 7.5 %
Frecuencias de recombinación Esperadas

GAMETAS
RECOMBINANTES
                       ½ P



 GAMETAS
                  ½ (1-p)
 PARENTALES
Frecuencias           Fase            Fase
Esperadas         acoplamiento      repulsión




PARENTALES      DC=1/2 (1-p)     Dc = 1/2 (1-p)
                dc = 1/2 (1-p)   dC = 1/2 (1-p)
RECOMBINANTES   Dc =1/2 (p)      DC=1/2(p)
                dC =1/2 (p)      dc=1/2(p)
MORGAN 1911 DESCUBRE QUE
 EXISTE UNA RELACIÓN LINEAL
 ENTRE LA FRECUENCIA DE
 RECOMBINACIÓN     Y     LA
 DISTANCIA ENTRE LOS GENES
 QUE SE ENCUENTRAN EN EL
 MISMO CROMOSOMA
PARA RELACIONAR LA DISTANCIA ENTRE LOS
 GENES CON LA FRECUENCIA DE RECOMBINACIÓN
 SE HA CREADO UNA MEDIDA:


UM= 1% frecuencia de
       recombinación

UNIDADES MORGAN= 100% frecuencia de
                      recombinación

1UM = 1cM= 1% frecuencia de recombinación
Frecuencia de recombinación para genes
   de beta hemoglobina y color de manto
 Es igual a 7,5%

1UM=1% frecuencia de recombinación
Estos genes se encuentran a 7,5 UM o cM

            D   c



           7.5 UM
recombinación



     50




                        distancia
                50 UM
Cuando p= 50 % =0.5
Gametas recombinantes= ½ p= ½ (0.5)
0.25
Gametas parentales = ½ (1-p)= ½ (1-0.5)
0.25

AUNQUE ESTEN EN EL MISMO
 CROMOSOMA (ligados) SE COMPORTAN
 COMO SI SE TRANSMITIERAN EN FORMA
 INDEPENDIENTE
Prueba de tres puntos


         A         C              B


              50 UM o más




Esto de que p: 0,5 ocurre cuando los genes están
         muy distantes a más de 50 UM
EN UN INDIVIDUO DIHIBRIDO

• CUANDO DOS GENES SE
  ENCUENTRAN EN DISTINTOS
  CROMOSOMAS (TRANSMISIÓN
  INDEPENDIENTE) PRODUCIRÁ
  CUATRO TIPOS DE GAMETAS
  IGUALMENTE PROBABLES : 25%
  PARA CADA UNA
EN UN INDIVIDUO DIHIBRIDO


CUANDO DOS GENES SE ENCUENTRAN EN
 EL MISMO CROMOSOMA SE DENOMINAN
 LIGADOS Y PRODUCIRÁ CUATRO TIPOS
 DE GAMETAS DEPENDIENDO DE LA FASE
 EN LA QUE SE ENCUENTRE, SIENDO

½ p GAMETAS RECOMBINANTES

 ½ 1-p GAMETAS PARENTALES
Frecuencias esperadas
CUANDO LA DISTANCIA ENTRE DOS
GENES TIENDE A CERO SE
DENOMINAN LIGADOS
TOTALMENTE .

 LA PROBABILIDAD DE
ENTRECRUZAMIENTOS TAMBIÉN
TIENDE A CERO POR LO TANTO
GENERARÁ SÓLO GAMETAS
PARENTALES
CUANDO LA DISTANCIA ENTRE DOS
GENES ES DE 50 UM O MAS SE
NECESITARÁ UN GEN MARCADOR
(PRUEBA DE TRES PUNTOS) PARA
SABER SI EXISTE LIGAMIENTO O
NO Y AVERIGUAR LA DISTANCIA.
Mapeo cromosómico. Mapa de ligamiento
Mapas para especies donde no se puede
   usar el Cruzamiento de prueba


 Hibridización in situ
 Secuenciación y armado de los mapas por
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Hoy en día lo más usado.
Hibridización in situ
Ensamble de genes en un Contig
Ligamiento Recombinación

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Ligamiento Recombinación

  • 1. LIGAMIENTO Y RECOMBINACIÓN
  • 2. TEORÍA CROMOSÓMICA DE LA HERENCIA (SUTTON 1903) • Los genes estan situados en los cromosomas • La ordenación de los mismos es lineal • Al fenómeno genético de la recombinación le corresponde un fenómeno citológico de intercambio se segmentos cromosómicos
  • 3. 1910 MORGAN POSTULA EL CONCEPTO DE GENES LIGADOS • Localizados en el mismo cromosoma • Tienden a permanecer juntos y a no sufrir segregaciones en las sucesivas generaciones
  • 4. W: estructura de pelo de "alambre", dominante sobre w: textura de pelo liso A: pigmentación normal de la piel, dominante sobre a: falta de pigmentación o albinismo FENOTIPO Pelo alambre Pelo liso pigmentado albino GENOTIPO WW AA X ww aa GAMETAS WA wa GENOTIPO F1 Ww Aa FENOTIPO F1 Pelo alambre, pigmentado
  • 5. CRUZAMIENTO DE PRUEBA: FENOTIPO Pelo alambre X Pelo liso pigmentado albino GENOTIPO Ww Aa ww aa
  • 6. FILIAL 2 GAMETAS WA Wa wA wa wa WwAa Wwaa wwAa wwaa FENOTIPO ALAMBRE ALAMBRE LISO LISO PIGMENTADO ALBINO PIGMENTADO ALBINO PROPORC. 25% 25% 25% 25% Esto sería en el caso de que W y A se transmitan independientemente
  • 8.
  • 9. D: BETA HEMOGLOBINA DIFUSA d: BETA HEMOGLOBINA SIMPLE C: COLOR SALVAJE c: ALBINO FENOTIPO Hb simple y color salvaje X Hb Difusa y albino GENOTIPO ddCC DDcc GAMETAS dC Dc GENOTIPO F1 DdCc FENOTIPO F1 Hemoglobina difusa y color salvaje
  • 10. CRUZAMIENTO DE PRUEBA: FENOTIPO Hb difusa y color salvaje x Hb simple y color albino GENOTIPO DdCc x ddcc
  • 11. FILIAL 2 GAMETAS DC Dc dC dc dc DdCc Ddcc ddCc ddcc FENOTIPO Difuso Difuso Simple Simple salvaje albino salvaje albino PROPORC. 1/40 22/40 15/40 2/40 Que ocurrió con las proporciones esperadas en la transmisión independiente planteadas por Mendel?
  • 12. FILIAL 2 GAMETAS DC Dc dC dc dc DdCc Ddcc ddCc ddcc FENOTIPO Difuso Difuso Simple Simple albino salvaje albino salvaje PROPORC. 1/40 22/40 15/40 2/40 recombinantes parentales parentales recombinantes
  • 13. SIMPLE SALVAJE X DIFUSO ALBINO ddCC DDcc dC Dc d C D c DdCc difuso salvaje
  • 14. D c d C difuso salvaje
  • 15. D c d C D c GAMETAS PARENTALES d C d c GAMETAS RECOMBINANTES D C
  • 16. GENES LIGADOS EN FASE DE REPULSIÓN D c d C
  • 17. GENES LIGADOS EN FASE DE ACOPLAMIENTO D C d c
  • 18. FILIAL 2 GAMETAS DC Dc dC dc dc DdCc Ddcc ddCc ddcc FENOTIPO Difuso Difuso Simple Simple albino salvaje albino salvaje PROPORC. 1/40 22/40 15/40 2/40 recombinantes parentales parentales recombinantes
  • 19. FRECUENCIAS Observadas FRECUENCIA DE RECOMBINACIÓN (p) FENOTIPOS RECOMBINANTES 3 = TOTAL DE FENOTIPOS 40 p= 7.5 %
  • 20. Frecuencias de recombinación Esperadas GAMETAS RECOMBINANTES ½ P GAMETAS ½ (1-p) PARENTALES
  • 21. Frecuencias Fase Fase Esperadas acoplamiento repulsión PARENTALES DC=1/2 (1-p) Dc = 1/2 (1-p) dc = 1/2 (1-p) dC = 1/2 (1-p) RECOMBINANTES Dc =1/2 (p) DC=1/2(p) dC =1/2 (p) dc=1/2(p)
  • 22. MORGAN 1911 DESCUBRE QUE EXISTE UNA RELACIÓN LINEAL ENTRE LA FRECUENCIA DE RECOMBINACIÓN Y LA DISTANCIA ENTRE LOS GENES QUE SE ENCUENTRAN EN EL MISMO CROMOSOMA
  • 23. PARA RELACIONAR LA DISTANCIA ENTRE LOS GENES CON LA FRECUENCIA DE RECOMBINACIÓN SE HA CREADO UNA MEDIDA: UM= 1% frecuencia de recombinación UNIDADES MORGAN= 100% frecuencia de recombinación 1UM = 1cM= 1% frecuencia de recombinación
  • 24. Frecuencia de recombinación para genes de beta hemoglobina y color de manto Es igual a 7,5% 1UM=1% frecuencia de recombinación Estos genes se encuentran a 7,5 UM o cM D c 7.5 UM
  • 25. recombinación 50 distancia 50 UM
  • 26. Cuando p= 50 % =0.5 Gametas recombinantes= ½ p= ½ (0.5) 0.25 Gametas parentales = ½ (1-p)= ½ (1-0.5) 0.25 AUNQUE ESTEN EN EL MISMO CROMOSOMA (ligados) SE COMPORTAN COMO SI SE TRANSMITIERAN EN FORMA INDEPENDIENTE
  • 27.
  • 28.
  • 29. Prueba de tres puntos A C B 50 UM o más Esto de que p: 0,5 ocurre cuando los genes están muy distantes a más de 50 UM
  • 30. EN UN INDIVIDUO DIHIBRIDO • CUANDO DOS GENES SE ENCUENTRAN EN DISTINTOS CROMOSOMAS (TRANSMISIÓN INDEPENDIENTE) PRODUCIRÁ CUATRO TIPOS DE GAMETAS IGUALMENTE PROBABLES : 25% PARA CADA UNA
  • 31. EN UN INDIVIDUO DIHIBRIDO CUANDO DOS GENES SE ENCUENTRAN EN EL MISMO CROMOSOMA SE DENOMINAN LIGADOS Y PRODUCIRÁ CUATRO TIPOS DE GAMETAS DEPENDIENDO DE LA FASE EN LA QUE SE ENCUENTRE, SIENDO ½ p GAMETAS RECOMBINANTES ½ 1-p GAMETAS PARENTALES Frecuencias esperadas
  • 32. CUANDO LA DISTANCIA ENTRE DOS GENES TIENDE A CERO SE DENOMINAN LIGADOS TOTALMENTE . LA PROBABILIDAD DE ENTRECRUZAMIENTOS TAMBIÉN TIENDE A CERO POR LO TANTO GENERARÁ SÓLO GAMETAS PARENTALES
  • 33.
  • 34. CUANDO LA DISTANCIA ENTRE DOS GENES ES DE 50 UM O MAS SE NECESITARÁ UN GEN MARCADOR (PRUEBA DE TRES PUNTOS) PARA SABER SI EXISTE LIGAMIENTO O NO Y AVERIGUAR LA DISTANCIA.
  • 35. Mapeo cromosómico. Mapa de ligamiento
  • 36. Mapas para especies donde no se puede usar el Cruzamiento de prueba  Hibridización in situ  Secuenciación y armado de los mapas por caminata cromosómica. Hoy en día lo más usado.
  • 38. Ensamble de genes en un Contig