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La Molécula de Agua en
Relación con las Biomoléculas
Una vez estudiado el tema relativo al
                agua deberías

•   Conocer:
     – Las propiedades básicas de la molécula de agua.
     – En qué condiciones se forman enlaces de hidrógeno.

•   Entender:
     – Por qué se produce el efecto hidrofóbico y qué son las interacciones de van
       der Waals.
     – La influencia que ejerce el agua, debido a sus propiedades, sobre las
       biomoléculas.
     – Por qué se forman espontáneamente las bicapas en un entorno acuoso.

•   Ser capaz de:
     – Predecir el pH de una disolución que contenga un ácido débil.
     – Preparar (teóricamente) una disolución que mantenga un valor de pH
       constante y conocido.
BIBLIOGRAFIA DEL TEMA:

• Capítulo 2 de "Bioquímica" por Mathews y
  van Holde (Ahern)

• Capítulo 2 de "Bioquímica" por Voet y Voet

• Captítulo 2 de “Principios de Bioquímica
  Lehninger" por Nelson y Cox
AGUA
     DISOLUCIONES REGULADORAS DE pH

1.   IMPORTANCIA DEL AGUA EN LOS SERES VIVOS.
2.   PROPIEDADES DEL AGUA.
3.   ESTRUCTURA DE LA MOLÉCULA DE AGUA.
•    ENLACES DE HIDRÓGENO. ESTRUCTURA DEL
     HIELO.
•    INTERACCIONES SOLUTO‑AGUA.
•    H2O COMO NUCLEÓFILO. REACCIONES DE
     HIDRÓLISIS.
•    DISOCIACIÓN DEL AGUA. SALTOS PROTÓNICOS.
El H2O cubre cerca del 71% de la superficie terrestre
1. IMPORTANCIA DEL AGUA EN
       LOS SERES VIVOS

 Constituye 60-90 % en peso de los seres vivos
 Disolvente de la mayoría de sustancias en los
 organismos
 Sus propiedades condicionan el
 comportamiento de las biomoléculas
 Participa en reacciones químicas (p.ej.
 hidrólisis, reacciones ácido-base...)
Las propiedades físicas del agua también
  son importantes para los seres vivos



• El agua puede actuar como:
  – Lubricante, facilitando movimientos
  – Agente protector frente a daños mecánicos
  – Regulador de la temperatura
El agua puede actuar como lubricante

 • Es el componente mayoritario del mucus, del líquido
      sinovial y otros fluidos con acción lubricante.
El agua puede actuar como
          agente protector
• El agua puede ser utilizada como protector de
  estructuras delicadas e importantes. Por ejemplo, el
  líquido cerebroespinal (o cefalorraquídeo),que es
  mayoritariamente agua, envuelve y amortigua los
  movimientos corporales bruscos, protegiendo al
  cerebro y a la médula espinal.

• El líquido amniótico envuelve y amortigua los
  movimientos bruscos del feto en el seno materno.
El agua como regulador de la
             temperatura
• El agua absorbe gran cantidad de energía sin que
  aumente su temperatura (elevado calor
  específico). Esto significa que se puede disipar
  calor (por ejemplo, el generado en el ejercicio
  muscular), manteniendo la temperatura constante.
• Si el calor generado es excesivo, se recurre a la
  evaporación del agua.
Algunas propiedades sorprendentes
            del agua
¿Cómo explicas que …




…El zapatero (Hydrometra stagnorum) pueda desplazarse sobre el agua?
¿Y que …




…El agua sobre determinadas superficies mantenga una disposición esférica?
Por otra parte, el agua tiene
un elevado punto de ebullición (100oC a nivel del mar)



        Punto de ebullición de algunos hidruros del grupo XVI


                   150
                              H2O
                   100
                    50                           H2Te
                     0              H2Se
                              H2S
           o
               C    -50
                   -100
                          0    40   80     120      160
                                     Peso molecular


                              ¡H2O debería estar aquí!
La densidad del H2O disminuye cuando se congela




      Fotografía del iceberg que supuestamente hundió al Titanic
               The only known photograph of the iceberg
                   believed to have sunk the Titanic
¿Cómo explicas que la densidad del agua cambie de una
         forma extraña con la temperatura?
Por otra parte, el agua pura no conduce la electricidad, pero
Fíjate en la elevada movilidad de los protones y de OH- en agua
          Movilidad iónicaa en H2O a 25°C.
En otras palabras,

2. EL AGUA PRESENTA VALORES ELEVADOS DE:
 2.1 TENSIÓN SUPERFICIAL

 2.2 CALOR DE VAPORIZACIÓN, (también de fusión y
  punto de ebullición)

 2.3 CONSTANTE DIELÉCTRICA

 2.4 MOVILIDAD DE H+
H 2O        Molécula de referencia




   Calor de fusión
                           80             16.7 para H2S
       (cal/g)



                                      32.6 metanol (H3COH)
   Cte. Dieléctrica        80                    ó
                                            1.9 hexano



                                           22.3 etanol
 Tensión superficial
                           72
       (dinas/cm)
                                          465 mercurio




Movilidad de protones                   51.9x10-5 para Na+
     (cm2 V-1 s-1)      362.4x10 -5
                                                ó
                                          40.1x10-5 Li+
…Para explicar estas propiedades del
agua es necesario conocer su estructura

3. ESTRUCTURA DE LA MOLÉCULA DE AGUA
La molécula de Agua posee enlaces Covalentes Polares

                       1S1




1S2 2S2 2P4
En la molécula de agua, dos orbitales contienen electrones sin compartir




El oxígeno forma orbitales híbridos SP3
La distribución de cargas es asimétrica en la molécula de agua




                                                                              el enlace O-H tiene
                                                                              un 33% de
                                                                              carácter iónico
Voet Biochemistry 3e Page 39
© 2004 John Wiley & Sons, Inc.




                                           Estructura de la molécula de agua.
                                     El O es mucho más electronegativo que el H
Al ser asimétrica la molécula de agua, se comporta como un dipolo




                                                  Tomada de
                                                  Lehninger Principles of Biochemistry
                                                  Nelson D.L. And Cox M.M..
             Estructura de la molécula de agua    3rd Ed. Worth Publishers
La molécula de agua es un dipolo
 en el que el átomo de oxígeno
posee densidad de carga negativa

 El agua es el disolvente mayoritario
    en los seres vivos: interacciona
  favorablemente con la mayoría de
           las biomoléculas.
4. ENLACES DE HIDRÓGENO:

una consecuencia de la estructura de
    algunas moléculas polares.
Dos moléculas
polares pueden
formar enlaces
de este tipo
entre sí,
al menos una,
contiene
hidrógeno, y la
otra posee pares
electrónicos sin
compartir
Los enlaces de hidrógeno:
• Son mucho más débiles que los enlaces covalentes
  (aprox. 4 Kcal/mol frente a aprox. 110 Kcal/mol)

• Suponen cierta compartición de electrones (10% de
  carácter covalente)

• Son direccionales (la geometría es importante)
•Los enlaces de hidrógeno explican la alta cohesión de las
moléculas de agua.

•En el agua líquida, cada molécula forma un promedio de
3.4 enlaces de hidrógeno
En la superficie del agua la resultante de las fuerzas atractivas
            es distinta que en el interior del líquido




Las moléculas de agua interaccionan de manera débil con las del aire
El agua posee elevado calor específico

 • Esta propiedad se debe a la gran cantidad de
   enlaces de hidrógeno que forma.
 • Esta propiedad nos ayuda a mantener la
   temperatura corporal constante. También
   disminuye las fluctuaciones de temperatura en
   nuestro planeta.

 Calor específico es la cantidad de calor necesaria para elevar en un grado
        la temperatura de un gramo de una sustancia determinada
La estructura del agua cambia
                cuando se forma hielo


     Mientras en el agua líquida la estructura fluctúa rápidamente
                  (vida media corta de cada enlace de H),
     en el hielo la estructura es más estable y abierta: menos densa

    http://web.educastur.princast.es/ies/salinas/recursos/Equimico.htm


http://sebbm.bq.ub.es/BioROM/contenido/biomodel/biomodel-misc/anim/agua/agua.html
Cada molécula de agua puede formar enlaces de hidrógeno con otras cuatro.

Esto ocurre en el hielo


                                                      Sin embargo, en el agua líquida
                                                      cada molécula se une por
                                                      término medio a otras 3.4




          Estructura básica del hielo: cada molécula de agua está enlazada
            de manera estable con otras cuatro, formando un tetraedro
Los enlaces de hidrógeno se forman
entre distintas biomoléculas polares y
entre éstas y el agua.


Todos estos enlaces son de gran
importancia tanto en la estructura como
en la función de la materia viva.
Salto protónico




                     La proximidad de
   Los saltos protónicos explican
                     moléculas de agua
   la elevada movilidad
                     Propicia los
   de los protones en agua

                     Saltos protónicos

Cada enlace tiene un momento dipolar μ que es una magnitud vectorial




                                                                              Tomada de
                                                                              Lehninger Principles of Biochemistry
                                                                              Nelson D.L. And Cox M.M..
                                                                              3rd Ed. Worth Publishers
“La electronegatividad es una medida de fuerza de atracción que ejerce un átomo sobre los electrones de otro, en un enlace químico”
Cada enlace tiene un momento dipolar μ que es una magnitud vectorial que depende de la diferencia
de electronegatividad entre los átomos. La intensidad del momento dipolar es μ = carga · distancia, la
dirección es la línea que une ambos átomos y el sentido va del menos electronegativo al más
electronegativo. Las unidades del momento dipolar en el S.I. son el coulombio por metro. Se suele
utilizar el debye (1 Debye = 3,34 .10-30 C·m)
En las moléculas que tienen más de un enlace, el momento dipolar total ∑μ depende del momento
dipolar de cada enlace μ y de la geometría de la molécula.




                 En el agua, el momento dipolar es de 1.85 debye
TIPO DE ENLACE                                ENERGÍA DE ENLACE (kcal/mol)


                                                    ENLACES DE VALENCIA PRIMARIOS

    Iónico, electrovalente, electropolar                                                      100 - 200

    Covalente, homopolar                                                                      50 - 150

                                                      FUERZAS INTERMOLECULARES

    Fuerzas ion-dipolo y de ion-dipolo inducido                                                1 - 10

    Fuerzas de van der Waals
•       Dipolo - dipolo (fuerza de Keesom)
•
                                                                                               1 - 10
        Dipolo- dipolo inducido (fuerza de Debye)
•       Dipolo inducido - dipolo inducido (fuerza de London)


Enlaces de hidrógeno
    Puentes de hidrógeno                                                                          6
•       O – H ·····O                                                                              2a3
•       C – H ·····O
•
                                                                                                  4a7
        O – H ·····N
•       N – H ·····O                                                                              2a3
•       F – H ·····F                                                                                7




            según la diferencia entre las electronegatividades se puede
determinar (convencionalmente) si el enlace será, según la escala de Linus Pauling:
                     Iónico (diferencia superior o igual a 1.8)
                   Covalente polar (diferencia entre 1.8 y 0.4)
                  Covalente no polar (diferencia inferior a 0.4)

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Propiedades del H2O y biomoléculas

  • 1. La Molécula de Agua en Relación con las Biomoléculas
  • 2. Una vez estudiado el tema relativo al agua deberías • Conocer: – Las propiedades básicas de la molécula de agua. – En qué condiciones se forman enlaces de hidrógeno. • Entender: – Por qué se produce el efecto hidrofóbico y qué son las interacciones de van der Waals. – La influencia que ejerce el agua, debido a sus propiedades, sobre las biomoléculas. – Por qué se forman espontáneamente las bicapas en un entorno acuoso. • Ser capaz de: – Predecir el pH de una disolución que contenga un ácido débil. – Preparar (teóricamente) una disolución que mantenga un valor de pH constante y conocido.
  • 3. BIBLIOGRAFIA DEL TEMA: • Capítulo 2 de "Bioquímica" por Mathews y van Holde (Ahern) • Capítulo 2 de "Bioquímica" por Voet y Voet • Captítulo 2 de “Principios de Bioquímica Lehninger" por Nelson y Cox
  • 4. AGUA DISOLUCIONES REGULADORAS DE pH 1. IMPORTANCIA DEL AGUA EN LOS SERES VIVOS. 2. PROPIEDADES DEL AGUA. 3. ESTRUCTURA DE LA MOLÉCULA DE AGUA. • ENLACES DE HIDRÓGENO. ESTRUCTURA DEL HIELO. • INTERACCIONES SOLUTO‑AGUA. • H2O COMO NUCLEÓFILO. REACCIONES DE HIDRÓLISIS. • DISOCIACIÓN DEL AGUA. SALTOS PROTÓNICOS.
  • 5. El H2O cubre cerca del 71% de la superficie terrestre
  • 6. 1. IMPORTANCIA DEL AGUA EN LOS SERES VIVOS Constituye 60-90 % en peso de los seres vivos Disolvente de la mayoría de sustancias en los organismos Sus propiedades condicionan el comportamiento de las biomoléculas Participa en reacciones químicas (p.ej. hidrólisis, reacciones ácido-base...)
  • 7. Las propiedades físicas del agua también son importantes para los seres vivos • El agua puede actuar como: – Lubricante, facilitando movimientos – Agente protector frente a daños mecánicos – Regulador de la temperatura
  • 8. El agua puede actuar como lubricante • Es el componente mayoritario del mucus, del líquido sinovial y otros fluidos con acción lubricante.
  • 9. El agua puede actuar como agente protector • El agua puede ser utilizada como protector de estructuras delicadas e importantes. Por ejemplo, el líquido cerebroespinal (o cefalorraquídeo),que es mayoritariamente agua, envuelve y amortigua los movimientos corporales bruscos, protegiendo al cerebro y a la médula espinal. • El líquido amniótico envuelve y amortigua los movimientos bruscos del feto en el seno materno.
  • 10. El agua como regulador de la temperatura • El agua absorbe gran cantidad de energía sin que aumente su temperatura (elevado calor específico). Esto significa que se puede disipar calor (por ejemplo, el generado en el ejercicio muscular), manteniendo la temperatura constante. • Si el calor generado es excesivo, se recurre a la evaporación del agua.
  • 12. ¿Cómo explicas que … …El zapatero (Hydrometra stagnorum) pueda desplazarse sobre el agua?
  • 13. ¿Y que … …El agua sobre determinadas superficies mantenga una disposición esférica?
  • 14. Por otra parte, el agua tiene un elevado punto de ebullición (100oC a nivel del mar) Punto de ebullición de algunos hidruros del grupo XVI 150 H2O 100 50 H2Te 0 H2Se H2S o C -50 -100 0 40 80 120 160 Peso molecular ¡H2O debería estar aquí!
  • 15. La densidad del H2O disminuye cuando se congela Fotografía del iceberg que supuestamente hundió al Titanic The only known photograph of the iceberg believed to have sunk the Titanic
  • 16. ¿Cómo explicas que la densidad del agua cambie de una forma extraña con la temperatura?
  • 17. Por otra parte, el agua pura no conduce la electricidad, pero Fíjate en la elevada movilidad de los protones y de OH- en agua Movilidad iónicaa en H2O a 25°C.
  • 18. En otras palabras, 2. EL AGUA PRESENTA VALORES ELEVADOS DE:  2.1 TENSIÓN SUPERFICIAL  2.2 CALOR DE VAPORIZACIÓN, (también de fusión y punto de ebullición)  2.3 CONSTANTE DIELÉCTRICA  2.4 MOVILIDAD DE H+
  • 19. H 2O Molécula de referencia Calor de fusión 80 16.7 para H2S (cal/g) 32.6 metanol (H3COH) Cte. Dieléctrica 80 ó 1.9 hexano 22.3 etanol Tensión superficial 72 (dinas/cm) 465 mercurio Movilidad de protones 51.9x10-5 para Na+ (cm2 V-1 s-1) 362.4x10 -5 ó 40.1x10-5 Li+
  • 20. …Para explicar estas propiedades del agua es necesario conocer su estructura 3. ESTRUCTURA DE LA MOLÉCULA DE AGUA
  • 21. La molécula de Agua posee enlaces Covalentes Polares 1S1 1S2 2S2 2P4
  • 22. En la molécula de agua, dos orbitales contienen electrones sin compartir El oxígeno forma orbitales híbridos SP3
  • 23. La distribución de cargas es asimétrica en la molécula de agua el enlace O-H tiene un 33% de carácter iónico Voet Biochemistry 3e Page 39 © 2004 John Wiley & Sons, Inc. Estructura de la molécula de agua. El O es mucho más electronegativo que el H
  • 24. Al ser asimétrica la molécula de agua, se comporta como un dipolo Tomada de Lehninger Principles of Biochemistry Nelson D.L. And Cox M.M.. Estructura de la molécula de agua 3rd Ed. Worth Publishers
  • 25. La molécula de agua es un dipolo en el que el átomo de oxígeno posee densidad de carga negativa El agua es el disolvente mayoritario en los seres vivos: interacciona favorablemente con la mayoría de las biomoléculas.
  • 26. 4. ENLACES DE HIDRÓGENO: una consecuencia de la estructura de algunas moléculas polares.
  • 27. Dos moléculas polares pueden formar enlaces de este tipo entre sí, al menos una, contiene hidrógeno, y la otra posee pares electrónicos sin compartir
  • 28. Los enlaces de hidrógeno: • Son mucho más débiles que los enlaces covalentes (aprox. 4 Kcal/mol frente a aprox. 110 Kcal/mol) • Suponen cierta compartición de electrones (10% de carácter covalente) • Son direccionales (la geometría es importante)
  • 29. •Los enlaces de hidrógeno explican la alta cohesión de las moléculas de agua. •En el agua líquida, cada molécula forma un promedio de 3.4 enlaces de hidrógeno
  • 30. En la superficie del agua la resultante de las fuerzas atractivas es distinta que en el interior del líquido Las moléculas de agua interaccionan de manera débil con las del aire
  • 31.
  • 32. El agua posee elevado calor específico • Esta propiedad se debe a la gran cantidad de enlaces de hidrógeno que forma. • Esta propiedad nos ayuda a mantener la temperatura corporal constante. También disminuye las fluctuaciones de temperatura en nuestro planeta. Calor específico es la cantidad de calor necesaria para elevar en un grado la temperatura de un gramo de una sustancia determinada
  • 33. La estructura del agua cambia cuando se forma hielo Mientras en el agua líquida la estructura fluctúa rápidamente (vida media corta de cada enlace de H), en el hielo la estructura es más estable y abierta: menos densa http://web.educastur.princast.es/ies/salinas/recursos/Equimico.htm http://sebbm.bq.ub.es/BioROM/contenido/biomodel/biomodel-misc/anim/agua/agua.html
  • 34. Cada molécula de agua puede formar enlaces de hidrógeno con otras cuatro. Esto ocurre en el hielo Sin embargo, en el agua líquida cada molécula se une por término medio a otras 3.4 Estructura básica del hielo: cada molécula de agua está enlazada de manera estable con otras cuatro, formando un tetraedro
  • 35. Los enlaces de hidrógeno se forman entre distintas biomoléculas polares y entre éstas y el agua. Todos estos enlaces son de gran importancia tanto en la estructura como en la función de la materia viva.
  • 36. Salto protónico La proximidad de Los saltos protónicos explican moléculas de agua la elevada movilidad Propicia los de los protones en agua Saltos protónicos Cada enlace tiene un momento dipolar μ que es una magnitud vectorial Tomada de Lehninger Principles of Biochemistry Nelson D.L. And Cox M.M.. 3rd Ed. Worth Publishers
  • 37. “La electronegatividad es una medida de fuerza de atracción que ejerce un átomo sobre los electrones de otro, en un enlace químico”
  • 38. Cada enlace tiene un momento dipolar μ que es una magnitud vectorial que depende de la diferencia de electronegatividad entre los átomos. La intensidad del momento dipolar es μ = carga · distancia, la dirección es la línea que une ambos átomos y el sentido va del menos electronegativo al más electronegativo. Las unidades del momento dipolar en el S.I. son el coulombio por metro. Se suele utilizar el debye (1 Debye = 3,34 .10-30 C·m) En las moléculas que tienen más de un enlace, el momento dipolar total ∑μ depende del momento dipolar de cada enlace μ y de la geometría de la molécula. En el agua, el momento dipolar es de 1.85 debye
  • 39. TIPO DE ENLACE ENERGÍA DE ENLACE (kcal/mol) ENLACES DE VALENCIA PRIMARIOS Iónico, electrovalente, electropolar 100 - 200 Covalente, homopolar 50 - 150 FUERZAS INTERMOLECULARES Fuerzas ion-dipolo y de ion-dipolo inducido 1 - 10 Fuerzas de van der Waals • Dipolo - dipolo (fuerza de Keesom) • 1 - 10 Dipolo- dipolo inducido (fuerza de Debye) • Dipolo inducido - dipolo inducido (fuerza de London) Enlaces de hidrógeno Puentes de hidrógeno 6 • O – H ·····O 2a3 • C – H ·····O • 4a7 O – H ·····N • N – H ·····O 2a3 • F – H ·····F 7 según la diferencia entre las electronegatividades se puede determinar (convencionalmente) si el enlace será, según la escala de Linus Pauling: Iónico (diferencia superior o igual a 1.8) Covalente polar (diferencia entre 1.8 y 0.4) Covalente no polar (diferencia inferior a 0.4)

Notas del editor

  1. La electronegatividad es una medida de fuerza de atracción que ejerce un átomo sobre los electrones de otro, en un enlace químico. Los diferentes valores de electronegatividad se clasifican según diferentes escalas, entre ellas la escala de Pauling y la escala de Mulliken. En general, los diferentes valores de electronegatividad de los átomos determinan el tipo de enlace que se formará en la molécula que los combina. Así, según la diferencia entre las electronegatividades de éstos se puede determinar (convencionalmente) si el enlace será, según la escala de Linus Pauling: Iónico (diferencia superior o igual a 1.8) Covalente polar (diferencia entre 1.8 y 0.4) Covalente no polar (diferencia inferior a 0.4) Cuanto más pequeño es el radio atómico , mayor es la energía de ionización y mayor la electronegatividad y viceversa.