Este documento describe tres casos de pacientes con enfermedad de Crohn que presentaban fístulas anales complejas. Se discuten dos estrategias para el tratamiento: un enfoque secuencial "step-up" o un enfoque quirúrgico inicial "top-down". Se presenta en detalle el caso de una paciente (CX001) que recibió tratamiento con células madre derivadas de grasa para cerrar sus fístulas, lo que tuvo éxito inicialmente pero requirió tratamientos de seguimiento.