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Universidad Nacional Autónoma de México
                  Centro de Ciencias Genómicas

                 Programa de Genómica Evolutiva
           Programa de Doctorado en Ciencias Biomédicas


       “Efecto de la composición lipídica en la
   localización de la maquinaria encargada de la
     replicación del ADN, la división celular y la
síntesis de pared celular en Sinorhizobium meliloti
                        1021”

Comité tutoral:                            Anteproyecto que presenta:

Dr. Miguel Ángel Cevallos
                                               Francisco Pedraza
Dr. Otto Geiger
                                                           López
Dr. José Luis Puente
Lemon and Grossman 2000
                                                        Localización
                                                            del
                                                         replisoma
E. coli


                                                         Localización
                                                         del divisoma


 Localización de                    Margolin, William, 2000
la maquinaria de
   síntesis de
     parded                             GFP-PbpH
                                                          . Scheffers and Pinho 2005
Matsumoto, Kouji et al., 2006
                                 Fluorescencia
                                 específica para
                                       PE
                                 Ro- biotinilado
                                  (Cinnamicina)                    Fluorescencia
E. coli                           Barak, Imrich et al., 2008
                                                                   específica para
                                                                 lípidos aniónicos
                                                                      (PG y CL)
                                                                       FM4-64


                                               B.
                                               subtillis
                                                                            E. coli
     B. subtillis
                                Fluorescencia
                                específica para
                                     CL                        Mileykovskaya and Dowhan, 2005
Objetivo General
• Sopesar el efecto que tiene la composición
  lipídica de la membrana en la determinación
  de la morfología celular y su estrecha
  relación con la localización de las
  maquinarias encargadas de la replicación, la
  división celular y la síntesis de pared
  celular, así como la consecuencia que tiene
  este efecto sobre el ciclo celular de la
  bacteria.

• Para ello usaremos una serie de mutantes
  que sabemos tienen una composición
  lipídica diferente y una morfología anómala y
  determinaremos la posición de estas
Sinorhizobium meliloti 1021

    Cromosoma
      3.65 Mb




      pSymb
     1.68 Mb




       pSymA
      1.35 Mb



                http://iant.toulouse.inra.fr/bacteria/annotation/cgi/rhime.cgi
Sinorhizobium meliloti 1021 como
                modelo

• Organismo que se puede manipular
  genéticamente.
• Se conoce la secuencia de su
  genoma.
• Presenta diferencias importantes con
  los modelos mejor estudiados
    • Diferente composición lipídica
    • Ausencia de MreB.
    • Localización de los origenes de replicación cercanos
      a los polos.
    • Presencia de una segunda proteína FtsZ
Sinorhizobium meliloti 1021 como
                modelo


• Se conocen bien las vías de síntesis de
  lípidos de membrana, incluyendo vías
  alternas para los principales fosfolípidos
  presentes en la membrana.

• Se cuentan con mutantes en estas vías
  (cambian proporciones y composiciones
  de lípidos)
S. meliloti 1021
                      CDP- diacilglicerol



                                                 Fosfatidil serina sintasa


                       Fosfatidil-serina


                                               Fosfatidil serina decarboxilasa


                     Fosfatidil Etanol-amina
  Fosfatidil
colina sintasa
                                                 Fosdatiidil metilo transferasa


                       Mono-metil- PE




                        Di-metil-PE




                     Fosfatidil Colina
Cepa       Mutación       Característica.       Composición de lípidos (%)


                          Membrana silvestre.
  1021       Ninguna        Componente
                            mayoritario PE




        ∆pss. Primer
       enzima de vía de Comopenente principal
 CS111  síntes de PC,     de membrana PG.
         por medio de    Ausencia de PS y PE
             PE.


      ∆psd. Segunda
                       Comopenente principal
      enzima de la vía
                         de membrana PC.
MAV01 de síntesis de      Ausencia de PE y
      PC por medio de
                        presencia al ta de PS
           PE.

          ∆pmtA;∆pcs
         Tercer enzima
           de la vía de Componente pricipal de
OG10017 síntesis de PC, membrana. Ausencia
        por medio de PE       de PC
         y única enzima
        de la vía directa.
Vías de síntesis de
    CDP- diacilglicerol

                                       Cardiolipina
                     Fosfatidil glicerol-fosfato sintasa


                                                           Smc02134
Fosfatidilglicerol-Fosfato
                                                                          ¿¿¿???

                 Fosfatidil glicerol-fosfato Fosfatasa




 Fosfatidil Glicerol
                                                           Cardiolipina

                                                                          Cardiolipina
                          Cardiolipina sintasa


      Cardiolipina
Cepa       Mutación        Características.       Composición de lípidos (%)


                           Membrana silvestre.
 1021       Ninguna          Componente
                             mayoritario PE



                ∆cls
              Enzima          Componente
 QN8      encargada de la mayoritario PE. CL se
         síntesis de CL en reduce en un 50%
        la vía conservada.



        ∆Smc02134
                          Componente
      Gen involucrado
MAV03                 mayoritario PE. CL se
        en la vía de
                       reduce en un 50%
       síntesis de CL


     ∆cls; ∆Smc02134
      Mutante en dos
                            Componente
     de las tres vías de
MAV04 síntesis de CL mayoritario PC. CL se
                         reduce en un 25%
      descritas en S.
       meliloti 1021
Objetivos particulares

• Construir una serie de fusiones traduccionales e
  inducibles con la proteína GFP y proteínas pertenecientes
  al: I) dividosoma (proteínas FtsZ1 y FtsZ2); II) al replisoma
  (subunidades α y τ de la PolIII), y III) la maquinaria
  encargada de la síntesis de la síntesis de pared celular (la
  proteína FtsI).

• Generar mutaciones sobre los genes de FtsZ1, FtsZ2, α y τ
  , dentro de la cepa silvestre y complementarlas con las
  fusiones previamente realizadas para determinar que las
  fusiones con GFP son funcionales.
Objetivos particulares

• Determinar la posición que guardan las proteínas de
  fusión dentro de la célula en los 7 fondos genéticos.

• Determinar la presencia y la posición de los dominios
  lipídicos enriquecidos en algunos fosfolípidos con
  colorantes específicos, NAO para la cardiolipina, Ro
  09-0198 (Cinnamycina) para la fosfatidiletanolamina, y
  FM4-64 para los fosfolípidos aniónicos, en cada uno
  en los 7 diferentes fondos genéticos.

• Determinar si existe una correlación entre la
  presencia de los dominios enriquecidos de
  fosfolípidos y la posición de las proteínas de fusión
  antes listadas, en los 7diferentes fondos genéticos.
Estrategia metodológica
Fusiones traduccionales
              EGFP

                        Características
FtsZ1         EGFP      del plásmido:

 FtsZ2        EGFP      De bajo número
                        de copias
                        Promotor
α             EGFP
                        constituvo o
                        inducible
    τ         EGFP
                        Marcador de
                        selección
FtsI          EGFP
Análisis de las
         construcciones
• Determinar que las fusiones se
  expresen
• Verificar que las fusiones puedan
  ser detectadas por medio de
  microscopía de fluorescencia.
• Comprobar que el ciclo celular no se
  afecte
• Verificar que la morfología de las
  diferentes cepas de bacterias no se
  afecte.
Complemento de las
  construcciones     KmR
Localización de las proteínas de
                  fusión    Kahng and Shapiro et al., 2003

                                         Orígenes de replicación
                                             del cromosoma
             A


                               B

           T
Localización relativa de las


                                   Longitud de la
                                   célula en µm.
        proteínas
    A                  B
    T                  T
Tinción específica para
      fosfolípidos

               10- NAO




FM4-64




               Ro 09-0198
               (Cinnamycina)
Evidencia previa.
Localización de la subunidad
alfa en la cepa silvestre 1021




                     α- GFP
   GFP
Localización de la subunidad
alfa en la cepa mutante CS111




   GFP              α-GFP
Localización de la subunidad
alfa en la cepa mutante MAV01




                    α-GFP
    GFP
Localización de la subunidad
alfa en la cepa mutante OG10017




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  • 1. Universidad Nacional Autónoma de México Centro de Ciencias Genómicas Programa de Genómica Evolutiva Programa de Doctorado en Ciencias Biomédicas “Efecto de la composición lipídica en la localización de la maquinaria encargada de la replicación del ADN, la división celular y la síntesis de pared celular en Sinorhizobium meliloti 1021” Comité tutoral: Anteproyecto que presenta: Dr. Miguel Ángel Cevallos Francisco Pedraza Dr. Otto Geiger López Dr. José Luis Puente
  • 2. Lemon and Grossman 2000 Localización del replisoma E. coli Localización del divisoma Localización de Margolin, William, 2000 la maquinaria de síntesis de parded GFP-PbpH . Scheffers and Pinho 2005
  • 3. Matsumoto, Kouji et al., 2006 Fluorescencia específica para PE Ro- biotinilado (Cinnamicina) Fluorescencia E. coli Barak, Imrich et al., 2008 específica para lípidos aniónicos (PG y CL) FM4-64 B. subtillis E. coli B. subtillis Fluorescencia específica para CL Mileykovskaya and Dowhan, 2005
  • 4. Objetivo General • Sopesar el efecto que tiene la composición lipídica de la membrana en la determinación de la morfología celular y su estrecha relación con la localización de las maquinarias encargadas de la replicación, la división celular y la síntesis de pared celular, así como la consecuencia que tiene este efecto sobre el ciclo celular de la bacteria. • Para ello usaremos una serie de mutantes que sabemos tienen una composición lipídica diferente y una morfología anómala y determinaremos la posición de estas
  • 5. Sinorhizobium meliloti 1021 Cromosoma 3.65 Mb pSymb 1.68 Mb pSymA 1.35 Mb http://iant.toulouse.inra.fr/bacteria/annotation/cgi/rhime.cgi
  • 6. Sinorhizobium meliloti 1021 como modelo • Organismo que se puede manipular genéticamente. • Se conoce la secuencia de su genoma. • Presenta diferencias importantes con los modelos mejor estudiados • Diferente composición lipídica • Ausencia de MreB. • Localización de los origenes de replicación cercanos a los polos. • Presencia de una segunda proteína FtsZ
  • 7. Sinorhizobium meliloti 1021 como modelo • Se conocen bien las vías de síntesis de lípidos de membrana, incluyendo vías alternas para los principales fosfolípidos presentes en la membrana. • Se cuentan con mutantes en estas vías (cambian proporciones y composiciones de lípidos)
  • 8. S. meliloti 1021 CDP- diacilglicerol Fosfatidil serina sintasa Fosfatidil-serina Fosfatidil serina decarboxilasa Fosfatidil Etanol-amina Fosfatidil colina sintasa Fosdatiidil metilo transferasa Mono-metil- PE Di-metil-PE Fosfatidil Colina
  • 9. Cepa Mutación Característica. Composición de lípidos (%) Membrana silvestre. 1021 Ninguna Componente mayoritario PE ∆pss. Primer enzima de vía de Comopenente principal CS111 síntes de PC, de membrana PG. por medio de Ausencia de PS y PE PE. ∆psd. Segunda Comopenente principal enzima de la vía de membrana PC. MAV01 de síntesis de Ausencia de PE y PC por medio de presencia al ta de PS PE. ∆pmtA;∆pcs Tercer enzima de la vía de Componente pricipal de OG10017 síntesis de PC, membrana. Ausencia por medio de PE de PC y única enzima de la vía directa.
  • 10. Vías de síntesis de CDP- diacilglicerol Cardiolipina Fosfatidil glicerol-fosfato sintasa Smc02134 Fosfatidilglicerol-Fosfato ¿¿¿??? Fosfatidil glicerol-fosfato Fosfatasa Fosfatidil Glicerol Cardiolipina Cardiolipina Cardiolipina sintasa Cardiolipina
  • 11. Cepa Mutación Características. Composición de lípidos (%) Membrana silvestre. 1021 Ninguna Componente mayoritario PE ∆cls Enzima Componente QN8 encargada de la mayoritario PE. CL se síntesis de CL en reduce en un 50% la vía conservada. ∆Smc02134 Componente Gen involucrado MAV03 mayoritario PE. CL se en la vía de reduce en un 50% síntesis de CL ∆cls; ∆Smc02134 Mutante en dos Componente de las tres vías de MAV04 síntesis de CL mayoritario PC. CL se reduce en un 25% descritas en S. meliloti 1021
  • 12. Objetivos particulares • Construir una serie de fusiones traduccionales e inducibles con la proteína GFP y proteínas pertenecientes al: I) dividosoma (proteínas FtsZ1 y FtsZ2); II) al replisoma (subunidades α y τ de la PolIII), y III) la maquinaria encargada de la síntesis de la síntesis de pared celular (la proteína FtsI). • Generar mutaciones sobre los genes de FtsZ1, FtsZ2, α y τ , dentro de la cepa silvestre y complementarlas con las fusiones previamente realizadas para determinar que las fusiones con GFP son funcionales.
  • 13. Objetivos particulares • Determinar la posición que guardan las proteínas de fusión dentro de la célula en los 7 fondos genéticos. • Determinar la presencia y la posición de los dominios lipídicos enriquecidos en algunos fosfolípidos con colorantes específicos, NAO para la cardiolipina, Ro 09-0198 (Cinnamycina) para la fosfatidiletanolamina, y FM4-64 para los fosfolípidos aniónicos, en cada uno en los 7 diferentes fondos genéticos. • Determinar si existe una correlación entre la presencia de los dominios enriquecidos de fosfolípidos y la posición de las proteínas de fusión antes listadas, en los 7diferentes fondos genéticos.
  • 15. Fusiones traduccionales EGFP Características FtsZ1 EGFP del plásmido: FtsZ2 EGFP De bajo número de copias Promotor α EGFP constituvo o inducible τ EGFP Marcador de selección FtsI EGFP
  • 16. Análisis de las construcciones • Determinar que las fusiones se expresen • Verificar que las fusiones puedan ser detectadas por medio de microscopía de fluorescencia. • Comprobar que el ciclo celular no se afecte • Verificar que la morfología de las diferentes cepas de bacterias no se afecte.
  • 17. Complemento de las construcciones KmR
  • 18. Localización de las proteínas de fusión Kahng and Shapiro et al., 2003 Orígenes de replicación del cromosoma A B T Localización relativa de las Longitud de la célula en µm. proteínas A B T T
  • 19. Tinción específica para fosfolípidos 10- NAO FM4-64 Ro 09-0198 (Cinnamycina)
  • 21. Localización de la subunidad alfa en la cepa silvestre 1021 α- GFP GFP
  • 22. Localización de la subunidad alfa en la cepa mutante CS111 GFP α-GFP
  • 23. Localización de la subunidad alfa en la cepa mutante MAV01 α-GFP GFP
  • 24. Localización de la subunidad alfa en la cepa mutante OG10017 α- GFP GFP