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Andrea Bonelli
 Neiry Briceño
Enzimas de restricción.
o Cortan las cadenas de ADN en sitios específicos.
o Son enzimas defensivas, protegen el ADN de los
 huéspedes bacterianos de otros mo extraños.
Enzimas de restricción.
 Reciben su nombre a partir de la bacteria de la cual
  fueron aisladas. Ejemplo: EcoRI
 Cada enzima puede reconocer y separar una secuencia
  especifica de ADN de tira doble de 4 a 7 pb.
 Los cortes de ADN pueden producir extremos romos o
  extremos adherentes o cohesivos.




       Los extremos adherentes son muy útiles a la hora de construir
                      moléculas hibridas de ADN.
Enzimas de restricción.
 Frecuencia con la que una enzima escindirá una molécula
  de ADN: 4 (nºde pb`s).


                         Importancia:
  Poseen gran especificidad de reconocimiento de una secuencia
   corta de ADN dúplex y la subsiguiente hidrólisis de un enlace
  fosfodiester en cada hebra. Los fragmentos originados son útiles
  para iniciar la clonación celular o acelular y la creación de mapas
                            de restricción.
Tipos de enzimas de
                     restricción.
Endonucleasas de restricción               Tipo I                             Tipo II                             Tipo III

                                Endonucleasa y metilasa en                                           Endonucleasa y metilasa en una
                                                                  Endonucleasa (metilasa en una
   Actividad enzimática        una misma proteína (distintas                                            misma proteína (distintas
                                                                     proteína independiente)
                                      subunidades)                                                           subunidades)

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                                  sitio de reconocimiento                 reconocimiento                      reconocimiento


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                                                                    reconocimiento. En ambas
                                          hebras                                                                 hebra
                                                                              hebras

         Ejemplos                       Eco k, Eco B                       Numerosos                         Eco PI, Eco P15
Papel biológico de sistema
    metilación- restricción.
 Por cada enzima de restricción, una metilasa reconoce
 la misma secuencia que forma parte del sistema de
 restricción y une de manera covalente grupos metilo a
 bases de esa secuencia.
Papel biológico de sistema
    metilación- restricción.

 El ADN de la bacteria se metila de forma especifica.
 La metilación impide la unión de la enzima de
  restricción (El ADN no es hidrolizado).
 Al entrar en la célula ADN de otro organismo, este
  ADN puede ser degradado por la ER.
 Las nucleasas restringen la posibilidad de infección
  por virus.
Papel biológico de sistema
     metilación- restricción.

 Si 1 sola hebra de ADN esta metilada, la ER           no
  reconoce el sitio. La metilasa añade el grupo metilo a la
  otra hebra.
 Afecta principalmente a citosinas y adeninas.
 Las metilasas utilizan como donador a S-
  adenosilmetionina.
 Este mecanismo regula la expresión génica, en
  eucariotas.
Acción de las enzimas de
      restricción de tipo II.

 Funcionan a manera de tijeras para el corte del ADN. El
  sitio de restricción es también el lugar de
  reconocimiento e hidrólisis.
 Se hidrolizan enlaces fosfoèster del ADN, uno en cada
  hebra, generando 2 segmentos de restricción. Quedan
  fragmentos 3’OH y 5’P.
ADN ligasas.
 Los fragmentos generados con una misma restrictasa a
  partir de ADN’s distintos se aparean por medio de sus
  extremos cohesivos a partir de ADN ligasas.
 Las ligasas forman el enlace fosfodiester que falta,
  consumiendo energía.
Proceso general para la clonación
           de genes
 Comprende siete pasos:
   Preparación del inserto de ADN.
   Preparación del vector de clonación.
   Formación de la molécula de ADN recombinante.
   Incorporación del ADN recombinante a la célula
    anfitriona.
   Propagación del cultivo.
   Detección y selección de los clones recombinantes.
   Expresión génica.
1.-Preparacion del inserto de ADN
 Lisis de células,(suspensión o centrifugación).

 Se eliminan proteínas, enzimas o fragmentos
 proteolíticos y se precipita y se concentra el ADN.

 Se fragmenta con endonucleasas de restricción.

 Los fragmentos son aislados:

   ADN vírico o de un plásmido, electroforesis en gel de agarosa.
   ADN genómico, un fragmento de ADN marcado con 32P, llamado
    sonda, se une con el inserto.
2.- Preparación del vector para la clonación
 Las características de la molécula de ADN para el
 vector:
   Pequeña.
   Con una secuencia de ADN y mapa de restricción
      reconocible.
     De fácil introducción a la célula anfitriona.
     Con capacidad de replicación autónoma.
     Que posea varios sitios de restricción
     Que incluya un gen marcador (resistente a un
      antibiotico)
 El vector puede provenir de una célula eucariota o
  procariota (bacteriófagos, plásmidos, quimeras…)
 Se fracciona con las mismas enzimas de restricción del
  inserto ADN
3.- Formación del ADN recombinante
  Unión in vitro del ADN de restricción y el vector, con el
   uso de ligasas:
    Une extremos cohesivos
    Une extremos romos con menor afinidad


  Las asociaciones pueden ser:
     Intramoleculares: baja concentración de ADN
     Intermoleculares: se forma el ADNr, vector+vector o
      inserto+inserto.
4.- Incorporación del ADNr a la célula
              anfitriona
 Para incorporar el ADNr a la célula se necesitan ciertos
 métodos:
   Físicos y químicos
   Pasivos
   Activos: uso de vectores víricos o aplicación de descargas
    eléctricas.

  -El inserto puede permanecer unido al vector o
    recombinarse con el ADN cromosomico
5.-Propagacion del cultivo
 La división de las células en el cultivo junto con la de
  su genoma, producirá la formación de copias de ADNr
  incorporados…Clonación.

 Estas células se colocan en un medio liquido donde
  forman poblaciones con copias de la célula original
  (clones celulares)
6.- Detección y sección de los
        clones recombinantes
 A través de la clonación se obtienen varias colonias y
  para seleccionar la necesaria se usan 3 tipos de
  métodos:

   Métodos de hibridación: uso de una sonda marcada.
   Métodos inmunoquímicos: uso de anticuerpo especifico.
   Métodos genéticos o selección fenotípico: genes
    marcadores
7.- Expresión génica
 Se necesitan vectores de expresión, que incluyen un
 promotor

   Región reguladora de transcripción
   Debe ser inducible, que se active bajo alguna
    circunstancia experimental controlable (adición de
    algún nutriente).
ADN recombinante

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ADN recombinante

  • 2. Enzimas de restricción. o Cortan las cadenas de ADN en sitios específicos. o Son enzimas defensivas, protegen el ADN de los huéspedes bacterianos de otros mo extraños.
  • 3. Enzimas de restricción.  Reciben su nombre a partir de la bacteria de la cual fueron aisladas. Ejemplo: EcoRI  Cada enzima puede reconocer y separar una secuencia especifica de ADN de tira doble de 4 a 7 pb.  Los cortes de ADN pueden producir extremos romos o extremos adherentes o cohesivos. Los extremos adherentes son muy útiles a la hora de construir moléculas hibridas de ADN.
  • 4. Enzimas de restricción.  Frecuencia con la que una enzima escindirá una molécula de ADN: 4 (nºde pb`s).  Importancia: Poseen gran especificidad de reconocimiento de una secuencia corta de ADN dúplex y la subsiguiente hidrólisis de un enlace fosfodiester en cada hebra. Los fragmentos originados son útiles para iniciar la clonación celular o acelular y la creación de mapas de restricción.
  • 5. Tipos de enzimas de restricción. Endonucleasas de restricción Tipo I Tipo II Tipo III Endonucleasa y metilasa en Endonucleasa y metilasa en una Endonucleasa (metilasa en una Actividad enzimática una misma proteína (distintas misma proteína (distintas proteína independiente) subunidades) subunidades) Coenzimas o cosustratos ATP, Mg2, S-adenosilmetionina Mg2 ATP, Mg2, S-adenosilmetionina 3 subunidades: 2 subunidades: S reconocimiento 1 subunidad, aunque actúa como Estructura proteica MS reconocimiento y metilación R restricción homodìmero R restricción M metilación No palindròmico, 2 partes Sitio de reconocimiento Palindròmico No palindromico separadas Corta las 2 hebras en puntos Corta las 2 hebras en puntos Corta las 2 hebras en puntos cercanos entre sí, poco equivalentes, muy específicos, distintos entre sí, situados a 24- Punto de corte específicos, a unos 1000 pb del dentro de la secuencia de 26 pb del sitio de sitio de reconocimiento reconocimiento reconocimiento Adenia o citosina muy específicas Dentro de la secuencia de Adenina dentro de la secuencia dentro de la secuencia de Punto de metilación reconocimiento. En ambas de reconocimiento. En una sola reconocimiento. En ambas hebras hebra hebras Ejemplos Eco k, Eco B Numerosos Eco PI, Eco P15
  • 6.
  • 7. Papel biológico de sistema metilación- restricción.  Por cada enzima de restricción, una metilasa reconoce la misma secuencia que forma parte del sistema de restricción y une de manera covalente grupos metilo a bases de esa secuencia.
  • 8. Papel biológico de sistema metilación- restricción.  El ADN de la bacteria se metila de forma especifica.  La metilación impide la unión de la enzima de restricción (El ADN no es hidrolizado).  Al entrar en la célula ADN de otro organismo, este ADN puede ser degradado por la ER.  Las nucleasas restringen la posibilidad de infección por virus.
  • 9. Papel biológico de sistema metilación- restricción.  Si 1 sola hebra de ADN esta metilada, la ER no reconoce el sitio. La metilasa añade el grupo metilo a la otra hebra.  Afecta principalmente a citosinas y adeninas.  Las metilasas utilizan como donador a S- adenosilmetionina.  Este mecanismo regula la expresión génica, en eucariotas.
  • 10. Acción de las enzimas de restricción de tipo II.  Funcionan a manera de tijeras para el corte del ADN. El sitio de restricción es también el lugar de reconocimiento e hidrólisis.  Se hidrolizan enlaces fosfoèster del ADN, uno en cada hebra, generando 2 segmentos de restricción. Quedan fragmentos 3’OH y 5’P.
  • 11. ADN ligasas.  Los fragmentos generados con una misma restrictasa a partir de ADN’s distintos se aparean por medio de sus extremos cohesivos a partir de ADN ligasas.  Las ligasas forman el enlace fosfodiester que falta, consumiendo energía.
  • 12. Proceso general para la clonación de genes  Comprende siete pasos:  Preparación del inserto de ADN.  Preparación del vector de clonación.  Formación de la molécula de ADN recombinante.  Incorporación del ADN recombinante a la célula anfitriona.  Propagación del cultivo.  Detección y selección de los clones recombinantes.  Expresión génica.
  • 13. 1.-Preparacion del inserto de ADN  Lisis de células,(suspensión o centrifugación).  Se eliminan proteínas, enzimas o fragmentos proteolíticos y se precipita y se concentra el ADN.  Se fragmenta con endonucleasas de restricción.  Los fragmentos son aislados:  ADN vírico o de un plásmido, electroforesis en gel de agarosa.  ADN genómico, un fragmento de ADN marcado con 32P, llamado sonda, se une con el inserto.
  • 14. 2.- Preparación del vector para la clonación  Las características de la molécula de ADN para el vector:  Pequeña.  Con una secuencia de ADN y mapa de restricción reconocible.  De fácil introducción a la célula anfitriona.  Con capacidad de replicación autónoma.  Que posea varios sitios de restricción  Que incluya un gen marcador (resistente a un antibiotico)
  • 15.  El vector puede provenir de una célula eucariota o procariota (bacteriófagos, plásmidos, quimeras…)  Se fracciona con las mismas enzimas de restricción del inserto ADN
  • 16. 3.- Formación del ADN recombinante  Unión in vitro del ADN de restricción y el vector, con el uso de ligasas:  Une extremos cohesivos  Une extremos romos con menor afinidad  Las asociaciones pueden ser:  Intramoleculares: baja concentración de ADN  Intermoleculares: se forma el ADNr, vector+vector o inserto+inserto.
  • 17.
  • 18. 4.- Incorporación del ADNr a la célula anfitriona  Para incorporar el ADNr a la célula se necesitan ciertos métodos:  Físicos y químicos  Pasivos  Activos: uso de vectores víricos o aplicación de descargas eléctricas. -El inserto puede permanecer unido al vector o recombinarse con el ADN cromosomico
  • 19. 5.-Propagacion del cultivo  La división de las células en el cultivo junto con la de su genoma, producirá la formación de copias de ADNr incorporados…Clonación.  Estas células se colocan en un medio liquido donde forman poblaciones con copias de la célula original (clones celulares)
  • 20. 6.- Detección y sección de los clones recombinantes  A través de la clonación se obtienen varias colonias y para seleccionar la necesaria se usan 3 tipos de métodos:  Métodos de hibridación: uso de una sonda marcada.  Métodos inmunoquímicos: uso de anticuerpo especifico.  Métodos genéticos o selección fenotípico: genes marcadores
  • 21. 7.- Expresión génica  Se necesitan vectores de expresión, que incluyen un promotor  Región reguladora de transcripción  Debe ser inducible, que se active bajo alguna circunstancia experimental controlable (adición de algún nutriente).