Characterization of Drug-Resistant Sallmonellaenterica Serotype Typhimurium by Antiobiograms, Plasmids, Integrons, Resistance Genes, and PFGEBanacer, Douadi; Institute of biological sciences, Faculty of science, University of Malaya, Kuala Lumpur 50603 MalaysiaMaria Fernanda Marin Betancourt3th semester, MedicineUPB2010
Introduction.Salmonella are composed by mobile enterobacterias. They are gram-negatives bacillus, facultative earobic organism, easy to maintain (37ºC) and resistant to external agents. According to the Kauffmann-White eschema, S. Typhimuriumbelongs to the group B of the genre Salmonella.The antibigram is a really important test, that allows you, to know the kind of treatment for a specific infection, if the microorganism is resistant or tolerant to the specific antibiotic.Plasmid (circular molecule DNA, which autoreplicates independently within bacteria) and integrons (group of genetic elements potentially mobiles and capable to integrate and express antibiotic resistance genes) are directed involve in the adaptation of cell to the enviroment.
General ObjectiveTo know the drug resistance rates of some strains of Salmonella Typhimurium to antibiotics like tetracycline, sulfonamides, streptomycin, ampicillin, nalidixic acid, kanamycin, chloramphenicol, trimethoprim and cephalosporins, through the use of PCR, PFGE, plasmid profiling, DNA sequencing and antibiogram techniques.
Materiales Y Métodos Cepas: se utilizaron 47 cepas:Humanas (14): (1969-2006) hospital local.Zoonoticas: (33):Aves (14)Ganado (9)Cerdo (1)Peces (1)Anfibios (1)Pruebas de susceptibilidad: estudio  in vitro  del  comportamiento  de antimicrobianos  frente  a  diferentes microorganismos.La sensibilidad  de un organismo  a determinado antimicrobianos: la menor  concentración antimicrobiano  en  pg/ml, evita  el crecimiento  in vitro y es la concentración  mínima  inhibitoria  (CMI).El punto  de  corte  de  la  CMI debe  ser menor  que  el  nivel  del  antimicrobiano  accesible  en  la sangre.PCR: prueba de reacción en cadena de la polimerasa. Se busca obtener una amplificación de una secuencia de DNA  o de RNA.
Materiales y MétodosSe utiliza una enzima in vitro, a partir de una muestra de DNA se pueden crear millones de copias de una secuencia especifica.En el proceso se desnaturaliza el DNA, para separar las hebras.Se le adicionan los primers, para que se unan a la hebra.La polimerasa empieza la replicación a partir del primer.PCR multiple: amplifican simultáneamente diferentes secuencias diana, lo cual permite la detección e identificación simultanea varios genes.Secuenciación del ADN: se basa en procedimientos con geles de secuenciación que son capaces de resolver cadenas sencillas de oligonucleotidos. Busca medir la cantidad de nucleotidos presentes en un fragmento especifico de ADN.Perfil de plásmidos: es una combinación de una técnica de aislamiento de ADN plasmidico, expuesto a un gel de agarosa. Se utiliza los plásmidos de E.coli como marcadores de peso molecular.
ResultadosPCR :204 pb, especifico para el genero salmonella.401 pb especifico para la secuencia Typhimurium.102 pb secuencia DT104.Que identifican a la cepa como S. Typhimurium (47 positivas): 2 bandas, 204 pb y 401 pb.La secuecia de 102 pb es el subtipo DT104, al cual dio positivo para 20 cepas de 47.Antibiogramas:las 47 cepas, 9 fueron susceptibles para los 22 antibióticos. Mientras 33, resultaron resistentes a mas de un antibiótico. Cepas animales susceptibles a la ciproxacina, cefuroxime, ceftazidime y aztreonam.
ResultadosAntibiograma
ResultadosDeteccion de genes de resistencia:blaTEM, strA, aadA, sul1, sul2, tetA, tetBy tetG.14 ampicilinoresistentes.25 estreptomicinaresistentes.27 sulfonamidoresistentes.33 tetraciclinoresistentes.
ResultadosDeteccion de integronesLos clase I estaban presentes en 33 cepas : 13 clinicas y 20 zoonoticas.3 cepas llevaban 1 integron.19 cepas llevaban 2 integrones.11 cepas llevaban 3 integrones.Integron 210 pb, gen purGla enzima fosforibosilformilglicinamidinasintetasa. Casi en todas.Integron 650 pb, gensat enzima: estreptomicina acetiltransferasa y confiere la resistencia a estreptomicina.Integron 800 pb, gen dfrA7 enzima: dihidrofolatoreductasa: resistencia a trimetoprima.Integron 1000 pb, gen aadA2 enzima: aminoglicosido adenltransferasa, resistencia a estreptomicina y espectinomicina.Integron 1200 pb, gen pse-1 enzima: betalactamasa y resistencia a ampicilina.Integron 1900 pb, gen dfrA12: dihidrofolatoreductasa y resistencia a trimetoprima, y gen aadA2 aminoglicosido adenltransferasa,  resistencia a estreptomicina y espectinomicina.
Discusion
Conclusions	This article has a big importance in medicine because we can see how the bacterias evolve and becomes more resistant to treatments.The application of this techniques can lead to a better treatment schema, although they are expensive.The drug resistance is public health problem, and it is not only in countries like Malaysia, it’s a global problem, even when the same study is realized in two places, results are not the same. In a near future this kind of investigation may contribute In the development of stronger antibiotics.

Seminario

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    Characterization of Drug-ResistantSallmonellaenterica Serotype Typhimurium by Antiobiograms, Plasmids, Integrons, Resistance Genes, and PFGEBanacer, Douadi; Institute of biological sciences, Faculty of science, University of Malaya, Kuala Lumpur 50603 MalaysiaMaria Fernanda Marin Betancourt3th semester, MedicineUPB2010
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    Introduction.Salmonella are composedby mobile enterobacterias. They are gram-negatives bacillus, facultative earobic organism, easy to maintain (37ºC) and resistant to external agents. According to the Kauffmann-White eschema, S. Typhimuriumbelongs to the group B of the genre Salmonella.The antibigram is a really important test, that allows you, to know the kind of treatment for a specific infection, if the microorganism is resistant or tolerant to the specific antibiotic.Plasmid (circular molecule DNA, which autoreplicates independently within bacteria) and integrons (group of genetic elements potentially mobiles and capable to integrate and express antibiotic resistance genes) are directed involve in the adaptation of cell to the enviroment.
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    General ObjectiveTo knowthe drug resistance rates of some strains of Salmonella Typhimurium to antibiotics like tetracycline, sulfonamides, streptomycin, ampicillin, nalidixic acid, kanamycin, chloramphenicol, trimethoprim and cephalosporins, through the use of PCR, PFGE, plasmid profiling, DNA sequencing and antibiogram techniques.
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    Materiales Y MétodosCepas: se utilizaron 47 cepas:Humanas (14): (1969-2006) hospital local.Zoonoticas: (33):Aves (14)Ganado (9)Cerdo (1)Peces (1)Anfibios (1)Pruebas de susceptibilidad: estudio in vitro del comportamiento de antimicrobianos frente a diferentes microorganismos.La sensibilidad de un organismo a determinado antimicrobianos: la menor concentración antimicrobiano en pg/ml, evita el crecimiento in vitro y es la concentración mínima inhibitoria (CMI).El punto de corte de la CMI debe ser menor que el nivel del antimicrobiano accesible en la sangre.PCR: prueba de reacción en cadena de la polimerasa. Se busca obtener una amplificación de una secuencia de DNA o de RNA.
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    Materiales y MétodosSeutiliza una enzima in vitro, a partir de una muestra de DNA se pueden crear millones de copias de una secuencia especifica.En el proceso se desnaturaliza el DNA, para separar las hebras.Se le adicionan los primers, para que se unan a la hebra.La polimerasa empieza la replicación a partir del primer.PCR multiple: amplifican simultáneamente diferentes secuencias diana, lo cual permite la detección e identificación simultanea varios genes.Secuenciación del ADN: se basa en procedimientos con geles de secuenciación que son capaces de resolver cadenas sencillas de oligonucleotidos. Busca medir la cantidad de nucleotidos presentes en un fragmento especifico de ADN.Perfil de plásmidos: es una combinación de una técnica de aislamiento de ADN plasmidico, expuesto a un gel de agarosa. Se utiliza los plásmidos de E.coli como marcadores de peso molecular.
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    ResultadosPCR :204 pb,especifico para el genero salmonella.401 pb especifico para la secuencia Typhimurium.102 pb secuencia DT104.Que identifican a la cepa como S. Typhimurium (47 positivas): 2 bandas, 204 pb y 401 pb.La secuecia de 102 pb es el subtipo DT104, al cual dio positivo para 20 cepas de 47.Antibiogramas:las 47 cepas, 9 fueron susceptibles para los 22 antibióticos. Mientras 33, resultaron resistentes a mas de un antibiótico. Cepas animales susceptibles a la ciproxacina, cefuroxime, ceftazidime y aztreonam.
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    ResultadosDeteccion de genesde resistencia:blaTEM, strA, aadA, sul1, sul2, tetA, tetBy tetG.14 ampicilinoresistentes.25 estreptomicinaresistentes.27 sulfonamidoresistentes.33 tetraciclinoresistentes.
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    ResultadosDeteccion de integronesLosclase I estaban presentes en 33 cepas : 13 clinicas y 20 zoonoticas.3 cepas llevaban 1 integron.19 cepas llevaban 2 integrones.11 cepas llevaban 3 integrones.Integron 210 pb, gen purGla enzima fosforibosilformilglicinamidinasintetasa. Casi en todas.Integron 650 pb, gensat enzima: estreptomicina acetiltransferasa y confiere la resistencia a estreptomicina.Integron 800 pb, gen dfrA7 enzima: dihidrofolatoreductasa: resistencia a trimetoprima.Integron 1000 pb, gen aadA2 enzima: aminoglicosido adenltransferasa, resistencia a estreptomicina y espectinomicina.Integron 1200 pb, gen pse-1 enzima: betalactamasa y resistencia a ampicilina.Integron 1900 pb, gen dfrA12: dihidrofolatoreductasa y resistencia a trimetoprima, y gen aadA2 aminoglicosido adenltransferasa, resistencia a estreptomicina y espectinomicina.
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    Conclusions This article hasa big importance in medicine because we can see how the bacterias evolve and becomes more resistant to treatments.The application of this techniques can lead to a better treatment schema, although they are expensive.The drug resistance is public health problem, and it is not only in countries like Malaysia, it’s a global problem, even when the same study is realized in two places, results are not the same. In a near future this kind of investigation may contribute In the development of stronger antibiotics.