Seminario Biología Molecular
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Seminario Biología Molecular Artículo de investigación Pablo José Arias Franco
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Seminario Biología Molecular
- 1. Pablo José Arias Franco | 3th Semester | Molecular Biology | Universidad Pontificia Bolivariana
- 2. Yersinia enterocolitica Serogroups Share the same surface antigens Categorized according to which O- antigen they express O:3 O:8 O:9 O:5 Pathogenecity INTRODUCTION Taken from: https://fineartamerica.com/featured/6-yersinia-enterocolitica-bacteria-scimat.html Arthritis Enterocolitis Pseudoappendicitis Erythema nodosum
- 3. Resistant = Superbugs Enterococcus Staphylococcus Klebsiella Acinetobacter Pseudomonas Enterobacter Change in ways that render the medications used to cure the infections they cause ineffective. Ferran Navarro Ab, Lectura interpretada del antibiograma de enterobacteriaswww.elsevier.es/eimc WHO, What is antimicrobial resistance?, http://www.who.int/ Antimicrobial resistance Intrinsic Extrinsic Change Mechanism Alterations in the wall Active efflux Betalactamases Use of alternate ways Mutations in the white site
- 4. OBJECTIVE The aim of this study is to characterise pathogenic Ye in slaughtered pigs located in central Italy using bioserotyping, antimicrobial susceptibility, multiplex PCR-detecting virulence factors, and pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) methods
- 5. Materiales y Métodos MUESTRAS Amígdalas 400 cerdos sacrificados Los animales originados de 13 diferentes porcícolas repartidos en 2 provincias. Matadero situado en la región de los Abruzos (centro de Italia) De febrero - marzo de 2011
- 6. Materiales y Métodos Identificación bacteriana y estudio de sensibilidad antimicrobiana, confirma que la muestra si era de Ye. Conocer si las yersinias son genéticamente la misma cepa o cepas distintas. Inoculación de una suspensión de microorganismos en tarjetas con diluciones estandarizadas de distintos antibióticos correspondientes a los puntos de corte de sensibilidad. Separación de material genético cortado previamente con enzimas de restricción (Xba l y Not l). PFGE VITEK ¿Para qué? Fundamento
- 7. Materiales y Métodos Identificar con una mayor probabilidad, virus o bacterias causantes de una enfermedad. Reacción enzimática in vitro que replica millones de veces una hebra sencilla por una DNA polimerasa a partir de un Primer. PCR ¿Para qué? Fundamento
- 8. Materiales y Métodos Evaluar la resistencia o susceptibilidad a los antimicrobianos que poseen las cepas de Ye que están siendo estudiadas. Se colocan los discos con los distintos antibióticos en el centro del agar, efecto sobre proliferación bacteriana, y se mide el grado de resistencia de acuerdo al halo inhibitorio. DIFUSIÓN EN DISCO ¿Para qué? Fundamento 16 antimicrobianos
- 9. Resultados Cepas de Ye de referencia utilizadas para la evaluación del ensayo de PCR múltiple y para el estudio.
- 10. Resultados
- 11. Resultados Antimicrobianos que fueron evaluados para la prueba de resistencia o susceptibilidad. Ampicilina Ácido clavulánico Ciprofloxacina Gentamicina Trimetoprim Sulfametoxazol
- 12. Resultados
- 13. Discussion Author Contribution Yes or Not Aarts et al. Several studies have described different multiplex PCR protocols for pathogenic Ye. Gierczynski et al Other studies described a simplex PCR for the detection of virulence genes Buchrieser et al. In the past, PFGE has been reported to be useful for typing many bacteria, including Ye.
- 14. Conclusions Preventive measures should be taken with those foods that may be contaminated with human pathogenic Ye strains and especially with resistance genes which result in problems for the treatment of the infection. The study allows us to show that strains with a bioserotype such as 4 / O: 3 have a great association to several human pathologies worldwide, such as enterocolitis and the best antibiotic treatment should be sought for each of them.
Notas del editor
- this bacterium is a gram negative, coccoid shaped, non spore-forming bacillus It is a facultative anaerobe and is motile at room temperature but non-motile at 37 ºC HOST RANGE: Yersinia enterocolitica has been found in humans, warm blooded animals (particularly in farm animals and pets). It has been found in the intestinal tracts of pigs, dogs and cats without any clinical manifestations MODE OF TRANSMISSION: Nosocomial infections and blood transfusion have been reported . Fecal-oral transmission from animal-to-human or consumption of contaminated foods (raw pork products, undercooked pork, tofu and unpasteurized milk have been shown to be a source of outbreaks) and untreated water are also common modes of transmission The serogroups are group serotypes that share the same surface antigens and are categorized according to which O-antigen they express Esos antigenos son los qu estan relacinaldos con los cerdos y una buena forma de identificarlos es através de as amigdalas de los cerdos
- What is: Antimicrobial resistance occurs when microorganisms such as bacteria, viruses, fungi and parasites change in ways that render the medications used to cure the infections they cause ineffective. When the microorganisms become resistant to most antimicrobials they are often referred to as “superbugs”. This is a major concern because a resistant infection may kill, can spread to others, and imposes huge costs to individuals and society. Existe un grupo que genera alta resistencia que es el grupo ESKAPE (in the word exist a bacteria group that is so important in the atimicrobial resistancie because is a superbugs) yersinia enterobacteria is part of enterobacter group. The bacteria groups have 2 kinds or types of resistence: intrinsic: when it is inherent to the bacteria o extrinsic when the bacteria change its dna, a drug that before works, will be stop working. Ahí estan los mecanismos… bla bla bla.
- The aim of this study is to analyse YE strains isolated from 400 slaughtered pigs from the Abruzzo region, Italy, using biochemical tests and a multiplex polymerase chain reaction PCR detecting 6 chromosomal genes (ystA, irp2, 16s, ail, inv, hemR) and one plasmid‑borne virulence gene (yadA). Antimicrobial susceptibility was evaluated and pulsed‑field gel electrophoresis (PFGE) was also performed in order to assess phylogenetic diversity.
- Amígdalas porcinas fueron retiradas asépticamente inmediatamente después de la evisceración, colocadas en bolsas de plástico estériles transportadas al laboratorio en condiciones de fríos, donde analizaron inmediatamente o dentro de 24 horas de la recolección.
- Vitek equipo automatizado confirma que la muestra tomada y que será evaluada si eran yersinias PFGE Electroforesis en gel de campo pulsado, separación de moléculas es decir material genético, el material genético es cortado previamente con enzimas de restricción Pulsed‑field gel electrophoresis was performed using 2 ‘rare cutting’ enzymes: XbaI and NotI. Las enzimas cortan en sitios especificos, para saber si las yersinias son genéticamente de la misma cepa o cepas distintas, me da un patron para establecer diferencias entre las yersinias
- Permite ampliar una secuencia específica de un gen, fragmento de DNA o de RNA para identificar con una muy mayor probabilidad, virus o bacterias causantes de una enfermedad.
- Se hicieron una serie de pruebas para evaluar la resistencia a los antibióticos por medio de difusión en disco, que es un método físico para evaluar la resistencia o susceptibilidad a los antibióticos según los halos de inhibición que produce el antibiótico sobre el agar que es el medio donde está sembrada la bacteria. La bacteria es sembrada sobre todo el agar, después se colocan los discos con antibióticos en el centro y según parámetros preestablecidos sobre la medida del radio inhibitorio que produce el antibiótico se determina el grado de susceptibilidad, es decir, de acuerdo al grado con el que prolifera la bacteria, y estas medidas son exclusivas para cada antibiótico
- Los biotipos y serotipos entre paréntesis se tipificaron en este estudio; los otros eran obtenido de los datos de la colección de cepas.