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Introducción
 Abundantemente estudiada y más
 temida, Escherichia coli tiene más
plasticidad genómica de lo que una
vez creímos y puede haber seguido
  varias vías de convertirse en un
          agente patógeno.
La Escherichia coli,
  ha estado sujeta a
      exámenes
  científicos por más
    de un siglo y ha
  ocupado el centro
  en el desarrollo de
     la ingeniería
 genética tecnológica
   en el laboratorio.

                La bacteria está sometida a pequeños
                cambios en su morfología, su genoma es
                pequeño y dinámico, y con numerosos
                cambios de entidad que no han parado de
                evolucionar
Se trata de un organismo modelo en estudios
     evolutivos, en poblaciones naturales y en el
  laboratorio en los estudios llamados “evolución
   experimental”. Estas investigaciones nos han
permitido comprender mejor la acción de 2 fuerzas
   evolutivas, la selección y la mutación. Estos
   estudios estaban basados en la prevaleciente
noción de que estas bacterias son clones, pasando
genes con un pequeño intercambio de generación
                    en generación.
Nuestra familiaridad con E. coli viene de nuestra
    íntima experiencia con ella, así como su uso
      extendido como caballo de fuerza en los
              laboratorios genéticos.
La E. coli vive en el intestino de los seres
       humanos como también en otros
  mamíferos. También vive en otras partes
    en la naturaleza. E. coli hace titulares
 cuando una cepa patogénica contamina la
  comida o la bebida, pero en realidad hay
       muchas cepas benignas viviendo
     inadvertidamente entre nuestra flora
   intestinal y en nuestro medio ambiente.
¿A que familia bacteriana pertenece?
                   La E. coli es un miembro de una familia
                     entero-bacteriana. Los estudios de la
                      filogenia molecular indican que está
                     estrechamente relacionada con otros
                    patógenos de vertebrados, incluyendo
                     Shigella y Salmonella, la bacteria del
                         Cólera y Haemophilus, que puede
                            causar neumonía y meningitis.

 Escherichia coli es un bastón Gramnegativo (bacilo) de la
 familia Enterobacteriaceae. La mayoría de las E. coli son
     comensales normales que se encuentran en el tracto
    digestivo. Las cepas patógenas de este organismo se
       distinguen de la flora normal por poseer factores de
   virulencia, como exotoxinas. Los factores de virulencia
específicos pueden utilizarse, junto al tipo de enfermedad,
             para separar dichos organismos en patotipos.
Escherichia coli coloniza el intestino del hombre pocas horas
     después del nacimiento y se considera de flora normal,
      pero hay descritos seis grupos de E. coli productora de
                                                       diarrea:
                            • E. coli entero-toxigénica (ETEC)
                          • E. coli entero-patogénica (EPEC)
                               • E. coli entero-invasiva (EIEC)
                                  • E. coli shigatoxina (STEC)
                             • E. coli adhesiva difusa (DAEC)
                           • E. coli entero-agregativa (EAEC)
    La bacteria se puede aislar e identificar tradicionalmente
 con base en sus características bioquímicas o serológicas,
       pero también se pueden estudiar sus mecanismos de
     patogenicidad mediante ensayos en cultivos celulares o
        modelos animales y, más recientemente, empleando
 técnicas de biología molecular que evidencian la presencia
             de genes involucrados en dichos mecanismos.
Características
• La entero-bacteria se caracteriza por la
  capacidad de una respiración facultativa.
• El genoma de la E. coli, en promedio, consiste
  en 50.8% de pares de bases G-C
• El ambiente natural de la E. coli es el intestino
  de mamíferos y aves. Estudios recientes indican
  que la E. coli también puede estar presente en
  otros órganos del organismo además de en el
  intestino. Pueden sobrevivir en otras partes del
  sistema digestivo, en sangre, en el tracto
  urogenital y en ambientes secundarios.
Mapa Genómico Circular de E.coli O:157 H:4. Nicole T. Perna
  and colleagues at the University of Wisconsin in 2001.
Existe una gran diversidad genética y
ecológica, así como una alta
recombinación e intercambio genético.
Estos fenómenos permiten generar gran
cantidad de genotipos a pesar de no
suceder en cada generación. No sólo se
mueven genes, sino que recombinan
plásmidos y fragmentos de genes.
Plásmidos:

   • Esta molécula de DNA circular es el componente más
    dinámico del genoma bacteriano ya que se mueven con
                                 facilidad entre las cepas.

      •   Se han descripto alrededor de 300 plásmidos en la
                                                   especie.

    • Muchos plásmidos son capaces de transferirse ellos
 mismos entre especies. Diferentes modelos de distribución
               de plásmidos son posibles en las bacterias.

• La transferencia horizontal o lateral es un talento especial
   de las bacterias las cuales pueden cambiar DNA por o a
    través de líneas de especies. Tal intercambio de genes
  toma lugar a través de la conjugación bacterial, cuando 2
                       bacterias se unen y comparten DNA.
Las bacterias pueden adquirir nuevos genes
    mediante varios métodos, uno de ellos es la
  transformación: Una bacteria capaz de adquirir
  DNA del entorno, adquiere los genes liberados
 por otra bacteria que ha sufrido una lisis celular
 e incorpora el nuevo DNA dentro de su genoma.
Las bacterias también pueden adquirir los genes
         provenientes de virus, y se llaman
                  bacteriófagos.
La conjugación bacteriana es un segundo
     método de trasferencia horizontal, en este
       ejemplo una bacteria posee un plásmido
    (elemento genético extracromosomal) de la
   que otra carece. El plásmido contiene genes
  que codifican para proteínas que le permite a
las bacterias reconocerse y unirse. La bacteria
 con el plásmido extiende una proyección para
      unirse con la segunda bacteria y crea una
  copia del plásmido para su vecina. La vecina
  adquiere una copia del plásmido original que
           puede incluir factores de virulencia o
                   resistencia a los antibióticos.
Los genes de las bacterias pueden experimentar la precombinación y la
                  transposición de elementos genéticos.
En este ejemplo podemos observar una transposición replicativa en la cual el
   elemento transponible es replicado e incorporado en el otro plásmido.
Serotipificación
• Para determinar el grupo patógeno al que
  pertenecen Kauffman desarrolló un esquema de
  serotipificación que continuamente varía y que
  actualmente tiene 176 antígenos somáticos (O),
  112 flagelares (H) y 60 capsulares (K). El
  antígeno “O” es el responsable del serogrupo; la
  determinación del antígeno somático y flagelar
  (O:H) indica el serotipo, el cual en ocasiones se
  asocia con un cuadro clínico en particular
Según los antígenos O (lipopolisacáridos
    somáticos), H (flagelares) y K (capsulares). Los
      serotipos que se conocen por contener ECEH
 incluyen a E. coli O157:H7, el organismo no móvil
            E. coli O157:H, y los miembros de otros
serogrupos, en particular O26, O103, O111 y O145
      pero también O91, O104, O113, O117, O118,
                                O121, O128 y otros.
 La E. coli O157:H está estrechamente relacionada
    con la E. coli O157:H7, pero no es simplemente
    una versión inmóvil de este organismo; también
        posee una combinación distintiva de rasgos
                         fenotípicos y de virulencia.
Algunos
Serotipos
Antes se usaban
determinaciones bioquímicas…
Patogenicidad
• En 1996 surgió una pregunta diferente acerca
  de los patrones de mutación cuando J. Eugene
  Leclerc encontró que las bacterias O157:H7 son
  hipermutables. Exhibían una gran tasa de
  mutación en relación a las no patogénicas.
  Según Leclerc los errores en el sistema de
  reparación del DNA podía constituir un estilo de
  adaptación que ayudaba a las bacterias a
  escapara del sistema inmune de sus
  hospedadores.
Dos de los tipos más peligrosos de E. coli
son EHEP (o cepa entero-hemorrágica)
cepa como O157:H7 comúnmente
relacionada con contaminación de
alimentos, y EPEC (o entero-patogénica)
cepa que tiene importancia en la causa de
diarrea.
Transmisión
• Las ECEH se transmiten por vía fecal–oral. Se pueden
  propagar entre animales por contacto directo o a través
  de bebederos, alimento compartido, lugares de pastaje
             contaminados u otras fuentes ambientales.
                                                      •
  • La ECEH O157:H7 se transmite principalmente a los
     humanos a través del consumo de alimentos y agua
  contaminados, o por el contacto con animales, heces y
        suelo contaminado. La transmisión de persona a
       persona puede contribuir con la propagación de la
        enfermedad durante los brotes; sin embargo, los
 humanos no parecen ser huésped de mantenimiento de
                                         este organismo
• Las epidemias de ECEH O157:H7 de origen alimentario
  generalmente son causadas por la ingesta de productos de
  origen animal mal cocidos o no pasteurizados, en especial,
  carne molida pero también otras carnes y embutidos, y
  leche y queso no pasteurizados.
• Otros brotes han estado vinculados a la alfalfa o brotes de
  rábanos, lechuga, espinaca y otros vegetales contaminados,
  así como también sidra no pasteurizada. El agua de riego
  contaminada con heces es una fuente importante de ECEH
  O157:H7 en los vegetales. Este organismo se puede adherir
  a las plantas, y sobrevive bien en la superficie de una
  variedad de frutas, vegetales y hierbas culinarias frescas.
• La ECEH O157:H7 puede permanecer viable por largos
  periodos en muchos productos alimenticios. Puede
  sobrevivir durante al menos 9 meses en carne molida
  almacenada a -20 °C. Tolera la acidez, y permanece
  infecciosa de semanas a meses en alimentos ácidos.
  Además, resiste la desecación
Factores de Virulencia
• El serotipeado, no es suficiente para la identificación de
     un organismo como una ECEH; también deben estar
                         presentes factores de virulencia.

       • Las cepas de E. coli O157:H7 son relativamente
        homogéneas, y casi todos estos organismos llevan
  factores de virulencia asociados con colitis hemorrágica
                                                   y SUH.

 • Debido a que muchos factores de virulencia (incluso la
           verocitotoxina) se llevan en los plásmidos o en
     bacteriófagos, pueden surgir nuevas cepas de E. coli
  que poseen nuevos patrones de la enfermedad y/o sean
          difíciles de clasificar por los sistemas actuales.
Se detecto en casos de Síndrome urémico hemolítico (SUH)
caracterizado por daño renal agudo, trombocitopenia y anemia
hemolítica microangiopática, precedida por diarrea con sangre, en
heces de E. coli, la presencia de produccion de una citotoxina con
actividad en células Vero, por lo que se le llama verotoxina (VT), y a
las cepas capaces de producirla se les denominó E. coli
verotoxigénicas (VTEC).

Además, se observó que la citotoxina se neutralizó con antitoxina
obtenida a partir de Shigella dysenteriae tipo 1, por lo que también
se le llamó “shiga-like toxin” o toxina semejante a shiga (SLT) o
“shiga toxin” (STX), y a las E. coli capaces de producirla se les da el
nombre de STEC

La capacidad toxigénica de las cepas es necesaria para que el
paciente desarrolle colitis hemorrágica y diarrea con sangre, ya que
la citotoxina STX es el principal mecanismo de patogenicidad de
EHEC y su síntesis está relacionada con la presencia del
bacteriófago STX, que está insertado en el genoma. La STX actúa a
nivel de síntesis de proteínas ya que se une a la subunidad 60S de
los ribosomas de las células intestinales o renales del hospedero
Además de la toxina, las EHEC
         tienen otros mecanismos de
patogenicidad como el fenómeno de
adherencia y esfacelación (A/E), y
 presentan el gen cromosomal eae
     que codifica para la proteína de
    membrana externa (OMP) de 94
kilodaltones (kDa), llamada intimina,
     cuya expresión es regulada por
     genes plasmídicos; el gene eae
 también se encuentra en las cepas
                              EPEC.
• El principal mecanismo de patogenicidad de las
      cepas EHEC no-O157:H7 es la toxina STX;
           también tienen el fenómeno de A/E y la
             presencia del plasmido pO157 como
                               mencionamos antes.
     • En los últimos veinte años, Escherichia coli
        productor de toxina Shiga (STEC) ha sido
  reconocido como agente causal de enfermedad
               gastrointestinal grave, con riesgo de
  complicaciones que ponen en peligro la vida de
                            las personas afectadas.
 • Escherichia coli O157:H7 es el prototipo de un
     grupo de más de 150 serotipos de STEC que
    poseen los mismos marcadores de virulencia.
       Entre ellos, existen 5 serotipos (O26:H11,
      O103:H2, O111:NM, O113:H21 y O145:NM)
       que fueron reconocidos por la Organización
 Mundial de la Salud por su potencial patogénico
E. coli tiene varias formas capaces de inducir la diarrea en un huésped
           mamífero; estas comparten algunos genes, pero puede variar
                                                           ampliamente.
         • E. coli enterotóxica inyecta toxinas en las células epiteliales
                                             las células del intestino (a).
 • E. coli enterohemorrágica, incluyendoO157: H7, causa diarrea con
                                                                sangre (b).
• La que daña las vellosidades intestinales e induce la polimerización
                de la actina en fragmentos del citoesqueleto de la célula
     huésped para formar un vínculo íntimo con la célula huésped, y se
  inyecta también toxinas en esta. Enteroagregativa E. coli, forma una
                      biopelícula y secretan citotoxinas en el epitelio(c).
   • E. coli de Adherencia difusa puede causar el alargamiento de las
                                                   microvellosidades (d).
   • Enteropatógena E. coli, una causa mundial de diarrea infantil, las
    acciones de exhibición similar a las bacterias enterohemorrágica, la
                        inducción de adherencia a la célula huésped (e).
• Por último,enteroinvasiva por E. coli puede invadir epiteliales de las
              células y se desplazan lateralmente dentro del epitelio (f).
Cassettes de genes patógenos, o "islas de patogenicidad“: se puede montar en
    el genoma bacteriano de varias maneras. Un virus llamado bacteriófago puede
    insertar genes individuales o paquetes de genes. (El virus rompe la membrana
    celular.)
•   Una bacteria por lo tanto, pueden adquirir la totalidad de factores de un
    virus fago, a traves de transducción (a).
•   Sin embargo, los factores se han encontrado de forma independiente
    en muchas cepas. Esto sugiere que dichos factores se pueden construir a
    traves de los elementos adquiridos en pedazos y luego se traslada en torno a el
    genoma en una secuencia de eventos, dejando copias de genes en diferentes
    ubicaciones(b).
•   Por otra parte, una isla inestable puede romper, desarmar a los patógenos,
    pero dejar de nuevo los fragmentos solos(c).
Métodos de Identificación
• Dado que los humanos habitualmente no son
  portadores la ECEH, los casos clínicos se
  pueden diagnosticar mediante el hallazgo de
  estos organismos en las muestras fecales.
• Las ECEH en ocasiones son difíciles de
  identificar. Son una población menor en la flora
  de la materia fecal o en los alimentos.
• No existe una técnica única que se pueda
  utilizar para aislar todos los serotipos de ECEH.
Para el aislamiento, la identificación y la caracterización
de cepas de E. coli se aplican métodos tradicionales,
  métodos in vivo e in vitro y de biología molecular.
  El método tradicional es el aislamiento de la bacteria,
    tomada directamente de materia fecal o con hisopo
                         rectal. Ocurre secuencialmente:
 – Siembra con la punta del hisopo en la parte superior
        de una placa de agar Mac Conkey u otro medio
                                                 selectivo.
    – Con una asa redonda de nicromel, se continúa el
            aislamiento, sembrando por estría cruzada.
                  – Se incuba a 37 °C durante 18-24 h.
  – Se seleccionan de 5 a 10 colonias típicas de E. coli
                                          lactosa positivas.
         Cuando se sospecha la presencia de EHEC se
   reemplaza lactosa por agar Mac Conkey con 1% de
                                                   sorbitol.
La identificación del grupo EHEC se
puede hacer por serotipificación o bien por
poner de manifiesto la producción de la
toxina STX también se puede cuantificar
la elevación de anticuerpos dirigidos hacia
el lipopolisacárido de E. coli O157:H7, así
como demostrar la presencia de factores
de virulencia como pO157, el fenómeno
de A/E o los genes involucrados, además
de la fagotipificación nombrados
anteriormente.
Métodos de Biología Molecular

La caracterización y clasificación de cepas
patógenas de E. coli se puede hacer con
métodos de biología molecular, una de las
herramientas de diagnóstico más
recientes, tal es el caso del uso de sondas
para la hibridación en fase sólida como es
el “colony blot”
Colony Blot
Se utilizan sondas. Las sondas son fragmentos pequeños de
DNA que contienen parte de los genes que codifican para
algún factor de virulencia y pueden estar marcadas
radioactivamente con 32P o no radiactivamente con biotina o
digoxigenina.
Implica la transferencia del DNA de una colonia de bacterias a
una fase sólida que puede ser nylon, papel filtro o nitrocelulosa,
para su posterior hibridación:
 – Las colonias se incuban 4 horas a 37 °C.
 – Después de este tiempo se coloca la membrana de nylon
   sobre la superficie de la placa.
 – Las bacterias se rompen sobre la membrana y el DNA se
   desnaturaliza al colocar ésta en una solución de hidróxido
   de sodio para posteriormente fijarle el DNA
 – La hibridación se realiza con una sonda marca da con
   digoxigenina empleando un anticuerpo antidigoxigenina
   conjugado a la enzima fosfatasa alcalina.
PCR
        Reaccion en cadena de la polimerasa

• Esta técnica también se utiliza como
  Método determinativa.
• Es hoy una de las técnicas moleculares
  mas utilizadas. Permite amplificar los
  fragmentos de DNA miles de millones de
  veces en pocas horas.
• La base PCR es la replicación catalizada
  por una enzima DNA Polimerasa.
Para llevar a cabo la PCR se comienza
con una solución que incluye
– El DNA blanco (DNA para amplificar).
– La DNA Polimerasa.
– Desoxirribonucleósidos trifosfato (dNTP)
– Los cebadores.
– Iones Mg2+ y otras sales.
Una reacción de la PCR típica incluye 3
pasos:
– Paso 1: Una solución de DNA se calienta entre
  90 y 100 grados para romper los puentes de
  Hidrogeno durante solo uno o dos minutos. Se
  crean moldes monocatenarios.
– Paso 2: La solución se enfría con rapidez a una
  temperatura entre 30 y 65ºC durante un minuto
  o menos. Los cebadores se unirán a las
  secuencias complementarias.
– Paso 3: La solución se calienta entre 60 y
  70ºC, temperatura a la cual la DNA Polimerasa
  puede sintetizar cadenas nuevas de DNA.
Específicamente la PCR para Escherichia coli
EHEC:
La muestra puede ser una cepa pura aislada de
muestra clínica.
La cepa se siembra por estría y se incuba durante
24 horas; a continuación se resuspenden cinco
colonias de bacterias en 0.2 ml de agua y se
somete a ebullición para desnaturalizar el DNA.
De la suspensión se toma una alícuota para el
tubo donde se realiza la PCR. Los reactivos
necesarios para la PCR de cada muestra son
adenina, timina, citocina, guanina, MgCl2,
iniciadores y enzima Taq polimerasa.
De esta etapa de PCR, luego sigue la
        electroforesis de campo pulsado
(pulsed-field gel electrophoresis PFGE), un
método de biología molecular que cada vez
 se emplea más con fines epidemiológicos,
debido a que separan largos fragmentos de
       DNA que se obtienen al digerir DNA
  genómico con enzimas de restricción que
            realizan cortes poco frecuentes.
Validación de una técnica de PCR múltiple para
                la detección de
  Escherichia coli productor de toxina Shiga

 “ La infección por Escherichia coli productor de
  toxina Shiga (STEC) es causa de diarrea con o
    sin sangre, colitis hemorrágica y síndrome
    urémico hemolítico (SUH) en humanos. El
  objetivo de este trabajo fue validar una técnica
   de PCR múltiple para el diagnóstico de STEC
 basado en la detección de los genes stx1, stx2 y
                      rfbO157.”

La técnica validada es una alternativa apropiada
 para la detección y confirmación de STEC O157
    y no-O157 a partir de cultivos bacterianos.
En Argentina, el SUH es endémico y
constituye la primera causa pediátrica de
insuficiencia renal aguda y la segunda de
 insuficiencia renal crónica, por eso es de
       gran importancia su análisis y
               determinación.
Como se menciono antes, el objetivo de este trabajo fue
validar una técnica de PCR múltiple basada en la
detección de los genes stx1, stx2 y rfbO157 de STEC
O157 y no-O157. Para ello se plantearon las siguientes
etapas:

– Comparar dos técnicas de extracción de ADN.
– Evaluar la técnica de PCR múltiple mediante los
  siguientes parámetros: a) rango de trabajo, b)
  selectividad, c) robustez.
– Desafiar la técnica de PCR múltiple combinando
  distintas concentraciones de dos cepas STEC con
  diferentes factores de virulencia blanco de la
  reacción.
Metodo
 • Las cepas utilizadas fueron identificadas por pruebas
          bioquímicas y seroagrupadas según su antígeno
         somático (O) y flagelar (H). Para la detección del
antígeno O se utilizó la técnica de aglutinación en lámina
   con antisuero policlonal anti-O y para la detección del
  antígeno H se utilizó la técnica de aglutinación en tubo
     con antisuero anti-H . Se determinó la capacidad de
producción de toxina Shiga de las cepas STEC mediante
      ensayos de citotoxicidad específica en células Vero
          utilizando anticuerpos monoclonales específicos
 MAb13C4 para Stx1 y BC5BB12 para Stx2 . Las células
   Vero poseen una alta sensibilidad a la actividad de las
       toxinas Shiga, por lo que la técnica de citotoxicidad
  utilizando esta línea celular es considerada prueba de
                                                         oro.
Las cepas conservadas a -70 °C en caldo
  tripticasa soja (CTS) con 20% de glicerol,
  fueron sembradas en CTS e incubadas a
  37 °C durante 4 h y luego en agar Mac
  Conkey (Becton Dickinson) incubándose a
  37 °C durante 18 horas. A partir de una
  colonia se realizó un subcultivo en CTS a
  37 °C durante 18 horas.
Secuencialmente:
  – Se realizaron diluciones decimales en agua tridestilada
    estéril,
  – Un ml de cada dilución se centrifugó a 10.000 rpm
    durante 5 minutos.
  – Se descartó el sobrenadante y se agregó a cada tubo
    solución de tritón X-100 al 1% en buffer TE 1X.
  – Luego de hervir en baño de agua durante 15 minutos,
    los tubos se centrifugaron a 10.000 rpm durante 5
    minutos.
  – Se conservó el sobrenadante para ser utilizado como
    blanco en la técnica de PCR múltiple.
Deteccion
• Se utilizaron tres pares de
  oligonucleótidos iniciadores para
  amplificar un fragmento del gen
  correspondiente a la subunidad B de stx1,
  un fragmento del gen correspondiente a la
  subunidad A de stx2 (52) y un fragmento
  del gen rfbO157.
• Se utilizó un termociclador Biometra
          • Mezcla de reacción de PCR,
  conteniendo Buffer PCR 10X, mezcla
               de dNTPs, Cl2Mg. pares de
          oligonucleótidos primers Stx2 y
           O157, par de oligonucleótidos
    primers Stx1, Taq polimerasa, Agua
    tridestilada estéril y finalmente ADN
                                 templado.
 • Como control positivo y negativo se
   utilizó el ADN templado de las cepas
    E. coli, además se utilizo mezcla de
    reacción de PCR sin ADN templado
                como control de sistema.
La preparación de las muestras se realizó por triplicado.

La PCR múltiple se realizó simultáneamente a todos los
extractos de ADN, empleando el mismo equipamiento y
los mismos reactivos.
En el caso de una PCR múltiple, lo que se persigue es
amplificar simultáneamente en un único tubo distintas
secuencias específicas, lo cual necesariamente
implica que los reactivos mezclados y el programa
utilizado sean suficientes y adecuados para permitir la
detección de cada diana y no inhibir la de las demás.
Con este fin, algunos parámetros, como la
concentración de magnesio y de cebadores, y el tipo y la
cantidad de ADN polimerasa, pueden ajustarse
experimentalmente. Para otros, en cambio, debe
realizarse un diseño exhaustivo previo.
Es necesario tener en cuenta varias premisas:

a ) escoger o diseñar oligonucleótidos que no
interaccionen entre sí, es decir, que no formen
oligómeros;

b ) que tengan temperaturas de anillamiento similares;

c ) que cada pareja amplifique una única secuencia
diana,

d ) que generen amplificaciones de tamaño
suficientemente diferente como para poder ser
separados y diferenciados tras la amplificación.
Análisis Estadístico
• Para el análisis estadístico de los resultados se
  utilizó una tabla de contingencia. Se
  compararon los resultados con los obtenidos
  mediante citotoxicidad específica en células
  Vero y serotipificación; considerándose
  positivo a todo resultado en el que se observó
  señal positiva para los genes stx1, stx2 y/o
  rfbO157 esperados, y negativo a todo resultado
  en el que no se observó señal positiva para los
  mismos.
Figura 1. Rango de trabajo, límite de corte y límite de
detección de la técnica de PCR múltiple para la detección
de los genes stx1, stx2 y rfbO157, con la cepa EDL933
(O157:H7, stx1/stx2), en concentraciones de 108 a 100
UFC/50 μl de mezcla de reacción. Calles 1 a 9: Extractos
de ADN. Calle 10: control de sistema. Calle 11: control
positivo, E. coli EDL933 (O157:H7, stx1/stx2). Calle 12:
control negativo, E. coli ATCC 25922 (sin factores de
virulencia). Calle 13: marcador de peso molecular (2000
pb).
•   Figura 2. Inclusividad de la técnica de PCR múltiple para la detección de
    los genes stx1, stx2 y rfbO157. Calle 1: FP 763/02 (O8:H19, stx2). Calle 2:
    FP 406/03 (O8:H19, stx1/stx2). Calle 3: FP 209/99 (O91:H21, stx2). Calle 4:
    FP 428/03 (O20:H19, stx2). Calle 5: FP 412/0 (O22:H16, stx2). Calle 6: FP
    573/01 (O25:NM, stx2). Calle 7: FP 238/03 (O25:NM, stx2). Calle 8: FP
    145/02 (O26:H11, stx1). Calle 9: S 17 B (O26:11, stx1). Calle 10: FP 156/03
    (O91:H21, stx2). Calle 11: T 171 (O91:H21, stx2). Calle 12: FP 257/02
    (O174:H28, stx2). Calle 13: T 154 (O161:H2, stx2). Calle 14: FP 433/01
    (O111:NM, stx1). Calle 15: FP 421/03 (O8:H21, stx2). Calle 16: FP 999/01
    (O11:NM, stx1). Calle 17: control positivo, E. coli EDL933 (O157:H7,
    stx1/stx2). Calle 18: control negativo, E. coli ATCC 25922 (sin factores de
    virulencia). Calle 19: control de sistema. Calle 20: marcador de peso
    molecular (2000 bp).
Tratamiento
El tratamiento de la colitis hemorrágica es de sostén, y
puede incluir líquidos y una dieta blanda. Los antibióticos
son controvertidos y, generalmente, se los evita:
aparentemente, no reducen los síntomas, no previenen
las complicaciones ni disminuyen la propagación, y
pueden aumentar el riesgo de presentar SUH. El uso de
agentes que disminuyen la motilidad (antidiarreicos) en
la colitis hemorrágica también parece aumentar el riesgo
de desarrollar SUH. Los pacientes con complicaciones
pueden requerir cuidados intensivos, incluyendo diálisis,
transfusión y/o infusión de plaquetas.
Síndrome Urémico Hemolítico

El síndrome urémico hemolítico se
produce en 16% de los pacientes con
colitis hemorrágica. Este síndrome es más
frecuente en niños, ancianos y personas
inmunodeprimidas.
Este síndrome se caracteriza por
insuficiencia renal, anemia hemolítica y
trombocitopenia.
Actualidad
• Los primeros informes de la actual epidemia de
  Escherichia coli en Europa, dieron la información que no
  resultó del todo desconocida: A todas luces, la epidemia
  europea sigue el mismo patrón: las personas se
  infectaron con E. coli luego de comer verduras
  contaminadas.
•
• Los brotes, procedentes de una plantación sospechosa
  en Bienenbüttel (Baja Sajonia), fueron recuperados en el
  cubo de la basura de una familia afectada por la
  infección de bacterias E.coli enterohemorrágicas (EHEC)
  O104:H4. Es la que contagió a más de 3.000 personas
  en las últimas semanas.
Los hospitales alemanes enviaron muestras del germen
           al Centro Genómico de Beijing para obtener la
    secuencia de ADN y, el 2 de junio, los investigadores
chinos informaron que la cepa de E. coli no era la misma
    que había contaminado la espinaca hacía cinco años
         (clasificada como O157:H7), sino una variedad
                     completamente distinta (O104:H4).

     A diferencia de la E. coli "común", estas variedades
   contienen los genes de un poderoso veneno conocido
   como toxina Shiga (en honor del bacteriólogo japonés
Kiyoshi Shiga) y con el tiempo fueron identificadas otras
    cepas causantes de diarrea que se clasifica según la
proteína hallada en su superficie. Fue así como la E. coli
O157:H7 irrumpió en escena, con especial virulencia, en
             1982. En aquella oportunidad, los científicos
         determinaron que el origen de la infección fue la
         presencia de la bacteria en hamburguesas poco
                                                 cocidas.
• Por otra parte, la composición genética de la O157:H7 también es
  causa de inquietud. La E. coli se transformó en un patógeno
  mortífero recogiendo los genes de otras bacterias mediante
  recombinación. Por ejemplo, los virus pueden pasar de una E. coli a
  otra e introducir en el nuevo huésped los genes tomados del
  anterior. La E. coli es una olla de recombinación.

• Al principio, se pensó que las bacterias provenían de pepinos y
  otras verduras españolas, pero nadie pudo detectar la presencia de
  O104:H4 en esos sitios. La hipótesis confirmada más reciente
  apunto directamente a brotes de soja de Baja Sajonia, en
  Alemania.

•    La secuencia genómica de la O104:H4 sugiere un nuevo
    ingrediente en el caldero de la evolución, pues las bacterias
    contienen numerosos segmentos de ADN que no están presentes
    en otras cepas de E. coli. Ese nuevo ADN podría ser la causa de su
    alto grado de virulencia. De hecho, la variedad O104:H4 adquirió
    nuevos genes que le vuelven resistente a los antibióticos, lo que
    limita el arsenal médico para combatir la bacteria
La Organización Mundial de la Salud (OMS) ha señalado
que la bacteria intestinal E. coli
Enterohemorrágica (EHEC) puede transmitirse de
persona a persona a través de las heces o por vía oral.

Científicos de las universidades alemanas han
identificado una posible causa de la gravedad de las
infecciones de la bacteria E. coli enterohemorrágica
(EHEC) que ha matado a varias personas en Europa.
Según estos, la infección por la toxina shiga que
segrega la bacteria -que en esta cepa es más de lo
normal- provoca que el organismo produzca
anticuerpos que lo atacan en una reacción de tipo
autoinmune. Esto explicaría por qué los pacientes
empeoran aunque los síntomas de la infección intestinal
empiecen a remitir. Estos anticuerpos dañan ciertas
estructuras cerebrales y renales. Combinados con el
síndrome urémico hemolítico (SUH) que desarrolla una
parte de los pacientes, agrava su estado. Este
síndrome se produce por efecto de la toxina y porque la
bacteria tiene el tamaño para obstruir los capilares que
se encargan de llevar la sangre que la depuren.
La cepa de E. coli encontrada en los pacientes, y que ha
 causado mas de 100 fallecimientos, corresponde a una
    cepa desconocida hasta ahora, altamente tóxica y
resistente a algunos antibióticos, según ha anunciado
      el portavoz de la Organización Mundial de la Salud
                                                     (OMS).
 Los análisis posteriores han mostrado que esta bacteria
             mortal porta fuertes genes resistentes a los
            antibióticos, entre los que se encuentran los
                aminoglucósidos, los macrólidos y los
            betalactámidos, resistentes a las penicilinas,
 cefalosporinas y los antobióticos de uso más frecuente,
   detallan los científicos chinos. Ello hace el tratamiento
                   antiobiótico extremadamente complejo
Opinión Publica:
    Hay cuatro evidencias científicas que supuestamente
    indican que se trata de un producto obtenido mediante
    Ingeniería Genética:
•   Liberación en distintos lugares.
•   Resistencia a múltiples fármacos.
•   No existe contaminación cruzada.
•   Recombinación de varias cepas/ADN se han
    encontrado.

      Este es el mayor brote de E. coli y el más mortífero
          hasta ahora, que se sepa. Esta nueva cepa
       enterohemorrágica de la bacteria Escherichia coli
    (EHEC) puede causar daños en la sangre, los riñones, el
                     hígado y el cerebro.
Una de las lecciones más perturbadoras
es que la O104:H4 no será la última de las
nuevas cepas mortíferas de E. coli: la
evolución dará origen a otras, y cuando
éstas ataquen, no se las podrá detectar
con pruebas comunes de laboratorio. Tarr
considera que tal incertidumbre debería
obligarnos a encontrar nuevos métodos
para proteger las frutas y verduras de la
contaminación con E. coli.
Conclusiones
• A pesar de que E. coli es la bacteria mejor conocida del
  mundo, apenas comenzamos realmente a entender su
  ecología y su biología evolutiva. Es claro que E. coli es
  una bacteria muy diversa y que su genoma es muy
  dinámico, pudiendo llegar a provocar efectos adversos.
• Además, no es el organismo clonal descrito en los
  primeros estudios de genética de poblaciones. Es una
  bacteria con una amplia y compleja sexualidad. Las
  combinaciones exitosas pueden dispersarse de manera
  epidémica en las poblaciones humanas o animales,
  dando una falsa señal de clonalidad.
• Las diversas herramientas genéticas moleculares y de
  genética de poblaciones abren la posibilidad de realizar
  adecuados estudios ecológicos y evolutivos en
  poblaciones bacterianas. Estos estudios deben de estar
  basados en un sólido conocimiento de sus poblaciones
  naturales, su ecología y su biología.
Referencias
•   The Evolutionary Ecology of Escherichia coli. Valeria Souza, Amanda Castillo and Luis E.
    Eguiarte.
•   E. coli Enterohemorrágica, Escherichia coli Productora de Verocitotoxina (ECVT), Escherichia
    coli Productora de Toxina Shiga (STEC), Escherichia coli O157:H7-
•   Validación de una técnica de PCR múltiple para la detección de Escherichia coli productor de
    toxina Shiga. G.A. LEOTTA1, I. CHINEN1, S. EPSZTEYN2, E. MILIWEBSKY1, I.C.
    MELAMED2, M. MOTTER, M. FERRER, E. MAREY, M. RIVAS.
•   DETECCIÓN MOLECULAR DE TOXINAS TERMOESTABLE Y TERMOLABIL DE Escherichia
    coli MEDIANTE HIBRIDACIÓN. Isabel Arias, José Carlos Huguet.
•   Factores de virulencia asociados a la enteropatogenicidad en cepas de Aeromonas spp.
    aisladas de niños con diarrea en Mérida, Venezuela. Lic. Aurora Longa, Lic. Luisa Vizcaya,
    Dra. Beatriz Nieves, Lic. Laura Bravo, Lic. Luis Morier, Dra. Irene Pérez-SchaeL y Dr. Luis
    Enrique Cabrera.
•   Detección de Escherichia coli productor de toxina Shiga en reses bovinas y carne molida de
    Corrientes, Argentina. Cicuta; Deza; Roibón; Pereyra; Benitez; Arzú; Boehringer.
•   Aislamiento, caracterización y subtipificación de cepas de Escherichia coli O157:H7 a partir
    de productos cárnicos y leche M. L. ROLDÁN, I. CHINEN, J. L. OTERO, E. S. MILIWEBSKY,
    N. ALFARO1, P. BURNS, M. RIVAS.
•   Serotypes, virulence genes, and PFGE patterns of enteropathogeni Escherichia coli isolated
    from Cuban pigs with diarrhea. Miguel Blanco Leonel Lazo Jesús E. Blanco Ghizlane Dahbi
    Azucena Mora Cecilia López Enrique A. González ¶Jorge Blanco1*
•   Enteropathogenic Escherichia coli in Psittaciformes. Caroline Schremmer1, J. E. Lohr1*, U.
    Wastlhuber1, J. KoÈ sters2, K. Ravelshofer2, H. SteinruÈ ck3 & L.H. Wieler
•   Principales características y diagnóstico de los grupos patógenos de Escherichia coli.
    Guadalupe Rodríguez-Angeles, M en C.(1)
•   INVESTIGACION DE LAS CEPAS 0111, 055 Y 026 EN LACTANTES CON ENTEROCOLITIS
    AGUDA, TOXICOSIS Y EN NINOS SIN SINDROME DIARREICO. Drs. MANUEL
    RODRIGUEZ, JULIO MENEGHELLO y RENE ADASM
•   http://www.elpais.com. Articulos actuales E. coli 0:157 H:4.
FIN
                                                   Olmedo, Daniela
                                                     Teruel, Nicolás
                                                   Villegas, Merlina
Genética e Introducción a la Biología Molecular – Lic. En Bioquímica

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Escherichia coli Enterohemorragica

  • 1.
  • 2. Introducción Abundantemente estudiada y más temida, Escherichia coli tiene más plasticidad genómica de lo que una vez creímos y puede haber seguido varias vías de convertirse en un agente patógeno.
  • 3. La Escherichia coli, ha estado sujeta a exámenes científicos por más de un siglo y ha ocupado el centro en el desarrollo de la ingeniería genética tecnológica en el laboratorio. La bacteria está sometida a pequeños cambios en su morfología, su genoma es pequeño y dinámico, y con numerosos cambios de entidad que no han parado de evolucionar
  • 4. Se trata de un organismo modelo en estudios evolutivos, en poblaciones naturales y en el laboratorio en los estudios llamados “evolución experimental”. Estas investigaciones nos han permitido comprender mejor la acción de 2 fuerzas evolutivas, la selección y la mutación. Estos estudios estaban basados en la prevaleciente noción de que estas bacterias son clones, pasando genes con un pequeño intercambio de generación en generación. Nuestra familiaridad con E. coli viene de nuestra íntima experiencia con ella, así como su uso extendido como caballo de fuerza en los laboratorios genéticos.
  • 5. La E. coli vive en el intestino de los seres humanos como también en otros mamíferos. También vive en otras partes en la naturaleza. E. coli hace titulares cuando una cepa patogénica contamina la comida o la bebida, pero en realidad hay muchas cepas benignas viviendo inadvertidamente entre nuestra flora intestinal y en nuestro medio ambiente.
  • 6. ¿A que familia bacteriana pertenece? La E. coli es un miembro de una familia entero-bacteriana. Los estudios de la filogenia molecular indican que está estrechamente relacionada con otros patógenos de vertebrados, incluyendo Shigella y Salmonella, la bacteria del Cólera y Haemophilus, que puede causar neumonía y meningitis. Escherichia coli es un bastón Gramnegativo (bacilo) de la familia Enterobacteriaceae. La mayoría de las E. coli son comensales normales que se encuentran en el tracto digestivo. Las cepas patógenas de este organismo se distinguen de la flora normal por poseer factores de virulencia, como exotoxinas. Los factores de virulencia específicos pueden utilizarse, junto al tipo de enfermedad, para separar dichos organismos en patotipos.
  • 7. Escherichia coli coloniza el intestino del hombre pocas horas después del nacimiento y se considera de flora normal, pero hay descritos seis grupos de E. coli productora de diarrea: • E. coli entero-toxigénica (ETEC) • E. coli entero-patogénica (EPEC) • E. coli entero-invasiva (EIEC) • E. coli shigatoxina (STEC) • E. coli adhesiva difusa (DAEC) • E. coli entero-agregativa (EAEC) La bacteria se puede aislar e identificar tradicionalmente con base en sus características bioquímicas o serológicas, pero también se pueden estudiar sus mecanismos de patogenicidad mediante ensayos en cultivos celulares o modelos animales y, más recientemente, empleando técnicas de biología molecular que evidencian la presencia de genes involucrados en dichos mecanismos.
  • 8. Características • La entero-bacteria se caracteriza por la capacidad de una respiración facultativa. • El genoma de la E. coli, en promedio, consiste en 50.8% de pares de bases G-C • El ambiente natural de la E. coli es el intestino de mamíferos y aves. Estudios recientes indican que la E. coli también puede estar presente en otros órganos del organismo además de en el intestino. Pueden sobrevivir en otras partes del sistema digestivo, en sangre, en el tracto urogenital y en ambientes secundarios.
  • 9. Mapa Genómico Circular de E.coli O:157 H:4. Nicole T. Perna and colleagues at the University of Wisconsin in 2001.
  • 10. Existe una gran diversidad genética y ecológica, así como una alta recombinación e intercambio genético. Estos fenómenos permiten generar gran cantidad de genotipos a pesar de no suceder en cada generación. No sólo se mueven genes, sino que recombinan plásmidos y fragmentos de genes.
  • 11. Plásmidos: • Esta molécula de DNA circular es el componente más dinámico del genoma bacteriano ya que se mueven con facilidad entre las cepas. • Se han descripto alrededor de 300 plásmidos en la especie. • Muchos plásmidos son capaces de transferirse ellos mismos entre especies. Diferentes modelos de distribución de plásmidos son posibles en las bacterias. • La transferencia horizontal o lateral es un talento especial de las bacterias las cuales pueden cambiar DNA por o a través de líneas de especies. Tal intercambio de genes toma lugar a través de la conjugación bacterial, cuando 2 bacterias se unen y comparten DNA.
  • 12. Las bacterias pueden adquirir nuevos genes mediante varios métodos, uno de ellos es la transformación: Una bacteria capaz de adquirir DNA del entorno, adquiere los genes liberados por otra bacteria que ha sufrido una lisis celular e incorpora el nuevo DNA dentro de su genoma. Las bacterias también pueden adquirir los genes provenientes de virus, y se llaman bacteriófagos.
  • 13.
  • 14. La conjugación bacteriana es un segundo método de trasferencia horizontal, en este ejemplo una bacteria posee un plásmido (elemento genético extracromosomal) de la que otra carece. El plásmido contiene genes que codifican para proteínas que le permite a las bacterias reconocerse y unirse. La bacteria con el plásmido extiende una proyección para unirse con la segunda bacteria y crea una copia del plásmido para su vecina. La vecina adquiere una copia del plásmido original que puede incluir factores de virulencia o resistencia a los antibióticos.
  • 15.
  • 16. Los genes de las bacterias pueden experimentar la precombinación y la transposición de elementos genéticos. En este ejemplo podemos observar una transposición replicativa en la cual el elemento transponible es replicado e incorporado en el otro plásmido.
  • 17. Serotipificación • Para determinar el grupo patógeno al que pertenecen Kauffman desarrolló un esquema de serotipificación que continuamente varía y que actualmente tiene 176 antígenos somáticos (O), 112 flagelares (H) y 60 capsulares (K). El antígeno “O” es el responsable del serogrupo; la determinación del antígeno somático y flagelar (O:H) indica el serotipo, el cual en ocasiones se asocia con un cuadro clínico en particular
  • 18.
  • 19. Según los antígenos O (lipopolisacáridos somáticos), H (flagelares) y K (capsulares). Los serotipos que se conocen por contener ECEH incluyen a E. coli O157:H7, el organismo no móvil E. coli O157:H, y los miembros de otros serogrupos, en particular O26, O103, O111 y O145 pero también O91, O104, O113, O117, O118, O121, O128 y otros. La E. coli O157:H está estrechamente relacionada con la E. coli O157:H7, pero no es simplemente una versión inmóvil de este organismo; también posee una combinación distintiva de rasgos fenotípicos y de virulencia.
  • 22.
  • 23. Patogenicidad • En 1996 surgió una pregunta diferente acerca de los patrones de mutación cuando J. Eugene Leclerc encontró que las bacterias O157:H7 son hipermutables. Exhibían una gran tasa de mutación en relación a las no patogénicas. Según Leclerc los errores en el sistema de reparación del DNA podía constituir un estilo de adaptación que ayudaba a las bacterias a escapara del sistema inmune de sus hospedadores.
  • 24. Dos de los tipos más peligrosos de E. coli son EHEP (o cepa entero-hemorrágica) cepa como O157:H7 comúnmente relacionada con contaminación de alimentos, y EPEC (o entero-patogénica) cepa que tiene importancia en la causa de diarrea.
  • 25. Transmisión • Las ECEH se transmiten por vía fecal–oral. Se pueden propagar entre animales por contacto directo o a través de bebederos, alimento compartido, lugares de pastaje contaminados u otras fuentes ambientales. • • La ECEH O157:H7 se transmite principalmente a los humanos a través del consumo de alimentos y agua contaminados, o por el contacto con animales, heces y suelo contaminado. La transmisión de persona a persona puede contribuir con la propagación de la enfermedad durante los brotes; sin embargo, los humanos no parecen ser huésped de mantenimiento de este organismo
  • 26.
  • 27. • Las epidemias de ECEH O157:H7 de origen alimentario generalmente son causadas por la ingesta de productos de origen animal mal cocidos o no pasteurizados, en especial, carne molida pero también otras carnes y embutidos, y leche y queso no pasteurizados. • Otros brotes han estado vinculados a la alfalfa o brotes de rábanos, lechuga, espinaca y otros vegetales contaminados, así como también sidra no pasteurizada. El agua de riego contaminada con heces es una fuente importante de ECEH O157:H7 en los vegetales. Este organismo se puede adherir a las plantas, y sobrevive bien en la superficie de una variedad de frutas, vegetales y hierbas culinarias frescas. • La ECEH O157:H7 puede permanecer viable por largos periodos en muchos productos alimenticios. Puede sobrevivir durante al menos 9 meses en carne molida almacenada a -20 °C. Tolera la acidez, y permanece infecciosa de semanas a meses en alimentos ácidos. Además, resiste la desecación
  • 28. Factores de Virulencia • El serotipeado, no es suficiente para la identificación de un organismo como una ECEH; también deben estar presentes factores de virulencia. • Las cepas de E. coli O157:H7 son relativamente homogéneas, y casi todos estos organismos llevan factores de virulencia asociados con colitis hemorrágica y SUH. • Debido a que muchos factores de virulencia (incluso la verocitotoxina) se llevan en los plásmidos o en bacteriófagos, pueden surgir nuevas cepas de E. coli que poseen nuevos patrones de la enfermedad y/o sean difíciles de clasificar por los sistemas actuales.
  • 29. Se detecto en casos de Síndrome urémico hemolítico (SUH) caracterizado por daño renal agudo, trombocitopenia y anemia hemolítica microangiopática, precedida por diarrea con sangre, en heces de E. coli, la presencia de produccion de una citotoxina con actividad en células Vero, por lo que se le llama verotoxina (VT), y a las cepas capaces de producirla se les denominó E. coli verotoxigénicas (VTEC). Además, se observó que la citotoxina se neutralizó con antitoxina obtenida a partir de Shigella dysenteriae tipo 1, por lo que también se le llamó “shiga-like toxin” o toxina semejante a shiga (SLT) o “shiga toxin” (STX), y a las E. coli capaces de producirla se les da el nombre de STEC La capacidad toxigénica de las cepas es necesaria para que el paciente desarrolle colitis hemorrágica y diarrea con sangre, ya que la citotoxina STX es el principal mecanismo de patogenicidad de EHEC y su síntesis está relacionada con la presencia del bacteriófago STX, que está insertado en el genoma. La STX actúa a nivel de síntesis de proteínas ya que se une a la subunidad 60S de los ribosomas de las células intestinales o renales del hospedero
  • 30. Además de la toxina, las EHEC tienen otros mecanismos de patogenicidad como el fenómeno de adherencia y esfacelación (A/E), y presentan el gen cromosomal eae que codifica para la proteína de membrana externa (OMP) de 94 kilodaltones (kDa), llamada intimina, cuya expresión es regulada por genes plasmídicos; el gene eae también se encuentra en las cepas EPEC.
  • 31. • El principal mecanismo de patogenicidad de las cepas EHEC no-O157:H7 es la toxina STX; también tienen el fenómeno de A/E y la presencia del plasmido pO157 como mencionamos antes. • En los últimos veinte años, Escherichia coli productor de toxina Shiga (STEC) ha sido reconocido como agente causal de enfermedad gastrointestinal grave, con riesgo de complicaciones que ponen en peligro la vida de las personas afectadas. • Escherichia coli O157:H7 es el prototipo de un grupo de más de 150 serotipos de STEC que poseen los mismos marcadores de virulencia. Entre ellos, existen 5 serotipos (O26:H11, O103:H2, O111:NM, O113:H21 y O145:NM) que fueron reconocidos por la Organización Mundial de la Salud por su potencial patogénico
  • 32.
  • 33. E. coli tiene varias formas capaces de inducir la diarrea en un huésped mamífero; estas comparten algunos genes, pero puede variar ampliamente. • E. coli enterotóxica inyecta toxinas en las células epiteliales las células del intestino (a). • E. coli enterohemorrágica, incluyendoO157: H7, causa diarrea con sangre (b). • La que daña las vellosidades intestinales e induce la polimerización de la actina en fragmentos del citoesqueleto de la célula huésped para formar un vínculo íntimo con la célula huésped, y se inyecta también toxinas en esta. Enteroagregativa E. coli, forma una biopelícula y secretan citotoxinas en el epitelio(c). • E. coli de Adherencia difusa puede causar el alargamiento de las microvellosidades (d). • Enteropatógena E. coli, una causa mundial de diarrea infantil, las acciones de exhibición similar a las bacterias enterohemorrágica, la inducción de adherencia a la célula huésped (e). • Por último,enteroinvasiva por E. coli puede invadir epiteliales de las células y se desplazan lateralmente dentro del epitelio (f).
  • 34. Cassettes de genes patógenos, o "islas de patogenicidad“: se puede montar en el genoma bacteriano de varias maneras. Un virus llamado bacteriófago puede insertar genes individuales o paquetes de genes. (El virus rompe la membrana celular.) • Una bacteria por lo tanto, pueden adquirir la totalidad de factores de un virus fago, a traves de transducción (a). • Sin embargo, los factores se han encontrado de forma independiente en muchas cepas. Esto sugiere que dichos factores se pueden construir a traves de los elementos adquiridos en pedazos y luego se traslada en torno a el genoma en una secuencia de eventos, dejando copias de genes en diferentes ubicaciones(b). • Por otra parte, una isla inestable puede romper, desarmar a los patógenos, pero dejar de nuevo los fragmentos solos(c).
  • 35.
  • 36. Métodos de Identificación • Dado que los humanos habitualmente no son portadores la ECEH, los casos clínicos se pueden diagnosticar mediante el hallazgo de estos organismos en las muestras fecales. • Las ECEH en ocasiones son difíciles de identificar. Son una población menor en la flora de la materia fecal o en los alimentos. • No existe una técnica única que se pueda utilizar para aislar todos los serotipos de ECEH.
  • 37. Para el aislamiento, la identificación y la caracterización de cepas de E. coli se aplican métodos tradicionales, métodos in vivo e in vitro y de biología molecular. El método tradicional es el aislamiento de la bacteria, tomada directamente de materia fecal o con hisopo rectal. Ocurre secuencialmente: – Siembra con la punta del hisopo en la parte superior de una placa de agar Mac Conkey u otro medio selectivo. – Con una asa redonda de nicromel, se continúa el aislamiento, sembrando por estría cruzada. – Se incuba a 37 °C durante 18-24 h. – Se seleccionan de 5 a 10 colonias típicas de E. coli lactosa positivas. Cuando se sospecha la presencia de EHEC se reemplaza lactosa por agar Mac Conkey con 1% de sorbitol.
  • 38. La identificación del grupo EHEC se puede hacer por serotipificación o bien por poner de manifiesto la producción de la toxina STX también se puede cuantificar la elevación de anticuerpos dirigidos hacia el lipopolisacárido de E. coli O157:H7, así como demostrar la presencia de factores de virulencia como pO157, el fenómeno de A/E o los genes involucrados, además de la fagotipificación nombrados anteriormente.
  • 39. Métodos de Biología Molecular La caracterización y clasificación de cepas patógenas de E. coli se puede hacer con métodos de biología molecular, una de las herramientas de diagnóstico más recientes, tal es el caso del uso de sondas para la hibridación en fase sólida como es el “colony blot”
  • 40. Colony Blot Se utilizan sondas. Las sondas son fragmentos pequeños de DNA que contienen parte de los genes que codifican para algún factor de virulencia y pueden estar marcadas radioactivamente con 32P o no radiactivamente con biotina o digoxigenina. Implica la transferencia del DNA de una colonia de bacterias a una fase sólida que puede ser nylon, papel filtro o nitrocelulosa, para su posterior hibridación: – Las colonias se incuban 4 horas a 37 °C. – Después de este tiempo se coloca la membrana de nylon sobre la superficie de la placa. – Las bacterias se rompen sobre la membrana y el DNA se desnaturaliza al colocar ésta en una solución de hidróxido de sodio para posteriormente fijarle el DNA – La hibridación se realiza con una sonda marca da con digoxigenina empleando un anticuerpo antidigoxigenina conjugado a la enzima fosfatasa alcalina.
  • 41.
  • 42.
  • 43. PCR Reaccion en cadena de la polimerasa • Esta técnica también se utiliza como Método determinativa. • Es hoy una de las técnicas moleculares mas utilizadas. Permite amplificar los fragmentos de DNA miles de millones de veces en pocas horas. • La base PCR es la replicación catalizada por una enzima DNA Polimerasa.
  • 44. Para llevar a cabo la PCR se comienza con una solución que incluye – El DNA blanco (DNA para amplificar). – La DNA Polimerasa. – Desoxirribonucleósidos trifosfato (dNTP) – Los cebadores. – Iones Mg2+ y otras sales.
  • 45. Una reacción de la PCR típica incluye 3 pasos: – Paso 1: Una solución de DNA se calienta entre 90 y 100 grados para romper los puentes de Hidrogeno durante solo uno o dos minutos. Se crean moldes monocatenarios. – Paso 2: La solución se enfría con rapidez a una temperatura entre 30 y 65ºC durante un minuto o menos. Los cebadores se unirán a las secuencias complementarias. – Paso 3: La solución se calienta entre 60 y 70ºC, temperatura a la cual la DNA Polimerasa puede sintetizar cadenas nuevas de DNA.
  • 46.
  • 47. Específicamente la PCR para Escherichia coli EHEC: La muestra puede ser una cepa pura aislada de muestra clínica. La cepa se siembra por estría y se incuba durante 24 horas; a continuación se resuspenden cinco colonias de bacterias en 0.2 ml de agua y se somete a ebullición para desnaturalizar el DNA. De la suspensión se toma una alícuota para el tubo donde se realiza la PCR. Los reactivos necesarios para la PCR de cada muestra son adenina, timina, citocina, guanina, MgCl2, iniciadores y enzima Taq polimerasa.
  • 48. De esta etapa de PCR, luego sigue la electroforesis de campo pulsado (pulsed-field gel electrophoresis PFGE), un método de biología molecular que cada vez se emplea más con fines epidemiológicos, debido a que separan largos fragmentos de DNA que se obtienen al digerir DNA genómico con enzimas de restricción que realizan cortes poco frecuentes.
  • 49.
  • 50. Validación de una técnica de PCR múltiple para la detección de Escherichia coli productor de toxina Shiga “ La infección por Escherichia coli productor de toxina Shiga (STEC) es causa de diarrea con o sin sangre, colitis hemorrágica y síndrome urémico hemolítico (SUH) en humanos. El objetivo de este trabajo fue validar una técnica de PCR múltiple para el diagnóstico de STEC basado en la detección de los genes stx1, stx2 y rfbO157.” La técnica validada es una alternativa apropiada para la detección y confirmación de STEC O157 y no-O157 a partir de cultivos bacterianos.
  • 51. En Argentina, el SUH es endémico y constituye la primera causa pediátrica de insuficiencia renal aguda y la segunda de insuficiencia renal crónica, por eso es de gran importancia su análisis y determinación.
  • 52.
  • 53. Como se menciono antes, el objetivo de este trabajo fue validar una técnica de PCR múltiple basada en la detección de los genes stx1, stx2 y rfbO157 de STEC O157 y no-O157. Para ello se plantearon las siguientes etapas: – Comparar dos técnicas de extracción de ADN. – Evaluar la técnica de PCR múltiple mediante los siguientes parámetros: a) rango de trabajo, b) selectividad, c) robustez. – Desafiar la técnica de PCR múltiple combinando distintas concentraciones de dos cepas STEC con diferentes factores de virulencia blanco de la reacción.
  • 54. Metodo • Las cepas utilizadas fueron identificadas por pruebas bioquímicas y seroagrupadas según su antígeno somático (O) y flagelar (H). Para la detección del antígeno O se utilizó la técnica de aglutinación en lámina con antisuero policlonal anti-O y para la detección del antígeno H se utilizó la técnica de aglutinación en tubo con antisuero anti-H . Se determinó la capacidad de producción de toxina Shiga de las cepas STEC mediante ensayos de citotoxicidad específica en células Vero utilizando anticuerpos monoclonales específicos MAb13C4 para Stx1 y BC5BB12 para Stx2 . Las células Vero poseen una alta sensibilidad a la actividad de las toxinas Shiga, por lo que la técnica de citotoxicidad utilizando esta línea celular es considerada prueba de oro.
  • 55. Las cepas conservadas a -70 °C en caldo tripticasa soja (CTS) con 20% de glicerol, fueron sembradas en CTS e incubadas a 37 °C durante 4 h y luego en agar Mac Conkey (Becton Dickinson) incubándose a 37 °C durante 18 horas. A partir de una colonia se realizó un subcultivo en CTS a 37 °C durante 18 horas.
  • 56. Secuencialmente: – Se realizaron diluciones decimales en agua tridestilada estéril, – Un ml de cada dilución se centrifugó a 10.000 rpm durante 5 minutos. – Se descartó el sobrenadante y se agregó a cada tubo solución de tritón X-100 al 1% en buffer TE 1X. – Luego de hervir en baño de agua durante 15 minutos, los tubos se centrifugaron a 10.000 rpm durante 5 minutos. – Se conservó el sobrenadante para ser utilizado como blanco en la técnica de PCR múltiple.
  • 57. Deteccion • Se utilizaron tres pares de oligonucleótidos iniciadores para amplificar un fragmento del gen correspondiente a la subunidad B de stx1, un fragmento del gen correspondiente a la subunidad A de stx2 (52) y un fragmento del gen rfbO157.
  • 58. • Se utilizó un termociclador Biometra • Mezcla de reacción de PCR, conteniendo Buffer PCR 10X, mezcla de dNTPs, Cl2Mg. pares de oligonucleótidos primers Stx2 y O157, par de oligonucleótidos primers Stx1, Taq polimerasa, Agua tridestilada estéril y finalmente ADN templado. • Como control positivo y negativo se utilizó el ADN templado de las cepas E. coli, además se utilizo mezcla de reacción de PCR sin ADN templado como control de sistema.
  • 59. La preparación de las muestras se realizó por triplicado. La PCR múltiple se realizó simultáneamente a todos los extractos de ADN, empleando el mismo equipamiento y los mismos reactivos. En el caso de una PCR múltiple, lo que se persigue es amplificar simultáneamente en un único tubo distintas secuencias específicas, lo cual necesariamente implica que los reactivos mezclados y el programa utilizado sean suficientes y adecuados para permitir la detección de cada diana y no inhibir la de las demás. Con este fin, algunos parámetros, como la concentración de magnesio y de cebadores, y el tipo y la cantidad de ADN polimerasa, pueden ajustarse experimentalmente. Para otros, en cambio, debe realizarse un diseño exhaustivo previo.
  • 60. Es necesario tener en cuenta varias premisas: a ) escoger o diseñar oligonucleótidos que no interaccionen entre sí, es decir, que no formen oligómeros; b ) que tengan temperaturas de anillamiento similares; c ) que cada pareja amplifique una única secuencia diana, d ) que generen amplificaciones de tamaño suficientemente diferente como para poder ser separados y diferenciados tras la amplificación.
  • 61. Análisis Estadístico • Para el análisis estadístico de los resultados se utilizó una tabla de contingencia. Se compararon los resultados con los obtenidos mediante citotoxicidad específica en células Vero y serotipificación; considerándose positivo a todo resultado en el que se observó señal positiva para los genes stx1, stx2 y/o rfbO157 esperados, y negativo a todo resultado en el que no se observó señal positiva para los mismos.
  • 62.
  • 63. Figura 1. Rango de trabajo, límite de corte y límite de detección de la técnica de PCR múltiple para la detección de los genes stx1, stx2 y rfbO157, con la cepa EDL933 (O157:H7, stx1/stx2), en concentraciones de 108 a 100 UFC/50 μl de mezcla de reacción. Calles 1 a 9: Extractos de ADN. Calle 10: control de sistema. Calle 11: control positivo, E. coli EDL933 (O157:H7, stx1/stx2). Calle 12: control negativo, E. coli ATCC 25922 (sin factores de virulencia). Calle 13: marcador de peso molecular (2000 pb).
  • 64. Figura 2. Inclusividad de la técnica de PCR múltiple para la detección de los genes stx1, stx2 y rfbO157. Calle 1: FP 763/02 (O8:H19, stx2). Calle 2: FP 406/03 (O8:H19, stx1/stx2). Calle 3: FP 209/99 (O91:H21, stx2). Calle 4: FP 428/03 (O20:H19, stx2). Calle 5: FP 412/0 (O22:H16, stx2). Calle 6: FP 573/01 (O25:NM, stx2). Calle 7: FP 238/03 (O25:NM, stx2). Calle 8: FP 145/02 (O26:H11, stx1). Calle 9: S 17 B (O26:11, stx1). Calle 10: FP 156/03 (O91:H21, stx2). Calle 11: T 171 (O91:H21, stx2). Calle 12: FP 257/02 (O174:H28, stx2). Calle 13: T 154 (O161:H2, stx2). Calle 14: FP 433/01 (O111:NM, stx1). Calle 15: FP 421/03 (O8:H21, stx2). Calle 16: FP 999/01 (O11:NM, stx1). Calle 17: control positivo, E. coli EDL933 (O157:H7, stx1/stx2). Calle 18: control negativo, E. coli ATCC 25922 (sin factores de virulencia). Calle 19: control de sistema. Calle 20: marcador de peso molecular (2000 bp).
  • 65. Tratamiento El tratamiento de la colitis hemorrágica es de sostén, y puede incluir líquidos y una dieta blanda. Los antibióticos son controvertidos y, generalmente, se los evita: aparentemente, no reducen los síntomas, no previenen las complicaciones ni disminuyen la propagación, y pueden aumentar el riesgo de presentar SUH. El uso de agentes que disminuyen la motilidad (antidiarreicos) en la colitis hemorrágica también parece aumentar el riesgo de desarrollar SUH. Los pacientes con complicaciones pueden requerir cuidados intensivos, incluyendo diálisis, transfusión y/o infusión de plaquetas.
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  • 67. Síndrome Urémico Hemolítico El síndrome urémico hemolítico se produce en 16% de los pacientes con colitis hemorrágica. Este síndrome es más frecuente en niños, ancianos y personas inmunodeprimidas. Este síndrome se caracteriza por insuficiencia renal, anemia hemolítica y trombocitopenia.
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  • 69.
  • 70. Actualidad • Los primeros informes de la actual epidemia de Escherichia coli en Europa, dieron la información que no resultó del todo desconocida: A todas luces, la epidemia europea sigue el mismo patrón: las personas se infectaron con E. coli luego de comer verduras contaminadas. • • Los brotes, procedentes de una plantación sospechosa en Bienenbüttel (Baja Sajonia), fueron recuperados en el cubo de la basura de una familia afectada por la infección de bacterias E.coli enterohemorrágicas (EHEC) O104:H4. Es la que contagió a más de 3.000 personas en las últimas semanas.
  • 71. Los hospitales alemanes enviaron muestras del germen al Centro Genómico de Beijing para obtener la secuencia de ADN y, el 2 de junio, los investigadores chinos informaron que la cepa de E. coli no era la misma que había contaminado la espinaca hacía cinco años (clasificada como O157:H7), sino una variedad completamente distinta (O104:H4). A diferencia de la E. coli "común", estas variedades contienen los genes de un poderoso veneno conocido como toxina Shiga (en honor del bacteriólogo japonés Kiyoshi Shiga) y con el tiempo fueron identificadas otras cepas causantes de diarrea que se clasifica según la proteína hallada en su superficie. Fue así como la E. coli O157:H7 irrumpió en escena, con especial virulencia, en 1982. En aquella oportunidad, los científicos determinaron que el origen de la infección fue la presencia de la bacteria en hamburguesas poco cocidas.
  • 72. • Por otra parte, la composición genética de la O157:H7 también es causa de inquietud. La E. coli se transformó en un patógeno mortífero recogiendo los genes de otras bacterias mediante recombinación. Por ejemplo, los virus pueden pasar de una E. coli a otra e introducir en el nuevo huésped los genes tomados del anterior. La E. coli es una olla de recombinación. • Al principio, se pensó que las bacterias provenían de pepinos y otras verduras españolas, pero nadie pudo detectar la presencia de O104:H4 en esos sitios. La hipótesis confirmada más reciente apunto directamente a brotes de soja de Baja Sajonia, en Alemania. • La secuencia genómica de la O104:H4 sugiere un nuevo ingrediente en el caldero de la evolución, pues las bacterias contienen numerosos segmentos de ADN que no están presentes en otras cepas de E. coli. Ese nuevo ADN podría ser la causa de su alto grado de virulencia. De hecho, la variedad O104:H4 adquirió nuevos genes que le vuelven resistente a los antibióticos, lo que limita el arsenal médico para combatir la bacteria
  • 73. La Organización Mundial de la Salud (OMS) ha señalado que la bacteria intestinal E. coli Enterohemorrágica (EHEC) puede transmitirse de persona a persona a través de las heces o por vía oral. Científicos de las universidades alemanas han identificado una posible causa de la gravedad de las infecciones de la bacteria E. coli enterohemorrágica (EHEC) que ha matado a varias personas en Europa. Según estos, la infección por la toxina shiga que segrega la bacteria -que en esta cepa es más de lo normal- provoca que el organismo produzca anticuerpos que lo atacan en una reacción de tipo autoinmune. Esto explicaría por qué los pacientes empeoran aunque los síntomas de la infección intestinal empiecen a remitir. Estos anticuerpos dañan ciertas estructuras cerebrales y renales. Combinados con el síndrome urémico hemolítico (SUH) que desarrolla una parte de los pacientes, agrava su estado. Este síndrome se produce por efecto de la toxina y porque la bacteria tiene el tamaño para obstruir los capilares que se encargan de llevar la sangre que la depuren.
  • 74. La cepa de E. coli encontrada en los pacientes, y que ha causado mas de 100 fallecimientos, corresponde a una cepa desconocida hasta ahora, altamente tóxica y resistente a algunos antibióticos, según ha anunciado el portavoz de la Organización Mundial de la Salud (OMS). Los análisis posteriores han mostrado que esta bacteria mortal porta fuertes genes resistentes a los antibióticos, entre los que se encuentran los aminoglucósidos, los macrólidos y los betalactámidos, resistentes a las penicilinas, cefalosporinas y los antobióticos de uso más frecuente, detallan los científicos chinos. Ello hace el tratamiento antiobiótico extremadamente complejo
  • 75.
  • 76.
  • 77. Opinión Publica: Hay cuatro evidencias científicas que supuestamente indican que se trata de un producto obtenido mediante Ingeniería Genética: • Liberación en distintos lugares. • Resistencia a múltiples fármacos. • No existe contaminación cruzada. • Recombinación de varias cepas/ADN se han encontrado. Este es el mayor brote de E. coli y el más mortífero hasta ahora, que se sepa. Esta nueva cepa enterohemorrágica de la bacteria Escherichia coli (EHEC) puede causar daños en la sangre, los riñones, el hígado y el cerebro.
  • 78. Una de las lecciones más perturbadoras es que la O104:H4 no será la última de las nuevas cepas mortíferas de E. coli: la evolución dará origen a otras, y cuando éstas ataquen, no se las podrá detectar con pruebas comunes de laboratorio. Tarr considera que tal incertidumbre debería obligarnos a encontrar nuevos métodos para proteger las frutas y verduras de la contaminación con E. coli.
  • 79. Conclusiones • A pesar de que E. coli es la bacteria mejor conocida del mundo, apenas comenzamos realmente a entender su ecología y su biología evolutiva. Es claro que E. coli es una bacteria muy diversa y que su genoma es muy dinámico, pudiendo llegar a provocar efectos adversos. • Además, no es el organismo clonal descrito en los primeros estudios de genética de poblaciones. Es una bacteria con una amplia y compleja sexualidad. Las combinaciones exitosas pueden dispersarse de manera epidémica en las poblaciones humanas o animales, dando una falsa señal de clonalidad. • Las diversas herramientas genéticas moleculares y de genética de poblaciones abren la posibilidad de realizar adecuados estudios ecológicos y evolutivos en poblaciones bacterianas. Estos estudios deben de estar basados en un sólido conocimiento de sus poblaciones naturales, su ecología y su biología.
  • 80. Referencias • The Evolutionary Ecology of Escherichia coli. Valeria Souza, Amanda Castillo and Luis E. Eguiarte. • E. coli Enterohemorrágica, Escherichia coli Productora de Verocitotoxina (ECVT), Escherichia coli Productora de Toxina Shiga (STEC), Escherichia coli O157:H7- • Validación de una técnica de PCR múltiple para la detección de Escherichia coli productor de toxina Shiga. G.A. LEOTTA1, I. CHINEN1, S. EPSZTEYN2, E. MILIWEBSKY1, I.C. MELAMED2, M. MOTTER, M. FERRER, E. MAREY, M. RIVAS. • DETECCIÓN MOLECULAR DE TOXINAS TERMOESTABLE Y TERMOLABIL DE Escherichia coli MEDIANTE HIBRIDACIÓN. Isabel Arias, José Carlos Huguet. • Factores de virulencia asociados a la enteropatogenicidad en cepas de Aeromonas spp. aisladas de niños con diarrea en Mérida, Venezuela. Lic. Aurora Longa, Lic. Luisa Vizcaya, Dra. Beatriz Nieves, Lic. Laura Bravo, Lic. Luis Morier, Dra. Irene Pérez-SchaeL y Dr. Luis Enrique Cabrera. • Detección de Escherichia coli productor de toxina Shiga en reses bovinas y carne molida de Corrientes, Argentina. Cicuta; Deza; Roibón; Pereyra; Benitez; Arzú; Boehringer. • Aislamiento, caracterización y subtipificación de cepas de Escherichia coli O157:H7 a partir de productos cárnicos y leche M. L. ROLDÁN, I. CHINEN, J. L. OTERO, E. S. MILIWEBSKY, N. ALFARO1, P. BURNS, M. RIVAS. • Serotypes, virulence genes, and PFGE patterns of enteropathogeni Escherichia coli isolated from Cuban pigs with diarrhea. Miguel Blanco Leonel Lazo Jesús E. Blanco Ghizlane Dahbi Azucena Mora Cecilia López Enrique A. González ¶Jorge Blanco1* • Enteropathogenic Escherichia coli in Psittaciformes. Caroline Schremmer1, J. E. Lohr1*, U. Wastlhuber1, J. KoÈ sters2, K. Ravelshofer2, H. SteinruÈ ck3 & L.H. Wieler • Principales características y diagnóstico de los grupos patógenos de Escherichia coli. Guadalupe Rodríguez-Angeles, M en C.(1) • INVESTIGACION DE LAS CEPAS 0111, 055 Y 026 EN LACTANTES CON ENTEROCOLITIS AGUDA, TOXICOSIS Y EN NINOS SIN SINDROME DIARREICO. Drs. MANUEL RODRIGUEZ, JULIO MENEGHELLO y RENE ADASM • http://www.elpais.com. Articulos actuales E. coli 0:157 H:4.
  • 81. FIN Olmedo, Daniela Teruel, Nicolás Villegas, Merlina Genética e Introducción a la Biología Molecular – Lic. En Bioquímica