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Universidad Central de Venezuela
Facultad de Medicina
Escuela de Medicina Luis Razetti
Cátedra de Bioquímica



   Tema 2:
   Estructura y Función de las
   Proteínas (1/5)
                         Dra. Vanessa Miguel
                       vanessa.miguel@ucv.ve
                             @bioquitips

                                     Noviembre 2011
¿Por Qué estudiar las proteínas?
Proteínas y enfermedad

                     Ausencia o
                     deficiencia
     Exceso de una                 Incorrecto
                     de una
     proteína                      plegamiento
                     proteína
                                   de la proteína




                     Enfermedad
Plegamiento incorrecto de proteínas en
enfermedades neurodegenerativas
Proteínas..nos podemos preguntar…

 ¿Dónde se forman?
 ¿Cómo son?

 ¿Cuántas son?

 ¿Cómo se estudian?

 ¿Qué funciones realizan?

 ¿Cómo se relacionan con la salud y la enfermedad?

 ¿Cómo pueden evitarse las enfermedades por
  deficiencia o por exceso en la alimentación?
Y muchas más…
Proteínas

   Macromoléculas orgánicas.
   Constituidas por C, H, O, N y S.
   Peso, tamaño y forma variable.
   Abundantes en los tipos celulares (una célula
    humana 10.000 proteínas distintas).
   Funciones diversas: metabolismo, contracción
    muscular, respuesta inmunológica, crecimiento,
    transporte, catálisis enzimática, funciones de sostén
    (huesos), etc.
   Polímeros lineales de L-aminoácidos.
Formas, tamaño y peso variables
Funciones
Fórmula General de los Aminoácidos


              H

   +H3N       C     COOH

               R
Fórmula General de los Aminoácidos

                            R
C (central)
Grupo amino
                            CH
Grupo carboxilo
Átomo de Hidrógeno
                     NH3+        COOH
Cadena lateral R
¿Cuál de las siguientes moléculas es un α-
aminoácido?
Aminoácidos

1. Glicina                                      11. Treonina
2. Alanina                                      12. Tirosina
3. Valina                    Cadena             13. Cisteína
4. Leucina                   Lateral            14. Arginina
5. Isoleucina                   o               15. Lisina
6. Prolina                    Grupo             16. Histidina
7. Fenilalanina                 R               17. Acido Aspártico
8. Triptófano                                   18. Acido Glutámico
9. Metionina                                    19. Asparagina
10. Serina                                      20. Glutamina


•Se conocen otros 150 aminoácidos pero NO forman parte de las proteínas.
Ejemplos de algunos aminoácidos
Aminoácidos

    Dos propiedades importantes que los distinguen
    son:
   Polaridad. Si un aminoácido es polar o no -
    polar influye como interactúa con el agua.
   Carga. Si tienen o no carga. Algunos
    aminoácidos pueden ionizarse para tener
    cargas positivas, otros se ionizan con cargas
    negativas.
Clasificación de los Aminoácidos
Enlace Peptídico
      •Entre el COOH de un aminoácido y el grupo amino NH3+ de otro aminoácido.




                                                     •Reacción de deshidratación.




                                                 •Enlace covalente tipo amida
                                                 •Carácter de doble enlace parcial
•Configuración Trans.                            •Imposibilidad de rotación.
Enlace peptídico
Polímeros Lineales de L-Aminoácidos
Macromoléculas orgánicas




     Péptidos hasta 102 monómeros, proteínas > 102
Esteroisomería de los aminoácidos

   Cuando cuatro grupos diferentes están
    unidos a un átomo de carbono, como el
    carbono α de los aminoácidos (excepto la
    glicina), resultan dos isómeros posibles, que
    son imágenes especulares no superponibles.
   Isómeros ópticos: en general, una molécula
    con n centros quirales tiene 2n
    estereoisómeros
   Esta característica es importante en los
    sistemas biológicos.
Dos moléculas son enantiómeros sino se sobreponen una
con otra, sin importar cuanto se roten en el espacio
Esteroisomería de los aa

   Todos los aminoácidos excepto la glicina poseen un
    carbono asimétrico.
    Esto hace que presenten esteroisomería, cada
    aminoácido posee dos esteroisómeros según
    como sea la colocación del grupo NH3+.
   Si el grupo NH3+ se sitúa a la derecha
    tendrá configuración D, si se sitúa a la izquierda
    tendrá configuración L (con base a la
    conformación del gliceraldehido).
    Los aminoácidos que forman las proteínas son
    todos de configuración L.
Esteroisomería de los aa
Isómeros alanina
Actividad óptica

   La presencia del carbono asimétrico, además
    les da a los aminoácidos actividad óptica, es
    decir en disolución son capaces de desviar el
    plano de polarización de la luz.
   Si lo desvían hacia la derecha (+) se
    llaman dextrógiros, si lo desvían hacia la
    izquierda (-) levógiros.
Estructura de las Proteínas
Estructura de Proteínas

   La estructura tridimensional de las proteínas
    viene determinada por su secuencia de aa
   La función de una proteína depende de su
    estructura tridimensional, la cual es única
   Las fuerzas más importantes que estabilizan
    la estructura tridimensional son interacciones
    no covalentes
Niveles de Organización
•   Estructura primaria.
•   Estructura secundaria.
•   Estructura terciaria.
•   Estructura cuaternaria.
Estructura primaria
   Secuencia de aminoácidos.
   Especificada en el DNA.
   Determina la forma que adopta la proteína
Estructura primaria
Es la secuencia de sus aminoácidos. Por convención el
orden de escritura es siempre desde el grupo amino-
terminal hasta el carboxilo final
Estructura de Proteínas

 Sólo una fracción (~105) de las posibles secuencias
  (>10400 ) de aa es una proteína “nativa”, codificada
  por un gen y fabricada en una célula
¿Qué tienen de peculiar esas secuencias?
 Se pliegan, como resultado de las interacciones
  laterales entre los aa, formando estructuras
  específicas
 Cadenas aleatorias de aa sintetizadas
  artificialmente usualmente no tienen un plegamiento
  bien definido
Plegamiento de Proteínas




                 Proceso secuencial espontáneo
                 Impulsado por interacciones no covalentes
Plegamiento de las Proteínas
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Plegamiento de las Proteínas
              Conformación Nativa:
              Estructura tridimensional con actividad biológica
Plegamiento de las proteínas
Conformación
   La disposición espacial de los átomos de una
    proteína
   Se refiere a un estado estructural que puede
    interconvertirse con otros sin romper enlaces
    covalentes
   Un cambio de conformación puede ser el
    resultado de la rotación de los enlaces sencillos
   De entre las innumerables conformaciones
    posibles, siempre hay una que es la más
    estable
Interacciones implicadas en el plegamiento

   Enlaces de hidrógeno internos
   Interacciones electrostáticas (o puentes salinos)
    entre grupos cargados de las cadenas laterales
    (Glu, Asp, Lys, Arg, etc)
   Interacciones de Van der Waals. Las proteínas
    están tan densamente empaquetadas que
    permiten el máximo contacto entre los átomos
    de las cadenas laterales
Interacciones implicadas en el plegamiento

   Restricciones impuestas por el propio enlace
    peptídico
   Interacciones hidrofóbicas. En un ambiente
    polar (agua) los grupos hidrófobos se agrupan
    en el interior de la molécula de proteína.
   Enlaces disulfuro. Contribuyen a estabilizar la
    estructura tridimensional de la proteína
Estructura de las Proteínas

Enlaces no covalentes que permiten y estabilizan
         la estructura de las proteínas
Estructura de Proteínas
Niveles de Organización (continuará..)
•   Estructura primaria.
•   Estructura secundaria.
•   Estructura terciaria.
•   Estructura cuaternaria.

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  • 1. Universidad Central de Venezuela Facultad de Medicina Escuela de Medicina Luis Razetti Cátedra de Bioquímica Tema 2: Estructura y Función de las Proteínas (1/5) Dra. Vanessa Miguel vanessa.miguel@ucv.ve @bioquitips Noviembre 2011
  • 2. ¿Por Qué estudiar las proteínas?
  • 3. Proteínas y enfermedad Ausencia o deficiencia Exceso de una Incorrecto de una proteína plegamiento proteína de la proteína Enfermedad
  • 4. Plegamiento incorrecto de proteínas en enfermedades neurodegenerativas
  • 5. Proteínas..nos podemos preguntar…  ¿Dónde se forman?  ¿Cómo son?  ¿Cuántas son?  ¿Cómo se estudian?  ¿Qué funciones realizan?  ¿Cómo se relacionan con la salud y la enfermedad?  ¿Cómo pueden evitarse las enfermedades por deficiencia o por exceso en la alimentación? Y muchas más…
  • 6. Proteínas  Macromoléculas orgánicas.  Constituidas por C, H, O, N y S.  Peso, tamaño y forma variable.  Abundantes en los tipos celulares (una célula humana 10.000 proteínas distintas).  Funciones diversas: metabolismo, contracción muscular, respuesta inmunológica, crecimiento, transporte, catálisis enzimática, funciones de sostén (huesos), etc.  Polímeros lineales de L-aminoácidos.
  • 7. Formas, tamaño y peso variables
  • 9. Fórmula General de los Aminoácidos H +H3N C COOH R
  • 10. Fórmula General de los Aminoácidos R C (central) Grupo amino CH Grupo carboxilo Átomo de Hidrógeno NH3+ COOH Cadena lateral R
  • 11. ¿Cuál de las siguientes moléculas es un α- aminoácido?
  • 12. Aminoácidos 1. Glicina 11. Treonina 2. Alanina 12. Tirosina 3. Valina Cadena 13. Cisteína 4. Leucina Lateral 14. Arginina 5. Isoleucina o 15. Lisina 6. Prolina Grupo 16. Histidina 7. Fenilalanina R 17. Acido Aspártico 8. Triptófano 18. Acido Glutámico 9. Metionina 19. Asparagina 10. Serina 20. Glutamina •Se conocen otros 150 aminoácidos pero NO forman parte de las proteínas.
  • 13.
  • 14. Ejemplos de algunos aminoácidos
  • 15. Aminoácidos Dos propiedades importantes que los distinguen son:  Polaridad. Si un aminoácido es polar o no - polar influye como interactúa con el agua.  Carga. Si tienen o no carga. Algunos aminoácidos pueden ionizarse para tener cargas positivas, otros se ionizan con cargas negativas.
  • 16. Clasificación de los Aminoácidos
  • 17. Enlace Peptídico •Entre el COOH de un aminoácido y el grupo amino NH3+ de otro aminoácido. •Reacción de deshidratación. •Enlace covalente tipo amida •Carácter de doble enlace parcial •Configuración Trans. •Imposibilidad de rotación.
  • 19. Polímeros Lineales de L-Aminoácidos
  • 20. Macromoléculas orgánicas Péptidos hasta 102 monómeros, proteínas > 102
  • 21. Esteroisomería de los aminoácidos  Cuando cuatro grupos diferentes están unidos a un átomo de carbono, como el carbono α de los aminoácidos (excepto la glicina), resultan dos isómeros posibles, que son imágenes especulares no superponibles.  Isómeros ópticos: en general, una molécula con n centros quirales tiene 2n estereoisómeros  Esta característica es importante en los sistemas biológicos.
  • 22.
  • 23. Dos moléculas son enantiómeros sino se sobreponen una con otra, sin importar cuanto se roten en el espacio
  • 24. Esteroisomería de los aa  Todos los aminoácidos excepto la glicina poseen un carbono asimétrico.  Esto hace que presenten esteroisomería, cada aminoácido posee dos esteroisómeros según como sea la colocación del grupo NH3+.  Si el grupo NH3+ se sitúa a la derecha tendrá configuración D, si se sitúa a la izquierda tendrá configuración L (con base a la conformación del gliceraldehido).  Los aminoácidos que forman las proteínas son todos de configuración L.
  • 27.
  • 28. Actividad óptica  La presencia del carbono asimétrico, además les da a los aminoácidos actividad óptica, es decir en disolución son capaces de desviar el plano de polarización de la luz.  Si lo desvían hacia la derecha (+) se llaman dextrógiros, si lo desvían hacia la izquierda (-) levógiros.
  • 29. Estructura de las Proteínas
  • 30. Estructura de Proteínas  La estructura tridimensional de las proteínas viene determinada por su secuencia de aa  La función de una proteína depende de su estructura tridimensional, la cual es única  Las fuerzas más importantes que estabilizan la estructura tridimensional son interacciones no covalentes
  • 31. Niveles de Organización • Estructura primaria. • Estructura secundaria. • Estructura terciaria. • Estructura cuaternaria.
  • 32. Estructura primaria  Secuencia de aminoácidos.  Especificada en el DNA.  Determina la forma que adopta la proteína
  • 33. Estructura primaria Es la secuencia de sus aminoácidos. Por convención el orden de escritura es siempre desde el grupo amino- terminal hasta el carboxilo final
  • 34. Estructura de Proteínas  Sólo una fracción (~105) de las posibles secuencias (>10400 ) de aa es una proteína “nativa”, codificada por un gen y fabricada en una célula ¿Qué tienen de peculiar esas secuencias?  Se pliegan, como resultado de las interacciones laterales entre los aa, formando estructuras específicas  Cadenas aleatorias de aa sintetizadas artificialmente usualmente no tienen un plegamiento bien definido
  • 35. Plegamiento de Proteínas Proceso secuencial espontáneo Impulsado por interacciones no covalentes
  • 36. Plegamiento de las Proteínas
  • 37. Plegamiento de las Proteínas
  • 38. Plegamiento de las Proteínas Conformación Nativa: Estructura tridimensional con actividad biológica
  • 39. Plegamiento de las proteínas
  • 40.
  • 41. Conformación  La disposición espacial de los átomos de una proteína  Se refiere a un estado estructural que puede interconvertirse con otros sin romper enlaces covalentes  Un cambio de conformación puede ser el resultado de la rotación de los enlaces sencillos  De entre las innumerables conformaciones posibles, siempre hay una que es la más estable
  • 42. Interacciones implicadas en el plegamiento  Enlaces de hidrógeno internos  Interacciones electrostáticas (o puentes salinos) entre grupos cargados de las cadenas laterales (Glu, Asp, Lys, Arg, etc)  Interacciones de Van der Waals. Las proteínas están tan densamente empaquetadas que permiten el máximo contacto entre los átomos de las cadenas laterales
  • 43. Interacciones implicadas en el plegamiento  Restricciones impuestas por el propio enlace peptídico  Interacciones hidrofóbicas. En un ambiente polar (agua) los grupos hidrófobos se agrupan en el interior de la molécula de proteína.  Enlaces disulfuro. Contribuyen a estabilizar la estructura tridimensional de la proteína
  • 44. Estructura de las Proteínas Enlaces no covalentes que permiten y estabilizan la estructura de las proteínas
  • 46. Niveles de Organización (continuará..) • Estructura primaria. • Estructura secundaria. • Estructura terciaria. • Estructura cuaternaria.