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Introducción al Metabolismo y
        Bioenergética

   Introducción a las oxidaciones biológicas y al ciclo de Krebs

Prof. Vanessa Miguel
@bioquitips
Metabolismo
   Conjunto de todas las reacciones enzimáticas
    de la célula mediante las cuales adquieren y
    utilizan la energía que necesitan para realizar
    sus funciones
   Representa la suma de todos los cambios
    químicos que convierten los nutrientes en
    energía y productos celulares químicamente
    complejos
Catabolismo y Anabolismo


                           CATABOLISMO




ANABOLISMO
Mecanismos de regulación del
metabolismo (enzimas)
   Control de la actividad de las enzimas en respuesta a la
    concentración de metabolitos
    a. Control por la concentración del producto de una
    reacción
    b. Regulación alostérica
   Control por modificación de la enzima (modificación
    covalente)
   Isoenzimas
   Compartamentalización
   Complejos multienzimáticos
   Especialización metabólica
   Control de la cantidad de enzima
Termodinámica
   Ley Cero (principio del equilibrio
    termodinámico). Si dos sistemas A y B están en
    equilibrio termodinámico, y B está en equilibrio
    termodinámico con un tercer sistema C, entonces A
    y C están a su vez en equilibrio termodinámico.
   Primera Ley (principio de conservación de la
    energía): si se realiza trabajo sobre un sistema o
    bien éste intercambia calor con otro, la energía
    interna del sistema cambiará.
   Segunda Ley: el calor no puede pasar de forma
    espontánea de una fuente fría a otra más caliente.
   Tercera Ley: que es imposible alcanzar una
    temperatura igual al cero absoluto
SISTEMA + ENTORNO (O MEDIO AMBIENTE) = UNIVERSO
En el intercambio de Energía entre Sistema-Medio Ambiente siempre se
cumple la ley de conservación de la energía

Esf - Esi = ∆Es = ∑Eintercambiadas

     En ambos casos la energía del universo se mantiene constante.
Tipos de Energía (ej.)
1 mol de sustancia pura en ciertas condiciones de P y T.

Energías intramoleculares
   Nuclear
   Electrónica
   Traslacional
   Vibracional
   Rotacional
(3, 4, y 5 son las Energías Térmicas)
Energías intermoleculares
   Fuerzas de atracción interiónicas (sales)
   Fuerzas de atracción Ión-dipolo
   Unión por puente de hidrógeno
   Fuerzas de atracción dipolo-dipolo
   Fuerzas de atracción entre iones o dipolos-moléculas polarizables
   Fuerzas entre dipolos instantáneos-dipolos inducidos
   Fuerzas hidrofóbicas
   Fuerzas de repulsión
Antes que seguir ... ¿qué es entropía?
Si fueramos ingenieros..
Entropía fácil…
   El flujo de energía es la esencia de la vida,
    se comprende mejor a una célula como un
    complejo sistema de transformación de
    energía
Espontaneidad de las reacciones

   Las reacciones químicas que tienen lugar
    espontáneamente suelen ser exotérmicas, es
    decir, con desprendimiento de calor.
   El calor que se desprende o absorbe en una
    reacción a presión constante recibe el nombre
    de Entalpía (∆ H). Las reacciones en las que se
    desprende calor son exotérmicas: ∆ H < 0
   Sin embargo, hay reacciones endotérmicas que
    cursan espontáneamente, ∆ H > 0; por ejemplo,
    la disolución de sulfato amónico en agua.
Espontaneidad de las reacciones

   La disolución de sulfato amónico en agua es un
    proceso por el cual se pasa de un estado
    cristalino altamente ordenado, a otro de mucho
    mayor desorden molecular.
   La función termodinámica que mide el desorden
    de un sistema recibe el nombre de Entropía (∆
    S). Puede observarse que muchas reacciones
    que cursan espontáneamente lo hacen con
    incremento positivo de entropía: ∆ S > 0.
   Sin embargo, hay procesos espontáneos que
    cursan con disminución de entropía. Ej: la
    solidificación del agua a 0 ºC.
Energía Libre de Gibbs

   Gibbs fue el primero en proponer que un
    sistema químico busca, no solamente el estado
    de mínima energía o entalpía (H), sino también
    el estado de máximo desorden o entropía (S).
   Definió una nueva función de estado, la energía
    libre, G, que relaciona la entalpía y la entropía:
    G = H - TS
   Pueden cursar espontáneamente aquellos
    procesos en los que se desprende energía libre
    (∆ G < 0); pero no aquellos procesos en los que
    se absorbe energía libre (∆ G > 0)
Energía Libre de Gibbs
Situaciones:

   Si ∆ H < 0 (exotérmico) y ∆ S > 0 (aumenta el
    "desorden") para cualquier temperatura, el G < 0
    siempre.
   Cuando ∆ H < 0 (exotérmico) y ∆ S < 0 (disminuye
    el desorden) el proceso ocurrirá espontáneamente
    si es suficientemente exotérmico para sobrepasar la
    disminución en entropía
   Si ∆ H > 0 (endotérmico) y ∆ S > 0; ∆ G < 0
    solamente a T bien altas.
Energía Libre de Gibbs
   En procesos irreversibles (espontáneos) ∆G < 0;
    esto representa una tendencia hacia el estado final.
    En una reacción química indica que la formación de
    productos está favorecida.
   Por el contrario, un valor de ∆G > 0 representa una
    tendencia de espontaneidad hacia los reactivos a
    partir de los productos.
   En procesos reversibles (de equilibrio) ∆G = 0; esto
    representa la condición de un sistema estable en
    que la velocidad de formación de productos y
    sustratos es igual.
Energía Libre de Gibbs

Dada una reacción A       B, ésta cursará de izquierda a
derecha cuando las concentraciones de A y B sean tales
que la ∆G <0.
La energía libre del sistema viene dada por:
                           [B]
         ∆ G = ∆ G + RT ln
                   0
                           [A]

Donde ∆G0 es la Energía Libre Standard de la reacción
(reactivos a concentración 1M, en condiciones STP) .
Conociendo ∆ G0 podemos calcular si un proceso puede
tener lugar espontáneamente o no en unas
determinadas condiciones.
Energía Libre de Gibbs

En el equilibrio, ∆G = 0; por tanto,

                               [Beq]
                0 = ∆G + RT ln [A ]
                       0
                                 eq


     [Beq]
Pero       = Keq       Por tanto, ∆G0 = -RT ln Keq
     [Aeq]
Glucosa 6P + H2O              Glucosa + Pi
Condiciones intracelulares:
Temperatura: 37 ºC, equivalentes a 310 ºK
[Glucosa-6-fosfato], 1 mM
[Glucosa], 0.01 mM
[fosfato], 10 mM
 ∆G0 = -3250 cal/mol


                        [Glucosa] [Fosfato]
   ∆G = ∆G + RT ln
            0


                    [Glucosa-6-fosfato]
Sustituyendo, obtenemos:

 ∆G = -3250 + 1.98*310*2.303* log 10-5*10-3
                                                = -8900 cal/mol
                                        10-2
Acoplamiento catabolismo-
anabolismo

              Estructuras complejas




Catabolismo          ∆G               Anabolismo




               Estructuras simples
En general, podemos decir:

          Reacciones catabólicas: ∆G < 0

          Reacciones anabólicas: ∆G > 0

Supongamos una reacción anabólica mediante la cual se forma
un enlace químico entre A y B; esquemáticamente,


       A+B                 A-B       (∆G > 0)

    La reacción no puede tener lugar espontáneamente.
   ¿Cómo puede entonces tener lugar en el metabolismo?
Acoplamiento catabolismo-
anabolismo

Lo que ocurre en el metabolismo es que las reacciones
endergónicas (∆G > 0) se acoplan a reacciones
exergónicas (∆G < 0) de manera que :

1. La energía liberada en una de las reacciones es
utilizada por la otra.

2. La suma total de energías libres de una y otra reacción
da un ∆G < 0, por lo que el proceso en conjunto tiene
lugar espontáneamente.
Así, la reacción

        A+B                   A-B       (∆G1 > 0)

  Se acopla a

     X-Y + H2O                X +Y       (∆G2 < 0)

   Siendo    |∆G2 | > |∆G1|


 Dando lugar a una reacción global


A + B + X-Y + H2O                    A-B + X + Y     (∆G < 0)
Acoplamiento catabolismo-
anabolismo
                                                                         NH2
   La reacción que se             O        O    O
                                                                     N
                                                                             N
    acopla en los seres     O  -
                                   P O P O P O CH2          O        N
                                                                         N
    vivos a procesos               O-       O-   O-


    endergónicos es, en la                             OH        OH
    mayoría de los casos,
    la hidrólisis de                                  ATP
    polifosfatos,         O        O                            O            O
    principalmente la R O P O
                           -
                                        -
                                   P O + H2O            R O P OH + HO P O-
                          O        O-                           O-           O-
    hidrólisis de ATP
                                        Hidrólisis de polifosfatos
Existen otras configuraciones de alta energía,
por ejemplo:

       O        O                         O
 H2N C O P O-
                    -
                                        R C S CoA
                O

 Carbamilfosfato            Tioésteres de Coenzima A

 COO- O                     O           CH3      O
 C O P O-                       C CH2   N C NH P O-
                        -
 CH2    O   -               O             NH     O-

  Fosfoenolpiruvato                       Fosfocreatina
Acoplamiento catabolismo-
anabolismo
Acoplamiento catabolismo-
anabolismo
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   Los procesos catabólicos productores de
    energía generan ATP, que se empleará en
    todas aquellas reacciones endergónicas en
    las que sea requerido.
   El ATP puede ser sintetizado mediante:
       Fosforilación a nivel de sustrato
       Fosforilación oxidativa
Óxido-Reducción
   Las reacciones de óxido reducción son
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    es decir pierde electrones, y otro elemento
    gana electrones, es decir, se reduce.
   El elemento que se oxida es el agente
    reductor porque dona los electrones,
    mientras que el elemento que se reduce es
    el agente oxidante.
Catabolismo y Anabolismo


                           CATABOLISMO




ANABOLISMO
Coenzimas óxido-reducción




             Adenina          Adenina
             Ribosa           Ribosa

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 Proteínas    Polisacáridos            Lípidos



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                    G
                    l
                    u
                    c
                    ó
                    l        Poder                Poder
                    i       reductor             reductor
                    s
                    i
                    s


                Piruvato



              Acetil CoA



                 Ciclo de
                  Krebs
                                Poder
                               reductor


               CO2 + H20
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Complejos multienzimáticos

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El complejo multienzimático
Piruvato deshidrogenasa (PDH) está formado
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  Piruvato       Dihidrolipoil     Dihidrolipoil
deshidrogenasa   transacetilasa   deshidrogenasa
      (E1)            (E2)              (E3)
Complejos multienzimáticos
         Piruvato deshidrogenasa
Complejo multienzimático de la
Piruvato Deshidrogenasa
Complejo multienzimático de la
Piruvato Deshidrogenasa
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Piruvato Deshidrogenasa
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  • 1. Introducción al Metabolismo y Bioenergética  Introducción a las oxidaciones biológicas y al ciclo de Krebs Prof. Vanessa Miguel @bioquitips
  • 2. Metabolismo  Conjunto de todas las reacciones enzimáticas de la célula mediante las cuales adquieren y utilizan la energía que necesitan para realizar sus funciones  Representa la suma de todos los cambios químicos que convierten los nutrientes en energía y productos celulares químicamente complejos
  • 3. Catabolismo y Anabolismo CATABOLISMO ANABOLISMO
  • 4. Mecanismos de regulación del metabolismo (enzimas)  Control de la actividad de las enzimas en respuesta a la concentración de metabolitos a. Control por la concentración del producto de una reacción b. Regulación alostérica  Control por modificación de la enzima (modificación covalente)  Isoenzimas  Compartamentalización  Complejos multienzimáticos  Especialización metabólica  Control de la cantidad de enzima
  • 5. Termodinámica  Ley Cero (principio del equilibrio termodinámico). Si dos sistemas A y B están en equilibrio termodinámico, y B está en equilibrio termodinámico con un tercer sistema C, entonces A y C están a su vez en equilibrio termodinámico.  Primera Ley (principio de conservación de la energía): si se realiza trabajo sobre un sistema o bien éste intercambia calor con otro, la energía interna del sistema cambiará.  Segunda Ley: el calor no puede pasar de forma espontánea de una fuente fría a otra más caliente.  Tercera Ley: que es imposible alcanzar una temperatura igual al cero absoluto
  • 6. SISTEMA + ENTORNO (O MEDIO AMBIENTE) = UNIVERSO
  • 7. En el intercambio de Energía entre Sistema-Medio Ambiente siempre se cumple la ley de conservación de la energía Esf - Esi = ∆Es = ∑Eintercambiadas En ambos casos la energía del universo se mantiene constante.
  • 8. Tipos de Energía (ej.) 1 mol de sustancia pura en ciertas condiciones de P y T. Energías intramoleculares  Nuclear  Electrónica  Traslacional  Vibracional  Rotacional (3, 4, y 5 son las Energías Térmicas) Energías intermoleculares  Fuerzas de atracción interiónicas (sales)  Fuerzas de atracción Ión-dipolo  Unión por puente de hidrógeno  Fuerzas de atracción dipolo-dipolo  Fuerzas de atracción entre iones o dipolos-moléculas polarizables  Fuerzas entre dipolos instantáneos-dipolos inducidos  Fuerzas hidrofóbicas  Fuerzas de repulsión
  • 9. Antes que seguir ... ¿qué es entropía?
  • 12.
  • 13. El flujo de energía es la esencia de la vida, se comprende mejor a una célula como un complejo sistema de transformación de energía
  • 14. Espontaneidad de las reacciones  Las reacciones químicas que tienen lugar espontáneamente suelen ser exotérmicas, es decir, con desprendimiento de calor.  El calor que se desprende o absorbe en una reacción a presión constante recibe el nombre de Entalpía (∆ H). Las reacciones en las que se desprende calor son exotérmicas: ∆ H < 0  Sin embargo, hay reacciones endotérmicas que cursan espontáneamente, ∆ H > 0; por ejemplo, la disolución de sulfato amónico en agua.
  • 15. Espontaneidad de las reacciones  La disolución de sulfato amónico en agua es un proceso por el cual se pasa de un estado cristalino altamente ordenado, a otro de mucho mayor desorden molecular.  La función termodinámica que mide el desorden de un sistema recibe el nombre de Entropía (∆ S). Puede observarse que muchas reacciones que cursan espontáneamente lo hacen con incremento positivo de entropía: ∆ S > 0.  Sin embargo, hay procesos espontáneos que cursan con disminución de entropía. Ej: la solidificación del agua a 0 ºC.
  • 16. Energía Libre de Gibbs  Gibbs fue el primero en proponer que un sistema químico busca, no solamente el estado de mínima energía o entalpía (H), sino también el estado de máximo desorden o entropía (S).  Definió una nueva función de estado, la energía libre, G, que relaciona la entalpía y la entropía: G = H - TS  Pueden cursar espontáneamente aquellos procesos en los que se desprende energía libre (∆ G < 0); pero no aquellos procesos en los que se absorbe energía libre (∆ G > 0)
  • 17. Energía Libre de Gibbs Situaciones:  Si ∆ H < 0 (exotérmico) y ∆ S > 0 (aumenta el "desorden") para cualquier temperatura, el G < 0 siempre.  Cuando ∆ H < 0 (exotérmico) y ∆ S < 0 (disminuye el desorden) el proceso ocurrirá espontáneamente si es suficientemente exotérmico para sobrepasar la disminución en entropía  Si ∆ H > 0 (endotérmico) y ∆ S > 0; ∆ G < 0 solamente a T bien altas.
  • 18. Energía Libre de Gibbs  En procesos irreversibles (espontáneos) ∆G < 0; esto representa una tendencia hacia el estado final. En una reacción química indica que la formación de productos está favorecida.  Por el contrario, un valor de ∆G > 0 representa una tendencia de espontaneidad hacia los reactivos a partir de los productos.  En procesos reversibles (de equilibrio) ∆G = 0; esto representa la condición de un sistema estable en que la velocidad de formación de productos y sustratos es igual.
  • 19. Energía Libre de Gibbs Dada una reacción A B, ésta cursará de izquierda a derecha cuando las concentraciones de A y B sean tales que la ∆G <0. La energía libre del sistema viene dada por: [B] ∆ G = ∆ G + RT ln 0 [A] Donde ∆G0 es la Energía Libre Standard de la reacción (reactivos a concentración 1M, en condiciones STP) . Conociendo ∆ G0 podemos calcular si un proceso puede tener lugar espontáneamente o no en unas determinadas condiciones.
  • 20. Energía Libre de Gibbs En el equilibrio, ∆G = 0; por tanto, [Beq] 0 = ∆G + RT ln [A ] 0 eq [Beq] Pero = Keq Por tanto, ∆G0 = -RT ln Keq [Aeq]
  • 21. Glucosa 6P + H2O Glucosa + Pi Condiciones intracelulares: Temperatura: 37 ºC, equivalentes a 310 ºK [Glucosa-6-fosfato], 1 mM [Glucosa], 0.01 mM [fosfato], 10 mM ∆G0 = -3250 cal/mol [Glucosa] [Fosfato] ∆G = ∆G + RT ln 0 [Glucosa-6-fosfato] Sustituyendo, obtenemos: ∆G = -3250 + 1.98*310*2.303* log 10-5*10-3 = -8900 cal/mol 10-2
  • 22. Acoplamiento catabolismo- anabolismo Estructuras complejas Catabolismo ∆G Anabolismo Estructuras simples
  • 23. En general, podemos decir: Reacciones catabólicas: ∆G < 0 Reacciones anabólicas: ∆G > 0 Supongamos una reacción anabólica mediante la cual se forma un enlace químico entre A y B; esquemáticamente, A+B A-B (∆G > 0) La reacción no puede tener lugar espontáneamente. ¿Cómo puede entonces tener lugar en el metabolismo?
  • 24. Acoplamiento catabolismo- anabolismo Lo que ocurre en el metabolismo es que las reacciones endergónicas (∆G > 0) se acoplan a reacciones exergónicas (∆G < 0) de manera que : 1. La energía liberada en una de las reacciones es utilizada por la otra. 2. La suma total de energías libres de una y otra reacción da un ∆G < 0, por lo que el proceso en conjunto tiene lugar espontáneamente.
  • 25. Así, la reacción A+B A-B (∆G1 > 0) Se acopla a X-Y + H2O X +Y (∆G2 < 0) Siendo |∆G2 | > |∆G1| Dando lugar a una reacción global A + B + X-Y + H2O A-B + X + Y (∆G < 0)
  • 26. Acoplamiento catabolismo- anabolismo NH2  La reacción que se O O O N N acopla en los seres O - P O P O P O CH2 O N N vivos a procesos O- O- O- endergónicos es, en la OH OH mayoría de los casos, la hidrólisis de ATP polifosfatos, O O O O principalmente la R O P O - - P O + H2O R O P OH + HO P O- O O- O- O- hidrólisis de ATP Hidrólisis de polifosfatos
  • 27. Existen otras configuraciones de alta energía, por ejemplo: O O O H2N C O P O- - R C S CoA O Carbamilfosfato Tioésteres de Coenzima A COO- O O CH3 O C O P O- C CH2 N C NH P O- - CH2 O - O NH O- Fosfoenolpiruvato Fosfocreatina
  • 30. Acoplamiento catabolismo- anabolismo  Los procesos catabólicos productores de energía generan ATP, que se empleará en todas aquellas reacciones endergónicas en las que sea requerido.  El ATP puede ser sintetizado mediante:  Fosforilación a nivel de sustrato  Fosforilación oxidativa
  • 31. Óxido-Reducción  Las reacciones de óxido reducción son reacciones de transferencia de electrones. En estas reacciones un elemento se oxida, es decir pierde electrones, y otro elemento gana electrones, es decir, se reduce.  El elemento que se oxida es el agente reductor porque dona los electrones, mientras que el elemento que se reduce es el agente oxidante.
  • 32. Catabolismo y Anabolismo CATABOLISMO ANABOLISMO
  • 33. Coenzimas óxido-reducción Adenina Adenina Ribosa Ribosa NAD+ NADH + H+
  • 38. Nutrientes Proteínas Polisacáridos Lípidos Aminoácidos Monosac. Ac. Grasos G l u c ó l Poder Poder i reductor reductor s i s Piruvato Acetil CoA Ciclo de Krebs Poder reductor CO2 + H20
  • 40. Metabolismo Mitocondrial El ciclo de Krebs o Ciclo de los Ácidos Tricarboxílicos
  • 41. Complejos multienzimáticos Ejemplo: El complejo multienzimático Piruvato deshidrogenasa (PDH) está formado por múltiples copias de tres enzimas: Piruvato Dihidrolipoil Dihidrolipoil deshidrogenasa transacetilasa deshidrogenasa (E1) (E2) (E3)
  • 42. Complejos multienzimáticos Piruvato deshidrogenasa
  • 43. Complejo multienzimático de la Piruvato Deshidrogenasa
  • 44. Complejo multienzimático de la Piruvato Deshidrogenasa
  • 45. Complejo multienzimático de la Piruvato Deshidrogenasa
  • 46. Regulación de la Piruvado Deshidrogensa h