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A muestra que va a ser objeto del análisis:
 Debe ser homogénea.
 Se debe tomar Aproximadamente 15 submuestras por
hectárea en forma de zigzag.
 Al final realizar la mezcla y obtener una muestra
compuesta de aproximadamente 500 gramos
Limpiar la superficie del suelo, cavar un hoyo de 20 cm de profundidad con las paredes
inclinadas, sacar una sección de 5 cm de grosor.
Luego con la ayuda de una paleta retirar los bordes laterales y tomar la parte que incluye
entre los 5 a 20 cm y colocar la muestra en un recipiente de plástico limpio.
Y colocarlo en una funda plástica limpia e identificarla con una tarjeta.
• información del remitente,
• fecha de muestreo
• cultivo,
• edad del cultivo
• manejo
• localidad
• si es posible indicar las coordenadas geográficas, condiciones
climáticas, aplicación de materia orgánica o productos biológicos,
aplicación de agroquímicos (fertilizantes y pesticidas), etc.
La composición del medio de crecimiento usado para contar
poblaciones microbianas es importante, ya que afectara mi
resultado final.
Selectivo
No selectivo
A las bacterias que obtienen su fuente de carbono a partir de
compuestos orgánicos .
Medio de cultivo que se utiliza para su identificación agar nutritivo
caldo nutritivo.
Fuentes de carbono y proteínas (peptona).
bacterias heterótrofas en menos de 3 días a 30 °C.
Técnica de cuenta por dilución en placa.
 Su desarrollo es muy lento.
 pH acido.
 Medios con gran cantidad de azúcar fácilmente
degradable.
 Usar mezclas de agar papa-harina de maíz.
 Agar papa dextroxa adicionada con rosa de bengala
para permitir el conteo de hongos así como la adición
de antibiótico.
 Incubar a 30 °C 5 días.
 Las bacterias hidrocarbonoclastas son aquellas capaces de
crecer en presencia de hidrocarburos como única fuente
de carbono y energía.
 Método de aislamiento y cuenta de las bacterias técnica
por dilución en placa
 Medio mineral basal que contenga petróleo crudo o un
hidrocarburo específico.
 Se agrega rosa de Bengala y se ajusta pH 4
Bacterias hidrocabonoclastas por dilución en placa
 En ausencia de un aceptador de electrones externo pueden
catabólizar los compuestos orgánicos mediante fermentación.
 Crecimiento se hace en medio de cultivo anaerobio utilizando
glucosa como única fuente de carbono y aceptor de electrones.
 Cuantificación se realiza con el numero mas probable. Utilizando
como indicador el azul de bromotimol, indicador de acidez.
DEFINICIÓN: REDUCTORAS DE
AZUFRE
 Son las bacterias que tienen la
facultad de reducir sulfato,
sulfito o tiosulfato de manera no
asimilatoria, utilizandolos como
aceptores de electrones,
produciendo como desecho
metabólico ácido sulfhídrico.
GÉNEROS : BRS.
• Actualmente se han reconocido 18 géneros,
subdivididos en dos grandes grupos según si
oxidan o no el acetato como fuente de
carbono y energía
1. GÉNEROS Desulfovibrio,
Desulfomonas, Desulfomaculum,
Desulfobulbus.
• Utilizan fundamentalmente lactato, piruvato
y etanol como fuente de energía y de
carbono, reduciendo el sulfato a sulfuro de
hidrógeno.
2. GÉNEROS Desulfobacter,
Desulfococcus,Desulfosarcina y
Desulfonema.
• Están particularmente especializados en la
oxidación de acetato, reduciendo el sulfato a
sulfuro.
Técnica del numero mas probable.
Indicador positivo de la sulfato reducción se muestra un
precipitado negro de sulfuro de fierro, resultado de la
reacción de sulfuro de hidrogeno producido por la
reducción biológica de sulfatos
Incubar 30 °C durante 30 dias
Crecen en utilizando sulfato u oxidantes de sulfuro
como aceptor de electrones y acetato, lactosa y
glucosa como donadores de electrones.
 El crecimiento especifico de las bacterias utilizando acetato
como fuente de carbono y fierro como aceptor de electrones
 Cuantificación por el NMP.
 Se utiliza como indicador positivo el cambio de color en el
medio de cultivo de amarillo a transparente  presencia de
citrato de hierro. Transparente indica reducción de Fe3+ a Fe2.
 Incubar 30 °C durante 30 días.
 El método es aplicable para el cultivo y la cuantificación de bacterias nitrato
reductoras en para la técnica NMP
Se basa en el crecimiento especifico en un medio de cultipo anaerobio por la
reducción de nitratos, empleando acetato como fuente de carbono.
El número de bacterias se hace por la técnica del NMP analizando la
aparición de nitritos por la adición de los reactivos Griess Llosvay y polvo de
zinc
 Griess Llosvay se basa en la adición de acido sulfanico y una solución acida de alfa
naftalina las cuales deben reaccionar con los nitritos forman un complejo color rojo de
diazonio p-sulfobenceno-azo-alfa naftilamina
Se encuentran en la familia Euryarchaeota coccus, Methanobacterium.
Aerobios estrictos producen metano por fermentación
de acetato o utilizando CO2 como aceptor de
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Crecimiento se hace en un medio de cultivo base
anaerobio empleando acetato como fuente de
carbono. La cuantificación utilizando el NMP Como
indicador la producción de metano.
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Análisis de suelo: Técnicas de muestreo y cuantificación de microorganismos

  • 1.
  • 2. A muestra que va a ser objeto del análisis:  Debe ser homogénea.  Se debe tomar Aproximadamente 15 submuestras por hectárea en forma de zigzag.  Al final realizar la mezcla y obtener una muestra compuesta de aproximadamente 500 gramos
  • 3. Limpiar la superficie del suelo, cavar un hoyo de 20 cm de profundidad con las paredes inclinadas, sacar una sección de 5 cm de grosor. Luego con la ayuda de una paleta retirar los bordes laterales y tomar la parte que incluye entre los 5 a 20 cm y colocar la muestra en un recipiente de plástico limpio. Y colocarlo en una funda plástica limpia e identificarla con una tarjeta. • información del remitente, • fecha de muestreo • cultivo, • edad del cultivo • manejo • localidad • si es posible indicar las coordenadas geográficas, condiciones climáticas, aplicación de materia orgánica o productos biológicos, aplicación de agroquímicos (fertilizantes y pesticidas), etc.
  • 4. La composición del medio de crecimiento usado para contar poblaciones microbianas es importante, ya que afectara mi resultado final. Selectivo No selectivo
  • 5. A las bacterias que obtienen su fuente de carbono a partir de compuestos orgánicos . Medio de cultivo que se utiliza para su identificación agar nutritivo caldo nutritivo. Fuentes de carbono y proteínas (peptona). bacterias heterótrofas en menos de 3 días a 30 °C. Técnica de cuenta por dilución en placa.
  • 6.  Su desarrollo es muy lento.  pH acido.  Medios con gran cantidad de azúcar fácilmente degradable.  Usar mezclas de agar papa-harina de maíz.  Agar papa dextroxa adicionada con rosa de bengala para permitir el conteo de hongos así como la adición de antibiótico.  Incubar a 30 °C 5 días.
  • 7.  Las bacterias hidrocarbonoclastas son aquellas capaces de crecer en presencia de hidrocarburos como única fuente de carbono y energía.  Método de aislamiento y cuenta de las bacterias técnica por dilución en placa  Medio mineral basal que contenga petróleo crudo o un hidrocarburo específico.  Se agrega rosa de Bengala y se ajusta pH 4 Bacterias hidrocabonoclastas por dilución en placa
  • 8.  En ausencia de un aceptador de electrones externo pueden catabólizar los compuestos orgánicos mediante fermentación.  Crecimiento se hace en medio de cultivo anaerobio utilizando glucosa como única fuente de carbono y aceptor de electrones.  Cuantificación se realiza con el numero mas probable. Utilizando como indicador el azul de bromotimol, indicador de acidez.
  • 9. DEFINICIÓN: REDUCTORAS DE AZUFRE  Son las bacterias que tienen la facultad de reducir sulfato, sulfito o tiosulfato de manera no asimilatoria, utilizandolos como aceptores de electrones, produciendo como desecho metabólico ácido sulfhídrico.
  • 10. GÉNEROS : BRS. • Actualmente se han reconocido 18 géneros, subdivididos en dos grandes grupos según si oxidan o no el acetato como fuente de carbono y energía
  • 11. 1. GÉNEROS Desulfovibrio, Desulfomonas, Desulfomaculum, Desulfobulbus. • Utilizan fundamentalmente lactato, piruvato y etanol como fuente de energía y de carbono, reduciendo el sulfato a sulfuro de hidrógeno.
  • 12. 2. GÉNEROS Desulfobacter, Desulfococcus,Desulfosarcina y Desulfonema. • Están particularmente especializados en la oxidación de acetato, reduciendo el sulfato a sulfuro.
  • 13. Técnica del numero mas probable. Indicador positivo de la sulfato reducción se muestra un precipitado negro de sulfuro de fierro, resultado de la reacción de sulfuro de hidrogeno producido por la reducción biológica de sulfatos Incubar 30 °C durante 30 dias Crecen en utilizando sulfato u oxidantes de sulfuro como aceptor de electrones y acetato, lactosa y glucosa como donadores de electrones.
  • 14.  El crecimiento especifico de las bacterias utilizando acetato como fuente de carbono y fierro como aceptor de electrones  Cuantificación por el NMP.  Se utiliza como indicador positivo el cambio de color en el medio de cultivo de amarillo a transparente  presencia de citrato de hierro. Transparente indica reducción de Fe3+ a Fe2.  Incubar 30 °C durante 30 días.
  • 15.
  • 16.
  • 17.
  • 18.  El método es aplicable para el cultivo y la cuantificación de bacterias nitrato reductoras en para la técnica NMP Se basa en el crecimiento especifico en un medio de cultipo anaerobio por la reducción de nitratos, empleando acetato como fuente de carbono. El número de bacterias se hace por la técnica del NMP analizando la aparición de nitritos por la adición de los reactivos Griess Llosvay y polvo de zinc  Griess Llosvay se basa en la adición de acido sulfanico y una solución acida de alfa naftalina las cuales deben reaccionar con los nitritos forman un complejo color rojo de diazonio p-sulfobenceno-azo-alfa naftilamina
  • 19. Se encuentran en la familia Euryarchaeota coccus, Methanobacterium. Aerobios estrictos producen metano por fermentación de acetato o utilizando CO2 como aceptor de electrones. Crecimiento se hace en un medio de cultivo base anaerobio empleando acetato como fuente de carbono. La cuantificación utilizando el NMP Como indicador la producción de metano. 30 °C durante 60 días