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Ecología
microbiana
Ecosistemas microbianos
Alguna terminología
Ecosistema: Es la unidad básica ecológica,
comprende tanto a los componentes bióticos
como a los abióticos.
Los ecosistemas de los microorganismos son
muy distintos desde el punto de vista de su
tamaño, ejem: la cavidad bucal, la panza
de los rumiantes, la región radical de la
planta, entre otros.
Alguna terminología
Hábitat: Es el lugar o espacio vital que
habita normalmente un microorganismo
determinado, donde se desarrolla y
multiplica.
A cada organismo se le puede asignar por l0
menos un hábitat en el que se encuentra
normalmente, ejem: sedimento de un lago,
el humus de un suelo fértil, la cavidad nasal,
Alguna terminología
Nicho: Hace referencia a una función de la
especie o población de microorganismos.
Depende:
Requerimientos nutricionales y fisiológicos.
Características genéticas.
Capacidades bioquímicas.
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Tolerancia a condiciones ambientales.
Habitantes del
ecosistema
Pueden distinguirse dos categorías:
Autóctonos: son propios de un determinado
ecosistema (suelo, intestino) y se encuentran
siempre en el, su presencia se debe a la
afluencia mas o menos constante de
nutrientes típicos del ecosistema.
Habitantes del
ecosistema
Alóctonos: aquellos cuya presencia se debe
al incremento ocasional de la concentraci6n
de nutrientes o de un nutriente
determinado.
Son hasta cierto punto extraños al
ecosistema y se presentan típicamente de
forma transitoria o permanecen en formas
de reposo.
Poblaciones, gremios
Es un sistema microbiano, el crecimiento
celular forma poblaciones.
Las poblaciones metabólicamente
relacionadas se denominan gremios.
Los conjuntos de agrupaciones
interaccionan formando comunidades
microbianas.
Ecosistema microbiano: Suma de todos los
microorganismos y los factores abióticos de
un ambiente partcular.
Poblaciones: Por crecimiento celular.
Gremios: Poblaciones metabólicamente
desarrolladas.
Comunidades microbianas: Conjunto de
gremios.
Energía entra en un ecosistema:
Luz, C orgánico, Sustancias redu-
Cidas: H2, Fe 2+, S, NH3.
El crecimiento depende de los recursos
disponibles y de las condiciones del nicho.
El nicho está determinado por:
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C orgánico/inorgánico
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Microambientes
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El crecimiento de los microorganismos en la
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Solución del suelo: Es una mezcla de agua y
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disueltos.
Microbiología de la superficie profunda
En la subsuperficie, existen microorganismos,
principalmente bacterias.
Incluyen:
Anaerobios estrictos.
Anaerobios facultativos.
Bacterias sulfato reductoras.
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Ciclos biogeoquímicos
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biológicos y químicos durante el reciclado de
elementos esenciales (C, S, N, Fe) de los
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Estos ciclos implican reacciones de oxidación-
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Ciclos del Carbono
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constituyen las rocas y sedimentos de la
corteza terrestre.
El C orgánico se encuentra en las plantas
terrestres, representa el C de los bosques, y
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fotosintética de CO2.
También el humus, mezcla compleja de
materia orgánica, contiene C orgánica.
Importancia de la fotosíntesis
La única vía importante de producción de
carbono orgánico nuevo, procede de la
fotosíntesis y de la quimiosintesis (fijación de
CO2 por quimiolitotrofos).
Los organismos fototróficos se encuentran en
la base del ciclo del carbono, hábitats donde
hay luz disponible.
Importancia de la fotosíntesis
Importancia de la fotosíntesis
Los organismos fototróficos oxigénicos
pueden dividirse en:
Plantas superiores: Predominan en
ambientes terrestres.
Microorganismos fototróficos: sintetizadores
de los ambientes acuáticos.
Fotosíntesis:
CO2 + H20 (CH2O) + O2
El CH2O representa la materia orgánica en
estado de oxidación de material celular
(polisacáridos).
Los microorg. fototróficos levan a cabo la
respiración, en presencia de luz como en
oscuridad.
(CH2O) + O2 CO2 + H2O
El ciclo del C se cosntruye a partir del
equilibrio neto de la tasas de fotosintesis
sobre la tasa de respiración.
Descomposición
El C fijado fotosintéticamente es degradado
finalmente por varios organismos. Se
observan dos estados de oxidación del C:
Metano (CH4): se produce por la actividad
de los metanógenos.
Diox. De C (CO2): por diversos
microorganismos mediante fermentación,
respiración aeróbica o anaeróbica.
Ciclos del Nitrógeno
El N2 constituye básico del protoplasma se
encuentra en varios estados de oxidación.
Los principales procesos de transformación
microbiana del nitrógeno:
Nitrificación
Desnitrificación
El N2 gaseoso es la forma mas estable, el
reservorio más importante esta en la
atmósfera.
La gran cantidad de E necesaria para
romper el enlace N-N, significa la reducción
del N2.
Un número de microorganismos
relativamente reducido puede utilizar N2
en el proceso de fijación de nitrógeno.
Desnitrificación
Es el proceso de conversión de nitrato a
nitrógeno gaseoso, es el prinicpal proceso
biológico de formación de N2.
La desnitrificación puede ser perjudicial,
pues elimina el Nitrógeno fijado del
ambiente.
Resulta beneficiosa, en el tto de aguas
residuales, donde se elimina el nitrato.
Flujo de amoniaco y nitrificación
El amoniaco se produce durante la
descomposición de os compuestos orgánicos
de nitrógeno como aas y nucleótidos.
En los suelos, una parte del amoniaco,
liberado por descomposición aeróbica es
reciclado y convertido en aas por plantas y
microorganismos.
Flujo de amoniaco y nitrificación
Nitrificación: Es la oxidación de NH3 a NO3,
principal proceso, que ocurre con facilidad
en suelos drenados a pH neutro por la
acción de bacterias nitrificantes.
La nitrificación no es beneficiosa para la
actividad agrícola, el nitrato es my solube
en agua y se lava rápidamente en los suelos
que reciben mucha agua lluvia.
Ciclo del Azufre
El azufre presenta variedad de estados de
oxidación, sólo tienen importancia en la
naturaleza;
Sufihidrilo (R-SH) Sulfuro (HS)
Azufre elemental (S) Sulfato (SO4)
La mayor parte de azufre de nuestro
planeta se encuentra en sedimentos y rocas
en forma de minerales de sulfato, el mar
constituye el mayor reservorio.
Ciclo del Azufre
El Azufre se encuentra además como sulfuro
de Hidrógeno (H2S), principal gas volátil de
azufre.
Se forma principalmente por reducción
bacteriana de SO4 (Sulfato), su presencia
depende del pH.
pH< 7 predomina H2S pH> 7 predomina HS
Las bacterias sulfato reductoras están
ampliamente distribuidas en la naturaleza.
Ciclo del Azufre
En condiciones óxicas, el sulfuro a pH neutro
se oxida rápida y espontáneamente.
Las bacterias oxidadoras de azufre
(aerobias) catalizan la reacción de estos
compuestos, sólo cuando el H2S procedente
de zonas anóxicas se encuentra con el O2
que desciende de las zonas óxicas.
La oxidación del azufre elemental produce
iones sulfato y de hidrogeno, pH caracte.
Ciclo del Azufre
El azufre elemental puede ser reducido, en
forma de respiración anaeróbica.
Constituye un proceso ecológico importante,
especialmente para arqueas hipertermófilas.
Los compuestos orgánicos de azufre que son
sintetizados por los seres vivos son
extremadamente volátiles, por lo que se van
rápidamente a la atmósfera (Dimetilsulfuro,
ambientes marinos).
Ciclo del Azufre
El dimetilsulfuro se libera a la atmósfera
donde experimenta una oxidación
fotoquímica dando metanosulfonato
(CH3SO3), los microorganismos lo utlizan:
1. Como sustrato para la metanogenésis.
2. Como donador de electrones para la
fijación fotosintética de CO2 por las
bacterias fototróficas rojas.
3. Como donador de electrones en el
metabolismo energético.
Ciclo del Hierro
El Hierro es uno de los elementos más
abundantes de la corteza terrestre.
Se presenta en dos estados de oxidación:
Ferroso (Fe2+) y Férrico (Fe3+).
En la naturaleza, el ciclo del hierro se da
entre las formas ferrosa y férrica.
Ciclo del Hierro
La reducción del Fe3+ se da en consecuencia
de la respiración anaeróbica.
La oxidación de Fe2+ se produce como
resultado de una forma de metabolismo
quimiolitotrófico.
Las bacterias utilizan el hierro férrico como
aceptor de electrones, se da en suelos
encharcados, turberas y sedimentos anóxicos
de lagos.
Ciclo del Hierro
Cuando las aguas cargadas de hierro,
alcanzan las zonas óxicas, el hierro ferroso se
oxida (bacterias) y se producen compuestos
férricos, que precipitan formando un
depósito marrón.
Este precipitado interacciona con otras
sustancias como el humus, reduciéndose a
Fe2+.
Ciclo del Hierro
Papel de las bacterias oxidadoras de
hierro en la oxidación del mineral pirita
Ciclo del Fósforo
El fósforo, principalmente en forma de
ciertos tipos de iones fosfato (PO43- y HPO4
2-), es un nutriente esencial para vegetales y
animales.
Diversas formas de fósforo son cicladas,
principalmente a través del agua, la corteza
de la Tierra y los organismos vivos, por el
ciclo del fósforo sedimentario.
Ciclo del Fósforo
El fósforo se mueve lentamente desde los
depósitos de fosfato en la tierra y los
sedimentos de los mares someros a los
organismos vivos, y luego de regreso a la
tierra y al océano.
El fósforo liberado por la degradación lenta
o intemperismo de los depósitos de fosfato
en las rocas, es disuelto en el agua del suelo
y tomado por las raíces vegetales.
Ciclo del Fósforo
Por otro lado, los animales obtienen su
fósforo comiendo productores o animales
que han ingerido a su vez productores
primarios.
De esta manera, los desechos animales y los
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  • 2. Alguna terminología Ecosistema: Es la unidad básica ecológica, comprende tanto a los componentes bióticos como a los abióticos. Los ecosistemas de los microorganismos son muy distintos desde el punto de vista de su tamaño, ejem: la cavidad bucal, la panza de los rumiantes, la región radical de la planta, entre otros.
  • 3. Alguna terminología Hábitat: Es el lugar o espacio vital que habita normalmente un microorganismo determinado, donde se desarrolla y multiplica. A cada organismo se le puede asignar por l0 menos un hábitat en el que se encuentra normalmente, ejem: sedimento de un lago, el humus de un suelo fértil, la cavidad nasal,
  • 4. Alguna terminología Nicho: Hace referencia a una función de la especie o población de microorganismos. Depende: Requerimientos nutricionales y fisiológicos. Características genéticas. Capacidades bioquímicas. Características estructurales. Tolerancia a condiciones ambientales.
  • 5. Habitantes del ecosistema Pueden distinguirse dos categorías: Autóctonos: son propios de un determinado ecosistema (suelo, intestino) y se encuentran siempre en el, su presencia se debe a la afluencia mas o menos constante de nutrientes típicos del ecosistema.
  • 6. Habitantes del ecosistema Alóctonos: aquellos cuya presencia se debe al incremento ocasional de la concentraci6n de nutrientes o de un nutriente determinado. Son hasta cierto punto extraños al ecosistema y se presentan típicamente de forma transitoria o permanecen en formas de reposo.
  • 7. Poblaciones, gremios Es un sistema microbiano, el crecimiento celular forma poblaciones. Las poblaciones metabólicamente relacionadas se denominan gremios. Los conjuntos de agrupaciones interaccionan formando comunidades microbianas.
  • 8. Ecosistema microbiano: Suma de todos los microorganismos y los factores abióticos de un ambiente partcular. Poblaciones: Por crecimiento celular. Gremios: Poblaciones metabólicamente desarrolladas. Comunidades microbianas: Conjunto de gremios. Energía entra en un ecosistema: Luz, C orgánico, Sustancias redu- Cidas: H2, Fe 2+, S, NH3.
  • 9. El crecimiento depende de los recursos disponibles y de las condiciones del nicho. El nicho está determinado por: Temperatura pH Disponibilidad de agua y O2. Fuente de E. C orgánico/inorgánico Macronutrientes Micronutrientes
  • 10. Microambientes Los microorganismos también habitan las superficies de organismos superiores y algunos pueden, incluso, vivir en el interior de plantas y animales. En dichos hábitat, sus poblaciones pueden ser muy numerosas y ser muy beneficiosos para la plana o el animal en relación con su nutrición.
  • 11. El crecimiento de los microorganismos en la naturaleza depende de los recursos disponibles y de las condiciones de crecimiento. Para cada microorganismo existe al menos un nicho, el principal será en el que crece mejor. Microambiente: Es el lugar del hábitat en el que un microorganismo vive y lleva a cabo su metabolismo.
  • 12. En una partícula de suelo de 3mm existen diversos microambientes. Interior: Anóxico (Sin O2) Exterior: Óxico (Con O2). Los microambientes son temporarios, las condiciones fisicoquímicas pueden cambiar rápidamente, los microambientes son heterogéneos.
  • 13. Niveles de nutrientes y velocidad de crecimiento Los nutrientes entran en el ecosistema de manera intermitente, los microorganismos han desarrollado sistemas bioquímicos. Las condiciones óptimas no se dan simultaneamente , la Vel. crecimiento en el medio natural es menor que las alcanzadas en laboratorio. Escherichia coli Intestino 12 h Cultivo 20 mi.
  • 14. Competencia y cooperación microbianas La competencia entre microorganismos depende de: Incorporación de nutrientes Tasas metabólicas inherentes Velocidad de crecimiento Un hábitat típico alberga una mezcla de diferentes microorganismos.
  • 15. Competencia y cooperación microbianas Sintrofia: Es una interacción microbiana en la cual existe una colaboración para llevar a cabo una transformación determinada, que o podrían realizar por si mismos. Metabolismos complementarios: Es una cooperación metabólica en grupos de microorganismos. Ejem: Bacterias nitrosificantes y nitirificantes, se combinan para oxidar el NH3 a NO3.
  • 16. Crecimiento en biofilms En el microambiente de una superficie, las concentraciones de nutrientes pueden ser muy superiores a las de toda la solución. Los biofilmes son microcolonias revestidas de células bacterianas adosadas a una superficie mediante polisacáridos adhesivos excretados por las propias células.
  • 17. Estos biofilmes atrapan nutrientes para el crecimiento de las poblaciones microbianas. Ayudan a impedir el desprendimiento de las células que crecen sobre las superficies expuestas a corrientes de líquido. Ejem: La Pseudomona aeruginosa es notable formadora de biofilmes
  • 18.
  • 19. Ambientes terrestres El crecimiento microbiano también tiene lugar en la superficie de las partículas del suelo, normalmente en la rizosfera. Incluso un pequeño agregado de suelo contiene microambientes muy diferentes, por tanto, podrían encontrarse diferentes tipos de microorganismos. El agua es un componente del suelo que presenta gran variabilidad.
  • 20. El agua permanece en el suelo de dos maneras: Por adsorción sobre las superficies. Como agua libre formando láminas o películas entre las partículas del suelo. Solución del suelo: Es una mezcla de agua y suelo, que contiene diversos materiales disueltos.
  • 21. Microbiología de la superficie profunda En la subsuperficie, existen microorganismos, principalmente bacterias. Incluyen: Anaerobios estrictos. Anaerobios facultativos. Bacterias sulfato reductoras.
  • 22. Microbiología de la superficie profunda En la subsuperficie, existen microorganismos, principalmente bacterias. Incluyen: Anaerobios estrictos. Anaerobios facultativos. Bacterias sulfato reductoras.
  • 23. Ciclos biogeoquímicos Es el resultado del conjunto de los procesos biológicos y químicos durante el reciclado de elementos esenciales (C, S, N, Fe) de los sistemas vivos. Estos ciclos implican reacciones de oxidación- reducción, a medida que el elemento se desplaza a través del ecosistema.
  • 24. Ciclos del Carbono El Carbono circula por todos los reservorios de la tierra que lo contienen: La atmósfera. El medio terrestre. Los mares y otros ambientes acuáticos. Sedimentos y rocas. Biomasa.
  • 25. Reservorios de Carbono El mayor reservorio de carbono lo constituyen las rocas y sedimentos de la corteza terrestre. El C orgánico se encuentra en las plantas terrestres, representa el C de los bosques, y praderas, son el principal lugar de fijación fotosintética de CO2. También el humus, mezcla compleja de materia orgánica, contiene C orgánica.
  • 26.
  • 27. Importancia de la fotosíntesis La única vía importante de producción de carbono orgánico nuevo, procede de la fotosíntesis y de la quimiosintesis (fijación de CO2 por quimiolitotrofos). Los organismos fototróficos se encuentran en la base del ciclo del carbono, hábitats donde hay luz disponible.
  • 28. Importancia de la fotosíntesis Importancia de la fotosíntesis Los organismos fototróficos oxigénicos pueden dividirse en: Plantas superiores: Predominan en ambientes terrestres. Microorganismos fototróficos: sintetizadores de los ambientes acuáticos. Fotosíntesis: CO2 + H20 (CH2O) + O2
  • 29. El CH2O representa la materia orgánica en estado de oxidación de material celular (polisacáridos). Los microorg. fototróficos levan a cabo la respiración, en presencia de luz como en oscuridad. (CH2O) + O2 CO2 + H2O El ciclo del C se cosntruye a partir del equilibrio neto de la tasas de fotosintesis sobre la tasa de respiración.
  • 30. Descomposición El C fijado fotosintéticamente es degradado finalmente por varios organismos. Se observan dos estados de oxidación del C: Metano (CH4): se produce por la actividad de los metanógenos. Diox. De C (CO2): por diversos microorganismos mediante fermentación, respiración aeróbica o anaeróbica.
  • 31. Ciclos del Nitrógeno El N2 constituye básico del protoplasma se encuentra en varios estados de oxidación. Los principales procesos de transformación microbiana del nitrógeno: Nitrificación Desnitrificación
  • 32. El N2 gaseoso es la forma mas estable, el reservorio más importante esta en la atmósfera. La gran cantidad de E necesaria para romper el enlace N-N, significa la reducción del N2. Un número de microorganismos relativamente reducido puede utilizar N2 en el proceso de fijación de nitrógeno.
  • 33. Desnitrificación Es el proceso de conversión de nitrato a nitrógeno gaseoso, es el prinicpal proceso biológico de formación de N2. La desnitrificación puede ser perjudicial, pues elimina el Nitrógeno fijado del ambiente. Resulta beneficiosa, en el tto de aguas residuales, donde se elimina el nitrato.
  • 34. Flujo de amoniaco y nitrificación El amoniaco se produce durante la descomposición de os compuestos orgánicos de nitrógeno como aas y nucleótidos. En los suelos, una parte del amoniaco, liberado por descomposición aeróbica es reciclado y convertido en aas por plantas y microorganismos.
  • 35. Flujo de amoniaco y nitrificación Nitrificación: Es la oxidación de NH3 a NO3, principal proceso, que ocurre con facilidad en suelos drenados a pH neutro por la acción de bacterias nitrificantes. La nitrificación no es beneficiosa para la actividad agrícola, el nitrato es my solube en agua y se lava rápidamente en los suelos que reciben mucha agua lluvia.
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  • 37. Ciclo del Azufre El azufre presenta variedad de estados de oxidación, sólo tienen importancia en la naturaleza; Sufihidrilo (R-SH) Sulfuro (HS) Azufre elemental (S) Sulfato (SO4) La mayor parte de azufre de nuestro planeta se encuentra en sedimentos y rocas en forma de minerales de sulfato, el mar constituye el mayor reservorio.
  • 38. Ciclo del Azufre El Azufre se encuentra además como sulfuro de Hidrógeno (H2S), principal gas volátil de azufre. Se forma principalmente por reducción bacteriana de SO4 (Sulfato), su presencia depende del pH. pH< 7 predomina H2S pH> 7 predomina HS Las bacterias sulfato reductoras están ampliamente distribuidas en la naturaleza.
  • 39. Ciclo del Azufre En condiciones óxicas, el sulfuro a pH neutro se oxida rápida y espontáneamente. Las bacterias oxidadoras de azufre (aerobias) catalizan la reacción de estos compuestos, sólo cuando el H2S procedente de zonas anóxicas se encuentra con el O2 que desciende de las zonas óxicas. La oxidación del azufre elemental produce iones sulfato y de hidrogeno, pH caracte.
  • 40. Ciclo del Azufre El azufre elemental puede ser reducido, en forma de respiración anaeróbica. Constituye un proceso ecológico importante, especialmente para arqueas hipertermófilas. Los compuestos orgánicos de azufre que son sintetizados por los seres vivos son extremadamente volátiles, por lo que se van rápidamente a la atmósfera (Dimetilsulfuro, ambientes marinos).
  • 41. Ciclo del Azufre El dimetilsulfuro se libera a la atmósfera donde experimenta una oxidación fotoquímica dando metanosulfonato (CH3SO3), los microorganismos lo utlizan: 1. Como sustrato para la metanogenésis. 2. Como donador de electrones para la fijación fotosintética de CO2 por las bacterias fototróficas rojas. 3. Como donador de electrones en el metabolismo energético.
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  • 43. Ciclo del Hierro El Hierro es uno de los elementos más abundantes de la corteza terrestre. Se presenta en dos estados de oxidación: Ferroso (Fe2+) y Férrico (Fe3+). En la naturaleza, el ciclo del hierro se da entre las formas ferrosa y férrica.
  • 44. Ciclo del Hierro La reducción del Fe3+ se da en consecuencia de la respiración anaeróbica. La oxidación de Fe2+ se produce como resultado de una forma de metabolismo quimiolitotrófico. Las bacterias utilizan el hierro férrico como aceptor de electrones, se da en suelos encharcados, turberas y sedimentos anóxicos de lagos.
  • 45. Ciclo del Hierro Cuando las aguas cargadas de hierro, alcanzan las zonas óxicas, el hierro ferroso se oxida (bacterias) y se producen compuestos férricos, que precipitan formando un depósito marrón. Este precipitado interacciona con otras sustancias como el humus, reduciéndose a Fe2+.
  • 46. Ciclo del Hierro Papel de las bacterias oxidadoras de hierro en la oxidación del mineral pirita
  • 47. Ciclo del Fósforo El fósforo, principalmente en forma de ciertos tipos de iones fosfato (PO43- y HPO4 2-), es un nutriente esencial para vegetales y animales. Diversas formas de fósforo son cicladas, principalmente a través del agua, la corteza de la Tierra y los organismos vivos, por el ciclo del fósforo sedimentario.
  • 48. Ciclo del Fósforo El fósforo se mueve lentamente desde los depósitos de fosfato en la tierra y los sedimentos de los mares someros a los organismos vivos, y luego de regreso a la tierra y al océano. El fósforo liberado por la degradación lenta o intemperismo de los depósitos de fosfato en las rocas, es disuelto en el agua del suelo y tomado por las raíces vegetales.
  • 49. Ciclo del Fósforo Por otro lado, los animales obtienen su fósforo comiendo productores o animales que han ingerido a su vez productores primarios. De esta manera, los desechos animales y los productos de su descomposición cuando mueren, devuelven mucho de este fósforo al suelo.