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DR. EN C. ERICEL
HERNÁNDEZ GARCÍA
MÉTODOS DE EXTRACCIÓN DE
ÁCIDOS NUCLEICOS Y
PROTEÍNAS
Consiste en lograr la lisis o ruptura de la
célula, y luego separar las moléculas de
ADN del resto de los constituyentes de la
célula.
FUNDAMENTO GENERAL
LISIS CELULAR
LISIS CELULAR
Componentes para lisar la célula
Componentes para lisar la célula
FUNDAMENTO GENERAL
PURIFICACIÓN Y REMOCIÓN DE LAS PROTEINAS
EXTRACCIÓN DE ADN CON DISOLVENTES ORGÁNICOS
.
El lisado de células se puede extraer con cloroformo, alcohol isoamílico o
fenol, siendo las proteínas y otros componentes de la célula solubles en el
disolvente orgánico, por lo que de esta forma se logra la separación de los
ácidos nucleicos
FACTORES QUE ASEGURAN UNA
BUENA SEPARACIÓN : Control de pH de
la fase acuosa y concentración de sales.
DESVENTAJAS
• Posible ruptura de las moléculas de
ADN que se intentan separar.
• Altamente tóxico
• El Fenol cloroformo puede quedar como
trazas en la muestra de ADN y luego
actuar como interferentes PCR.
las muestras son digeridas con proteinasa K y un detergente como Triton X-100 o
SDS, que rompe las membranas celulares.
25:24:1, v/v
Fenol-cloroformo – alcohol isoamilico
Proteínas
CTAB
Cetyl Trimethyl Ammonium Bromide
Bromuro de cetiltrimetilamonio
C19H42BrN
Es una sal de amonio cuaternario surfactante catiónico
LISADO Y PURIFICACIÓN CON UN DETERGENTE IÓNICO. MÉTODO DEL
CTAB
FUNDAMENTO: El CTAB puede romper la pared celular y producir lisis celular.
Uso: extraer ADN genómico de células vegetales
Las moléculas lipídicas están formadas por extremos hidrófilos «cabezas», y extremos
hidrófobos, «colas». El CTAB provoca la lisis de la membrana. Como la composición
de los lípidos y del detergente es similar, el componente CTAB del tampón de
extracción captura los lípidos que integran la membrana celular y nuclear.
CTAB (detergente) EDTA (agente quelatante)
TRIS-HCl (tampón) Complejos insolubles con el ADN.
Lavar el precipitado con
etanol.
Complejos insolubles con el ADN.
Extraer residuos orgánicos con
cloroformo
Precipitar el Acido
nucleico con Isopropanol
Método de salting-out
A partir de un lisado celular se pueden separar las moléculas de proteínas y otros
contaminantes del ADN mediante la adición de altas concentraciones de sal que
hacen que disminuya la solubilidad de las moléculas orgánicas en la fase acuosa.
En este método se utiliza frecuentemente la proteinasa K, el TRIS-HCl para regular el
pH.
Cloruro de sodio
Perclorato de sodio
Acetato de sodio
• Las sales precipitan las
moléculas orgánicas.
• El precipitado formado se
separa por centrifugación.
• El ADN de la disolución
acuosa puede extraerse
mediante la adición de
alcohol, por precipitación.
Método de Isotiocianato de Guanidina
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  • 1. DR. EN C. ERICEL HERNÁNDEZ GARCÍA MÉTODOS DE EXTRACCIÓN DE ÁCIDOS NUCLEICOS Y PROTEÍNAS
  • 2. Consiste en lograr la lisis o ruptura de la célula, y luego separar las moléculas de ADN del resto de los constituyentes de la célula. FUNDAMENTO GENERAL
  • 8. PURIFICACIÓN Y REMOCIÓN DE LAS PROTEINAS
  • 9.
  • 10. EXTRACCIÓN DE ADN CON DISOLVENTES ORGÁNICOS . El lisado de células se puede extraer con cloroformo, alcohol isoamílico o fenol, siendo las proteínas y otros componentes de la célula solubles en el disolvente orgánico, por lo que de esta forma se logra la separación de los ácidos nucleicos FACTORES QUE ASEGURAN UNA BUENA SEPARACIÓN : Control de pH de la fase acuosa y concentración de sales. DESVENTAJAS • Posible ruptura de las moléculas de ADN que se intentan separar. • Altamente tóxico • El Fenol cloroformo puede quedar como trazas en la muestra de ADN y luego actuar como interferentes PCR.
  • 11. las muestras son digeridas con proteinasa K y un detergente como Triton X-100 o SDS, que rompe las membranas celulares. 25:24:1, v/v Fenol-cloroformo – alcohol isoamilico Proteínas
  • 12.
  • 13. CTAB Cetyl Trimethyl Ammonium Bromide Bromuro de cetiltrimetilamonio C19H42BrN Es una sal de amonio cuaternario surfactante catiónico LISADO Y PURIFICACIÓN CON UN DETERGENTE IÓNICO. MÉTODO DEL CTAB FUNDAMENTO: El CTAB puede romper la pared celular y producir lisis celular. Uso: extraer ADN genómico de células vegetales
  • 14. Las moléculas lipídicas están formadas por extremos hidrófilos «cabezas», y extremos hidrófobos, «colas». El CTAB provoca la lisis de la membrana. Como la composición de los lípidos y del detergente es similar, el componente CTAB del tampón de extracción captura los lípidos que integran la membrana celular y nuclear.
  • 15. CTAB (detergente) EDTA (agente quelatante) TRIS-HCl (tampón) Complejos insolubles con el ADN.
  • 16. Lavar el precipitado con etanol. Complejos insolubles con el ADN. Extraer residuos orgánicos con cloroformo Precipitar el Acido nucleico con Isopropanol
  • 17. Método de salting-out A partir de un lisado celular se pueden separar las moléculas de proteínas y otros contaminantes del ADN mediante la adición de altas concentraciones de sal que hacen que disminuya la solubilidad de las moléculas orgánicas en la fase acuosa. En este método se utiliza frecuentemente la proteinasa K, el TRIS-HCl para regular el pH. Cloruro de sodio Perclorato de sodio Acetato de sodio • Las sales precipitan las moléculas orgánicas. • El precipitado formado se separa por centrifugación. • El ADN de la disolución acuosa puede extraerse mediante la adición de alcohol, por precipitación.
  • 18. Método de Isotiocianato de Guanidina Degradante de proteínas Isotiocianato de Guanidina:
  • 19. Método de Extracción por Trizol Trizol: Solución monofásica de Isotiocianato de Guanidino y Fenol
  • 20.
  • 21. Método de Extracción por Shock Térmico 1. Centrifugar
  • 22.
  • 24.

Notas del editor

  1. Dodecilsulfato sódico – sds / El tensoactivo no iónico Tritón-X 100 
  2. Proteinasa K: Elimina proteinas
  3. El catión de amonio cuaternario es un catión de estructura NR4+, donde R representa un grupo alquilo o uno arilo.1 A diferencia del ion amonio (NH4+) y los cationes de amonio primario, secundario o ternario, los cationes de amonio cuaternario están cargados permanentemente, independientemente del pH de su solución. Las sales de amonio cuaternario o compuestos de amonio cuaternario (comúnmente llamadas aminas cuaternarias) son sales de cationes de amonio cuaternario enlazadas a un anión. surfactante catiónico: la parte hidrofílica de estos tensioactivos posee una carga positiva. Estos tensoactivos suelen tener una alta adherencia en diferentes sustratos y una alta "persistencia" en esa adhesión. Un hecho experimental que caracteriza a estos compuestos es que cambia las propiedades superficiales y convierte una superficie hidrofílica en hidrofóbica y viceversa.2
  4. Tampón: Tienen la propiedad de mantener estable el pH de una disolución
  5. El cloroformo elimina el fenol Etanol limpia el precipitado