El mesencéfalo se ubica en la parte superior del tronco cerebral y tiene caras anterior, posterior y laterales. En la cara anterior se encuentran los pedúnculos cerebrales y la sustancia perforada posterior. En la cara posterior están los tubérculos cuadrigéminos. Internamente contiene la sustancia negra, los pedúnculos cerebrales, el núcleo rojo y las fibras del nervio motor ocular común.