La segunda ley de Mendel establece que en la generación F2 aparecen los fenotipos de la generación F1, lo que demuestra que los alelos se han separado en los gametos y se recombinan de nuevo en la F2. Cuando se cruzan heterocigóticos, en la F1 solo aparece el carácter dominante, pero en la F2 se observan los dos carácteres en una proporción de 3:1.