3. Productores y Hectáreas sembradas de Arroz
Productores y Hectáreas sembradas de Arroz
Hectáreas. Productores
90,000 2,500
80,000
70,000 2,000
60,000
1,500
50,000
40,000
1,000
30,000
20,000 500
10,000
0 0
00‐01, 01‐02, 02‐03, 03‐04, 04‐05, 05‐06, 06‐07, 07‐08, 08‐09,
AÑO
Productores Ha. Sembradas Ha. Cosechadas
4. Producción Nacional a través del tiempo
p
Área Ha 76,699
2003 ‐
2003 2004 Producción Kg/Ha 4,499
28.85%
Área Ha 77,209
2004 ‐2005 Producción Kg/Ha 3,201
Área Ha 68,354
2005‐2006 Producción Kg/Ha 4,072
Área Ha 59,613
2006‐2007
Producción Kg/Ha 4,138
2007‐2008 Área Ha 59,603
Producción Kg/Ha 4,511
Área Ha 60,778
2008‐2009 Producción Kg/Ha 4,725
5. Nuestro Grupo
CALESA
Producción, Procesamiento
y comercialización de azúcar
CEGRACO CAMACO
Producción, Procesamiento Producción y Procesamiento
y comercialización de arroz de camarones
SECOSA
Producción de semillas INASA
de arroz Producción de alimentos
balanceados
CASA GANACO
Distribuidora de agroquímicos Producción de Ganado
y veterinaria de carne
23. Umbrales para Ácaro
6% 6%-
6%-10%
30 35 40 45 50 55 60 65 70 75 80 90 115
Inicio d Primordio-
I i i de P i
Primordio-
di
Primordio Embuchamiento
1 = 1 a 5 acaros
2 = 6 a 10 acaros
3 = 11 a 15 acaros
4 = 16 a 20 acaros
5 = mayor a 20 acaros
24.
25. Cada Época, Cada Finca, Cada Campo, Es Diferente
20
18 30
34
16
38
14 42
46
12
50
10 54
58
8
62
6 66
70
4
70 74
2 50 78
0 30 82
31. 1er PROYECTO SENACYT – CEGRACO – F C A
1er. F.C.A.
Localidades y Patógenos Evaluados
•Bayano (Chepo) Panamá
•La Cabezona (Alanje) Chiriquí
•Ganaco (Natá) Coclé
•Sierra (El Roble) Coclé
Sierra
•Santa Rita (Santa María) Herrera
PCR
Patógeno # muestras (campo)
Burkholderia glumae 620
Burkholderia gladioli 670
Pseudomonas avenae
P d
Pseudomonas fuscovaginae
290
430
Total
T t l: 3494
Pseudomonas syringae 373
Xanthomonas oryzae pv. oryzae 370
Xanthomonas oryzae pv. oryzicola
X th i l 330
Nested-PCR RHBV 411
32. Muestreo
- Recolección al azar de plantas sintomáticas y asintomáticas.
-CCampos en etapa d fl
t de floración
ió
- Época lluviosa
Diferentes partes de la planta :
Espiga,
Espiga hoja bandera vaina de la hoja bandera espiguilla, raíz semilla
bandera, bandera, espiguilla raíz, semilla.
33. Evaluación de las metodologías para la
extracción de ácidos nucleicos (ADN ARN)
(ADN,
A partir de diferentes tejidos de planta
(Raíces, tallos, hojas, vainas, espigas)
A partir de cultivos puros de bacterias
Evaluación de las metodologías para la
extracción de ácidos nucleicos
Selección de primers y condiciones de
amplificación.
34. Selección de primers y amplificación por PCR
Burkholderia glumae
Primer 1 amplicon de 227 pb
Primer 2 amplicon de 528 pb
Pruebas de sensibilidad:
Diluciones del ADN (desde 10-1 hasta 10-6 )
(
C- 10-1 10-2 10-3 10-4 10-5 10-6 C+
Primer 1
10¯1 10¯2 10¯3 10-4 10-5 10-6 C+
Primer 2
El juego de primers 2 ha sido seleccionado por ser el más sensible de los demás,
tanto a partir de bacterias crecidas en agua de peptona como en LB.
35. Selección de primers y amplificación por PCR
Burkholderia glumae
Confirmación de las secuencias detectadas
La comparación entre la secuencia del producto de amplificación y secuencias publicadas en
GenBank permite confirmar su pertenencia a Burkholderia glumae.
Burkholderia
glumae
36. Amplificación por PCR de Otros Patógenos
Sondeo epidemiológico de la
finca La Cabezona para
Burkholderia l di li
B kh ld i gladioli
Pseudomonas
avenae
37. Tropismo Tisular
P t l í
Patología Tejido
T jid
Burkholderia glumae Espiga
Xanthomona oryzae pv oryzae
pv. Vaina
RHBV Hoja y Vaina
Pseudomona avenae Espiga
X. oryzae pv.oryzicola Vaina
B. gladioli
g Hoja, Vaina, Espiga
j , , pg
P. fuscovagine Espiga
P. syringae Espiga
38. Identificación y determinación de la frecuencia de
bacterias en l fi
b t i las fincas d CEGRACO
de
%
%
30
25
20
15
10
5
0
B. glumae B. gladioli P. fuscovagine P.avenae P. syringe X. oryzae X orizicola
BAYANO GANACO CABEZONA SIERRA STA RITA
39. 2o.
2o PROYECTO SENACYT – CEGRACO – U P
U.P.
Estudio Epidemiológico y Diagnóstico Molecular de
Burkholderia glumae y B. gladioli en las principales
zonas arroceras de Panamá
Diagnosticar mediante
g
Determinar los posibles
biología molecular las
agentes diseminadores de
bacterias B. glumae y B.
las bacterias Burkholderia
gladioli en las 16 etapas
g p
glumae y B gladioli
B.
fenológicas del arroz.
40. Electroforesis para el diagnóstico de B. glumae y B.
gladioli a partir de tejidos de espiga y vaina.
l di li ti d t jid d i i
Determinación de B. glumae en espiga y vaina.
M v E1 E2 E3 E4 E5 E6 E7 E8 E9 E10 v V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9 V10 v P+
Determinación de B. gladioli en espiga y vaina
M v E1 E2 E3 E4 E5 E6 E7 E8 E9 E10 v V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9 V10 v P+
42. Actividades Realizadas
Recolección
R l ió Extracción de
E t ió d PCR Electroforesis
El t f i
de muestras ADN • Primers para • B. glumae:
• Tomadas al azar • Validación de B.glumae 528 pb
• 4 zonas protocolos • Primers para • B. gladioli:
• 3 Fincas para cada B. gladioli 471 pb
• 5 diseminadores
posible
diseminador
43. Extracción de ADN en posibles diseminadores
AGUA
(1) Extracción con buffer de lisis y proteinasa K (AP) según Poutou et al., 2001
(2) Modificación del método anterior aplicando, pero utilizando filtración con membrana
(FM) de acetato de celulosa de 0.45 μm.
SUELO
(1) Mét d d sucrosa con cloruro d calcio con volumen original (SC1) y volumen reducido
Método de l de l i l i i l l d id
(modificación) (SC2) según Pillai et al., 1991
( 2) Método de bead beating con cloruro de calcio precipitado con isopropanol (BC1) o
etanol y acetato de sodio (modificación) (BC2) según Sagova-Mareckova et al., 2008
( )
(3) Método de bead beating ( ) según Yeates et al., 1998
g (B) g ,
(4) Método de lisis enzimática (K1) según Yeates et al., 1998
ACARO
(1) Método de buffer de lisis con CTAB (BL) según Desloire et al., 2006
(2) Mét d d papel filt (F) según D l i et al., 2006
Método de l filtro ú Desloire t l
(3) Digestión enzimática con proteinasa K y sin PK
(4) Extracción orgánica según Ausubel et al., 1992
MALEZAS Y SEMILLAS
(1) Buffer de lisis con CTAB (BL2)
(2) Utilizando el reactivo comercial Trizol de Invitrogen (T)
44. PCR a partir de ADN de muestras de
ácaros extraídos por cuatro métodos
á t íd t ét d
A BL1 F
M1 v P‐1 P‐2 P+1 P+2 v E‐1 1 2 3 4 5 v E‐2 6 7 8 9 10
M1 v P‐1 P‐2 P+1 P+2 v E‐1 1 2 3 4 5 v E‐2 6 7 8 9 10
B
K2 KP
M1 v E‐1 1 2 3 4 5 v E‐2 6 7 8 9 10
A. Amplificación de ADN de ácaros. Línea 1 – 5: Método de Buffer de Lisis con
CTAB (BL1). Línea 6 – 10: Método de Papel Filtro (F).
B. Amplificación de ADN de ácaros. Línea 1 – 5: Método de Proteinasa K crudo
para á
ácaros (K2) Lí
(K2). Línea 6 – 10 Mét d d P t i
10: Método de Proteinasa K con F
Fenol Cl f
l Cloroformo
Alcohol Isoamílico (KP).
E-1 y E-2 controles negativos de extracción para cada método
P-1 y P-2 controles negativos de PCR
g
P+1 y P+2, controles positivos de PCR (ADN de bacteria).
45. Frecuencia de B. glumae y B. gladioli en los posibles
di
diseminadores d acuerdo a l zona
i d de d la
80
70
60
50
40
30
20
10
0
B.glumae B. gladioli B.glumae B. gladioli B.glumae B. gladioli
ACARO MALEZA SEMILLA
NATA STA MARIA ALANJE CHEPO
46. Frecuencia de B. glumae y B. gladioli en la evaluación
de l
d los posibles diseminadores
ibl di i d
Fr%
12
10
8
6
4
2
0
B. glumae B. gladioli
j
Porcentaje de frecuencia de B. g gladioli tomado del total de
glumae y B. g
muestras de los diseminadores evaluados
47. Frecuencia de B. glumae y B. gladioli en Malezas
g g
9
8
recuencia 7
6
5
4
% Fr
3
2
1
0
B. glumae B. gladioli
M v 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20
500 pb
500 pb
Electroforesis de productos de PCR de muestras malezas de la zona Chepo, Panamá
Este para la detección de B. gladioli . Línea 1 – 20: Amplicones de ADN extraído a partir
p g p p
de distintas especies de malezas, entre las cuales destacan como positivas las especies
Leptochloa spp., Echinocloa spp., Ciperaceae spp. y el arroz rojo.
48. Frecuencia de B glumae y B gladioli en Semillas
B. B.
7
6
5
ecuencia
4
% Fre
3
2
1
0
B. glumae B. gladioli
M v 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 v E‐ P‐ v P+
Análisis molecular de semillas de la zona de Santa María, Herrera para la
patología de B. gladioli
49. Electroforesis para el diagnóstico de B. glumae y
B. l di li
B gladioli en 21 lotes de Semillas
l t d S ill
Determinación de B. gladioli mediante PCR en muestras de semillas. Línea 3-7: Lote 17
Línea 9-13: Lote 9, se observa barrido. Línea 15-19: Lote 16. Línea 21-25: Lote 21.
Determinación de B. glumae mediante PCR en muestras de semillas. Línea 3-7: Lote 17
Línea 9-13: Lote 9 Línea 15-19: Lote 16 Línea 21-25: Lote 21
9. 16. 21.
51. Frecuencia de B glumae y B gladioli en Acaros
B. B.
70
60
50
ecuencia
40
% Fre
30
20
10
0
g
B. glumae g
B. gladioli
52. Electroforesis para el diagnóstico de B. glumae y B.
gladioli a partir de ácaros
M v 1 2 3 4 5 6 v E‐ P‐ v P+ v 1 2 3 4 5 6 v E‐ P‐ v P+
B. glumae B. gladioli
Muestra de ácaros de varias fincas.
M v 1 2 3 4 5 6 7 v v v 8 9 10 11 12 13 14 15 v E P v P+
500 pb
Muestras de ácaros de las zonas de Natá, Coclé y Santa María, Herrera para
la detección de B. gladioli
Línea 1 – 7, muestras de la zona de Natá. Línea 8 – 15. zona de Santa María.
E- control negativo de extracción
P- P+ control negativo y positivo de PCR (ADN de bacteria).
Las bandas muy tenues se muestran encerradas en un círculo.
53. Etapas Fenológicas
Semilla Inicio de
Primordio Floral Grano Maduro
Embuchamiento
Germinación Inicio de
Embuchamiento Grano Pastoso
Primordio Floral
Plántula Máximo Máximo
Grano Lechoso
Macollamiento Embuchamiento
Inicio de Inicio de
Macollamiento Macollamiento Floración
Floración
54. Actividades Realizadas
Recolecta de
Muestras Extracción de
ADN PCR
Electroforesis
60 muestras
por etapa
55. Electroforesis para el diagnóstico de B. glumae
y B gladioli en dif
B. l di li diferentes etapas fenológicas
t t f ló i
Detección, mediante PCR de B. gladioli en 60 muestras de la etapa de máximo
macollamiento del campo 922. Línea 1 – 18: Muestras de ADN en la etapa de
macollamiento. La letra E- indica el control negativo de extracción. La letra P- corresponde
al control negativo de PCR; y P+, al control p
g ; , positivo de PCR ((ADN de bacteria). La letra M
)
corresponde al marcador de ADN de 100 pb. La letra “v” señala los pocillos vacíos
56. f
%
% Frecuencia
a
25
0
5
10
15
20
SEMILLA
ló i
GE
ERMINACION
fenológicas
PLANTULA
I. MACO
OLLAMIENTO
CAMPO 907
MACO
OLLAMIENTO
MAX. MACO
OLLAMIENTO
I.
. PRIMORDIO
CAMPO 922
PRIMORDIO
I. EMBU
UCHAMIENTO
EMBU
UCHAMIENTO
CAMPO 943
MAX.EMBU
UCHAMIENTO
I
I. FLORACION
FLORACION
Frecuencia de B. glumae en las diferentes etapas
GRA
ANO LECHOSO
TENDENCIA
GRANO PASTOSO
NO MADURO
GRAN
57. f
%
% Frecuencia
a
0
5
10
15
20
25
30
SEMILLA ló i
GERMINACION
fenológicas
PLANTULA
I. MA
ACOLLAMIENTO
907
MA
ACOLLAMIENTO
MAX. MA
ACOLLAMIENTO
922
I. PRIMORDIO
PRIMORDIO
943
I. EMBUCHAMIENTO
EMBUCHAMIENTO
MAX.EMBUCHAMIENTO
TENDENCIA I. FLORACION
FLORACION
Frecuencia de B. gladioli en las diferentes etapas
GR
RANO LECHOSO
GR
RANO PASTOSO
GR
RANO MADURO
58. Acaro, B. glumae y B. gladioli B. gladioli en las
dif
diferentes etapas f
t t ló i
fenológicas
25
C- 907
20 g
3,673 Kg/Ha
15
% Fr.
10
5
0
r.
% Fr
C-943
4,443 Kg/Ha
60. Temperaturas Mínimas La Estrella
Mínimas.
25
24
Temperaturas mínimas 23
Grados Centígrados
g 22
21
20
19
ENE FEB MAR ABR MAY JUN JUL AGO SEP OCT NOV DIC
2009 2008
100
80
60
Frecuencia de días con
temperatura mínima mayor a
40 23 Grados Centígrados
20
0
ENE FEB MARZ ABR MAY JUN JUL AGO SEP OCT NOV DIC
2009 2008
61. Factores Climáticos. Finca La Cabezona
800 Precipitación Anual
mm 600
400
200
0
ENE FEB MARZ ABR MAY JUN JUL AGO SEP OCT NOV DIC
2009 2008
Temperaturas mínimas Fr. Temp. mínima mayor a 23 C
25 80
70
24 60
50
23
40
22 30
20
21 10
20 0
ENE FEB MARZ ABR MAY JUN JUL AGO SEP OCT NOV DIC ENE FEB MARZ ABR MAY JUN JUL AGO SEP OCT NOV DIC
2009 2008 2009 2008
62. Prácticas de Manejo del Cultivo
• Mantener períodos libres de
arroz el campo, como
períodos de veda
veda.
• Eliminar por completo los
restos de cosecha y de
malezas
• Sembrar los campos
cercanos en un período de
tiempo definido.
63.
64.
65. Estrategia de Siembra
Radiación 20 Años.
Canal. Panamá
500
450
400
cal/cm2/día
m
350
300
JUL AGO SEP OCT NOV DIC ENE FEB MAR ABR MAY JUN
67. Manejo del cultivo de Acuerdo a las Etapas Fenológicas
Control de Malezas, Fertilización, Riego
68.
69. La clave en la disminución del vaneamiento es el Manejo
Integrado del Cultivo
Nutrición
Destrucción
Destrucción Época de
Época de Monitoreo
Control de
Control de de plantas
de plantas
de Residuos Siembra. de Plagas ,
Escoger la Semilla malezas y de Protección
de cosecha. Enfermeda
Siembra Variedad Certificada limpieza acuerdo de Espiga
des y
Vedas en bloque de bordes análisis de
Ácaro
suelo