D. Victor González - Jefe de Proyectos

1. FORO DE TRANSFERENCIA TECNOLÓGICA
BIOTRANSFER
Precise Pathology – Personalized Medicine
Víctor González Rumayor
Jefe de Proyectos
Althia Health SL
Granada, octubre 2014

2. INVESTIGACION EN DIAGNOSTICO
• Althia está dedicada a la investigación traslacional y
al diagnóstico clínico del cáncer, lesiones pre-cancerosas
y enfermedades inflamatorias.
• Soluciones para la investigación de la firma
molecular especifica del tumor, estudios de
diagnóstico no-invasivo (exosomas y CTC) y uso de
técnicas moleculares que definan la mejor terapia
2

3. Medicina Personalizada
3
La transición de la Medicina Molecular a la Medicina Personalizada
pasa por tener un conocimiento profundo de la biología de la
enfermedad y por la incorporación de nuevos retos y tecnologías
• Herramientas para la
integración y
consolidación de la
información clínica
• Soluciones
Bioinformáticas
Conveniencia
• Procesamiento
automático de datos
para diagnóstico y
tratamiento
• Algoritmos de
Inteligencia Artificial
Objetividad
• Abordaje
multidisciplinar y
multicéntrico de la
oncología
• Redes Colaborativas
de Especialistas
Universalidad
DATOS INFORMACION CONOCIMIENTO ACCIÓN

4. Proyectos en medicina personalizada
4
Organización estructurada de la
información clínica y molecular
Mejor estratificación del paciente
oncológico a terapias más específicas
Ayudar a la mejor selección de las
técnicas de diagnóstico, reduciendo
gastos al sistema
Generar modelos predictores de
seguimiento y de tratamientos con la
mejor elección de la terapéutica
INVESTIGADORES
CLINICOS
INVESTIGADORES
BASICOS
TECNICOS EN
SISTEMAS
DE INFORMACION
ESPECIALISTAS EN
MODELOS MATEMATICOS

5. PROYECTOS
TITLE PARTICIPANTS OBJECTIVES AND RESEARCH AREA PATENT SITUATION
Gliomas ALTHIA,
IDIBELL
Patient stratification through the
applications of molecular and precise
pathology
FINAL REPORT US
FINAL REPORT CAN
OFFICIAL ACTIONS EU
Lymphoma
(DLBCL)
ALTHIA,
H Clinic
Patient stratification through the
applications of molecular and precise
pathology
OFFICIAL WRITING
PROPOSAL (WO)
TradionP
ALTHIA, INDRA
Lorgen
Prototype expert system for diagnosis
and personalized treatment in cancer
patients
UNDER DEVELOPMENT
Proyectos I+D
5

6. PROYECTO TRADIONP
• ESTUDIO BASADO EN MEDICINA PERSONALIZADA
• MUESTRAS DE CÁNCER DE MAMA, COLORRECTAL Y PULMON
• DOS REGIMENES TERAPEUTICOS
•QUIMIO & RADIOTERAPIA
•TERAPIA BIOLOGICA
Base de datos
• 451 cáncer de mama (298 biopsias tumor)
• 330 cáncer Colorrectal (250 biopsias tumor)
• 150 cáncer pulmón
Clínical
Data,
Images...
(+15,000)
Metilation
(+400,000)
Genotyping
(+200,000)

7. PROYECTO TRADIONP
PROTOTIPO DE SISTEMA EXPERTO
ALGORTIMOS DE COMBINACION E
INFORMACION
BBDD CON DATOS CLINICOS Y
MOLECULARES ENTRELAZADOS
Terapias Imágenes
Datos
Informes
mutaciones
marcadores
pruebas
biopsias
ESTUDIO RETROSPECTIVO
SELECCIÓN DE PACIENTES
DATOS CLINICOS CLAVES
INFORMACION MOLECULAR
DISEÑO DE ALGORITMOS
COMITÉ
CIENTÍFICO
BASE DATOS MULTIMODAL

8. BBDDS
PROYECTO TRADIONP
DATOS
CLINICOS
15,000
GENOTIPAJE (SNPs)
HISTOLOGIA PRECISA
FISH
MULTIPLEX
SECUENCIAS
GENES
METILACION

9. 9
08 Resultados
Muestra
Histología Funcional
Análisis histológico
Multiplex
FISH
ADN Firma molecular del tumor
Mutaciones de baja frecuencia en genes relevantes
Identificación de mutaciones puntuales en secuenciación
Presencia redundante de polimorfismos -SNPs
Posiciones hipo/hipermetiladas en el ADN tumoral
BBDD
Analíticas

10. 10
MINERIA
DATOS
?
SISTEMA
EXPERTO
¿SURVIVAL?
¿RELAPSED?
¿2, 5, 10 YEARS?
DATOS CLINICOS
DATOS
EXPERIMENTALES
HELP DESK
COMBINATORIAL
DATA
PROYECTO TRADIONP

11. PROYECTO GLIOMAS
PTEN Probe
CEN10 Probe
PTEN MEASUREMENT BY FISH
• Cirugia
• Radioterapia (RT)
− 3-4 w
• Quimioterapia
− temozolomide (TMZ)
SELECCIÓN DE PACIENTES QUE
RESPONDEN AL FARMACO, Y DE
PACIENTES QUE DEBEN USAR
TERAPIAS ALTERNATIVAS
LA MEDICINA PERSONALIZADA NOS PERMITEN UNA MEJOR ESTRATIFICACION
DE PACIENTES USANDO TÉCNICAS SIMPLES

12. − 230 pacientes astrocitoma (GBM, AA, y otros)
− Base de datos con informacion clinica patologica
− IF (EGFR, PTEN, Ki67) + FISH (EGFR, PTEN)
− Supervivenvia recidiva (estudio retrospectivo)
12
PROYECTO GLIOMAS
AMP.LOH.comb
0 1000 2000 3000 4000
0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0
Days from surgery
Survival
OTHER (n=25)
AMP LOH0.4 (n=10)
p-value (log-rank): 0.001
AA
AMP.LOH.comb
GBM
0 500 1000 1500 2000
0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0
Days from surgery
Survival
OTHER (n=73)
AMP LOH0.4 (n=40)
p-value (log-rank): 0.002
AMP.LOH.comb
ALL
0 1000 2000 3000 4000
0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0
Days from surgery
Survival
OTHER (n=98)
AMP LOH0.4 (n=50)
p-value (log-rank): 0.001
PTEN/EGFR (FISH)
GBM/AA patients
EGFR AMP/HP
PTEN LOH 10%

13. PROYECTO LINFOMA
Diagnostico y pronostico integral para el Linfoma Difuso de
Celulas B grandes(DLBCL) usando patología de precisión
Objetivos
• Combinar técnicas de diagnostico IF Mplex y FISH para
identificar un fenotipo sólido y asociado a la supervivencia
235 pacientes diagnosticado y tratados de Diffuse large B cell
lymphoma (DLBCL)
• Datos clínicos de 153 pacientes tratados con rituximab
CHOP, y seguidos durante 3 años. Análisis con 26 variables
• 3 Hospitales

14. PROJECT LYMPHOMA
• VEGF y BCL6 son marcadores predictivos de respuesta a las
terapias en uso (R-CHOP)
• CMYC, MUM1 y posiblemente CD68, pueden ser relevantes basados
en el estado de la variable IPI (international prognostic index)
LA MEDICINA PERSONALIZADA NOS PERMITE ASOCIAR MARCADORES PARTICULARES A
LA RESPUESTA ESPECIFICA DEL PACIENTE A LA TERAPIA EN USO.

15. PROYECTOS EN DESARROLLO
TITLE PARTICIPANTS OBJECTIVES AND RESEARCH AREA
START
ONCOEXPERT
INDRA, ALTHIA,
LORGEN,
MASTER, ERA7
System for better diagnosis and
treatment
April 2013
ADELIS
ROVI, ALTHIA,
VAXDYN
BIOMEDAL
BIONATURIS
Pharmacogenomics to
aromatase inhibitor response in
breast cancer
April 2013
Prostate Predict
ALTHIA,
Amadix, H
Clinic, H. Vall
d’Hebron, H
12Oct
Combination of protein markers
and miRNA
October 2012
PRECISESADS
PROGSALUD
ALTHIA 22+ Tissue connective pathology Feb 2014
ANXARECU
ALTHIA, Vall
d
´
Hebron, IRB
Lleida, Formune
Anexine: predictor biomarker for
recurrent endometrial cancer
iDOCTUS
eDoctores,
ALTHIA, Blueliv
Plataforma ayuda detección
temparana enfermedades
infecciosas
RD Translational Projects
15

16. PROYECTO PROSTATE PREDICT
Pacientes Prostatectomizados
Búsqueda de marcadores predictores microRNA+proteinas
Desarrollo de nuevos algoritmos de respuesta a
recidivas.
Identificación de nuevos marcadores “in situ”
utilizando patología de sistemas o precisa.
Modelos Predictivos que incluyan miRNA y proteínas
de potencial interés.
16
STARTING Nov 2013--- FINISH 2015

17. PROYECTO ANXARECU
Validación de Anexina 2 como biomarcador para recidiva de
cáncer de endometrio.
17
Validación proteica y transcriptómica (mRNA) en
biopsia y aspirado.
Desarrollo de sistema predictivo no o mínimamente
invasivo
Desarrollo de algoritmos de integración
Desarrollo de un dispositivo de microfluidica para
aislamiento de CTCs y exosomas
Exploración del potencial de Anxa 2 como diana
terapéutica

18. PROYECTO iDOCTUS
Sistema de detección temprana de enfermedades infecciosas.
Desarrollo de un modelo de análisis de datos
microbiológicos basados en técnicas de Big Data
Basado en un sistema de geolocalización de eventos
de diagnóstico de enfermedades infecciosas
Desarrollo de un nuevo sistema de recogida de
datos basado en hacking ético
Sistema de ayuda a la toma de decisiones mediante
aplicaciones móviles con información on-line/ of-line .
18

19. PROYECTO PRECISESADS : IMI. EU-FP7
MOLECULAR RECLASSIFICATION
TO FIND CLINICAL USEFUL BIOMARKERS
FOR SYSTEMIC AUTOIMMUNE DISEASES.
(lupus, artritis reumatoide, sindrome …etc)
19
Coordinador Marta Alarcón-Riquelme, Genyo
Granada
24 partners de 6 diferentes países Europeos y 14
Hospitales
Althia participa en “Tissue based taxonomy and
exosomes”.

20. Nilo1 and Nilo2 antibodies
Nilo1 and Nilo2 are hamster monoclonal antibodies directed against
cell surface mouse neural stem cells.
B: radial
glia
A:
neuroblast
SOX2 GFAP Vimentin
bIII Tub PSA-NCAM DCX
NILO1
NILO2
Nestin,
GFAP
Vimentin
EGFR
Sox2
DCX,
PSA-NCAM,
MUSH1,
NG2,
Tuj1
Neurosphere cell growth inhibition
13,5d
embryo
Olfactory
bulb
neurospheres
(passage 5-6)
IP immunization
hamster
hamster
spleen
cells X
HAT selection
Balb/c
myeloma
X63.Ag8
Flow cytometer
Nilo1 identify
human
GBM-derived
neurosphere
s

21. Nilo2 as a marker of brain damage
• Nilo2 identify neuroblast cells in the brain niches. This cells
could be followed inside the brain moving into damaged areas
TEM

22. Nilo1 a somatic stem biomarker
Nilo1+ cells
oligodendrocytes
neuron
s
astrocytes
NSC
neurosphere
NSC
Neural tissue Nilo1+, Sox2+ 1
adipocytes
osteocyte
s
chondriocytes
Early MSC
progenitors
Nilo1+, Sox2+,
CD29+, CD45-
mature MSC
Nilo1-, Sox2-,
CD29+, CD45-
Bone marrow tissue
2
3 asymmetric division
0 100 200
Nilo1
labeled f=1/10
5
fraction of non
responding cultures
1
0,1
Cells/well
4 Intestinal crypt

23. El futuro en I+D: áreas de interés
• Desarrollo de nuevos marcadores de diagnóstico
dirigidos a la medicina personalizada
• Combinación e integración de ómicas para el
desarrollo de algoritmos con capacidad predictiva
• Desarrollo de biosensores robustos que permitan la
automatización de procesos diagnósticos
• Aplicación de TIC al desarrollo de sistemas expertos
de soporte a la toma de decisiones
• Uso de marcadores de células stem somáticas en
diagnóstico y terapia
23

24. El futuro en I+D
24
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25. 25

26. 26
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