La respiración anaeróbica se produce en ausencia de oxígeno y su mecanismo más común es la fermentación. La fermentación es un proceso catabólico totalmente anaeróbico donde los monosacáridos se transforman en compuestos como el alcohol etílico, ácido láctico o dióxido de carbono para generar energía. Pasteur descubrió que la fermentación es causada por la actividad de microorganismos como las levaduras.