13/03/2012




ENLACES QUIMICOS




 GRUPOS FUNCIONES




                            1
13/03/2012




               MACROMOLECULAS
 Principales clases de macromoléculas :
 La palabra proteína proviene del griego protos, que
 significa "lo primero o lo más importante".
     1. proteínas

     2. Están formadas por: carbono, oxígeno,
        carbohidratos
 hidrógeno y nitrógeno fundamentalmente, aunque
     3. lípidos
 también podemos encontrar, en alguna de ellas,
 azufre, fósforo, hierro y cobre.
     4. Ácidos nucleícos
       Las   proteínas    se   distinguen   de   los
 carbohidratos y de los lípidos por contener además
 nitrógeno en su composición, aproximadamente un
 16%




                AMINOACIDOS
Unidades estructurales básicas de las proteínas. Un
aminoácido (libre, sin polimerizar) siempre tiene:
- Un grupo amino -NH2
- Un grupo carboxilo -COOH
- Un hidrógeno -H
- Una cadena lateral -R
       Estos cuatro elementos están unidos entre sí a
través de un carbono central, conocido como carbono .



                             




                                                                 2
13/03/2012




      Puesto que estos cuatro elementos son
diferentes (excepto en el caso de la glicina), los
aminoácidos son estereisómeros.
Sólo encontramos L-aminoácidos en las
proteínas.




                    CARACTERÍSTICAS

 Solubles en solventes polares e insolubles en
  solventes apolares

 Altos puntos de fusión ( > 200°C)

 Clasificación según grupo R :
       alifáticos
       aromáticos
       ácidos
       básicos
       neutros




                                                             3
13/03/2012




                Clasificación según grupo R
R : CADENAS ALIFATICAS
Son hidrofóbicos (apolares) y por ello tienen tendencia a situarse en el
interior de las proteínas globulares cuando están en solución acuosa. (Glicina,
Alanina, Valina, Leucina, Isoleucina y Prolina)




R : GRUPOS AROMATICOS
Poseen un anillo aromático en la cadena lateral. Debido a ello, son altamente
hidrofóbicos. (Fenilalanina, Tirosina y Triptófano)




                                                                                          4
13/03/2012




Espectro de Absorbancia de luz UV por aminoácidos aromáticos




  R : GRUPOS QUE CONTIENEN AZUFRE




                                                                       5
13/03/2012




                 Aminoácidos hidrofílicos
  Ácidos (Ácido aspártico, Ácido glutámico)




       Ácido aspártico                  Ácido glutámico

  Están cargados negativamente a pH fisiológico, altamente polares




Básicos (Lisina, Arginina, Histidina)




            Están cargados positivamente a pH fisiológico




                                                                             6
13/03/2012




Neutros (Serina, Treonina, Asparragina, Glutamina)




           Asparragina                            Glutamina
No se encuentran cargados a pH fisiológico, cadenas polares capaces
de establecer puentes de hidrógeno




         Aminoácidos esenciales
 1. Valina                      5. Triptófano

 2. Leucina                     6. Lisina

 3. Isoleucina                  7. Metionina

 4. Treonina                    8. Fenilalanina




                                                                              7
13/03/2012




 Especies isoeléctricas (Zwitteriones)




    2

2




                                                  8
13/03/2012




        9
13/03/2012




    SEPARACION DE AMINOACIDOS

Detección de Aminoácidos
1. Reacción de ninhidrina




2. Cloruro de Dansilo




                                       10
13/03/2012




  3. Fluorescamina




 Aislamiento de aminoácidos
1. Cromatografía en papel
2. Cromatografía en capa fina
3. Cromatografía de intercambio iónico




                                                11
13/03/2012




AMINOACIDOS NO ESTANDAR

• 4-hidroxiprolina

• 5-hidroxilisina

• N-metil-lisina

•  carboxiglutamato

• Desmosina

• Ornitina y citrulina




                                 12
13/03/2012




                     ENLACE PEPTIDICO




La unión entre dos aminoácidos se establece entre el grupo carboxilo
(-COOH) de un aminoácido y el grupo amino (-NH2) del aminoácido
inmediato, con la pérdida de una molécula de agua.




                                                                              13
13/03/2012




       ESTRUCTURA DE LOS PEPTIDOS

  • OLIGOPEPTIDOS
  • POLIPEPTIDOS




• EXTREMO AMINO-TERMINAL
• EXTREMO CARBOXI-TERMINAL




                                           14
13/03/2012




                          AlanilGlutamilGlicil-Lisina
                  Los grupos ionizados se indican en rojo




    DETERMINACION DE SECUENCIAS PEPTIDICAS

•   Hidrólisis química : hidrolizar cadena polipeptídica mediante
    ebullición con ácido fuerte ( HCL 6M; 110°C por 24-72 o 96 horas)


•   Separación e identificación de aminoácidos por cromatografía


•   Secuenciación de Edman




                                                                               15
13/03/2012




         DETERMINACION DE SECUENCIA DE
               PEPTIDOS GRANDES

 Hidrólisis química : hidrolizar cadena polipeptídica mediante
  ebullición con ácido fuerte ( HCL 6M; 110°C por 24-72 o 96 horas)

 Hidrólisis enzimática (proteasas específicas):

   •   Tripsina         : (Lys, Arg)         C
   •   Quimiotripsina   : (Phe, Trp, Tyr)    C
   •   Pepsina          : (Phe, Trp, Tyr)    N
   •   Termolisina      : (Val, Leu, Ile)    N

   bromuro de cianógeno (BrCN) : Met         C


 Secuenciación de Edman




                                                                             16
13/03/2012




Secuenciación y orden de fragmentos peptídicos




 Ruptura de puentes disulfuro en las proteínas




                                                        17
13/03/2012




ELECTROFORESIS




                        18
13/03/2012




Polipéptidos pequeños con actividad biológica
• Insulina (2 cadenas; 30 y 21 a.a.)

• Glucagón (29 a.a.)

• Corticotropina (39 a.a.)

• Oxitocina (9 a.a.)

• Bradiquinina (9 a.a.)

• Neuropéptidos:             - encefalinas (5 a.a.)

• Venenos:                   - amanitina (8 a.a.)

• Antibióticos:              - penicilina
                             - gramicidina S
                             - valinomicina




                                                             19

Clases1 2012

  • 1.
  • 2.
    13/03/2012 MACROMOLECULAS Principales clases de macromoléculas : La palabra proteína proviene del griego protos, que significa "lo primero o lo más importante". 1. proteínas 2. Están formadas por: carbono, oxígeno, carbohidratos hidrógeno y nitrógeno fundamentalmente, aunque 3. lípidos también podemos encontrar, en alguna de ellas, azufre, fósforo, hierro y cobre. 4. Ácidos nucleícos Las proteínas se distinguen de los carbohidratos y de los lípidos por contener además nitrógeno en su composición, aproximadamente un 16% AMINOACIDOS Unidades estructurales básicas de las proteínas. Un aminoácido (libre, sin polimerizar) siempre tiene: - Un grupo amino -NH2 - Un grupo carboxilo -COOH - Un hidrógeno -H - Una cadena lateral -R Estos cuatro elementos están unidos entre sí a través de un carbono central, conocido como carbono .  2
  • 3.
    13/03/2012 Puesto que estos cuatro elementos son diferentes (excepto en el caso de la glicina), los aminoácidos son estereisómeros. Sólo encontramos L-aminoácidos en las proteínas. CARACTERÍSTICAS  Solubles en solventes polares e insolubles en solventes apolares  Altos puntos de fusión ( > 200°C)  Clasificación según grupo R : alifáticos aromáticos ácidos básicos neutros 3
  • 4.
    13/03/2012 Clasificación según grupo R R : CADENAS ALIFATICAS Son hidrofóbicos (apolares) y por ello tienen tendencia a situarse en el interior de las proteínas globulares cuando están en solución acuosa. (Glicina, Alanina, Valina, Leucina, Isoleucina y Prolina) R : GRUPOS AROMATICOS Poseen un anillo aromático en la cadena lateral. Debido a ello, son altamente hidrofóbicos. (Fenilalanina, Tirosina y Triptófano) 4
  • 5.
    13/03/2012 Espectro de Absorbanciade luz UV por aminoácidos aromáticos R : GRUPOS QUE CONTIENEN AZUFRE 5
  • 6.
    13/03/2012 Aminoácidos hidrofílicos Ácidos (Ácido aspártico, Ácido glutámico) Ácido aspártico Ácido glutámico Están cargados negativamente a pH fisiológico, altamente polares Básicos (Lisina, Arginina, Histidina) Están cargados positivamente a pH fisiológico 6
  • 7.
    13/03/2012 Neutros (Serina, Treonina,Asparragina, Glutamina) Asparragina Glutamina No se encuentran cargados a pH fisiológico, cadenas polares capaces de establecer puentes de hidrógeno Aminoácidos esenciales 1. Valina 5. Triptófano 2. Leucina 6. Lisina 3. Isoleucina 7. Metionina 4. Treonina 8. Fenilalanina 7
  • 8.
  • 9.
  • 10.
    13/03/2012 SEPARACION DE AMINOACIDOS Detección de Aminoácidos 1. Reacción de ninhidrina 2. Cloruro de Dansilo 10
  • 11.
    13/03/2012 3.Fluorescamina Aislamiento de aminoácidos 1. Cromatografía en papel 2. Cromatografía en capa fina 3. Cromatografía de intercambio iónico 11
  • 12.
    13/03/2012 AMINOACIDOS NO ESTANDAR •4-hidroxiprolina • 5-hidroxilisina • N-metil-lisina •  carboxiglutamato • Desmosina • Ornitina y citrulina 12
  • 13.
    13/03/2012 ENLACE PEPTIDICO La unión entre dos aminoácidos se establece entre el grupo carboxilo (-COOH) de un aminoácido y el grupo amino (-NH2) del aminoácido inmediato, con la pérdida de una molécula de agua. 13
  • 14.
    13/03/2012 ESTRUCTURA DE LOS PEPTIDOS • OLIGOPEPTIDOS • POLIPEPTIDOS • EXTREMO AMINO-TERMINAL • EXTREMO CARBOXI-TERMINAL 14
  • 15.
    13/03/2012 AlanilGlutamilGlicil-Lisina Los grupos ionizados se indican en rojo DETERMINACION DE SECUENCIAS PEPTIDICAS • Hidrólisis química : hidrolizar cadena polipeptídica mediante ebullición con ácido fuerte ( HCL 6M; 110°C por 24-72 o 96 horas) • Separación e identificación de aminoácidos por cromatografía • Secuenciación de Edman 15
  • 16.
    13/03/2012 DETERMINACION DE SECUENCIA DE PEPTIDOS GRANDES  Hidrólisis química : hidrolizar cadena polipeptídica mediante ebullición con ácido fuerte ( HCL 6M; 110°C por 24-72 o 96 horas)  Hidrólisis enzimática (proteasas específicas): • Tripsina : (Lys, Arg) C • Quimiotripsina : (Phe, Trp, Tyr) C • Pepsina : (Phe, Trp, Tyr) N • Termolisina : (Val, Leu, Ile) N bromuro de cianógeno (BrCN) : Met C  Secuenciación de Edman 16
  • 17.
    13/03/2012 Secuenciación y ordende fragmentos peptídicos Ruptura de puentes disulfuro en las proteínas 17
  • 18.
  • 19.
    13/03/2012 Polipéptidos pequeños conactividad biológica • Insulina (2 cadenas; 30 y 21 a.a.) • Glucagón (29 a.a.) • Corticotropina (39 a.a.) • Oxitocina (9 a.a.) • Bradiquinina (9 a.a.) • Neuropéptidos: - encefalinas (5 a.a.) • Venenos: - amanitina (8 a.a.) • Antibióticos: - penicilina - gramicidina S - valinomicina 19