OntoDDB es un sistema de gestión de datos basado en ontologías que permite modelar datos de forma declarativa y extraerlos. Consiste en Protégé para modelar ontologías, una base de datos OWL-DB para almacenar instancias de datos y un portal web para extraer datos siguiendo el modelo ontológico. Proporciona ventajas como simplificar el desarrollo de aplicaciones y facilitar el mantenimiento al separar el conocimiento de los datos y usar estándares semánticos.