resultados del software

1. UNIVERSIDAD NACIONAL DE LA AMAZONIA PERUANA
FACULTAD DE CIENCIAS BIOLÓGICAS
ESCUELA PROFESIONAL DE BIOLOGÍA
ESTUDIO IN SILICO DEL SOFTWARE “SWISSMODEL” UN
MODELO COMPARATIVO DE HOMOLOGÍA DE SECUENCIAS
PARA EVALUAR CEPAS DE RHIZOBIUM
ESTUDIANTES:
Agurto Chong Jenifer Xiomara
Aching Apagueño Ner
Araujo Manihuari, Laura Clara
DOCENTE
Blga. Martha E. Rengifo Pinedo Dra.
INVESTIGACIÓN FORMATIVA

2. PASO: 01
Ingrese al link del servidor https://swissmodel.expasy.org/interactive

3. PASO: 02
El programa se puede ejecutar con secuencias en formato FASTA

4. Para nuestra primera evaluación de secuencias de proteínas por homología
podemos utilizar secuencias de plantas, animales, bacterias, etc., elegimos
la secuencia proteica de una bacteria Rhizobium
WP_163904834.1 MULTISPECIES: DNA-binding protein HupB
[Rhizobium]MNKNELVSAVAEKAGLTKADAASAVDAVFETVQAELKTGGDVRLAGFGAFTVARR
EASKGRNPSTGAEVDIPARNVPKFTAGKGLKDAVNS

5. PASO 03:
Resultados cuando se consulta una sola cadena

6. PASO 04:
Para construir nuestro modelo podemos seleccionar buscar las
plantillas o construir el modelo

7. PASO 05:
Buscará las proteínas con información cercana

8. PASO 06:
50 estructura similares ordenadas desde la de mayor compatibilidad. Podemos
selecconar una o mas secuencias y seleccionar la opción Build models

9. PASO 07:
Dos modelos de identidad secuencial

10. PASO 07:
A nivel de cristalografía puede evidenciar que proteínas o cuales son las diferencias entre
secuencias homólogas.

11. PASO 08:
Para comparar se seleccionan las proteínas de interés o de acuerdo si quiere
evaluar la compatibilidad.

12. Resultados de la compatibilidad

13. La cadena aminoacídica nos demuestra en rosado la diferencia y
que no están haciendo MATCH

14. Al seleccionar todas las cadenas se pueden observar todas
las moléculas

15. PASO 09:
Previamente ha realizado pruebas en el software

16. PASO 10:
Puede trabajar con múltiples cadenas o mutar las mismas

17. Pasará lo mismo con cadenas cortas o largas asociará a proteínas con
características más similares

18. Desde la más cercana molecularmente a la mas divergente

19. GRAFICA

20. Puede descargar los archivos o las proteínas que superpuso

21. PASO 11:
Lo bueno del programa es que toda información de los cristales esta a
disposición y es fácil manejo