Las secuencias básicas en RM incluyen la secuencia SE, que consiste en dos pulsos de RF de 90° y 180°, y la secuencia GE, que sustituye el pulso de 180° por gradientes. La relajación longitudinal (T1) y transversal (T2) de los tejidos determinan el tiempo de repetición y eco óptimos. Las secuencias IR y FLAIR utilizan un pulso de inversión para eliminar señales de tejidos con determinados tiempos de relajación.