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Aislamiento de
Bacteriofagos de Fuentes
Naturales
Instituto Politécnico Nacional
Escuela Nacional de Ciencias Biológicas
Químico Bacteriólogo Parasitólogo
DESCUBRIMIENTO
Twort, inoculó
muestras de vacuna
de la viruela en
agar nutritivo, y
observó placas de
aspecto vidriosa
(enfermedad
bacteriana).
1915 D’Herelle propuso
que se podían usar
para el control
biológico de
enfermedades.
Tuvieron gran
impacto
antecedido de los
antibióticos.
1917
DEFINICIÓN:
BACTERIOFAGO:
Son agentes infecciosos (virus)
que se replican
intracelularmente de manera
obligada en bacterias.
Fig. 1. Imágenes de bacteriófagos. A. Fagos filamentosos
(Inoviridae); B. Sulfolobus neozealandicus infectada por Guttaviridae
(en forma de gotitas); C. Acidianus filamentous (Lipothrixviridae) con
estructuras de cola; D. Bacteriófago T4 (Myoviridae); E. Bacteriófago
SPP1 (Siphoviridae); F. Bacteriófago P22 (Podoviridae). Las barras
son 50 nm.
COMPOSICIÓN ESTRUCTURA
Ácidos
nucleicos
Cápside (capa
protectora de
proteína)
Bacteriófagos
Material
genético
Estructura
Ciclo de
multiplicación
Composición
Material genético Cadena Ejemplo
RNA Sencilla
Doble
MS2
QB
DNA Sencilla M13
Doble Lambda
Fagos Filamentosos
Tienen la forma de una barra filamentosa. Los fagos filamentosos por
lo general contienen un genoma de una sola hebra de ADN y son
capaces de infectar a las bacterias gram-negativas.
Ejemplos:
• M13
• F1
• Fd
• lke
• N1
Fig. 2 Bacteriófago M13.
Fagos Icosaédricos
LambdaT4
Ejemplos:
• T4
• T7
• Lambda
Fig. 4 Bacteriófago Lambda.Fig. 3 Bacteriófago T4.
Fagos Esféricos
Fig. 5 Bacteriófago Phi 6.
CICLO LÍTICO
CICLO LISOGÉNICO
Ciclo no lítico
Multiplicidad de Infección (MOI)
Se define como el número de fagos adicionados por
células en un determinado volumen de la mezcla de
infección.
Definiciones
Amplitud del
huespéd.
Tipos diferentes
de bacterias que
pueden ser
infectadas por
un mismo fago.
Tamaño del
estallido
Número de
fagos que se
libera por cada
célula
monoinfectada.
Propagación
fágica
Amplificación o
multiplicación
del número de
bacteriófagos
presentes en la
muestra.
Lisado fágico
La suspensión de
la progenie
fágica liberada
después de un
proceso de
propagación.
Curva de crecimiento en un solo paso y lisis artificial.
Bacteriófagos
T4
Bacteriófago
icosaédrico
con cola.
Receptor es
la proteína
OmpC de
membrana
Fago
(virulento)
Ciclo lítico
DNA lineal y
bicatenario
(165000 pb)
Fig. 6 Bacteriófago T4.
Bacteriófagos
λ
Bacteriófago
icosaédrico
con cola.
Receptor de
maltosa
LamB en
membrana.
Fago
temperado
DNA lineal y
bicatenario
(48502 pb) Fig. 7 Bacteriófago Lambda..
M13
Bacteriófago filamentoso
Receptor: es la proteína to1A
del pili bacteriano
Virulento no citocida, sigue el
ciclo no lítico.
DNA monocatenario, circular (
6407 NT)
Bacteriófagos
Fig. 8 Bacteriófago
M13.
Placas líticas
Placas claras (T4) Placas turbias (M13)
Turbias homogéneas
Placas turbias (λ)
Turbias no homogéneas
Propiedades estructurales y
biológicas de Mycoplasmavirus
MVL3: Una inusual interacción
virus-procariote.
Klaus Haberer, Gunther Klotz, Jack Maniloff. Journal of Virology,
Otubre 1979, pp.268-275
Demostrar el tipo y cinética de
infeccion que MVL3 presenta
sobre Acholeplasma laidlawii
1305.K2 como célula hospedera.
Objetivo
oGrupo 1:
Virones desnudos en forma de bala
Tipo: MVL51
Molécula de DNA circular de una cadena sencilla (1.5X106
Da.)
oGrupo 2:
Virones envueltos en partículas esféricas
Tipo: MVL 2
Contiene una doble cadena de DNA en superenrollado
circular covalentemente cerrado (7.8X106 Da.)
oGrupo 3:
Partícula poliédrica desnuda con una cola corta
Tipo: MVL3
Contiene una doble cadena de DNA
Citocida pero no
provoca lisis
celular
Virus no
citocidas
Materiales
y métodos
• Caldo triptosa (cultivar célula huesped K 2).
• Agar triptosa (cultivar célula huesped K2).
• Buffer Tris-EDTA-NaCl (TES) usado para la
lavado celular.
Cepa y virus empleados
• Acholeplasma laidlawii 1305.K2 célula
hospedera. (K2)
• Mycoplasmavirus MVL3
Células y virus
200 mL K2 +
800 mL
caldo
triptosa
2 hrs 37 °C
MVL3
MOI
a 1
24 hrs a 37 °C
Pp
polietilenglicol
1 noche a 3-5°C a 5 °C 15000 x
g por 30’
Resuspendido
en 10% del
volumen
original de TES
Solubilizado
con Triton x-
100
2 hrs a 37 °C
Dializado toda
la noche con
2 L- TES
δ 1.48 g/cm3
con CsCl
a 40000 rpm
Virus en banda
en la mitad del
gradiente
Remover parte
superior
Virus a 4 °C
sin con CsCl
es estable
por un año
Rendimiento en el rango de
1013 a 5 x 1014 unidades
infecciosas/L de cultivo.
Objetivo: Reproducir MVL3.
Determinación del título de células y título viral.
Cultivo celular
Evitar errores,
suspensión de
células puestas en
un baño ultrasónico
Seguido por
microscopia de
contraste de
fase
Colonias visibles 4
días a 37 °C agar
triptosa
Tinción de Dienes
Conteo de UFC.
0.1 mL de muestra
viral + 0.1 mL cultivo
celular + 1 mL de
caldo triptosa
brevemente a 45 °C
1 ml al 0.7% de agar
con TES a 45 °C
Placa de agar
triptosa
Placas contadas
después de 24 hrs a
37 °C Conteo de UFP.
MVL3 agregado a
MOI a 1
Cultivo celular
(K2) Dilución (1:5)
Se toman
muestras cada 5
minutos.
Filtrado en filtro de
0.2 μm
Obtención de UFP
Adsorción del virus
Objetivo: Cuantificar la tasa de adsorción de MVL3 y
comparar con el numero de colisiones virus-célula
Discusión y Conclusiones
Adsorción de MVL3 sigue una
cinética de primer orden, el
numero de UFP no adsorbidas
durante el proceso de
adsorción disminuye
exponencialmente (datos no
mostrados). La velocidad de
adsorción es de 3 X 10 -10
cm3/min
Discusión
Tasa de adsorción experimental fue
de 3x10-10 mientras que la teórica es
de 2x10-9.
La adsorción requiere un alto grado
de especificidad en la interacción
virus-célula.
Cultivo celular
(K2) Dilución
(1:5)
MVL3 agregado
a MOI a 0.1
30 min a 37 °C
Cultivo infectado
se diluye 106 en
caldo triptosa
Se toman
muestras a
diferentes
tiempos durante
5 horas
Calcular UFP
para cada
muestra
Crecimiento en un solo paso
Objetivo: Determinar las diferentes fases de
crecimiento del virus MLV3.
Resultados y conclusiones
Figura 10. Crecimiento en un paso del
MVL3. MOI de alrededor de 0.1. La
gráfica semilogarítmica claramente
muestra el comienzo de la liberación
del virus después de un periodo latente
de 90 minutos.
Conclusiones
Periodo de latencia de MVL3 de
90 minutos.
La liberación del virus continúa
por más de 5 horas.
Cultivo celular
(K2) Dilución
(1:5)
MVL3 agregado
a MOI a 10
Se toma una
muestra cada 30
min. durante las
primeras 4 horas,
posteriormente
cada 2 horas.
Esto durante 42
horas.
Calcular las UFP
para cada
muestra tomada
Nota: Un identico cultivo fue iniciado e
infectado 12 horas despues del primer cultivo
Crecimiento a tiempo largo del virus
Objetivo: Conocer como se lleva la producción del
virus MVL3 en tiempos largos.
Resultados y conclusiones
Figura 11. Crecimiento a largo
plazo del MVL3. MOI de 10,. El
título final del virus es
alrededor de 120 veces el
número de unidades
infecciosas medidas después
de 1 hora de infección.
Conclusiones
Estallido es de 120 unidades
infecciosas.
El virus es liberado de manera
constante después de 10-15
horas.
Cultivo celular
(K2) Dilución
(1:5)
MVL3 agregado
a MOI a 0.1
30 min a 37 °C
Se realiza una
dilución 1:100 en
caldo triptosa
Muestras
por
duplicado
Triton X-100
concentra
ción final
de 0.1%
Calcular
UFP
Calcular
UFP
Lisis Artificial
Objetivo: Determinar la posible existencia de partículas
infecciosas intracelulares del virus durante el periodo
latente.
Resultados y conclusiones
Figura 12. Lisis artificial del
MVL3. MOI de 0.1. Muestras por
duplicado en diferentes
tiempos. Una se sembró (O). La
otra se lisó por medio de la
adición de Tritón X-100 (•).
Conclusiones
Solo se encuentran partículas virales
maduras a los 70 minutos después de la
infección.
MOI=1
30 minutos
200 ml 10-
8
100 muestras
1 ml c/u
Analizadas para
UFP después de 8
horas de
infección.
Analizadas para
UFP después de
24 horas de
infección.
Experimento modificado de estallido simple.
Objetivo: Cuantificar el numero de fagos liberados
por célula
Resultados
Conclusiones
Conclusiones
El tamaño de estallido varia por cada
célula monoinfectada y es independiente
del tiempo.
Cinética de estallido simple.
Filtros de 0.2 μm,
inoculados con 0
ó una célula
infectada.
Jeringa con
caldo triptosa
Jeringa vacía
MOI=1
30
minutos 200 ml 10-
8
1 ml
Objetivo: Determinar el tamaño del estallido durante
un tiempo establecido
Se hace pasar 1
mL de caldo a
través del filtro a
las 3, 8 y 24 horas
después de la
infección
A las muestras
de 1 mL
obtenidas se
les determina
UFP
*Cada vez que
se obtiene una
muestra se
hacen pasar 5
mL de caldo
para eliminar
restos de virus
libres.
Resultados y conclusiones
Tabla 2.- Datos de la
cinética de estallido
simple (de 20 filtros, 7
fueron sin virus).
Conclusiones
Aparición y la tasa de liberación
del virus de células individuales
en función del tiempo de
infección son altamente variables
MVL3 purificado
Adsorbido en
rejilla
Teñido
negativamente
Acido
fosfotungstico
(pH 7)
Similares
micrografías
obtenidas con
acetato de uranilo
Fotografías
tomadas con
aumento de
50,000 x Microscopia
electrónica
Microscopia electrónica
Objetivo: Identificar a MVL3 a partir de características
estructurales (forma y tamaño del material genético)
Resultados y conclusiones
Figura 13 : Viriones MVL3
teñidos negativamente con
ácido Fosfotúngstico al 2%.
Cola Corta
Cabeza poliédrica
Fibras
Conclusiones
Partículas de virus poliédricas
cercanas a 60 nm de diámetro.
Tienen una pequeña cola cercana a
20 nm de longitud y 10 nm de
diámetro adjunto a un collar cercano
a 8 nm de grueso y 16 nm de
amplitud.
Medida del DNA
MVL3 purificado
contiene 1011 UFP/mL
Disociado SDS 1%
Agitado suave Dializado con
TES
Dilución
1:10
Acetato de amonio
0.5M + 0.1mg/ml
Citocromo c
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Acetato de amonio
0.25 M
Acetato de uranilo
5x10-4 M en Etanol
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Medición por
proyección de los
negativos con una
computadora
Wang 2200
Separacion de
fases
Resultados
Figura 14. Histograma de las
mediciones de DNA del MVL3.
Conclusiones
Peso molecular de las moléculas
de DNA es de (26+0.6) x 106 Da.
Moléculas de DNA de MVL3 son
lineales.
MOI=10
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Análisis
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UFC.
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infectadas con MVL3
Objetivo: Determinar si después de la infección con el
fago la célula sigue teniendo viabilidad
Resultados y conclusión
Figura 15. Viabilidad de las células
infectadas con MVL3. Al tiempo cero
un cultivo se dividió. Una parte fue
desinfectada (o) y la otra se infectó a
una MOI=10(•).
Conclusiones
La célula infectada no puede
formar colonias.
• MVL3 se asemeja al grupo de bacteriófagos de cola corta, además éste es el
único virus de micoplasma que contiene DNA lineal.
• La constante tasa de adsorción encontrada experimentalmente fue de 3x10-10
cm3/min, mientras que la teorica fue de 2.9x10-9, que se trata de un orden de
magnitud mayor que los resultados experimentales.
Estructuralmente:
Ciclo de multiplicación:
• Las células infectadas con MVL3 aunque ya no son viables continúan
liberando progenie viral por varias horas.
• La tasa de liberación fluctuó durante el tiempo que la célula estuvo
produciendo el virus, por lo tanto la interacción virus-célula infectada de
MVL3 se asemeja a virus citocidas no líticos de animales.
Conclusiones generales
Objetivos
Conocer
algunos
aspectos de la
metodología
empleada en el
trabajo con
bacteriófagos.
Establecer
algunas de las
propiedades de
las partículas
fágicas que
permiten su
identificación.
Aislar
bacteriófagos a
partir de
muestras de
aguas negras.
Determinar el
título y ciclo de
multiplicación
de los fagos
presentes en la
muestra de
agua, con base
en su morfología
de placa.
PROTOCOLO
Materiales
Medio Composición
2YT Triptona (16g), Extracto
de levadura (10 g), NaCl
(10g)
Luria (L) Triptona (10 g), Extracto
de levadura (5g), NaCl
(10g)
Agar Lambda (λ) Triptona (10 g), NaCl (10
g) B1- 0.1%
Agar blando Agar (7g)
Agar lambda
blando
Triptona (10 g), NaCl(10
g)
Agar (7.5 g) B1- 0.1%
Cepa Genotipo y/o fenotipo
Escherichia coli W3110 F- λ-, rph-1, sup-
Escherichia coli B 837 Silvestre
Escherichia coli TG1 glnV44, thi-1, Δ(lac-proAB),
Δ(mcrB-hsdsSM)5,(rk
-mk
-
)/F,traD36, lac Iq,lacZΔM15,
proAB+
Bacillus subtilis SB19 Silvestre
Salmonella typhimuriumLT2 Silvestre
Staphylococcus aureus Silvestre
Klebsiella pneumoniae Silvestre
Bacteriófag
o
Hospedero Estructura Acido
nucleico
Tamaño del
genoma
(kb)
Receptor
T4 Escherichia
coli
Icosaédrica
con cola
DNA lineal
doble
cadena
172 Lipopolisaca
ridos
λ Escherichia
coli
Icosaédrica
con cola
DNA lineal
doble
cadena
49.5 LamB
M13 Escherichia
coli
Filamentoso DNA circular
de cadena
sencilla
6.4 Pilina
Características generales de Bacteriofagos.
A. Aislamiento de bacteriófagos a partir
de muestras de aguas negras
a) Preparación de las cepas indicadoras
Escherichia coli W3110,TG1, B837, Bacillus
subtilis SB19, Klebsiella pneumoniae,
Salmonella typhimurium LT2,
Staphylococcus aureus
5 mL caldo L
Incubar
37°C,
durante 18 h,
sin agitación
1er día.
A. Aislamiento de bacteriófagos a partir
de muestras de aguas negras
b) Tratamiento de las muestras
Papel filtro y
gasas de filtrado
claro Volumen =
10 mL
Hasta obtener
filtrado claro
5 ml de filtrado
anterior
Esterilización por
filtración. *Poro 0.22 o
45 µm*
5 mL
Refrigerar hasta su uso
2do día
A. Aislamiento de bacteriófagos a partir de muestras de aguas negras
c)Prueba de gota del filtrado de aguas negras
0.1mL de
cada una
de las
cepas
indicadoras
3mL agar blando
fundido 45 °C
Agregar 3 gotas
del filtrado de la muestra
Incubar a 37° C
durante 18 h
3er día.
Registrar
resultados
2do día
Mezclar y vaciar el
contenido del tubo
En caja con agar L
Una caja para cada cepa
A. Aislamiento de bacteriófagos a partir de muestras de
aguas negras
d) Determinación de la concentración de bacteriófagos en las muestras de agua
Diluciones
de
filtrado
(+)
Sol. salina
estéril
Para
cada
tubo
0.1 mL
de la
dilución
3mL agar blando
fundido 45 °C
0.1 ml de la
cepa
indicadora
Mezclar y vaciar
Medio rico sólido
Incubar a 37° C
durante 18-24 h
3er día.
Describir
morfología
de placas
líticas
obtenidas
Contar el
numero de
placas líticas
obtenidas
Calcular el
titulo del fago
o fagos
presentes en
la muestra
4to día.
• B. Diferenciación de fagos temperados, virulentos líticos y
virulentos no citocidas por morfología de placa
1er día
Diluciones de lisado de
bacteriófago T4, M13 y
lambda
Bacteriófago Dilución
Cepa
indicador
a
Medio
Agar
blando
λ 10-4, 10-5 AB1157 o
W3110
Lambda
Agar
blando
Lambda
T4 10-4, 10-5 AB1157 o
W3110
Luria
Agar
blando
M13 10-4, 10-5 TG1 o
JC4046
2YT
Agar
blando
Incubar a
37° C
durante 18
h
1er día.
Ejemplo Bacteriófago λ
50 μL 50 μL 500 μL
100
10-2
10-4 10-5
0.1 mL bacteria
indicadora
+
0.1mL diluciones del
fago
Agar blando
fundido 45°C
Vaciar cajas medio
rico solido según se
indica
2do día.
B. Diferenciación de fagos temperados, virulentos
líticos y virulentos no citocidas por morfología de
placa
• Determinación de la amplitud de huésped de los bacteriófagos T4, M13 y λ
• Seleccionar 3 placas
de cada fago con
misma morfología y
aisladas.
Con punta de
micropipeta
tomar las tres de
cada fago
Colocar por
separado en
tubos de
hemólisis
0.5 mL Caldo
rico
Macerar
Agar
blando
fundido
45°C
0.1 mL de cultivo
de 18 h de
incubación a
37°C de las
cepas.
Escherichia coli W3110, TG1,
B837, Bacillus subtilis SB19,
Klebsiella pneumoniae,
Salmonella typhimurium LT2,
Staphylococcus aureus
Agitar y
vaciar cada
tubo en cajas
con medio
rico
3er día.
Dejar solidificar
Gota del macerado y 0.5 ml de
caldo rico
Incubar 37°C por 18 y 24 hrs.
4to día.
Referencias
 Klug, Cummings, Spencer, Palladino, “Conceptos de Genética”, Ed Pearson, 10° edición, 2013,
págs. 168-180
 Benito César, Espino Fco. Javier, “Génetica”, Ed. Médica Panamericana, 2013 págs. 109-112
 Watson, Baker, Bell, Gann, Levine, Losick, “Biología Molecular del Gen”, Ed. Médica
Panamericana, 7ma edición, 2016, págs. 798-803
 Shors, “Virus, estudio molecular con orientación clínica”, Ed. Médica Panamericana, 2009, págs.
49-63
 Jauregui Rincón Juan, Chávez Vela Norma Ángela, “Glosario de Biotecnología”, 1ra edición,
2006, pág 33
 Neil A. Campbell, Jane B. Reece. “Biología”, 7° Edición. Ed. Médica panamericana, pág. 339
 Vidania M. R., “Estudio del rendimiento en fagos para los procesos de lisis bacteriana”, Junta de
energía nuclear, Madrid, España, 1979.
 Fernández Espinel, C., Flores Dominick, V., & Medina Morillo, M., “Aislamiento y caracterización
del bacteriófago Va1 específico a Vibrio alginolyticus.” Revista peruana de biología, 2017, 24(1),
93-100.

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Aislamiento de bacteriofagos de fuentes naturales

  • 1. Aislamiento de Bacteriofagos de Fuentes Naturales Instituto Politécnico Nacional Escuela Nacional de Ciencias Biológicas Químico Bacteriólogo Parasitólogo
  • 2. DESCUBRIMIENTO Twort, inoculó muestras de vacuna de la viruela en agar nutritivo, y observó placas de aspecto vidriosa (enfermedad bacteriana). 1915 D’Herelle propuso que se podían usar para el control biológico de enfermedades. Tuvieron gran impacto antecedido de los antibióticos. 1917
  • 3. DEFINICIÓN: BACTERIOFAGO: Son agentes infecciosos (virus) que se replican intracelularmente de manera obligada en bacterias. Fig. 1. Imágenes de bacteriófagos. A. Fagos filamentosos (Inoviridae); B. Sulfolobus neozealandicus infectada por Guttaviridae (en forma de gotitas); C. Acidianus filamentous (Lipothrixviridae) con estructuras de cola; D. Bacteriófago T4 (Myoviridae); E. Bacteriófago SPP1 (Siphoviridae); F. Bacteriófago P22 (Podoviridae). Las barras son 50 nm.
  • 6. Composición Material genético Cadena Ejemplo RNA Sencilla Doble MS2 QB DNA Sencilla M13 Doble Lambda
  • 7. Fagos Filamentosos Tienen la forma de una barra filamentosa. Los fagos filamentosos por lo general contienen un genoma de una sola hebra de ADN y son capaces de infectar a las bacterias gram-negativas. Ejemplos: • M13 • F1 • Fd • lke • N1 Fig. 2 Bacteriófago M13.
  • 8. Fagos Icosaédricos LambdaT4 Ejemplos: • T4 • T7 • Lambda Fig. 4 Bacteriófago Lambda.Fig. 3 Bacteriófago T4.
  • 9. Fagos Esféricos Fig. 5 Bacteriófago Phi 6.
  • 13. Multiplicidad de Infección (MOI) Se define como el número de fagos adicionados por células en un determinado volumen de la mezcla de infección.
  • 14. Definiciones Amplitud del huespéd. Tipos diferentes de bacterias que pueden ser infectadas por un mismo fago. Tamaño del estallido Número de fagos que se libera por cada célula monoinfectada. Propagación fágica Amplificación o multiplicación del número de bacteriófagos presentes en la muestra. Lisado fágico La suspensión de la progenie fágica liberada después de un proceso de propagación.
  • 15. Curva de crecimiento en un solo paso y lisis artificial.
  • 16. Bacteriófagos T4 Bacteriófago icosaédrico con cola. Receptor es la proteína OmpC de membrana Fago (virulento) Ciclo lítico DNA lineal y bicatenario (165000 pb) Fig. 6 Bacteriófago T4.
  • 17. Bacteriófagos λ Bacteriófago icosaédrico con cola. Receptor de maltosa LamB en membrana. Fago temperado DNA lineal y bicatenario (48502 pb) Fig. 7 Bacteriófago Lambda..
  • 18. M13 Bacteriófago filamentoso Receptor: es la proteína to1A del pili bacteriano Virulento no citocida, sigue el ciclo no lítico. DNA monocatenario, circular ( 6407 NT) Bacteriófagos Fig. 8 Bacteriófago M13.
  • 19. Placas líticas Placas claras (T4) Placas turbias (M13) Turbias homogéneas Placas turbias (λ) Turbias no homogéneas
  • 20. Propiedades estructurales y biológicas de Mycoplasmavirus MVL3: Una inusual interacción virus-procariote. Klaus Haberer, Gunther Klotz, Jack Maniloff. Journal of Virology, Otubre 1979, pp.268-275 Demostrar el tipo y cinética de infeccion que MVL3 presenta sobre Acholeplasma laidlawii 1305.K2 como célula hospedera. Objetivo
  • 21. oGrupo 1: Virones desnudos en forma de bala Tipo: MVL51 Molécula de DNA circular de una cadena sencilla (1.5X106 Da.) oGrupo 2: Virones envueltos en partículas esféricas Tipo: MVL 2 Contiene una doble cadena de DNA en superenrollado circular covalentemente cerrado (7.8X106 Da.) oGrupo 3: Partícula poliédrica desnuda con una cola corta Tipo: MVL3 Contiene una doble cadena de DNA Citocida pero no provoca lisis celular Virus no citocidas
  • 22. Materiales y métodos • Caldo triptosa (cultivar célula huesped K 2). • Agar triptosa (cultivar célula huesped K2). • Buffer Tris-EDTA-NaCl (TES) usado para la lavado celular. Cepa y virus empleados • Acholeplasma laidlawii 1305.K2 célula hospedera. (K2) • Mycoplasmavirus MVL3
  • 23. Células y virus 200 mL K2 + 800 mL caldo triptosa 2 hrs 37 °C MVL3 MOI a 1 24 hrs a 37 °C Pp polietilenglicol 1 noche a 3-5°C a 5 °C 15000 x g por 30’ Resuspendido en 10% del volumen original de TES Solubilizado con Triton x- 100 2 hrs a 37 °C Dializado toda la noche con 2 L- TES δ 1.48 g/cm3 con CsCl a 40000 rpm Virus en banda en la mitad del gradiente Remover parte superior Virus a 4 °C sin con CsCl es estable por un año Rendimiento en el rango de 1013 a 5 x 1014 unidades infecciosas/L de cultivo. Objetivo: Reproducir MVL3.
  • 24. Determinación del título de células y título viral. Cultivo celular Evitar errores, suspensión de células puestas en un baño ultrasónico Seguido por microscopia de contraste de fase Colonias visibles 4 días a 37 °C agar triptosa Tinción de Dienes Conteo de UFC. 0.1 mL de muestra viral + 0.1 mL cultivo celular + 1 mL de caldo triptosa brevemente a 45 °C 1 ml al 0.7% de agar con TES a 45 °C Placa de agar triptosa Placas contadas después de 24 hrs a 37 °C Conteo de UFP.
  • 25. MVL3 agregado a MOI a 1 Cultivo celular (K2) Dilución (1:5) Se toman muestras cada 5 minutos. Filtrado en filtro de 0.2 μm Obtención de UFP Adsorción del virus Objetivo: Cuantificar la tasa de adsorción de MVL3 y comparar con el numero de colisiones virus-célula
  • 26. Discusión y Conclusiones Adsorción de MVL3 sigue una cinética de primer orden, el numero de UFP no adsorbidas durante el proceso de adsorción disminuye exponencialmente (datos no mostrados). La velocidad de adsorción es de 3 X 10 -10 cm3/min Discusión Tasa de adsorción experimental fue de 3x10-10 mientras que la teórica es de 2x10-9. La adsorción requiere un alto grado de especificidad en la interacción virus-célula.
  • 27. Cultivo celular (K2) Dilución (1:5) MVL3 agregado a MOI a 0.1 30 min a 37 °C Cultivo infectado se diluye 106 en caldo triptosa Se toman muestras a diferentes tiempos durante 5 horas Calcular UFP para cada muestra Crecimiento en un solo paso Objetivo: Determinar las diferentes fases de crecimiento del virus MLV3.
  • 28. Resultados y conclusiones Figura 10. Crecimiento en un paso del MVL3. MOI de alrededor de 0.1. La gráfica semilogarítmica claramente muestra el comienzo de la liberación del virus después de un periodo latente de 90 minutos. Conclusiones Periodo de latencia de MVL3 de 90 minutos. La liberación del virus continúa por más de 5 horas.
  • 29. Cultivo celular (K2) Dilución (1:5) MVL3 agregado a MOI a 10 Se toma una muestra cada 30 min. durante las primeras 4 horas, posteriormente cada 2 horas. Esto durante 42 horas. Calcular las UFP para cada muestra tomada Nota: Un identico cultivo fue iniciado e infectado 12 horas despues del primer cultivo Crecimiento a tiempo largo del virus Objetivo: Conocer como se lleva la producción del virus MVL3 en tiempos largos.
  • 30. Resultados y conclusiones Figura 11. Crecimiento a largo plazo del MVL3. MOI de 10,. El título final del virus es alrededor de 120 veces el número de unidades infecciosas medidas después de 1 hora de infección. Conclusiones Estallido es de 120 unidades infecciosas. El virus es liberado de manera constante después de 10-15 horas.
  • 31. Cultivo celular (K2) Dilución (1:5) MVL3 agregado a MOI a 0.1 30 min a 37 °C Se realiza una dilución 1:100 en caldo triptosa Muestras por duplicado Triton X-100 concentra ción final de 0.1% Calcular UFP Calcular UFP Lisis Artificial Objetivo: Determinar la posible existencia de partículas infecciosas intracelulares del virus durante el periodo latente.
  • 32. Resultados y conclusiones Figura 12. Lisis artificial del MVL3. MOI de 0.1. Muestras por duplicado en diferentes tiempos. Una se sembró (O). La otra se lisó por medio de la adición de Tritón X-100 (•). Conclusiones Solo se encuentran partículas virales maduras a los 70 minutos después de la infección.
  • 33. MOI=1 30 minutos 200 ml 10- 8 100 muestras 1 ml c/u Analizadas para UFP después de 8 horas de infección. Analizadas para UFP después de 24 horas de infección. Experimento modificado de estallido simple. Objetivo: Cuantificar el numero de fagos liberados por célula
  • 35. Conclusiones Conclusiones El tamaño de estallido varia por cada célula monoinfectada y es independiente del tiempo.
  • 36. Cinética de estallido simple. Filtros de 0.2 μm, inoculados con 0 ó una célula infectada. Jeringa con caldo triptosa Jeringa vacía MOI=1 30 minutos 200 ml 10- 8 1 ml Objetivo: Determinar el tamaño del estallido durante un tiempo establecido
  • 37. Se hace pasar 1 mL de caldo a través del filtro a las 3, 8 y 24 horas después de la infección A las muestras de 1 mL obtenidas se les determina UFP *Cada vez que se obtiene una muestra se hacen pasar 5 mL de caldo para eliminar restos de virus libres.
  • 38. Resultados y conclusiones Tabla 2.- Datos de la cinética de estallido simple (de 20 filtros, 7 fueron sin virus). Conclusiones Aparición y la tasa de liberación del virus de células individuales en función del tiempo de infección son altamente variables
  • 39. MVL3 purificado Adsorbido en rejilla Teñido negativamente Acido fosfotungstico (pH 7) Similares micrografías obtenidas con acetato de uranilo Fotografías tomadas con aumento de 50,000 x Microscopia electrónica Microscopia electrónica Objetivo: Identificar a MVL3 a partir de características estructurales (forma y tamaño del material genético)
  • 40. Resultados y conclusiones Figura 13 : Viriones MVL3 teñidos negativamente con ácido Fosfotúngstico al 2%. Cola Corta Cabeza poliédrica Fibras Conclusiones Partículas de virus poliédricas cercanas a 60 nm de diámetro. Tienen una pequeña cola cercana a 20 nm de longitud y 10 nm de diámetro adjunto a un collar cercano a 8 nm de grueso y 16 nm de amplitud.
  • 41. Medida del DNA MVL3 purificado contiene 1011 UFP/mL Disociado SDS 1% Agitado suave Dializado con TES Dilución 1:10 Acetato de amonio 0.5M + 0.1mg/ml Citocromo c 50 μL Acetato de amonio 0.25 M Acetato de uranilo 5x10-4 M en Etanol 50% Medición por proyección de los negativos con una computadora Wang 2200 Separacion de fases
  • 42. Resultados Figura 14. Histograma de las mediciones de DNA del MVL3. Conclusiones Peso molecular de las moléculas de DNA es de (26+0.6) x 106 Da. Moléculas de DNA de MVL3 son lineales.
  • 43. MOI=10 Células no infectad as Análisis de UFC. 37° C Análisis de UFC. Viabilidad de las células infectadas con MVL3 Objetivo: Determinar si después de la infección con el fago la célula sigue teniendo viabilidad
  • 44. Resultados y conclusión Figura 15. Viabilidad de las células infectadas con MVL3. Al tiempo cero un cultivo se dividió. Una parte fue desinfectada (o) y la otra se infectó a una MOI=10(•). Conclusiones La célula infectada no puede formar colonias.
  • 45. • MVL3 se asemeja al grupo de bacteriófagos de cola corta, además éste es el único virus de micoplasma que contiene DNA lineal. • La constante tasa de adsorción encontrada experimentalmente fue de 3x10-10 cm3/min, mientras que la teorica fue de 2.9x10-9, que se trata de un orden de magnitud mayor que los resultados experimentales. Estructuralmente: Ciclo de multiplicación: • Las células infectadas con MVL3 aunque ya no son viables continúan liberando progenie viral por varias horas. • La tasa de liberación fluctuó durante el tiempo que la célula estuvo produciendo el virus, por lo tanto la interacción virus-célula infectada de MVL3 se asemeja a virus citocidas no líticos de animales. Conclusiones generales
  • 46. Objetivos Conocer algunos aspectos de la metodología empleada en el trabajo con bacteriófagos. Establecer algunas de las propiedades de las partículas fágicas que permiten su identificación. Aislar bacteriófagos a partir de muestras de aguas negras. Determinar el título y ciclo de multiplicación de los fagos presentes en la muestra de agua, con base en su morfología de placa. PROTOCOLO
  • 47. Materiales Medio Composición 2YT Triptona (16g), Extracto de levadura (10 g), NaCl (10g) Luria (L) Triptona (10 g), Extracto de levadura (5g), NaCl (10g) Agar Lambda (λ) Triptona (10 g), NaCl (10 g) B1- 0.1% Agar blando Agar (7g) Agar lambda blando Triptona (10 g), NaCl(10 g) Agar (7.5 g) B1- 0.1%
  • 48. Cepa Genotipo y/o fenotipo Escherichia coli W3110 F- λ-, rph-1, sup- Escherichia coli B 837 Silvestre Escherichia coli TG1 glnV44, thi-1, Δ(lac-proAB), Δ(mcrB-hsdsSM)5,(rk -mk - )/F,traD36, lac Iq,lacZΔM15, proAB+ Bacillus subtilis SB19 Silvestre Salmonella typhimuriumLT2 Silvestre Staphylococcus aureus Silvestre Klebsiella pneumoniae Silvestre
  • 49. Bacteriófag o Hospedero Estructura Acido nucleico Tamaño del genoma (kb) Receptor T4 Escherichia coli Icosaédrica con cola DNA lineal doble cadena 172 Lipopolisaca ridos λ Escherichia coli Icosaédrica con cola DNA lineal doble cadena 49.5 LamB M13 Escherichia coli Filamentoso DNA circular de cadena sencilla 6.4 Pilina Características generales de Bacteriofagos.
  • 50. A. Aislamiento de bacteriófagos a partir de muestras de aguas negras a) Preparación de las cepas indicadoras Escherichia coli W3110,TG1, B837, Bacillus subtilis SB19, Klebsiella pneumoniae, Salmonella typhimurium LT2, Staphylococcus aureus 5 mL caldo L Incubar 37°C, durante 18 h, sin agitación 1er día.
  • 51. A. Aislamiento de bacteriófagos a partir de muestras de aguas negras b) Tratamiento de las muestras Papel filtro y gasas de filtrado claro Volumen = 10 mL Hasta obtener filtrado claro 5 ml de filtrado anterior Esterilización por filtración. *Poro 0.22 o 45 µm* 5 mL Refrigerar hasta su uso 2do día
  • 52. A. Aislamiento de bacteriófagos a partir de muestras de aguas negras c)Prueba de gota del filtrado de aguas negras 0.1mL de cada una de las cepas indicadoras 3mL agar blando fundido 45 °C Agregar 3 gotas del filtrado de la muestra Incubar a 37° C durante 18 h 3er día. Registrar resultados 2do día Mezclar y vaciar el contenido del tubo En caja con agar L Una caja para cada cepa
  • 53. A. Aislamiento de bacteriófagos a partir de muestras de aguas negras d) Determinación de la concentración de bacteriófagos en las muestras de agua Diluciones de filtrado (+) Sol. salina estéril Para cada tubo 0.1 mL de la dilución 3mL agar blando fundido 45 °C 0.1 ml de la cepa indicadora Mezclar y vaciar Medio rico sólido Incubar a 37° C durante 18-24 h 3er día.
  • 54. Describir morfología de placas líticas obtenidas Contar el numero de placas líticas obtenidas Calcular el titulo del fago o fagos presentes en la muestra 4to día.
  • 55. • B. Diferenciación de fagos temperados, virulentos líticos y virulentos no citocidas por morfología de placa 1er día Diluciones de lisado de bacteriófago T4, M13 y lambda Bacteriófago Dilución Cepa indicador a Medio Agar blando λ 10-4, 10-5 AB1157 o W3110 Lambda Agar blando Lambda T4 10-4, 10-5 AB1157 o W3110 Luria Agar blando M13 10-4, 10-5 TG1 o JC4046 2YT Agar blando Incubar a 37° C durante 18 h 1er día. Ejemplo Bacteriófago λ 50 μL 50 μL 500 μL 100 10-2 10-4 10-5 0.1 mL bacteria indicadora + 0.1mL diluciones del fago Agar blando fundido 45°C Vaciar cajas medio rico solido según se indica
  • 56. 2do día. B. Diferenciación de fagos temperados, virulentos líticos y virulentos no citocidas por morfología de placa
  • 57. • Determinación de la amplitud de huésped de los bacteriófagos T4, M13 y λ • Seleccionar 3 placas de cada fago con misma morfología y aisladas. Con punta de micropipeta tomar las tres de cada fago Colocar por separado en tubos de hemólisis 0.5 mL Caldo rico Macerar Agar blando fundido 45°C 0.1 mL de cultivo de 18 h de incubación a 37°C de las cepas. Escherichia coli W3110, TG1, B837, Bacillus subtilis SB19, Klebsiella pneumoniae, Salmonella typhimurium LT2, Staphylococcus aureus Agitar y vaciar cada tubo en cajas con medio rico 3er día. Dejar solidificar Gota del macerado y 0.5 ml de caldo rico Incubar 37°C por 18 y 24 hrs.
  • 59. Referencias  Klug, Cummings, Spencer, Palladino, “Conceptos de Genética”, Ed Pearson, 10° edición, 2013, págs. 168-180  Benito César, Espino Fco. Javier, “Génetica”, Ed. Médica Panamericana, 2013 págs. 109-112  Watson, Baker, Bell, Gann, Levine, Losick, “Biología Molecular del Gen”, Ed. Médica Panamericana, 7ma edición, 2016, págs. 798-803  Shors, “Virus, estudio molecular con orientación clínica”, Ed. Médica Panamericana, 2009, págs. 49-63  Jauregui Rincón Juan, Chávez Vela Norma Ángela, “Glosario de Biotecnología”, 1ra edición, 2006, pág 33  Neil A. Campbell, Jane B. Reece. “Biología”, 7° Edición. Ed. Médica panamericana, pág. 339  Vidania M. R., “Estudio del rendimiento en fagos para los procesos de lisis bacteriana”, Junta de energía nuclear, Madrid, España, 1979.  Fernández Espinel, C., Flores Dominick, V., & Medina Morillo, M., “Aislamiento y caracterización del bacteriófago Va1 específico a Vibrio alginolyticus.” Revista peruana de biología, 2017, 24(1), 93-100.