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R.T y P.C hortalizas en dos prov. de Costa Rica

  • 1. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERÍA AMBIENTAL TEMA: RAOULTELLA TERRIGENA Y PECTOBACTERIUM CAROTOVORUM EN HORTALIZAS EN DOS PROVINCIAS DE COSTA RICA CURSO: BIOTECNOLOGÍA DOCENTE: BLGO. HERNAN HEBERT SOTO GONZALES INTEGRANTES: GRUPO 06 • JUAN CARLOS BUSTINZA COAILA • KAREN JULISSA COAPAZA CHAMBILLA • MARTHA GABRIELA CUENTAS RIOS • DIEGO HERNAN FLORES FLORES • MAYRA VILCA OCHOA CICLO: VII ILO – PERÚ 2021
  • 2. R.T y P.C hortalizas en dos prov. de Costa Rica Materiales y metodos Recoleccion de muestras Alajuela Cartago - Chile dulce - Hojas y bulbo de cebolla. - Plantas de zucchini - frutos de tomate - plantas de tomate y papa. Chile dulce donde de usando - Análisis moleculares. - Analisis enzimáticos - Técnicas de patogenicidad. Aislamiento bacteriano - Lavado de las muestras con agua esteril. - Toma de 3 secciones dañadas, desinfectadas en hipoclorito de sodio. - Enjuagdas 3 veces en agua esteril. - Se inoculo en 3 tubos con agua esteril y 3 con caldo nut. y med. liq. pectina. - Los tubos con agua se agitaron a 50 rpm por 5 min. Se incubaron por 24h a 28°C. - Los tubos con caldo nutritivo y med. liq. pectina se mantuvo en condiciones de anaerobiosis y aceite mineral, por 24h a 28°C. - Se cultiva el resultado. - Las colonias observadas se clasifican segun morfologia y pruebas de tinción de Gram. - Analisis de oxidasa, coloración MacConkey, crec. anaerobico y pectinolisis en papa. se realiza metodos donde - Laboratorio Microbiología Ambiental del Centro de Investigación en Biología Celular y Molecular (CIBCM). - Invernadero de Microbiología de Suelos del Centro de Investigaciones Agronómicas de la Universidad de Costa Rica. instalaciones Prueba de reacción de hipersensibilidad - Las cepas se cultivaron en medio de agar nutritivo (OXOID) y se incubaron a 30 °C por 24 h. Una vez transcurrido el tiempo, se prepararon suspensiones bacterianas en agua estéril a una concentración de 9X108 UFC ml-1 (unidades formadoras de colonias), comparada con un patrón de turbidez McFarland número tres (McFarland, 1907). - Cada cepa se inoculó en cinco hojas, donde se realizaron cuatro puntos de inoculación en cada una, tres de las cepas bacterianas evaluadas y una de agua estéril como control negativo. Se aplicó aproximadamente 50 ?l por punto por medio de presión en el envés de las hojas, con una jeringa sin aguja, el proceso de inoculación se llevó a cabo en el invernadero donde se encontraban las plantas. Actividad pectinolítica en medio cristal violeta y pectato - Las bacterias seleccionadas se cultivaron en agar nutritivo (OXOID) y se incubaron a 30 °C durante 24 h. - El medio de CVP se preparó según lo descrito por Schaad et al. (2001), donde se utilizó como fuente de pectina el ácido polianhidrogalacturónico (Sigma-Aldrich Ref. P3850). Se evaluó la presencia o ausencia de cavidades en los puntos donde fueron inoculados los aislamientos, lo cual se determinó como la capacidad de las bacterias de metabolizar la pectina presente en el medio. luego donde por último donde Postulados de Koch para aislamientos seleccionados - Se dio para aquellos aislamientos causados RH. - Esto consiste en la inoculación de bacterias en hospederos sanos. - El objetivo era verificar si existe relación en diferentes aislamientos con pudrición. Frutos de chile dulce Cebolla Plantas de papa - Se cultivaron en medio de agar nutritivo (OXOID) - Se incubaron a 30 °C por 24h. - Se tomaron colonias aisladas para preparar suspensiones bacterianas a una concentración de 9X108 UFC ml-1 - Se uso frutos secos para desinfectar con hipoclorito de sodio al 2% en 3 minutos en cámara de flujo laminar. - Se remueve el exceso de agua. - Se realizo 4 Hoyos en el pericarpio de 5.5mm y se inocula 30ul. - El resultado final indica colocar en cámaras húmedas, encubadas a 30°C sometido a evaluaciones diarias - Se coloca en bolsas plásticas para aumentar la humedad relativa. - Siembra en bandejas de 72 celdas con suelo estéril. - A los 15 días de emergidas, las plantas (brotes de 10 cm altura) se trasladaron al invernadero del CIA. - Se trasplantaron a potes de 2 L y se realizó una inoculación de 5 ml de suspensión bacteriana. - Los potes se rellenaron con suelo y se colocaron dentro de una caja plástica. - Para esta prueba se utilizaron tres que contenían tres plantas cada uno. Dos se inocularon con la bacteria y uno con agua estéril como control negativo. - Las evaluaciones se realizaron diariamente durante 22 días. - Se utilizaron bulbos maduros de cebolla - Se plantaron en potes con 200 ml con suelo. - Se inocularon con una suspensión bacteriana a una concentración de 10X8 UFC ml-1 - Se utilizaron 2 métodos de inoculación: agregar 5 ml de suspensión bacteriana en la siembra del bulbo y el segundo en inocular el mismo volumen entre la base de las hojas y el bulbo. - Luego fueron trasladas al invernadero y las evaluaciones se realizaron diariamente durante 15 días. donde para Extracción de ADN y análisis fligenéticos Comparacion de cepa inoculada con la reaislada en los postulados de koch Análisis filogenético del gen 16S ARNr para las cepas causantes de pudrición blanda - Se comparan las cepas inoculadas con las recuperadas mediante amplificación. - Se realizo un análisis UPGMA. - Extracción de ADN. - Se amplifica mediante la reacción en cadena polimerasa (PCR). - Se edito con el software Bioedit. - Se utilizó la herramienta BLAST, para la comparación con los de la base de datos. - Se alineo con el Programa MEGA. - El árbol se obtuvo por la aplicación de 1000 réplicas y se visualizó. - Los intervalos de confianza se calcularon en porcentaje. se realiza donde donde se realizan