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ENZIMAS
Son biomoléculas cuya función es
aumentar la velocidad de las reacciones
bioquímicas, actúan por lo tanto como
catalizadores biológicos.
M. Sc. Liliana Sumarriva
¿Cuál es su naturaleza química?
La gran mayoría de las enzimas son
proteínas.
Sin embargo existen algunos ARN que
pueden actuar como enzimas (ribozimas)
¿Cuál es la estructura de una
proteína?
Las proteínas son macromoléculas,
polímeros de aminoácidos
Analizando estas palabras…
Makrós: grande
Polymerés: compuesto de varias partes
Son cadenas simples, no ramificadas, de
aminoácidos unidos unos a otros.
¿Cuál es la estructura de un
aminoácido?
Todos los aminoácidos están formados
por un grupo amino y un grupo carboxilo.
Amino Carboxilo
¿Cómo actúan las enzimas?
Las enzimas son catalizadores y como
tales aumentan la velocidad de la reacción
química, sin modificar su resultado.
No modifican la energía de los reactivos ni
de los productos pero sí disminuyen la
energía de activación, una especie de
barrera energética que deben pasar los
reactivos para convertirse en productos.
¿ Una misma enzima cataliza las
distintas reacciones?
No, las enzimas son específicas, cada una
cataliza una determinada reacción.
La alta especificidad
se debe a que su
estructura terciaria
le permite formar
cavidades llamadas
sitios activos, lugar
donde se ubica el
sustrato durante el
proceso de catálisis.
La enzima se une
específicamente a las
moléculas denominadas
sustratos, formando un
complejo enzima-sustrato y
favoreciendo su transformación
en productos
sustrato
Complejo
enzima-sustrato
productos
Una Reacción
Enzimática:
¿La velocidad de una reacción
catalizada por una enzima es
siempre la misma?
No, depende de muchos factores entre los
que se cuentan:
Concentración del sustrato
Temperatura
pH
Concentración de sustrato
A mayor concentración de sustrato es
mayor la velocidad.
Pero no aumenta indefinidamente, cuando
no hay más enzima para unirse al sustrato
se alcanza la velocidad máxima
pH
Cada enzima tiene un pH óptimo en el
cual la actividad enzimática es máxima
Temperatura
Cada enzima tiene una temperatura
óptima en la cual su actividad es máxima
De modo que …
si variamos el pH o la temperatura, la
velocidad de la reacción catalizada por
una enzima también varía.
Los valores de pH y temperatura óptima
son aquellos a los cuales se alcanza la
máxima actividad enzimática o la mayor
velocidad de reacción
Estado Nativo Estado Desnaturalizado
Desnaturalización de una Proteína
Se llama desnaturalización de las proteínas a la pérdida de las
estructuras de orden superior (secundaria, terciaria y
cuaternaria), quedando la cadena polipeptídica reducida a un
polímero estadístico sin ninguna estructura tridimensional fija
Desnaturalización de
la ribonucleasa. En
general, la
desnaturalización fuerte
produce una destrucción
permanente de la
molécula
Agentes desnaturalizantes: Se
distinguen agentes físicos (calor) y
químicos (detergentes, disolventes
orgánicos, pH, fuerza iónica).
Cofactor (Coenzima): Átomo, ion o molécula que participa en el
proceso catalítico sin ser enzima ni substrato.
Los cofactores participan de dos maneras distintas:
1. A través de una fijación muy fuerte a la proteína y salen
sin ser modificados del ciclo catalítico
2. Como un segundo substrato; salen modificados del ciclo
catalítico y por lo general requieren otra enzima para volver
al estado original.
Cofactores Enzimáticos
R CH
NH3
+
COO-
+ O2 + H2O R CO COO-
+ H2O2 + NH4
+
Aminoácido Cetoácido
LAO
LAO: L-aminoácido oxidasa: es una flavoproteína
Las flavoproteínas tienen un grupo prostético flavínico,
que interviene en el proceso catalítico sin salir modificado
del mismo
NH
N
NH
N O
H3C
H3C
O
Los cofactores enzimáticos suelen ser moléculas complejas,
que nuestro organismo no puede sintetizar, por lo general.
Por esa razón muchos cofactores enzimáticos deben ser, en
todo en parte, ingresados con la dieta; muchos de ellos son, por
lo tanto, vitaminas.
Ni todos los cofactores son vitamínicos ni todas las vitaminas
son cofactores enzimáticos
Cofactores de naturaleza vitamínica; ejemplos
1. Hidrosolubles
Tiamina Tiamina pirofosfato B1
Riboflavina Flavinas: FAD, FMN B2
Piridoxal Piridoxal fosfato B6
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Ác.Lipoico Lipoamida
Ác.Fólico Coenzimas folínicos
Ác.Pantoténico Panteteínas (CoA, p.e.)
2. Liposolubles
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Cofactores de naturaleza no vitamínica: ejemplos
Hemo Hemoenzimas, citocromos
Complejos Fe-S Ferredoxinas
Quinonas Tr.electrónico mitocondrial y fotosintético
Glutatión Redox; transporte de aminoácidos
ATP Transf.de fosfato y/o de energía
UTP Transf.de grupos glicosídicos
PAPS Transf.de grupos sulfato
S-AM Transf.de grupos metilo
Carnitina Transportador de grupos acil-
Vitaminas que no forman parte de cofactores enzimáticos
Liposolubles
Retinoides vit. A
Calciferoles vit. D
Tocoferoles vit. E
Modelo de Llave y Cerradura (Emil Fischer)
Substrato y enzima se acoplan de
forma estereospecífica,
de la misma manera que una
llave se ajusta a su cerradura.
Modelo aceptado durante mucho
tiempo; hoy se considera
insuficiente al no explicar
algunos fenómenos de la inhibi-
ción enzimática.
Teorías de la Acción
Enzimática
Modelo de Ajuste Inducido (Koshland)
Tanto la enzima como el
substrato sufren una
alteración en su estructura
por el hecho físico de la
unión.
Está mucho más de
acuerdo con todos los
datos experimentales
conocidos hasta el
momento.
La teoría del Ajuste Inducido se amplía en la actualidad
definiendo la acción enzimática como
Estabilización del Estado de Transición
Según lo cual, el Centro Activo enzimático es en realidad
complementario no al substrato o al producto, sino al
estado de transición entre ambos.
R C
O
O R' Substrato: un éster
R C O R'
O-
O-
Estado de transición:
intermediario tetraédrico,
inestable
R C
O
O-
HO R' Productos
Clasificación y
Nomenclatura de
Enzimas
ATP: hexosa fosfotransferasa
Nombre sistemático:
Donador Aceptor
Grupo transferido
EC 2.7.1.1
Número sistemático
Enzyme
Comission
Grupo
Subgrupo
Sub-subgrupo
Enzima
Nombre común: Hexokinasa
1. Oxidorreductasas
2. Transferasas
•grupos aldehidos
•gupos acilos
•grupos glucosilos
•grupos fosfatos (kinasas)
3. Hidrolasas
•Transforman polímeros en monómeros.
Actuan sobre:
•enlace éster
•enlace glucosídico
•enlace peptídico
•enlace C-N
Clasificación de enzimas: Grupos
4. Liasas
•(Adición a los dobles enlaces)
•Entre C y C
•Entre C y O
•Entre C y N
5. Isomerasas
•(Reacciones de isomerización)
6. Ligasas
•(Formación de enlaces, con
aporte de ATP)
Entre C y O
•Entre C y S
•Entre C y N
•Entre C y C
Inhibidor:
Efector que hace disminuir la actividad enzimática, a través de
interacciones con el centro activo u otros centros específicos
(alostéricos).
Esta definición excluye todos aquellos agentes que inactivan a
la enzima a través de desnaturalización de la molécula enzimática
Inhibición Enzimática
De esta forma, habrá dos tipos de inhibidores:
I. Isostéricos: ejercen su acción sobre el centro activo
II. Alostéricos: ejercen su acción sobre otra parte de la molécula,
causando un cambio conformacional con repercusión negativa en la
actividad enzimática.
Activador alostérico:
favorece la unión del
sustrato
Inhibidor alostérico:
impide la unión del
sustrato
Los inhibidores isostéricos pueden ser de dos tipos:
1. Inhibidor reversible: establece un equilibrio con la enzima libre,
con el complejo enzima-substrato o con ambos:
E + I EI
2. Inhibidor irreversible: modifica químicamente a la enzima:
E + I E’
ES + I ESI
Inhibición reversible
(a) El inhibidor se fija al centro activo
de la enzima libre, impidiendo la
fijación del substrato: Inhibición
Competitiva
(c) El inhibidor se fija únicamente al complejo enzima-substrato
una vez formado, impidiendo la acción catalítica; este tipo se
conoce como Inhibición Anticompetitiva
(b) El inhibidor se fija a la enzima
independientemente de que lo
haga o no el substrato; el inhibidor,
por tanto, no impide la fijación del
substrato a la enzima, pero sí impide
la acción catalítica: Inhibición No
Competitiva
E ES
EI
I
S
E + P
Inhibición
Competitiva
Las fijaciones de substrato e inhibidor son
mutuamente exclusivas; el complejo EI no es productivo
E ES
EI
I
S
E + P
I
ESI
S
Inhibición
No Competitiva
El inhibidor se fija
indistintamente a la enzima
libre E y al complejo
enzima-substrato ES; ni el
complejo EI ni el complejo
ESI son productivos
E ES
S
E + P
I
ESI
Inhibición
Anticompetitiva
El inhibidor sólo puede
fijarse al complejo ES;
el complejo ESI no es
productivo
E ES
EI
I
S
E + P
Características:
- Las fijaciones de substrato e inhibidor son mutuamente exclusivas
- A muy altas concentraciones de substrato desaparece la inhibición
- Por lo general, el inhibidor competitivo es un análogo químico del
substrato.
- El inhibidor es tan específico como el substrato
Se define una constante de
equilibrio de disociación del
inhibidor:
Ki =
[E] [I]
[EI]
Inhibición Competitiva
H2N S
O
O
NH2
H2N C
O
O-
4-aminobenceno
sulfonamida
4-aminobenzoato
N
N
N
N
H2N
N
C NH
O
C H
COO-
CH2
CH2
CO OH
CH3
n
Ác. Fólico
Methotrexate
N
N
N
N
OH
H2N
N
C NH
O
C H
COO-
CH2
CH2
CO OH
H
n
NH
HN
O
O
CH3
NH
HN
O
O
Br
Timina
5-Bromouracilo
Análogos de base
O
HOCH2
OH
N
O
NH2
OH
O
HOCH2
OH
N
O
NH2
OH
Citidina
Citosina
arabinósido
Análogos de
nucleósido
Inhibición Irreversible
- Los inhibidores irreversibles reaccionan con un grupo
químico de la enzima, modificándola covalentemente
- Su acción no se describe por una constante de equilibrio Ki,
sino por una constante de velocidad ki:
E + I E’
- A diferencia de la inhibición reversible, el efecto de los
inhibidores irreversibles depende del tiempo de actuación
del inhibidor.
- Los inhibidores irreversibles son, por lo general, altamente
tóxicos.
Algunos tipos de inhibidores irreversibles
1. Reactivos de grupos -SH
2. Organofosfóricos
3. Ligandos de metales
4. Metales pesados
Regulación de la Actividad
Enzimática
Regulación alostérica
Procesos a nivel celular; regulación de ajuste fino
de la actividad enzimática, a través de efectos de
retroalimentación (negativa o positiva)
Regulación por modificación covalente
Procesos a nivel supracelular (orgánico); regulación
a gran escala de actividades enzimáticas, a través de
modificación covalente de enzimas, provocadas por
señales (transducción de señales)
Retroalimentación negativa en vías metabólicas, 1
Thr a-cetobutirato Ile
Treonina
desaminasa
Síntesis de Isoleucina
El producto final de la ruta, Isoleucina, inhibe a la primera
enzima de la misma, Treonina desaminasa
Regulación alostérica
Suele haber fenómenos de modificación covalente de
enzimas en la respuesta celular a señales químicas:
1. Neurotransmisores
2. Hormonas
3. Factores de crecimiento
4. Estímulos morfogenéticos y de diferenciación
5. Muerte celular programada (apoptosis)
6. Estímulos antigénicos
7. Luz y otros agentes físico-químicos
Regulación por modificación covalente
EFECTO DE LA MODIFICACIÓN COVALENTE
SOBRE LAACTIVIDAD ENZIMÁTICA
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La Enzima no
fosforilada es inactiva
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es activa
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  • 1. ENZIMAS Son biomoléculas cuya función es aumentar la velocidad de las reacciones bioquímicas, actúan por lo tanto como catalizadores biológicos. M. Sc. Liliana Sumarriva
  • 2. ¿Cuál es su naturaleza química? La gran mayoría de las enzimas son proteínas. Sin embargo existen algunos ARN que pueden actuar como enzimas (ribozimas)
  • 3. ¿Cuál es la estructura de una proteína? Las proteínas son macromoléculas, polímeros de aminoácidos Analizando estas palabras… Makrós: grande Polymerés: compuesto de varias partes Son cadenas simples, no ramificadas, de aminoácidos unidos unos a otros.
  • 4. ¿Cuál es la estructura de un aminoácido? Todos los aminoácidos están formados por un grupo amino y un grupo carboxilo. Amino Carboxilo
  • 5.
  • 6. ¿Cómo actúan las enzimas? Las enzimas son catalizadores y como tales aumentan la velocidad de la reacción química, sin modificar su resultado. No modifican la energía de los reactivos ni de los productos pero sí disminuyen la energía de activación, una especie de barrera energética que deben pasar los reactivos para convertirse en productos.
  • 7.
  • 8.
  • 9. ¿ Una misma enzima cataliza las distintas reacciones? No, las enzimas son específicas, cada una cataliza una determinada reacción.
  • 10. La alta especificidad se debe a que su estructura terciaria le permite formar cavidades llamadas sitios activos, lugar donde se ubica el sustrato durante el proceso de catálisis.
  • 11. La enzima se une específicamente a las moléculas denominadas sustratos, formando un complejo enzima-sustrato y favoreciendo su transformación en productos
  • 12.
  • 15. ¿La velocidad de una reacción catalizada por una enzima es siempre la misma? No, depende de muchos factores entre los que se cuentan: Concentración del sustrato Temperatura pH
  • 16. Concentración de sustrato A mayor concentración de sustrato es mayor la velocidad. Pero no aumenta indefinidamente, cuando no hay más enzima para unirse al sustrato se alcanza la velocidad máxima
  • 17.
  • 18. pH Cada enzima tiene un pH óptimo en el cual la actividad enzimática es máxima
  • 19. Temperatura Cada enzima tiene una temperatura óptima en la cual su actividad es máxima
  • 20. De modo que … si variamos el pH o la temperatura, la velocidad de la reacción catalizada por una enzima también varía. Los valores de pH y temperatura óptima son aquellos a los cuales se alcanza la máxima actividad enzimática o la mayor velocidad de reacción
  • 21. Estado Nativo Estado Desnaturalizado Desnaturalización de una Proteína Se llama desnaturalización de las proteínas a la pérdida de las estructuras de orden superior (secundaria, terciaria y cuaternaria), quedando la cadena polipeptídica reducida a un polímero estadístico sin ninguna estructura tridimensional fija
  • 22. Desnaturalización de la ribonucleasa. En general, la desnaturalización fuerte produce una destrucción permanente de la molécula Agentes desnaturalizantes: Se distinguen agentes físicos (calor) y químicos (detergentes, disolventes orgánicos, pH, fuerza iónica).
  • 23. Cofactor (Coenzima): Átomo, ion o molécula que participa en el proceso catalítico sin ser enzima ni substrato. Los cofactores participan de dos maneras distintas: 1. A través de una fijación muy fuerte a la proteína y salen sin ser modificados del ciclo catalítico 2. Como un segundo substrato; salen modificados del ciclo catalítico y por lo general requieren otra enzima para volver al estado original. Cofactores Enzimáticos
  • 24. R CH NH3 + COO- + O2 + H2O R CO COO- + H2O2 + NH4 + Aminoácido Cetoácido LAO LAO: L-aminoácido oxidasa: es una flavoproteína Las flavoproteínas tienen un grupo prostético flavínico, que interviene en el proceso catalítico sin salir modificado del mismo NH N NH N O H3C H3C O
  • 25. Los cofactores enzimáticos suelen ser moléculas complejas, que nuestro organismo no puede sintetizar, por lo general. Por esa razón muchos cofactores enzimáticos deben ser, en todo en parte, ingresados con la dieta; muchos de ellos son, por lo tanto, vitaminas. Ni todos los cofactores son vitamínicos ni todas las vitaminas son cofactores enzimáticos
  • 26. Cofactores de naturaleza vitamínica; ejemplos 1. Hidrosolubles Tiamina Tiamina pirofosfato B1 Riboflavina Flavinas: FAD, FMN B2 Piridoxal Piridoxal fosfato B6 Cobalamina Coenzimas cobamídicos B12 Ác.Ascórbico Ac. Ascórbico C Nicotinamida NAD+, NADP+ PP Ác.Lipoico Lipoamida Ác.Fólico Coenzimas folínicos Ác.Pantoténico Panteteínas (CoA, p.e.) 2. Liposolubles Naftoquinonas g-Carboxilación K
  • 27. Cofactores de naturaleza no vitamínica: ejemplos Hemo Hemoenzimas, citocromos Complejos Fe-S Ferredoxinas Quinonas Tr.electrónico mitocondrial y fotosintético Glutatión Redox; transporte de aminoácidos ATP Transf.de fosfato y/o de energía UTP Transf.de grupos glicosídicos PAPS Transf.de grupos sulfato S-AM Transf.de grupos metilo Carnitina Transportador de grupos acil-
  • 28. Vitaminas que no forman parte de cofactores enzimáticos Liposolubles Retinoides vit. A Calciferoles vit. D Tocoferoles vit. E
  • 29. Modelo de Llave y Cerradura (Emil Fischer) Substrato y enzima se acoplan de forma estereospecífica, de la misma manera que una llave se ajusta a su cerradura. Modelo aceptado durante mucho tiempo; hoy se considera insuficiente al no explicar algunos fenómenos de la inhibi- ción enzimática. Teorías de la Acción Enzimática
  • 30. Modelo de Ajuste Inducido (Koshland) Tanto la enzima como el substrato sufren una alteración en su estructura por el hecho físico de la unión. Está mucho más de acuerdo con todos los datos experimentales conocidos hasta el momento.
  • 31. La teoría del Ajuste Inducido se amplía en la actualidad definiendo la acción enzimática como Estabilización del Estado de Transición Según lo cual, el Centro Activo enzimático es en realidad complementario no al substrato o al producto, sino al estado de transición entre ambos.
  • 32. R C O O R' Substrato: un éster R C O R' O- O- Estado de transición: intermediario tetraédrico, inestable R C O O- HO R' Productos
  • 34. ATP: hexosa fosfotransferasa Nombre sistemático: Donador Aceptor Grupo transferido EC 2.7.1.1 Número sistemático Enzyme Comission Grupo Subgrupo Sub-subgrupo Enzima Nombre común: Hexokinasa
  • 35. 1. Oxidorreductasas 2. Transferasas •grupos aldehidos •gupos acilos •grupos glucosilos •grupos fosfatos (kinasas) 3. Hidrolasas •Transforman polímeros en monómeros. Actuan sobre: •enlace éster •enlace glucosídico •enlace peptídico •enlace C-N Clasificación de enzimas: Grupos
  • 36. 4. Liasas •(Adición a los dobles enlaces) •Entre C y C •Entre C y O •Entre C y N 5. Isomerasas •(Reacciones de isomerización) 6. Ligasas •(Formación de enlaces, con aporte de ATP) Entre C y O •Entre C y S •Entre C y N •Entre C y C
  • 37. Inhibidor: Efector que hace disminuir la actividad enzimática, a través de interacciones con el centro activo u otros centros específicos (alostéricos). Esta definición excluye todos aquellos agentes que inactivan a la enzima a través de desnaturalización de la molécula enzimática Inhibición Enzimática
  • 38. De esta forma, habrá dos tipos de inhibidores: I. Isostéricos: ejercen su acción sobre el centro activo II. Alostéricos: ejercen su acción sobre otra parte de la molécula, causando un cambio conformacional con repercusión negativa en la actividad enzimática. Activador alostérico: favorece la unión del sustrato Inhibidor alostérico: impide la unión del sustrato
  • 39. Los inhibidores isostéricos pueden ser de dos tipos: 1. Inhibidor reversible: establece un equilibrio con la enzima libre, con el complejo enzima-substrato o con ambos: E + I EI 2. Inhibidor irreversible: modifica químicamente a la enzima: E + I E’ ES + I ESI
  • 40. Inhibición reversible (a) El inhibidor se fija al centro activo de la enzima libre, impidiendo la fijación del substrato: Inhibición Competitiva (c) El inhibidor se fija únicamente al complejo enzima-substrato una vez formado, impidiendo la acción catalítica; este tipo se conoce como Inhibición Anticompetitiva (b) El inhibidor se fija a la enzima independientemente de que lo haga o no el substrato; el inhibidor, por tanto, no impide la fijación del substrato a la enzima, pero sí impide la acción catalítica: Inhibición No Competitiva
  • 41. E ES EI I S E + P Inhibición Competitiva Las fijaciones de substrato e inhibidor son mutuamente exclusivas; el complejo EI no es productivo
  • 42. E ES EI I S E + P I ESI S Inhibición No Competitiva El inhibidor se fija indistintamente a la enzima libre E y al complejo enzima-substrato ES; ni el complejo EI ni el complejo ESI son productivos
  • 43. E ES S E + P I ESI Inhibición Anticompetitiva El inhibidor sólo puede fijarse al complejo ES; el complejo ESI no es productivo
  • 44. E ES EI I S E + P Características: - Las fijaciones de substrato e inhibidor son mutuamente exclusivas - A muy altas concentraciones de substrato desaparece la inhibición - Por lo general, el inhibidor competitivo es un análogo químico del substrato. - El inhibidor es tan específico como el substrato Se define una constante de equilibrio de disociación del inhibidor: Ki = [E] [I] [EI] Inhibición Competitiva
  • 46. N N N N H2N N C NH O C H COO- CH2 CH2 CO OH CH3 n Ác. Fólico Methotrexate N N N N OH H2N N C NH O C H COO- CH2 CH2 CO OH H n
  • 49. Inhibición Irreversible - Los inhibidores irreversibles reaccionan con un grupo químico de la enzima, modificándola covalentemente - Su acción no se describe por una constante de equilibrio Ki, sino por una constante de velocidad ki: E + I E’ - A diferencia de la inhibición reversible, el efecto de los inhibidores irreversibles depende del tiempo de actuación del inhibidor. - Los inhibidores irreversibles son, por lo general, altamente tóxicos.
  • 50. Algunos tipos de inhibidores irreversibles 1. Reactivos de grupos -SH 2. Organofosfóricos 3. Ligandos de metales 4. Metales pesados
  • 51. Regulación de la Actividad Enzimática
  • 52. Regulación alostérica Procesos a nivel celular; regulación de ajuste fino de la actividad enzimática, a través de efectos de retroalimentación (negativa o positiva) Regulación por modificación covalente Procesos a nivel supracelular (orgánico); regulación a gran escala de actividades enzimáticas, a través de modificación covalente de enzimas, provocadas por señales (transducción de señales)
  • 53. Retroalimentación negativa en vías metabólicas, 1 Thr a-cetobutirato Ile Treonina desaminasa Síntesis de Isoleucina El producto final de la ruta, Isoleucina, inhibe a la primera enzima de la misma, Treonina desaminasa Regulación alostérica
  • 54. Suele haber fenómenos de modificación covalente de enzimas en la respuesta celular a señales químicas: 1. Neurotransmisores 2. Hormonas 3. Factores de crecimiento 4. Estímulos morfogenéticos y de diferenciación 5. Muerte celular programada (apoptosis) 6. Estímulos antigénicos 7. Luz y otros agentes físico-químicos Regulación por modificación covalente
  • 55. EFECTO DE LA MODIFICACIÓN COVALENTE SOBRE LAACTIVIDAD ENZIMÁTICA Elementos de la reacción La Enzima no fosforilada es inactiva La enzima fosforilada es activa