genoma bovino

1. GENOMA BOVINO
Brigith Briceño Romero cod. 121002505
Bayron Camilo Lopez Jimenez cod. 121002714

2. GENOMA BOVINO
 Permite la selección de características
importantes para la producción y
mejoramiento genético.

10.  2003 = secuenciar, ensamblar, y anotar el genoma completo.
 Consorcio internacional (Baylor college)= secuenciar y ensamblar un
prototipo del genoma bovino y base de datos con nformacion de SNPs.
 G.B 22.000 genes, además de una serie de segmentos duplicados y elementos
repetitivos.
 Hay una relación inter especie con respecto a los genes de lactancia y
respuesta inmunológica.

13. MARCADOR GENETICO

14. ¿ COMO OBTENER UN MARCADOR GENETICO?

15. DETECTORES DE GENES EN BOVINOS
 Tiroglobulina
 Calpastatina
 Miostatina
Características del
marmóreo, terneza y la
doble musculatura.

16. USOS COMERCIALES DE LOS MARCADORES
GENETICOS.

21. CROMOSOMA 14
 BTA14 Ha sido explorado en distintos locus en ganado de leche como de
carne.
 Se encontraron 126 QLT para el genoma ganado carne, en la región 15 a la 45
del cromosoma.
 Rasgos de importancia económica:

22. IMPORTANCIA ECONOMICA
 Ganancia diaria promedio pre-destete
(PrWADG).
 Ganancia diaria promedio post-destete
(ProWADG).
 Peso al nacimiento (BW).
 Peso de la canal (CW).
 Espesor de grasa dorsal (BFT).
 Marmoleo (ABW).
 Calidad de canal (EQT).
 Tasa de crecimiento (GR).
 Area de Rib eye (REA).

24. RASGOS DE IMPORTANCIA ECONOMICA
CON MAYORES BENEFICIOS POTENCIALES
 Poseen baja heredabilidad (caracteres reproductivos).
 Son difíciles o costosos de medir (resistencia a enfermedades).
 Pueden ser medidos en la descendencia (reproducción y longevidad
reproductiva).
 Únicamente se miden en estado post-mortem (terneza).
 Comúnmente no se seleccionan porque no existen mediciones rutinarias
(eficiencia de conversión).
 Están correlacionados genéticamente con otra variable que no se desea
modificar (grasa intramuscular vs espesor de grasa dorsal).

25. METODOLOGIA DE ANALISIS DE LOS
GENOMAS.
 Mapeo físico
 Mapeo genético
 Mapeo comparativo
Asignación física especifica de los genes
dentro de un cromosoma, establecen la
sistenia entre marcadores y la obtención
de información de genes y de os
marcadores.

26. TIPOS DE MAPAS
 MAPAS FISICOS: Localización de los genes dentro de los cromosomas.
TECNICAS: Hibridos somáticos, H por radiación (HR) e Hibridacion in-situ
fluorescente (FISH).
 MAPAS GENETICOS O DE LIGAMIENTO: Se obtiene mediante el pedigrí .
 MAPAS DE DESEQUILIBRIO DE LIGAMIENTO: Asociación de alelos de 2 o mas
locus, dando así asociación en el genoma completo o en bloques.
Es de gran importancia en biología evolutiva y genética (H, sist. Apareamiento, y
patrón de subdivisiones geográficas), (posibles efectos de selección natural,
conversión genética, mutación, cambios en la frecuencia genética).
Bovinos ° de diversidad entre razas y regiones genómicas.

27. SECUENCIACION DE GENOMAS
 SECUENCIACIÓN JERÁRQUICA: El genoma completo es digerido con EZ de
restricción y los fragmentos insertados en vectores de clonación (BACs-
YACs)=GENOTECAS que representen el total del genoma a secuenciar .
Secuenciar segmentos Ensamblaje: filtro, ensamblaje y unión =contigs.
 SECUENCIACION POR SHOTGUN: Los multiples clones son secuenciados una o
varias veces y esta no es obtenida de manera consecutiva a lo largo de la
longitud del cromosoma.
Se usa algoritmos de computador para ensamblar los contigs.
 ANOTACION DE GENES: Consiste en la identificación de los genes en el
genoma estudiado y posteriormente determinar su posible función.

28. DESCRIPCION MOLECULAR DEL GENOMA
BOVINO
 29 pares de autosomas y un par de
cromosomas sexuales.
 Diferencia entre el Bos Tauros y el Bos
indicus, se encuentra en el
cromosoma Y : en Bos indicus es
acrocéntrico y en Bos Tauros es
submetacéntrico.
 Consta de 2870 millones de pares de
bases , 4000 genes cuentan con
anotación de los 22000 que lo
constituye.
 496 micro RNAs, la mitad constituidos
en 60 grupos genéticos separados 10kb
conteniendo de 2 a 7 genes cada uno.

29. ELEMENTOS CORTOS Y DISPERSOS
 Son secuencias cortas de no mas de 400 pb repetidas hasta un millo de copias
dentro de los genomas.
 Un 39% de la tripeta AGC esta asociada con el elemento SINE de Bov-A2
 Esta asociado SINE microsatelite ha sido utilizada para desarrollar iniciadores
específicos y amplificar regiones.

30. ELEMENTOS LARGOS DISPERSOS (LINE)
BOV A
Es una región de 115 pb la cual
se puede estar duplicada y se
denomina Bov-A2.
Pseudogen para un RNA de
transferencia de Glicina Bov-tA
Bov B
El elemento completo
corresponde a una secuencia
de 3,1 kb asociada con Bov-b