1. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
ESCUELA PROFESIONAL
DE INGENIERIA AMBIENTAL
CURSO: BIOTECNOLOGÍA
INTEGRANTE:
MORALES QUISPE, LETICIA INES
DOCENTE:
Dr. SOTO GONZALES, HEBERT HERNAN
SECUENCIACION DE
ADN AUTOMATICO
(METODO DE SANGER)
2. INDICE
Pàg.
CAPITULO 1. INTRODUCCION.........................................................................................3
1.1. OBJETIVOS....................................................................................................................3
1.1.1. Objetivos general......................................................................................................3
1.1.2. Objetivos especifico .................................................................................................3
CAPITULO 2. FUNDAMENTO TEORICO ........................................................................4
2.1. ¿QUÉ ES SECUENCIACIÓN DEL ADN?....................................................................4
2.2. SECUENCIADOR DE NUEVA GENERACIÓN..........................................................4
2.2.1. Aplicaciones: ............................................................................................................4
2.3. METODO DE SECUENCIACIÓN DE SANGER.........................................................4
CAPITULO 3. MARETIAL Y PROCEDIMIENTO ...........................................................6
3.1. MATERIALES................................................................................................................6
3.2. PROCEDIMIENTO ........................................................................................................6
CAPITULO 4. RESULTADOS ............................................................................................10
CAPITULO 5. CONCLUSIONES .......................................................................................11
CAPITULO 6. BIBLIOGRAFIA .........................................................................................12
3. CAPITULO 1. INTRODUCCION
El ADN es una de las moléculas más importantes para la vida. Consiste de una doble hélice
donde cada una de las cadenas es un polímero integrado por miles o incluso millones de nucleótidos
(Stansfield 1992).
Cada nucleótido, está formado por un azúcar (desoxirribosa), una base nitrogenada que puede
ser adenina (A), timina (T), citosina (C) o guanina (G) y un grupo fosfato (Stansfield 1992). El orden
que tienen los nucleótidos en el ADN es lo que se denomina secuencia (Figura 1) y las técnicas y
métodos que se utilizan para conocer esa secuencia son llamados de secuenciación (de Necochea y
Canul 2004).
Conocer el orden de los nucleótidos es una herramienta con infinidad de aplicaciones porque
la diferencia fundamental entre todas las moléculas de ADN que forman el material genético de los
seres vivos es la secuencia de estas cuatro bases nitrogenadas (de Necochea y Canul 2004).
1.1. OBJETIVOS
1.1.1. Objetivos general
La elaboración de la maqueta sobre secuenciador automático de ADN
utilizando el método de sanger a base de materiales reciclables.
1.1.2. Objetivos especifico
Explicitar sobre la secuenciación automática de ADN y el método de
sanger
Dar a conocer el procedimiento de la elaboración de la maqueta
4. CAPITULO 2. FUNDAMENTO TEORICO
2.1. ¿QUÉ ES SECUENCIACIÓN DEL ADN?
Es un conjunto de técnicas bioquímicas cuya finalidad es la determinación de
nucleótidos de adenina, citosina guanina y timina. En un Oligonucleótido de ADN, También
constituye la información genética heredable de los seres vivos.Existen varios métodos de
secuenciación de ADN. Las cuales cumplen diversas funciones, desde conocer cómo ocurren
los procesos biológicos fundamentales, Investigar las mutaciones somáticas, hasta Identificar
y cartografiar hasta aproximadamente 20 a 25 mil genes que compone el genoma humano.
2.2. SECUENCIADOR DE NUEVA GENERACIÓN
Sistema integrado para generación automática de clusters de ADN por amplificación en
puente, secuenciación y análisis primario y secundario de secuencias. Posee un servidor para
almacenamiento de datos, sistema con pantalla táctil y computadora integrada (para análisis de
datos en el equipo).
Capacidad de generación de datos hasta 15 Gb. Análisis de secuencias (on-instrument)
en menos de 2 hs, excepto para la aplicación de Metagenómica del 16S. Lectura paired end con
calidad esperada de Q30 para más del 70% de las bases llamadas en la secuenciación de
fragmentos de 600pb, 75% para fragmentos de 250pb, 85% para fragmentos de 75 bp, 80 %
para fragmentos de 150 bp, 90% para fragmentos menores (25, 36 y 100 pb).
2.2.1. Aplicaciones:
Secuenciación de genomas pequeños
Secuenciación de novo. Re-secuenciación
Plásmidos. Re-secuenciación dirigida: Secuenciación de amplicones
(centenas de blancos).
Captura de regiones de interés Metagenómica del 16S Chequeo de clones.
Secuenciación de ARN: RNA-Seq Secuanciación de smRNA.
Secuenciación de paneles prediseñados
Control de calidad de bibliotecas genómicas: Control de calidad para
secuenciación en HiSeq Regulación: ChIP-Seq.
Otras: Genotipificación por secuenciación (reducción de complejidad de
genomas de mayor tamaño)
2.3. METODO DE SECUENCIACIÓN DE SANGER
Proceso biológico de la replicación del ADN junto con el empleo de diodeoxi de
nucleótidos. Esta técnica emplea didesoxinucleótidos (ddATP, ddGTP, ddCTP, ddTTP)
que carecen del grupo hidroxilode carbono 3, que al unirse una cadena de DNA en
crecimiento impiden que esta se continúe elogando. En la reacción normal se usan los
desoxinucleótidos dATP-dGTP- dCTP- dTTP.
6. CAPITULO 3. MARETIAL Y PROCEDIMIENTO
3.1. MATERIALES
Cartones
Plumones
Temperas
Laptop
Cartulina
Caja de metal
Velitas de vidrio
Tijeras
Silicona
Lapicero negro
Cinta negra
Cinta
Cinta de agua
Tecnopor
3.2. PROCEDIMIENTO
Se realizó el molde del secuenciador automático (sistema Miseq-15 Gb) de 40 cm
de altura y 60 de ancho.
Seguidamente se pegó los lados con silicona dándole forma al equipo
7. Se le pega encima del molde con cartulina negra
Se le coloca la pantalla del equipo y también la parte de abajo se le pone un
tecnopor pintado de plomo.
Sus partes del equipo se isieron de una caja de reloj la cual se le pinto de color
negro y después de secar se le paso con blanco, pero de forma de líneas.
8. Utilicé lata de reloj de color negra puse dentro de ella tecnopor y di un espacio
para colocar el velero de recordatorios la cual se sacó todo lo que contenía dentro
para tomarlo para las muestras.
Lugo diseñe el método de sanger mediante dibujos y paso a paso, así mismos se
pintó con temperas cada dibujo.
Se pega todos los dibujos en una cartulina para poder explicarlo y se enumera
cada paso con hojas celestes.
9. Diseñe un cuadrado de 15 * 15 que será nuestra Pc que recibirá los resultados del
secuenciador.
Se le pinto sus lados de color negro y seguidamente se dibujó secuencias de ADN
repasando con plumones.
11. CAPITULO 5. CONCLUSIONES
Como conclusión es importante mencionar que el análisis de la estructura del ADN y
de su papel en la expresión genética se ha visto facilitado por el desarrollo de poderosas
técnicas para la secuenciación de moléculas de ADN.
La clave para la secuenciación del ADN es la generación de fragmentos de ADN
cuya longitud depende de la última base de la secuencia.
Se puede generar conjuntos de fragmentos de este tipo mediante la interrupción
controlada de replicación lo cual se lo conoce como método de sanger, debido qué es un
método desarrollado por el bioquímico Frederick sanger y sus colaboradores este método se
basa en el empleo de dióxido nucleótidos que carecen del grupo hidroxilo del carbono 3 de
manera que cuando uno es nucleótidos se incorpora a una cadena de ADN en crecimiento, la
cadena ya no puede elongando.
Este es un método que ha sido utilizado como método alternativo a otros métodos
debido a su utilil procedimiento el cual se lleva a cabo a través de 4 mezclas simultáneas.
En cada mezcla se utiliza un ADN polimerasa para sintetizar la hebra complementaria
a una secuencia concreta perteneciente a una molécula de ADN de hebra sencilla.
12. CAPITULO 6. BIBLIOGRAFIA
Avise J.C. 1994. Molecular markers, natural history and evolution. Chapman y Hall. New
York, Estados Unidos de América. Baker C. S. y S.R. Palumbi. 1996.
Population structure, molecular systematics, and forensic identification of whales and dolphins.
En: J.C Avise y J.L Hamrick (eds.).
Conservation Genetics Case histories from nature. Chapman & Hall, New York, Estados
Unidos de América. Brown T. A. 1999.
Genomes. Wiley-Liss, United Kingdom. Cano R.J., H.N. Poinar, N.J. Pieniazek, A. Acra y
D.R. Talbott. 1993. Amplification and sequencing of DNA from a 120-135-million-year-old
weevil. Nature 363:536-538. De Necochea R. y J. C. Canul. 2004.
Métodos fisicoquímicos en biotecnología: Secuenciación de ácidos nucleicos. Instituto de
Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México. Espinosa de los Monteros A.
2003.
Sistemática y evolución molecular: su importancia en la conservación de aves. En: H. Gómez
de Silva y A. Oliveras de Ita (eds.).
Conservación de aves experiencias en México. Editorial CIPAMEX. México. Fiers W., R.
Contreras, F. Duerinck, G. Haegeman , D. Iserentant, J. Merregaert, W. Min Jou, F. Molemans,
A. Raeymaekers, A. Van den Berghe, G. Volckaert y M