Este documento describe la proteómica como el estudio a gran escala de las proteínas, su estructura y función. Explica que el proteoma es la dotación completa de proteínas de un organismo y puede variar con el tiempo y las condiciones. También describe las principales técnicas utilizadas en la proteómica como la espectrometría de masas y la electroforesis bidimensional para identificar y caracterizar proteínas.

1. Proteómica
Dra. Martha Leticia Zamudio Aguilar
Facultad de Medicina Xalapa
UNIVERSIDAD VERAcruzana

2. Proteómica
• Estudio a gran escala de las PROTEÍNAS, su estuctura y
función.​
• Componentes principales de las rutas metabólicas .
• El término proteómica fue acuñado en 1997​ como una
analogía con genómica,
• La palabra "proteoma" es la fusión de "proteína" y
"genoma", y fue acuñada por Marc Wilkins en 1994,
• El proteoma es la dotación completa de proteínas.​
• Esto varía con el tiempo y con requisitos diferentes, o debido
al estrés que sufre una célula o un organismo.

3. Proteoma
• Permite tener una imagen dinámica de todas las proteínas
expresadas, en un momento dado y bajo determinadas condiciones
concretas de tiempo y ambiente.
• Permite identificar aquellas proteínas cuya presencia, ausencia o
alteración se correlaciona con determinados estadios fisiológicos.
• El análisis proteómico asociado a patologías concretas, permite
diagnosticar la enfermedad o pronosticar la evolución.
• Dichas proteínas se conocen con el nombre genérico
de BIOMARCADORES

4. Proteómica
• Proteómica es una ciencia relativamente
reciente.
• Principlamente la ESPECTROMETRÍA DE MASAS
• Esto, combinado con el empleo de potentes métodos de
fraccionamiento y separación de péptidos y proteínas como
poliacriilamida de dos dimensiones y cromatografía líquida

5. El problema
• La PROTEÓMICA es considerada el siguiente paso en el
estudio de un sistema biológico, luego de la genómica.
• Más complicada que la genómica: el GENOMA en un
organismo es constante, el PROTEOMA difiere de una célula
a otra y de un momento a otro.
• Estos se debe a que en los distintos tipos de células se
expresan genes distintos, lo que implica que se debe
determinar hasta el conjunto básico de proteínas producido
en una célula.

6. El problema
• Un factor adicional de complejidad son las modificaciones
que puede sufrir la estructura o secuencia básica de la
proteína,
• Dos fuentes: el recorte o SPLICING ALTERNATIVO​ de los
ARNm que codifican la proteína y las modificaciones
postraduccionales.
• A partir de los 25 000-30 000 genes que codifican proteínas
en el genoma humano, podrían generarse un número de
proteínas diferentes que oscilaría entre 500 000-1 000 000.

7. Contenido proteico
• 1.- No existe una correlación directa entre el contenido en
ARNm y el contenido proteico.​
• 2.- El ARNm no siempre se traduce a proteína;
• 3.- La cantidad de proteína producida por una cantidad dada
de ARNm depende del estado fisiológico de la célula.
• 4.- Las técnicas proteómicas actuales permiten confirmar la
presencia o ausencia de una o más proteínas concretas y
determinar su cantidad, bien en valores absolutos o relativos.

8. Funciones de la proteómica
•Identificación de proteínas y caracterización de
sus modificaciones postraduccionales.
•Estudio de las interacciones proteína-proteína

9. Técnicas
• La enorme complejidad (varios miles de proteínas diferentes) del
Proteoma de la mayor parte de los organismos vivos obliga al
empleo de diversas técnicas.
• La técnica más extendida es la ELECTROFORESIS en geles
de POLIACRILAMIDA donde las proteínas puedan migrar en un
campo eléctrico en función de su masa molecular relativa (Mr).
• Existen variantes de la Electroforesis: electroforesis
bidimensional o 2D-PAGE, en la que el fraccionamiento en geles
es precedido por una separación basada en el PUNTO
ISOELÉCTRICO de las proteínas(según como se muevan por la
carga eléctrica).

11. Técnicas
• La CROMATOGRAFÍA líquida también se emplea en el
fraccionamiento y separación de proteomas complejos.
•

14. Interacciones proteína-proteína
• La mayoría de las proteínas funcionan en colaboración con otras
• Una meta de la proteómica es identificar cuales proteínas interactúan
entre sí.
• Esto es útil para determinar asociaciones potenciales en las rutas de
señalización celular.
• El método tradicional es el SISTEMA DE DOBLE HÍBRIDO .
• Métodos nuevos incluyen MICROARRAYS de
proteína, CROMATOGRAFÍA DE INMUNOAFINIDAD seguida
por ESPECTOMETRÍA DE MASAS, INTERFEROMETRÍA DE DOBLE
POLARIZACIÓN