El documento clasifica las bacterias por su forma (cocos, bacilos, espirilos), agrupamiento, requerimientos de oxígeno (aerobias, anaerobias, microaerófilas), temperatura óptima de crecimiento (termófilas, mesófilas, psicrófilas), pH óptimo y forma de nutrición. Otra forma de clasificación es mediante la tinción de Gram, que distingue entre bacterias gram positivas y gram negativas en función de la composición de su pared celular.