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Jerónimo Buriticá González
Carolina Cardona Tobón
Third semester
Molecular biology
Introduction
Enterobacter Cloacae
It’s a oportunistic bacteria → in the human in digestive tract
Gender: Enterobacter
Species: E. Clocae
Gram negative Bacillus
Urinary tract infections, surgical wounds, bacteremia
May Result
Osteomyelitis
suppurative
arthritis
Intravenous
fluid
contaminant
Treatment
Carbapenem
(ertapenem,
imipenem and
meropenem)
Aminoglycoside
(gentamicin)
Resistant
cephalosporins
Enterobacter Cloacae
OXA - 48
Mechanism of pathogenic bacteria to
generate multi-resistance
A mutation in bacteria enables them
to produce an enzyme called BLA-
KPC
inactivates carbapenem antibiotics
OXA - 48
Usually found in infections → urinary tract, the respiratory tract and soft tissues
Symptoms
Sore
throat
Spread nausea
Fever sometimes reach up to 41 ° C
Vomiting Chills
Several
headaches
Beta-lactamase
Enzime responsable for the strength of
beta – lactam antibiotics
Penicilins, cephalosporins,
carbapenemases
Betalactam ring
The β-lactamase may be chromosomal
or plasmidic
Once kind of chromosomal is the CTX - M
CTX - M
Named for their
activity against
cefotaxime
ceftazidime,
ceftriaxone or
cefepime
More than 80 types
of CTX-M are
currently known
Salmonella enterica
serovar
typhimurium, E. coli,
Enterobacteriaceae
CTX-M-15
United
Kingdom
Prevalence
in E. Coli
2006
General purpose
General purpose
Report the
clinical and
genetic features
of 21 E. cloacae
isolates
producing CTX-
M-15, OXA-48
or both
which were
mainly
recovered
from critically
ill patients
in a Spanish
hospital
during a 1-
year period
Pacientes y métodos
MALDI - TOF
Matrix Assisted
Laser
Desorption
Ionization Time-
of-flight
Examina los
patrones de
proteínas
detectadas
directamente de
la batería intacta
Usado para la
confirmación
de la
identificación
bacteriana
MALDI - TOF
Procedimiento
Matriz → muestra analizada
Aplicada a una superficie de metal
Se irradia con luz láser
Matriz absorbe laser y vaporiza
durante ionización
Campos eléctricos guían iones y
separa por masas
Cantidad de cada ion determinada
→ detección
Concentración Mínima
Inhibitoria MIC
Concentración
mas baja de un
antimicrobiano
Inhibe
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microorganismo
después de su
incubación
confirmar la
resistencia de
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antimicrobiano
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actividad de
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antimicrobianos
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determinación de los
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sospechosos de
producción de
carbapenemasas.
tiras de plástico, incorporan
un gradiente de
concentración de
antimicrobiano.
Se depositan sobre las placas
de agar inoculadas,
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en incubación, se determina
la CMI en el punto de
intersección de la elipse de
inhibición del crecimiento
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Etest
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segmento especifico
con polimerasa y se
obtiene millones de
copias
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repetidos en los que
la secuencia blanco
es copiado fielmente
Reacción enzimática
que amplifica
millones de veces
una secuencia de
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PCR
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Hibridación
Replicación
(síntesis)
PGFE
Pulsed Gel Field
Electroforesis
• Se usa corriente eléctrica controlada, con
la afinidad de separar biomoléculas según
su tamaño y carga eléctrica.
• Separa grandes fragmentos de DNA
induciendo su reorientación mediante
cambios periódicos en el campo eléctrico.
PGFE
Pulsed Gel Field
Electroforesis
• A mayor tamaño de los fragmentos a
separar, debe ser mayor la duración de los
campos aplicados.
PGFE
PGFE vs
Electroforesis
tradicional
• Su mayor diferencia radica en que los
fragmentos de DNA separados son de
mayor tamaño
Su diferencia
es por el
numero de
cámaras
MLST
Mide directamente los cambios en la secuencia de una serie de genes de
mantenimiento y caracteriza cepas mediante sus perfiles alélicos únicos.
Técnica consiste en amplificación mediante PCR seguida de la
secuenciación del ADN.
Se uso para aislamientos representativos con diferentes
perfiles de PFGE y para asignar tipos de secuencia (STS).
Resultados
Además de los Antibióticos B-Lactámicos, todos los aislamientos de
E.Cloacae fueron resistentes a otros grupos antimicrobiales.
Todos los aislamientos resistentes a Imipenem mostraron un plásmido.
La localización genética de blaCTX-M-15 y blaOXA-48 fue establecida por
análisis plasmìdico, hibridación y conjugación.
Tabla 2
Electroforesis
PFGE
Los plásmidos que hibridan
blaCTX-M-15 → flecha
blaOXA-48 → *
Λ Escalera PFG Marker
β ADN de Salmonella entérica
serovar Braenderup
9
15
15-CRO
15-ERT
15-ERT
15-ERT
10
8
10-ERT
10
6
9
8
3
5
7
Dendrograma de
similitud
Relación de los perfiles, aislados de cada perfil,
sala del hospital y edificio donde se
recogieron.
Genes relevantes y plásmidos portados por
cada aislado.
Clusters I y II comprenden ST74 (clon 1) ST78
(positivo para blaOXA-48) y ST66 (clon 2,
positivo para blaCTX-M-15 ± blaOXA-48).
X, XbaI perfil; ST, tipo de secuencia; UCI, unidad de cuidados intensiv|os; Inc, grupo de incompatibilidad; S,
coeficiente de Jaccard de similitud
Discussion
The ST74 clone consisted of carbapenem resistant isolates
carrying the blaOXA-48 gene.
Isolates belonging to clone 2 also carried the blaOXA-48
plasmid, producing Enterobacteria cloacae circulating in
the hospital.
None of these clones had been previously associated with
OXA-48 production.
Montero I, Fleites A,
Fernandez J, et al.
“Noticeably some isolates
belonging to clone 2 also
carried the blaOXA-48
plasmid, which could have
been acquired from other
OXA-48 producing
enterobacteriaceae
circulating in the hospital.
Adler A, Solter E, Masarwa
S, et al.
“This is the first outbreak
caused by OXA-48
producing E. Cloacae
reported in Europe, but a
previous outbreak has
been noticed in a neonatal
ICU in Jerusalem”.
Pasanen T, Jalava J, Horsma
J, et al.
“Additional outbreaks of E.
Cloacae producing CTX-
M15 have occurred in a
new born ICU in Spain as
well as in children`s
hospital in Finland”.
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R, et al.
“Most E. Cloacae reported
in this study were assigned
to STs previously
associated with ESBL and
cambapenemase
producers and considered
as high risk international
clones (ST45, ST66, ST74
and ST78) with the latter
two belonging to the same
clonal complex”.
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This investigation was necessary to let the people now more about intrahospital
infections caused by a Bacteria. It is a common reality we do not know much about;
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infections use, give us information to implement a better control and treatment
strategy with the purpose of reducing associated complications in the future.
Carolina Cardona Tobón
Personal Conclusion
This type of research allows us to
know by an infectious agent,
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occurs and these can develop
through interaction with others of
the same species but are able to
fight other antibiotics, confirming
the existence of bacterial
resistance.
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resistance that patients have. to
also avoid interacting with others
who may have other bacteria
capable of fighting other
antibiotics and not a bacteria
that can not be treated forms
Jerónimo Buriticá G.
Carolina Cardona Tobón
Jerónimo Buriticá G.
Bibliografía
• Andrews, J. M. Determination of minimum inhibitory concentrations. Journal of
Antimicrobial Chemotherapy 48 (Suppl. 1):5-16, (2001)
• Fernández J, et al. Disemination of multiresistant Enterobacter Cloace isolates
producing OXA-48 and CTX-M-15 in a Spanish hospital. Int J Antimicrob Agents
(2015), http://dx.doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2015.07.003
• Martínez, L.M. Biología Molecular. Universidad Pontificia Bolivariana. 8va edición.
Medellín. 2015
¡Gracias!

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E clocae

  • 1.
  • 2. Jerónimo Buriticá González Carolina Cardona Tobón Third semester Molecular biology
  • 4. Enterobacter Cloacae It’s a oportunistic bacteria → in the human in digestive tract Gender: Enterobacter Species: E. Clocae Gram negative Bacillus Urinary tract infections, surgical wounds, bacteremia
  • 6. OXA - 48 Mechanism of pathogenic bacteria to generate multi-resistance A mutation in bacteria enables them to produce an enzyme called BLA- KPC inactivates carbapenem antibiotics
  • 7. OXA - 48 Usually found in infections → urinary tract, the respiratory tract and soft tissues Symptoms Sore throat Spread nausea Fever sometimes reach up to 41 ° C Vomiting Chills Several headaches
  • 8. Beta-lactamase Enzime responsable for the strength of beta – lactam antibiotics Penicilins, cephalosporins, carbapenemases Betalactam ring The β-lactamase may be chromosomal or plasmidic Once kind of chromosomal is the CTX - M
  • 9. CTX - M Named for their activity against cefotaxime ceftazidime, ceftriaxone or cefepime More than 80 types of CTX-M are currently known Salmonella enterica serovar typhimurium, E. coli, Enterobacteriaceae
  • 12. General purpose Report the clinical and genetic features of 21 E. cloacae isolates producing CTX- M-15, OXA-48 or both which were mainly recovered from critically ill patients in a Spanish hospital during a 1- year period
  • 14.
  • 15. MALDI - TOF Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time- of-flight Examina los patrones de proteínas detectadas directamente de la batería intacta Usado para la confirmación de la identificación bacteriana
  • 16. MALDI - TOF Procedimiento Matriz → muestra analizada Aplicada a una superficie de metal Se irradia con luz láser Matriz absorbe laser y vaporiza durante ionización Campos eléctricos guían iones y separa por masas Cantidad de cada ion determinada → detección
  • 17. Concentración Mínima Inhibitoria MIC Concentración mas baja de un antimicrobiano Inhibe crecimiento del microorganismo después de su incubación confirmar la resistencia de microorganismos a agente antimicrobiano monitorizar actividad de nuevos agentes antimicrobianos
  • 18. Usados para determinación de los “MIC" de ertapenem e imipenem en aislamientos sospechosos de producción de carbapenemasas. tiras de plástico, incorporan un gradiente de concentración de antimicrobiano. Se depositan sobre las placas de agar inoculadas, el antimicrobiano difunde en el medio en incubación, se determina la CMI en el punto de intersección de la elipse de inhibición del crecimiento Tiras de Etest
  • 19. Análisis de plásmidos PCR Aumenta un segmento especifico con polimerasa y se obtiene millones de copias Durante varios ciclos repetidos en los que la secuencia blanco es copiado fielmente Reacción enzimática que amplifica millones de veces una secuencia de ADN
  • 21. PGFE Pulsed Gel Field Electroforesis • Se usa corriente eléctrica controlada, con la afinidad de separar biomoléculas según su tamaño y carga eléctrica. • Separa grandes fragmentos de DNA induciendo su reorientación mediante cambios periódicos en el campo eléctrico.
  • 22. PGFE Pulsed Gel Field Electroforesis • A mayor tamaño de los fragmentos a separar, debe ser mayor la duración de los campos aplicados.
  • 23. PGFE PGFE vs Electroforesis tradicional • Su mayor diferencia radica en que los fragmentos de DNA separados son de mayor tamaño Su diferencia es por el numero de cámaras
  • 24. MLST Mide directamente los cambios en la secuencia de una serie de genes de mantenimiento y caracteriza cepas mediante sus perfiles alélicos únicos. Técnica consiste en amplificación mediante PCR seguida de la secuenciación del ADN. Se uso para aislamientos representativos con diferentes perfiles de PFGE y para asignar tipos de secuencia (STS).
  • 25. Resultados Además de los Antibióticos B-Lactámicos, todos los aislamientos de E.Cloacae fueron resistentes a otros grupos antimicrobiales. Todos los aislamientos resistentes a Imipenem mostraron un plásmido. La localización genética de blaCTX-M-15 y blaOXA-48 fue establecida por análisis plasmìdico, hibridación y conjugación.
  • 27. Electroforesis PFGE Los plásmidos que hibridan blaCTX-M-15 → flecha blaOXA-48 → * Λ Escalera PFG Marker β ADN de Salmonella entérica serovar Braenderup 9 15 15-CRO 15-ERT 15-ERT 15-ERT 10 8 10-ERT 10 6 9 8 3 5 7
  • 28. Dendrograma de similitud Relación de los perfiles, aislados de cada perfil, sala del hospital y edificio donde se recogieron. Genes relevantes y plásmidos portados por cada aislado. Clusters I y II comprenden ST74 (clon 1) ST78 (positivo para blaOXA-48) y ST66 (clon 2, positivo para blaCTX-M-15 ± blaOXA-48). X, XbaI perfil; ST, tipo de secuencia; UCI, unidad de cuidados intensiv|os; Inc, grupo de incompatibilidad; S, coeficiente de Jaccard de similitud
  • 29. Discussion The ST74 clone consisted of carbapenem resistant isolates carrying the blaOXA-48 gene. Isolates belonging to clone 2 also carried the blaOXA-48 plasmid, producing Enterobacteria cloacae circulating in the hospital. None of these clones had been previously associated with OXA-48 production.
  • 30. Montero I, Fleites A, Fernandez J, et al. “Noticeably some isolates belonging to clone 2 also carried the blaOXA-48 plasmid, which could have been acquired from other OXA-48 producing enterobacteriaceae circulating in the hospital.
  • 31. Adler A, Solter E, Masarwa S, et al. “This is the first outbreak caused by OXA-48 producing E. Cloacae reported in Europe, but a previous outbreak has been noticed in a neonatal ICU in Jerusalem”.
  • 32. Pasanen T, Jalava J, Horsma J, et al. “Additional outbreaks of E. Cloacae producing CTX- M15 have occurred in a new born ICU in Spain as well as in children`s hospital in Finland”.
  • 33. Girlich D, Poirel L, Izdebski R, et al. “Most E. Cloacae reported in this study were assigned to STs previously associated with ESBL and cambapenemase producers and considered as high risk international clones (ST45, ST66, ST74 and ST78) with the latter two belonging to the same clonal complex”.
  • 34. Personal conclusions This investigation was necessary to let the people now more about intrahospital infections caused by a Bacteria. It is a common reality we do not know much about; That`s why it is so importante to find the reason of this situations through investigation processes. Understanding some of the mechanisms this bacteria related with nosocomial infections use, give us information to implement a better control and treatment strategy with the purpose of reducing associated complications in the future. Carolina Cardona Tobón
  • 35. Personal Conclusion This type of research allows us to know by an infectious agent, bacteria, ways of how resistance occurs and these can develop through interaction with others of the same species but are able to fight other antibiotics, confirming the existence of bacterial resistance. We must know what is bacterial resistance that patients have. to also avoid interacting with others who may have other bacteria capable of fighting other antibiotics and not a bacteria that can not be treated forms Jerónimo Buriticá G.
  • 38. Bibliografía • Andrews, J. M. Determination of minimum inhibitory concentrations. Journal of Antimicrobial Chemotherapy 48 (Suppl. 1):5-16, (2001) • Fernández J, et al. Disemination of multiresistant Enterobacter Cloace isolates producing OXA-48 and CTX-M-15 in a Spanish hospital. Int J Antimicrob Agents (2015), http://dx.doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2015.07.003 • Martínez, L.M. Biología Molecular. Universidad Pontificia Bolivariana. 8va edición. Medellín. 2015

Notas del editor

  1. KPC-OXA 48 es un mecanismo de bacterias patógenas para generar multi-resistencia  usualmente encontrado en diversos tipos de infecciones (en el tracto urinario, el sistema respiratorio y en tejidos blandos). Una mutación en las bacterias les permite producir una enzima llamada BLA-KPC, la cual inactiva a los antibióticos carbapenémicos con los que se solía combatir estos microorganismos, haciendo de esta una bacteria de difícil tratamiento, con pautas aún no establecidas y con diferentes respuestas en planes terapéuticos1 . La bacteria desarrolla resistencia a los antimicrobianos (sustancia que mata o inhibe el crecimiento de microbios, ) debido al abuso del medicamento, y por esta causa la humanidad podría retroceder a la época anterior al descubrimiento de los antibióticos en el control de las enfermedades infecciosas. Síntomas Fiebre que a veces alcanzan hasta los 41 ºc Dolor de garganta. Náuseas. Vómitos. Escalofríos. Fuertes dolores de cabeza. Leves manchas en la piel. Propagación Esta bacteria empieza a actuar entre el primer y cuarto día después de la exposición a la kpc-oxa 48 donde da entrada al cuerpo y el acceso a las zonas del huésped que gana el patógeno, seguido de eso hace su período de incubación.
  2. Severe headaches. Slight skin blemishes. Spread
  3. La betalactamasa (a veces usado con el guion: beta-lactamasa) es una enzima (EC 3.5.2.6) producida por algunas bacterias y es responsable por la resistencia que éstas exhiben ante la acción de antibióticos betalactámicos como las penicilinas, las cefalosporinas, monobactamicos y carbapenémicos (carbapenemasas). Todos estos antibióticos tienen un elemento en común dentro de su estructura molecular denominado anillo betalactámico, un anillo químico de cuatro átomos. Las lactamasas rompen el anillo, desactivando las propiedadesantimicrobianas de la molécula. Las betalactamasas por lo general son producidas por bacterias Gram negativas en forma secretada. Por lo general, las cepas resistentes a la penicilina se relaciona directamente con el porcentaje de cepas productoras de betalactamasa.1 Es el mecanismo de resistencia a los β-lactámicos más importante en las enterobacterias y otros bacilos gramnegativos. Las β-lactamasas pueden ser cromosómicas o plasmídicas.2 is an enzyme (EC 3.5.2.6) produced by some bacteria and is responsible for the strength they exhibited before the action of beta-lactam antibiotics such as penicillins, cephalosporins, and carbapenems monobactams (carbapenemases). These antibiotics have a common element in their molecular structure called beta-lactam ring, a chemical ring of four atoms. Lactamases break ring deactivating the antimicrobial properties of the molecule. Betalactamase usually are produced by Gram negative bacteria in secreted form. Usually, the penicillin-resistant strains are directly related to the percentage of strains producing betalactamasa.1 It is the mechanism of resistance to the most important enterobacteria and other gram-negative bacilli β-lactams. The β-lactamase may be chromosomal or plasmídicas.2
  4. Estas enzimas reciben su nombre por su especial actividad contra la cefotaxima, así como otros substratos betalactámicos como ceftazidima, ceftriaxona, o cefepime. Este genotipo es un buen ejemplo de betalactamasas cromosómicas, encontradas normalmente en especies de "Kluyvera", un grupo relativamente raro de patógenos comensales. Estas enzimas no están muy relacionadas con las TEM o SHV, ya que solo muestran un 40% de identidad con las mismas. Se conocen actualmente más de 80 tipos de CTX-M, de las cuales algunas son más activas contra ceftazidima que contra cefotaxima. Además, se han encontrado en cepas de Salmonella enterica serovar typhimurium y en E.coli, pero también han sido descritas en otras especies de Enterobacteriaceae y son la BLEE predominante en algunas partes de Suramérica, hallándose también en Europa del Este, siendo los tipos CTX-M-14, CTX-M-3, y CTX-M-2 los más habituales. CTX-M-15 es, desde el 2006 el tipo de BLEE con mayor prevalencia en aislamientos de E.coli en el Reino Unido.13
  5. las tiras de Etest, consiste en unas tiras de plástico inerte que incorporan un gradiente de concentración de antimicrobiano. Cuando se depositan sobre las placas de agar inoculadas, el antimicrobiano difunde en el medio, y tras la incubación, se determina la CMI en el punto de intersección de la elipse de inhibición del crecimiento
  6. A) los perfiles de plásmido de E. cloacae representante aislamientos y sus transconjugantes. Lanes I y II, los plásmidos obtenidos de Escherichia coli 39R861 (NCTC 50192) y RP4 plásmido utilizado como estándares de tamaño molecular de ADN para cortar; carril 1, Ecl9; carril 2, Ecl15; carril 3, Tc-Ecl15-CRO (1); carril 4, Tc-Ecl15-ERT (1); carril 5, Tc-Ecl15-ERT (2); carril 6, Tc-Ecl15-ERT (3); carriles 7, Ecl10; y el carril 8, Tc-Ecl10-ERT (1). B electroforesis en gel de campo pulsado (PFGE) perfiles generados a partir de E. cloacae aisla por digestión XbaI. Lane, Lambda Escalera PFG Marker (New England Biolabs, Beverly, MA) y el carril B, el ADN de Salmonella enterica serovar Braenderup H9812 digeridos con XbaI, ambos utilizados como estándares de tamaño. 1 carriles, Ecl10; X2 carril, ECL6; X3 carril, Ecl9; X4 carril, Ecl8; X5 carril, Ecl3; X6 carril, Ecl5; y X7 carril, Ecl7.
  7. X, XbaI perfil; ST, tipo de secuencia; UCI, unidad de cuidados intensivos; Inc, grupo de incompatibilidad; S, el coeficiente de Jaccard de similitud.