M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
¿Cuál es la composición química¿Cuál es la composición química
de los Seres Vivos?de los Seres Vivos?
M. en C. Rafael Govea VillaseñorM. en C. Rafael Govea Villaseñor
Nivel “Molécula”Nivel “Molécula”
11aa
parteparte
Versión 2.8Versión 2.8
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Podemos responder la pregunta a 3 niveles dePodemos responder la pregunta a 3 niveles de
OrganizaciónOrganización
•A nivel “Átomo”A nivel “Átomo”
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Podemos responder la pregunta a 3 niveles dePodemos responder la pregunta a 3 niveles de
OrganizaciónOrganización
•A nivel “Átomo”A nivel “Átomo”
•A nivel “Molécula”A nivel “Molécula”
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Podemos responder la pregunta a 3 niveles dePodemos responder la pregunta a 3 niveles de
OrganizaciónOrganización
•A nivel “Átomo”A nivel “Átomo”
•A nivel “Molécula”A nivel “Molécula”
•A nivel “Macromolécula”A nivel “Macromolécula”
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Composición a nivel “MOLÉCULA”Composición a nivel “MOLÉCULA”
• Los Seres Vivos estamos hechos de cientosLos Seres Vivos estamos hechos de cientos
de miles de Compuestos Químicos quede miles de Compuestos Químicos que
forman parte estructural y funcional deforman parte estructural y funcional de
nosotros.nosotros.
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Composición a nivel “MOLÉCULA”Composición a nivel “MOLÉCULA”
• Todos los Compuestos químicos sonTodos los Compuestos químicos son
conjuntos del 1 sólo tipo de {Moléculas}conjuntos del 1 sólo tipo de {Moléculas}
((molemole- = masa y -- = masa y -ulasulas = pequeñas)= pequeñas)
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Composición a nivel “MOLÉCULA”Composición a nivel “MOLÉCULA”
• Clasificamos las moléculas de acuerdo aClasificamos las moléculas de acuerdo a
su tamaño en:su tamaño en:
–MicroMicromoléculas cuando su Pesomoléculas cuando su Peso
molecular ≤ 1000molecular ≤ 1000
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Composición a nivel “MOLÉCULA”Composición a nivel “MOLÉCULA”
• Las clasificamos de acuerdo a suLas clasificamos de acuerdo a su
tamaño en:tamaño en:
–MicroMicromoléculas cuando su Pesomoléculas cuando su Peso
molecular ≤ 1000molecular ≤ 1000
–OligoOligomoléculas cuando sumoléculas cuando su
1000 < PM < 50001000 < PM < 5000
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Composición a nivel “MOLÉCULA”Composición a nivel “MOLÉCULA”
• Las clasificamos de acuerdo a suLas clasificamos de acuerdo a su
tamaño en:tamaño en:
–MicroMicromoléculas cuando su masamoléculas cuando su masa
molecular ≤ 1000molecular ≤ 1000
–OligoOligomoléculas cuando su masamoléculas cuando su masa
1000 < PM < 50001000 < PM < 5000
–MacroMacromoléculas cuando su MM ≥ 5000moléculas cuando su MM ≥ 5000
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
¿Qué son las Micromoléculas?¿Qué son las Micromoléculas?
• Las Micromoléculas son cientos, casi milLas Micromoléculas son cientos, casi mil
sustancias distintas que constituyensustancias distintas que constituyen
alrededor de ¾ de la masa de unalrededor de ¾ de la masa de un
organismo.organismo.
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
¿Qué son las Micromoléculas?¿Qué son las Micromoléculas?
• Las clasificamos de acuerdo a suLas clasificamos de acuerdo a su
contenido de átomos decontenido de átomos de C reducidoC reducido ((CC
unido a Hunido a H) en:) en:
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
¿Qué son las Micromoléculas?¿Qué son las Micromoléculas?
• Las clasificamos de acuerdo a su contenido de átomos deLas clasificamos de acuerdo a su contenido de átomos de
C reducidoC reducido ((C unido a HC unido a H) en:) en:
–Pequeñas MoléculasPequeñas Moléculas InInorgánorgánicas. (icas. (inin-- ==
No yNo y organorgan- = carbono reducido).- = carbono reducido).
–Pequeñas Moléculas Orgánicas .Pequeñas Moléculas Orgánicas .
≅≅ 6% de S. V.6% de S. V.
• El resto de los S. V. está conformado por cientos deEl resto de los S. V. está conformado por cientos de
miles de oligo y macromoléculas diferentes.miles de oligo y macromoléculas diferentes.
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Las PMI se clasifican enLas PMI se clasifican en
• Sales MineralesSales Minerales
• Agua (HAgua (H22O).O).
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Las PMI se clasifican enLas PMI se clasifican en
• Sales Minerales (= Iones Inorgánicos).Sales Minerales (= Iones Inorgánicos).
– Disueltas en agua, las sales forman ionesDisueltas en agua, las sales forman iones
(cationes [+] y aniones [-])(cationes [+] y aniones [-])
– Conforman el 1% de la masa de los organismosConforman el 1% de la masa de los organismos
–Son apenas unas decenas, por ejemplo:Son apenas unas decenas, por ejemplo:
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Las PMI se clasifican enLas PMI se clasifican en
• Sales Minerales (= Iones Inorgánicos).Sales Minerales (= Iones Inorgánicos).
✔
Los cationes: KLos cationes: K++
, Na, Na++
, NH, NH44
++
,, CaCa2+2+
, Mg, Mg2+2+
,, FeFe33++
,,
……
✔
Los aniones: ClLos aniones: Cl--
, HCO, HCO33
--
,, COCO33
2-2-
, HPO, HPO44
2-2-
, SO, SO44
2-2-
,,
POPO44
3-3-
……
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Las PMI se clasifican enLas PMI se clasifican en
• Agua (HAgua (H22O).O). Sólo 1 tipo = 70% de la masaSólo 1 tipo = 70% de la masa
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Composición química de una célula deComposición química de una célula de
Escherichia coliEscherichia coli
Categoría Compuesto # de tipos de
moléculas (%)
PMI Agua (H2O) 1 (70%)
PMI Iónes inorgánicos 20 (1%)
PMO Monosacáridos y precursores 200 (6% todas las
PMO)
PMO Aminoácidos y precursores 100
PMO Nucleótidos y metabolitos 200
PMO Lípidos y precursores 50
PMO Otros compuestos 200
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
El Agua es una moléculaEl Agua es una molécula
ExtraordinariaExtraordinaria
• Tiene Propiedades fuera de lo común:Tiene Propiedades fuera de lo común:
–Tf = 0º C yTf = 0º C y
–Teb = 100ºCTeb = 100ºC
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
El Agua es una moléculaEl Agua es una molécula
ExtraordinariaExtraordinaria
• Tiene Propiedades fuera de lo común:Tiene Propiedades fuera de lo común:
–DD20ºC20ºC
= 0.99823 g/cm= 0.99823 g/cm33
–DD4ºC4ºC
= 1.00000 g/cm= 1.00000 g/cm33
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
El Agua es una moléculaEl Agua es una molécula
ExtraordinariaExtraordinaria
• Tiene Propiedades fuera deTiene Propiedades fuera de
lo común:lo común:
–DD20ºC20ºC
= 0.99823 g/cm= 0.99823 g/cm33
–DD4ºC4ºC
= 1.00000 g/cm= 1.00000 g/cm33
–DD0ºC0ºC
= 0.99987 g/cm= 0.99987 g/cm33
–DD0ºChielo0ºChielo
= 0.915 g/cm= 0.915 g/cm33
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
El Agua es una moléculaEl Agua es una molécula
ExtraordinariaExtraordinaria
• Tiene Propiedades fuera de loTiene Propiedades fuera de lo
común:común:
–Calor EspecíficoCalor Específico4-25ºC4-25ºC
==
1.018 cal/g ºC1.018 cal/g ºC
–Calor de Evapora-ción =Calor de Evapora-ción =
9,719 cal/mol9,719 cal/mol
–Constante DipolarConstante Dipolarenen
BencenoBenceno
= 1.76= 1.76
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Temperatura de ebullición de los HidrurosTemperatura de ebullición de los Hidruros
del Grupo IVAdel Grupo IVA
CH4 SiH4 GeH4 SnH4
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Temperatura de ebullición de los HidrurosTemperatura de ebullición de los Hidruros
del Grupo IVAdel Grupo IVA
-180
-160
-140
-120
-100
-80
-60
-40
-20
0
12.01 28.09 72.59 118.89
Teb
CH4 SiH4 GeH4 SnH4
Peso molecular
Temperaturadeebullición
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Temperatura de ebullición de los HidrurosTemperatura de ebullición de los Hidruros
del Grupo IVAdel Grupo IVA
-180
-160
-140
-120
-100
-80
-60
-40
-20
0
12.01 28.09 72.59 118.89
Teb
CH4 SiH4 GeH4 SnH4
Peso molecular
Temperaturadeebullición
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Temperatura de ebullición de los HidrurosTemperatura de ebullición de los Hidruros
del Grupo IVAdel Grupo IVA
-180
-160
-140
-120
-100
-80
-60
-40
-20
0
12.01 28.09 72.59 118.89
Teb
CH4 SiH4 GeH4 SnH4
Peso molecular
Temperaturadeebullición
Conclusión: a mayor PM mayor T de ebulliciónConclusión: a mayor PM mayor T de ebullición
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Si Extrapolamos la temperatura deSi Extrapolamos la temperatura de
ebullición de los Hidruros del Grupo delebullición de los Hidruros del Grupo del
OxígenoOxígeno
-100
-90
-80
-70
-60
-50
-40
-30
-20
-10
0
- 32.06 79.9 127.6
Teb
H2O H2S H2Se H2Te
Peso molecular
Temperaturadeebullición
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Si Extrapolamos la temperatura deSi Extrapolamos la temperatura de
ebullición de los Hidruros del Grupoebullición de los Hidruros del Grupo
VIA…VIA…
-100
-90
-80
-70
-60
-50
-40
-30
-20
-10
0
- 32.06 79.9 127.6
Teb
H2O H2S H2Se H2Te
Peso molecular
Temperaturadeebullición
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Si Extrapolamos la temperatura deSi Extrapolamos la temperatura de
ebullición de los Hidruros del Grupoebullición de los Hidruros del Grupo
VIA…VIA…
-100
-90
-80
-70
-60
-50
-40
-30
-20
-10
0
- 32.06 79.9 127.6
Teb
H2O H2S H2Se H2Te
Peso molecular
Temperaturadeebullición
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Si Extrapolamos la temperatura deSi Extrapolamos la temperatura de
ebullición de los Hidruros del Grupoebullición de los Hidruros del Grupo
VIA…VIA…
-100
-90
-80
-70
-60
-50
-40
-30
-20
-10
0
- 32.06 79.9 127.6
Teb
H2O H2S H2Se H2Te
Peso molecular
Temperaturadeebullición
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Si Extrapolamos la temperatura deSi Extrapolamos la temperatura de
ebullición de los Hidruros del Grupoebullición de los Hidruros del Grupo
VIA…VIA…
-100
-90
-80
-70
-60
-50
-40
-30
-20
-10
0
- 32.06 79.9 127.6
Teb
H2O H2S H2Se H2Te
Peso molecular
Temperaturadeebullición
Conclusión: El agua debiera hervir a -100 ºCConclusión: El agua debiera hervir a -100 ºC
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
El agua, todo se lo debe a suEl agua, todo se lo debe a su
EstructuraEstructura
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
El agua, todo se lo debe a suEl agua, todo se lo debe a su
EstructuraEstructura
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
El agua, todo se lo debe a suEl agua, todo se lo debe a su
EstructuraEstructura
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
El agua, todo se lo debe a suEl agua, todo se lo debe a su
EstructuraEstructura
Conclusión: El agua es una molécula muy polarConclusión: El agua es una molécula muy polar
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Enlaces por Puentes de HidrógenoEnlaces por Puentes de Hidrógeno
Puent e de HidrógenoPuent e de Hidrógeno
Átomo de hidrógenoÁtomo de hidrógeno
unido covalentementeunido covalentemente
a oxígeno, nitrógeno oa oxígeno, nitrógeno o
fluorfluor
Enlace covalenteEnlace covalente
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Enlaces por Puentes de HidrógenoEnlaces por Puentes de Hidrógeno
Puent e de HidrógenoPuent e de Hidrógeno
Átomos electro-Átomos electro-
negativosnegativos
como:como:
OxígenoOxígeno
Nitrógeno oNitrógeno o
FluorFluor
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Enlaces por Puentes de HidrógenoEnlaces por Puentes de Hidrógeno
Puent e de HidrógenoPuent e de Hidrógeno
Cargas eléctricasCargas eléctricas
Parciales y opuestasParciales y opuestas
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Enlaces por Puentes de HidrógenoEnlaces por Puentes de Hidrógeno
Puent e de HidrógenoPuent e de Hidrógeno
Cargas eléctricasCargas eléctricas
Parciales y opuestasParciales y opuestas
La alineación de los 3 átomos forma un enlace intermolecular débil que daLa alineación de los 3 átomos forma un enlace intermolecular débil que da
origen a las propiedades EXTRAORDINARIAS del Aguaorigen a las propiedades EXTRAORDINARIAS del Agua
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
El Agua es muy importanteEl Agua es muy importante
porque:porque:
• En la Tierra existe en 3En la Tierra existe en 3
estados físicos (Cicloestados físicos (Ciclo
del Hdel H22O)O)
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
El Agua es muy importanteEl Agua es muy importante
porque:porque:
• El hielo flota sobre elEl hielo flota sobre el
agua líquida.agua líquida. Eso evitaEso evita
la congelación de todala congelación de toda
el agua de losel agua de los
océanos.océanos.
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
El Agua es muy importanteEl Agua es muy importante
porque:porque:
• Otorga una gran inercia térmica a losOtorga una gran inercia térmica a los
organismosorganismos
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
El Agua es muy importanteEl Agua es muy importante
porque:porque:
• Regula el sobrecalentamiento por su CalorRegula el sobrecalentamiento por su Calor
de Evaporación.de Evaporación.
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
El Agua es muy importanteEl Agua es muy importante
porque:porque:
• Es el mejor Disolvente por su granEs el mejor Disolvente por su gran
polaridadpolaridad
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
El Agua es muy importanteEl Agua es muy importante
porque:porque:
• Permite el auto-ensamble de lípidos enPermite el auto-ensamble de lípidos en
bicapas.bicapas.
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
El Agua es muy importanteEl Agua es muy importante
porque:porque:
• Estabiliza la estructura Tridimensional deEstabiliza la estructura Tridimensional de
los Biopolímeros por medio delos Biopolímeros por medio de “Puentes“Puentes
de Hidrógeno”.de Hidrógeno”.
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
El Agua es muy importanteEl Agua es muy importante
porque:porque:
• Tiene una gran fuerzaTiene una gran fuerza
de cohesiónde cohesión
intermolecular que seintermolecular que se
expresa en laexpresa en la
capilaridad.capilaridad.
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Las Pequeñas MoléculasLas Pequeñas Moléculas
OrgánicasOrgánicas
• Son varios miles de moléculas queSon varios miles de moléculas que
contienen ≤ 50 C unidos a H por lo que sucontienen ≤ 50 C unidos a H por lo que su
masa molecular ≤ 1000masa molecular ≤ 1000
• La mayoría de las PMO están presentes enLa mayoría de las PMO están presentes en
todas las célulastodas las células
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Las Pequeñas MoléculasLas Pequeñas Moléculas
OrgánicasOrgánicas
• Las propiedades Físico-químicas de lasLas propiedades Físico-químicas de las
PMO difieren porque contienen uno oPMO difieren porque contienen uno o
varios grupos funcionales distintos.varios grupos funcionales distintos.
• Las PMO se clasifican en familias deLas PMO se clasifican en familias de
compuestos de acuerdo a los gruposcompuestos de acuerdo a los grupos
químicos funcionales que poseenquímicos funcionales que poseen
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Fórmulas Químicas, laFórmulas Químicas, la
representación de las Moléculasrepresentación de las Moléculas
• Como las moléculas son {átomos} en lasComo las moléculas son {átomos} en las
fórmulas se escriben los símbolos de losfórmulas se escriben los símbolos de los
elementos participantes.elementos participantes.
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Fórmulas Químicas, laFórmulas Químicas, la
representación de las Moléculasrepresentación de las Moléculas
• Las Fórmulas se Clasifican de acuerdo a laLas Fórmulas se Clasifican de acuerdo a la
información que proporcionan acerca de lasinformación que proporcionan acerca de las
moléculas, en:moléculas, en:
–Fórmulas MínimasFórmulas Mínimas
–Fórmulas estructuralesFórmulas estructurales
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Fórmulas Químicas, laFórmulas Químicas, la
representación de las Moléculasrepresentación de las Moléculas
–Fórmulas Mínimas, cuando sólo dicen elFórmulas Mínimas, cuando sólo dicen el
# de átomos que hay de cada elemento# de átomos que hay de cada elemento
en la molécula .en la molécula .
–Fórmulas estructurales, cuando ademásFórmulas estructurales, cuando además
se indican los enlaces químicos entrese indican los enlaces químicos entre
los átomos de la moléculalos átomos de la molécula
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Pros y Contras de las FórmulasPros y Contras de las Fórmulas
MínimasMínimas
• Son fáciles de escribir, pero por ejemplo la fórmula:Son fáciles de escribir, pero por ejemplo la fórmula:
CC22HH66OO
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Pros y Contras de las FórmulasPros y Contras de las Fórmulas
MínimasMínimas
• Son fáciles de escribir, pero por ejemplo la fórmula:Son fáciles de escribir, pero por ejemplo la fórmula:
CC22HH66OO
Representa a varios compuestosRepresenta a varios compuestos isóisómermerosos
diferentesdiferentes
y con propiedades distintasy con propiedades distintas
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Pros y Contras de las FórmulasPros y Contras de las Fórmulas
MínimasMínimas
• Son fáciles de escribir, pero por ejemplo la fórmula:Son fáciles de escribir, pero por ejemplo la fórmula:
CC22HH66OO
CHCH33-CH-CH22-OH-OH
EtanolEtanol
TTebeb = 78.4 ºC= 78.4 ºC
LíquidoLíquido
Soluble en HSoluble en H22OO
Representa a varios compuestosRepresenta a varios compuestos isóisómermeros diferentesos diferentes
y con propiedades distintasy con propiedades distintas
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
Pros y Contras de las FórmulasPros y Contras de las Fórmulas
MínimasMínimas
• Son fáciles de escribir, pero por ejemplo la fórmula:Son fáciles de escribir, pero por ejemplo la fórmula:
CC22HH66OO
CHCH33-CH-CH22-OH-OH CHCH33-O-CH-O-CH33
EtanolEtanol
TTebeb = 78.4 ºC= 78.4 ºC
LíquidoLíquido
Soluble en HSoluble en H22OO
DimetiléterDimetiléter
TTebeb = -23.6 ºC= -23.6 ºC
gasgas
Poco soluble en aguaPoco soluble en agua
Representa a varios compuestosRepresenta a varios compuestos isóisómermeros diferentesos diferentes
y con propiedades distintasy con propiedades distintas
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
En Biología usamos con frecuenciaEn Biología usamos con frecuencia
Fórmulas MínimasFórmulas Mínimas
CC55HH1212OO
Cuando sabemos a cual compuesto isómero nosCuando sabemos a cual compuesto isómero nos
referimosreferimos
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
En Biología usamos con frecuenciaEn Biología usamos con frecuencia
Fórmulas Estructurales CondensadasFórmulas Estructurales Condensadas
CHCH33-CH-CH22-CH-CH22-CH-CH22-CH-CH22-OH-OH
Cuando necesitamos saber qué átomo de carbono estáCuando necesitamos saber qué átomo de carbono está
unido con cual otro.unido con cual otro.
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
En Biología usamos con frecuenciaEn Biología usamos con frecuencia
Fórmulas Estructurales SimplificadasFórmulas Estructurales Simplificadas
66
Cuando necesitamos tener un visión general de laCuando necesitamos tener un visión general de la
estructura de la molécula.estructura de la molécula.
OHOH11
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
En Biología usamos con frecuenciaEn Biología usamos con frecuencia
Fórmulas Estructurales SimplificadasFórmulas Estructurales Simplificadas
• En ellas No se escribe el símbolo de losEn ellas No se escribe el símbolo de los
carbonos ni de los hidrógenos enlazadoscarbonos ni de los hidrógenos enlazados
a estos.a estos.
66
OHOH11
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
En Biología usamos con frecuenciaEn Biología usamos con frecuencia
Fórmulas Estructurales SimplificadasFórmulas Estructurales Simplificadas
• Sólo se dibujan los enlaces C-C. En cadaSólo se dibujan los enlaces C-C. En cada
vértice y extremo hay un átomo de C.vértice y extremo hay un átomo de C.
66
OHOH11
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
En Biología usamos con frecuenciaEn Biología usamos con frecuencia
Fórmulas Estructurales SimplificadasFórmulas Estructurales Simplificadas
• En cambio si se escriben los símbolos deEn cambio si se escriben los símbolos de
los demás elementos (incluso del H unidolos demás elementos (incluso del H unido
a ellos). Por ejemplo:a ellos). Por ejemplo:
66
OHOH11
CHCH33-CH-CH22-CH-CH22-CH-CH-CH-CH22-OH-OH
CHCH33
es igual a
M en C Rafael GoveaM en C Rafael Govea
FINFIN
8-hidroxiquinolinas unidas por enlaces intermoleculares8-hidroxiquinolinas unidas por enlaces intermoleculares
débiles al microscopio de fuerza atómicadébiles al microscopio de fuerza atómica

Composición Molecular de los Organismos 1

  • 1.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea ¿Cuál es la composición química¿Cuál es la composición química de los Seres Vivos?de los Seres Vivos? M. en C. Rafael Govea VillaseñorM. en C. Rafael Govea Villaseñor Nivel “Molécula”Nivel “Molécula” 11aa parteparte Versión 2.8Versión 2.8
  • 2.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Podemos responder la pregunta a 3 niveles dePodemos responder la pregunta a 3 niveles de OrganizaciónOrganización •A nivel “Átomo”A nivel “Átomo”
  • 3.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Podemos responder la pregunta a 3 niveles dePodemos responder la pregunta a 3 niveles de OrganizaciónOrganización •A nivel “Átomo”A nivel “Átomo” •A nivel “Molécula”A nivel “Molécula”
  • 4.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Podemos responder la pregunta a 3 niveles dePodemos responder la pregunta a 3 niveles de OrganizaciónOrganización •A nivel “Átomo”A nivel “Átomo” •A nivel “Molécula”A nivel “Molécula” •A nivel “Macromolécula”A nivel “Macromolécula”
  • 5.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Composición a nivel “MOLÉCULA”Composición a nivel “MOLÉCULA” • Los Seres Vivos estamos hechos de cientosLos Seres Vivos estamos hechos de cientos de miles de Compuestos Químicos quede miles de Compuestos Químicos que forman parte estructural y funcional deforman parte estructural y funcional de nosotros.nosotros.
  • 6.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Composición a nivel “MOLÉCULA”Composición a nivel “MOLÉCULA” • Todos los Compuestos químicos sonTodos los Compuestos químicos son conjuntos del 1 sólo tipo de {Moléculas}conjuntos del 1 sólo tipo de {Moléculas} ((molemole- = masa y -- = masa y -ulasulas = pequeñas)= pequeñas)
  • 7.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Composición a nivel “MOLÉCULA”Composición a nivel “MOLÉCULA” • Clasificamos las moléculas de acuerdo aClasificamos las moléculas de acuerdo a su tamaño en:su tamaño en: –MicroMicromoléculas cuando su Pesomoléculas cuando su Peso molecular ≤ 1000molecular ≤ 1000
  • 8.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Composición a nivel “MOLÉCULA”Composición a nivel “MOLÉCULA” • Las clasificamos de acuerdo a suLas clasificamos de acuerdo a su tamaño en:tamaño en: –MicroMicromoléculas cuando su Pesomoléculas cuando su Peso molecular ≤ 1000molecular ≤ 1000 –OligoOligomoléculas cuando sumoléculas cuando su 1000 < PM < 50001000 < PM < 5000
  • 9.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Composición a nivel “MOLÉCULA”Composición a nivel “MOLÉCULA” • Las clasificamos de acuerdo a suLas clasificamos de acuerdo a su tamaño en:tamaño en: –MicroMicromoléculas cuando su masamoléculas cuando su masa molecular ≤ 1000molecular ≤ 1000 –OligoOligomoléculas cuando su masamoléculas cuando su masa 1000 < PM < 50001000 < PM < 5000 –MacroMacromoléculas cuando su MM ≥ 5000moléculas cuando su MM ≥ 5000
  • 10.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea ¿Qué son las Micromoléculas?¿Qué son las Micromoléculas? • Las Micromoléculas son cientos, casi milLas Micromoléculas son cientos, casi mil sustancias distintas que constituyensustancias distintas que constituyen alrededor de ¾ de la masa de unalrededor de ¾ de la masa de un organismo.organismo.
  • 11.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea ¿Qué son las Micromoléculas?¿Qué son las Micromoléculas? • Las clasificamos de acuerdo a suLas clasificamos de acuerdo a su contenido de átomos decontenido de átomos de C reducidoC reducido ((CC unido a Hunido a H) en:) en:
  • 12.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea ¿Qué son las Micromoléculas?¿Qué son las Micromoléculas? • Las clasificamos de acuerdo a su contenido de átomos deLas clasificamos de acuerdo a su contenido de átomos de C reducidoC reducido ((C unido a HC unido a H) en:) en: –Pequeñas MoléculasPequeñas Moléculas InInorgánorgánicas. (icas. (inin-- == No yNo y organorgan- = carbono reducido).- = carbono reducido). –Pequeñas Moléculas Orgánicas .Pequeñas Moléculas Orgánicas . ≅≅ 6% de S. V.6% de S. V. • El resto de los S. V. está conformado por cientos deEl resto de los S. V. está conformado por cientos de miles de oligo y macromoléculas diferentes.miles de oligo y macromoléculas diferentes.
  • 13.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Las PMI se clasifican enLas PMI se clasifican en • Sales MineralesSales Minerales • Agua (HAgua (H22O).O).
  • 14.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Las PMI se clasifican enLas PMI se clasifican en • Sales Minerales (= Iones Inorgánicos).Sales Minerales (= Iones Inorgánicos). – Disueltas en agua, las sales forman ionesDisueltas en agua, las sales forman iones (cationes [+] y aniones [-])(cationes [+] y aniones [-]) – Conforman el 1% de la masa de los organismosConforman el 1% de la masa de los organismos –Son apenas unas decenas, por ejemplo:Son apenas unas decenas, por ejemplo:
  • 15.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Las PMI se clasifican enLas PMI se clasifican en • Sales Minerales (= Iones Inorgánicos).Sales Minerales (= Iones Inorgánicos). ✔ Los cationes: KLos cationes: K++ , Na, Na++ , NH, NH44 ++ ,, CaCa2+2+ , Mg, Mg2+2+ ,, FeFe33++ ,, …… ✔ Los aniones: ClLos aniones: Cl-- , HCO, HCO33 -- ,, COCO33 2-2- , HPO, HPO44 2-2- , SO, SO44 2-2- ,, POPO44 3-3- ……
  • 16.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Las PMI se clasifican enLas PMI se clasifican en • Agua (HAgua (H22O).O). Sólo 1 tipo = 70% de la masaSólo 1 tipo = 70% de la masa
  • 17.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Composición química de una célula deComposición química de una célula de Escherichia coliEscherichia coli Categoría Compuesto # de tipos de moléculas (%) PMI Agua (H2O) 1 (70%) PMI Iónes inorgánicos 20 (1%) PMO Monosacáridos y precursores 200 (6% todas las PMO) PMO Aminoácidos y precursores 100 PMO Nucleótidos y metabolitos 200 PMO Lípidos y precursores 50 PMO Otros compuestos 200
  • 18.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea El Agua es una moléculaEl Agua es una molécula ExtraordinariaExtraordinaria • Tiene Propiedades fuera de lo común:Tiene Propiedades fuera de lo común: –Tf = 0º C yTf = 0º C y –Teb = 100ºCTeb = 100ºC
  • 19.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea El Agua es una moléculaEl Agua es una molécula ExtraordinariaExtraordinaria • Tiene Propiedades fuera de lo común:Tiene Propiedades fuera de lo común: –DD20ºC20ºC = 0.99823 g/cm= 0.99823 g/cm33 –DD4ºC4ºC = 1.00000 g/cm= 1.00000 g/cm33
  • 20.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea El Agua es una moléculaEl Agua es una molécula ExtraordinariaExtraordinaria • Tiene Propiedades fuera deTiene Propiedades fuera de lo común:lo común: –DD20ºC20ºC = 0.99823 g/cm= 0.99823 g/cm33 –DD4ºC4ºC = 1.00000 g/cm= 1.00000 g/cm33 –DD0ºC0ºC = 0.99987 g/cm= 0.99987 g/cm33 –DD0ºChielo0ºChielo = 0.915 g/cm= 0.915 g/cm33
  • 21.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea El Agua es una moléculaEl Agua es una molécula ExtraordinariaExtraordinaria • Tiene Propiedades fuera de loTiene Propiedades fuera de lo común:común: –Calor EspecíficoCalor Específico4-25ºC4-25ºC == 1.018 cal/g ºC1.018 cal/g ºC –Calor de Evapora-ción =Calor de Evapora-ción = 9,719 cal/mol9,719 cal/mol –Constante DipolarConstante Dipolarenen BencenoBenceno = 1.76= 1.76
  • 22.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Temperatura de ebullición de los HidrurosTemperatura de ebullición de los Hidruros del Grupo IVAdel Grupo IVA CH4 SiH4 GeH4 SnH4
  • 23.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Temperatura de ebullición de los HidrurosTemperatura de ebullición de los Hidruros del Grupo IVAdel Grupo IVA -180 -160 -140 -120 -100 -80 -60 -40 -20 0 12.01 28.09 72.59 118.89 Teb CH4 SiH4 GeH4 SnH4 Peso molecular Temperaturadeebullición
  • 24.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Temperatura de ebullición de los HidrurosTemperatura de ebullición de los Hidruros del Grupo IVAdel Grupo IVA -180 -160 -140 -120 -100 -80 -60 -40 -20 0 12.01 28.09 72.59 118.89 Teb CH4 SiH4 GeH4 SnH4 Peso molecular Temperaturadeebullición
  • 25.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Temperatura de ebullición de los HidrurosTemperatura de ebullición de los Hidruros del Grupo IVAdel Grupo IVA -180 -160 -140 -120 -100 -80 -60 -40 -20 0 12.01 28.09 72.59 118.89 Teb CH4 SiH4 GeH4 SnH4 Peso molecular Temperaturadeebullición Conclusión: a mayor PM mayor T de ebulliciónConclusión: a mayor PM mayor T de ebullición
  • 26.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Si Extrapolamos la temperatura deSi Extrapolamos la temperatura de ebullición de los Hidruros del Grupo delebullición de los Hidruros del Grupo del OxígenoOxígeno -100 -90 -80 -70 -60 -50 -40 -30 -20 -10 0 - 32.06 79.9 127.6 Teb H2O H2S H2Se H2Te Peso molecular Temperaturadeebullición
  • 27.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Si Extrapolamos la temperatura deSi Extrapolamos la temperatura de ebullición de los Hidruros del Grupoebullición de los Hidruros del Grupo VIA…VIA… -100 -90 -80 -70 -60 -50 -40 -30 -20 -10 0 - 32.06 79.9 127.6 Teb H2O H2S H2Se H2Te Peso molecular Temperaturadeebullición
  • 28.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Si Extrapolamos la temperatura deSi Extrapolamos la temperatura de ebullición de los Hidruros del Grupoebullición de los Hidruros del Grupo VIA…VIA… -100 -90 -80 -70 -60 -50 -40 -30 -20 -10 0 - 32.06 79.9 127.6 Teb H2O H2S H2Se H2Te Peso molecular Temperaturadeebullición
  • 29.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Si Extrapolamos la temperatura deSi Extrapolamos la temperatura de ebullición de los Hidruros del Grupoebullición de los Hidruros del Grupo VIA…VIA… -100 -90 -80 -70 -60 -50 -40 -30 -20 -10 0 - 32.06 79.9 127.6 Teb H2O H2S H2Se H2Te Peso molecular Temperaturadeebullición
  • 30.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Si Extrapolamos la temperatura deSi Extrapolamos la temperatura de ebullición de los Hidruros del Grupoebullición de los Hidruros del Grupo VIA…VIA… -100 -90 -80 -70 -60 -50 -40 -30 -20 -10 0 - 32.06 79.9 127.6 Teb H2O H2S H2Se H2Te Peso molecular Temperaturadeebullición Conclusión: El agua debiera hervir a -100 ºCConclusión: El agua debiera hervir a -100 ºC
  • 31.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea El agua, todo se lo debe a suEl agua, todo se lo debe a su EstructuraEstructura
  • 32.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea El agua, todo se lo debe a suEl agua, todo se lo debe a su EstructuraEstructura
  • 33.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea El agua, todo se lo debe a suEl agua, todo se lo debe a su EstructuraEstructura
  • 34.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea El agua, todo se lo debe a suEl agua, todo se lo debe a su EstructuraEstructura Conclusión: El agua es una molécula muy polarConclusión: El agua es una molécula muy polar
  • 35.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Enlaces por Puentes de HidrógenoEnlaces por Puentes de Hidrógeno Puent e de HidrógenoPuent e de Hidrógeno Átomo de hidrógenoÁtomo de hidrógeno unido covalentementeunido covalentemente a oxígeno, nitrógeno oa oxígeno, nitrógeno o fluorfluor Enlace covalenteEnlace covalente
  • 36.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Enlaces por Puentes de HidrógenoEnlaces por Puentes de Hidrógeno Puent e de HidrógenoPuent e de Hidrógeno Átomos electro-Átomos electro- negativosnegativos como:como: OxígenoOxígeno Nitrógeno oNitrógeno o FluorFluor
  • 37.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Enlaces por Puentes de HidrógenoEnlaces por Puentes de Hidrógeno Puent e de HidrógenoPuent e de Hidrógeno Cargas eléctricasCargas eléctricas Parciales y opuestasParciales y opuestas
  • 38.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Enlaces por Puentes de HidrógenoEnlaces por Puentes de Hidrógeno Puent e de HidrógenoPuent e de Hidrógeno Cargas eléctricasCargas eléctricas Parciales y opuestasParciales y opuestas La alineación de los 3 átomos forma un enlace intermolecular débil que daLa alineación de los 3 átomos forma un enlace intermolecular débil que da origen a las propiedades EXTRAORDINARIAS del Aguaorigen a las propiedades EXTRAORDINARIAS del Agua
  • 39.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea El Agua es muy importanteEl Agua es muy importante porque:porque: • En la Tierra existe en 3En la Tierra existe en 3 estados físicos (Cicloestados físicos (Ciclo del Hdel H22O)O)
  • 40.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea El Agua es muy importanteEl Agua es muy importante porque:porque: • El hielo flota sobre elEl hielo flota sobre el agua líquida.agua líquida. Eso evitaEso evita la congelación de todala congelación de toda el agua de losel agua de los océanos.océanos.
  • 41.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea El Agua es muy importanteEl Agua es muy importante porque:porque: • Otorga una gran inercia térmica a losOtorga una gran inercia térmica a los organismosorganismos
  • 42.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea El Agua es muy importanteEl Agua es muy importante porque:porque: • Regula el sobrecalentamiento por su CalorRegula el sobrecalentamiento por su Calor de Evaporación.de Evaporación.
  • 43.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea El Agua es muy importanteEl Agua es muy importante porque:porque: • Es el mejor Disolvente por su granEs el mejor Disolvente por su gran polaridadpolaridad
  • 44.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea El Agua es muy importanteEl Agua es muy importante porque:porque: • Permite el auto-ensamble de lípidos enPermite el auto-ensamble de lípidos en bicapas.bicapas.
  • 45.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea El Agua es muy importanteEl Agua es muy importante porque:porque: • Estabiliza la estructura Tridimensional deEstabiliza la estructura Tridimensional de los Biopolímeros por medio delos Biopolímeros por medio de “Puentes“Puentes de Hidrógeno”.de Hidrógeno”.
  • 46.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea El Agua es muy importanteEl Agua es muy importante porque:porque: • Tiene una gran fuerzaTiene una gran fuerza de cohesiónde cohesión intermolecular que seintermolecular que se expresa en laexpresa en la capilaridad.capilaridad.
  • 47.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Las Pequeñas MoléculasLas Pequeñas Moléculas OrgánicasOrgánicas • Son varios miles de moléculas queSon varios miles de moléculas que contienen ≤ 50 C unidos a H por lo que sucontienen ≤ 50 C unidos a H por lo que su masa molecular ≤ 1000masa molecular ≤ 1000 • La mayoría de las PMO están presentes enLa mayoría de las PMO están presentes en todas las célulastodas las células
  • 48.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Las Pequeñas MoléculasLas Pequeñas Moléculas OrgánicasOrgánicas • Las propiedades Físico-químicas de lasLas propiedades Físico-químicas de las PMO difieren porque contienen uno oPMO difieren porque contienen uno o varios grupos funcionales distintos.varios grupos funcionales distintos. • Las PMO se clasifican en familias deLas PMO se clasifican en familias de compuestos de acuerdo a los gruposcompuestos de acuerdo a los grupos químicos funcionales que poseenquímicos funcionales que poseen
  • 49.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Fórmulas Químicas, laFórmulas Químicas, la representación de las Moléculasrepresentación de las Moléculas • Como las moléculas son {átomos} en lasComo las moléculas son {átomos} en las fórmulas se escriben los símbolos de losfórmulas se escriben los símbolos de los elementos participantes.elementos participantes.
  • 50.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Fórmulas Químicas, laFórmulas Químicas, la representación de las Moléculasrepresentación de las Moléculas • Las Fórmulas se Clasifican de acuerdo a laLas Fórmulas se Clasifican de acuerdo a la información que proporcionan acerca de lasinformación que proporcionan acerca de las moléculas, en:moléculas, en: –Fórmulas MínimasFórmulas Mínimas –Fórmulas estructuralesFórmulas estructurales
  • 51.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Fórmulas Químicas, laFórmulas Químicas, la representación de las Moléculasrepresentación de las Moléculas –Fórmulas Mínimas, cuando sólo dicen elFórmulas Mínimas, cuando sólo dicen el # de átomos que hay de cada elemento# de átomos que hay de cada elemento en la molécula .en la molécula . –Fórmulas estructurales, cuando ademásFórmulas estructurales, cuando además se indican los enlaces químicos entrese indican los enlaces químicos entre los átomos de la moléculalos átomos de la molécula
  • 52.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Pros y Contras de las FórmulasPros y Contras de las Fórmulas MínimasMínimas • Son fáciles de escribir, pero por ejemplo la fórmula:Son fáciles de escribir, pero por ejemplo la fórmula: CC22HH66OO
  • 53.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Pros y Contras de las FórmulasPros y Contras de las Fórmulas MínimasMínimas • Son fáciles de escribir, pero por ejemplo la fórmula:Son fáciles de escribir, pero por ejemplo la fórmula: CC22HH66OO Representa a varios compuestosRepresenta a varios compuestos isóisómermerosos diferentesdiferentes y con propiedades distintasy con propiedades distintas
  • 54.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Pros y Contras de las FórmulasPros y Contras de las Fórmulas MínimasMínimas • Son fáciles de escribir, pero por ejemplo la fórmula:Son fáciles de escribir, pero por ejemplo la fórmula: CC22HH66OO CHCH33-CH-CH22-OH-OH EtanolEtanol TTebeb = 78.4 ºC= 78.4 ºC LíquidoLíquido Soluble en HSoluble en H22OO Representa a varios compuestosRepresenta a varios compuestos isóisómermeros diferentesos diferentes y con propiedades distintasy con propiedades distintas
  • 55.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea Pros y Contras de las FórmulasPros y Contras de las Fórmulas MínimasMínimas • Son fáciles de escribir, pero por ejemplo la fórmula:Son fáciles de escribir, pero por ejemplo la fórmula: CC22HH66OO CHCH33-CH-CH22-OH-OH CHCH33-O-CH-O-CH33 EtanolEtanol TTebeb = 78.4 ºC= 78.4 ºC LíquidoLíquido Soluble en HSoluble en H22OO DimetiléterDimetiléter TTebeb = -23.6 ºC= -23.6 ºC gasgas Poco soluble en aguaPoco soluble en agua Representa a varios compuestosRepresenta a varios compuestos isóisómermeros diferentesos diferentes y con propiedades distintasy con propiedades distintas
  • 56.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea En Biología usamos con frecuenciaEn Biología usamos con frecuencia Fórmulas MínimasFórmulas Mínimas CC55HH1212OO Cuando sabemos a cual compuesto isómero nosCuando sabemos a cual compuesto isómero nos referimosreferimos
  • 57.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea En Biología usamos con frecuenciaEn Biología usamos con frecuencia Fórmulas Estructurales CondensadasFórmulas Estructurales Condensadas CHCH33-CH-CH22-CH-CH22-CH-CH22-CH-CH22-OH-OH Cuando necesitamos saber qué átomo de carbono estáCuando necesitamos saber qué átomo de carbono está unido con cual otro.unido con cual otro.
  • 58.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea En Biología usamos con frecuenciaEn Biología usamos con frecuencia Fórmulas Estructurales SimplificadasFórmulas Estructurales Simplificadas 66 Cuando necesitamos tener un visión general de laCuando necesitamos tener un visión general de la estructura de la molécula.estructura de la molécula. OHOH11
  • 59.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea En Biología usamos con frecuenciaEn Biología usamos con frecuencia Fórmulas Estructurales SimplificadasFórmulas Estructurales Simplificadas • En ellas No se escribe el símbolo de losEn ellas No se escribe el símbolo de los carbonos ni de los hidrógenos enlazadoscarbonos ni de los hidrógenos enlazados a estos.a estos. 66 OHOH11
  • 60.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea En Biología usamos con frecuenciaEn Biología usamos con frecuencia Fórmulas Estructurales SimplificadasFórmulas Estructurales Simplificadas • Sólo se dibujan los enlaces C-C. En cadaSólo se dibujan los enlaces C-C. En cada vértice y extremo hay un átomo de C.vértice y extremo hay un átomo de C. 66 OHOH11
  • 61.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea En Biología usamos con frecuenciaEn Biología usamos con frecuencia Fórmulas Estructurales SimplificadasFórmulas Estructurales Simplificadas • En cambio si se escriben los símbolos deEn cambio si se escriben los símbolos de los demás elementos (incluso del H unidolos demás elementos (incluso del H unido a ellos). Por ejemplo:a ellos). Por ejemplo: 66 OHOH11 CHCH33-CH-CH22-CH-CH22-CH-CH-CH-CH22-OH-OH CHCH33 es igual a
  • 62.
    M en CRafael GoveaM en C Rafael Govea FINFIN 8-hidroxiquinolinas unidas por enlaces intermoleculares8-hidroxiquinolinas unidas por enlaces intermoleculares débiles al microscopio de fuerza atómicadébiles al microscopio de fuerza atómica