La teoría de orbitales moleculares explica la formación de enlaces covalentes. Los electrones se ubican en orbitales moleculares que se forman por el solapamiento de los orbitales atómicos cuando los átomos se acercan a la distancia de equilibrio. Cuanto mayor es el solapamiento, menor es la energía del orbital molecular y más estable es el enlace. La molécula de hidrógeno tiene menor energía que los átomos separados porque los electrones ocupan el orbital molecular enlazante de menor energía.