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Curso de Evolución 2009
Facultad de Ciencias
Montevideo, Uruguay
http://evolucion.fcien.edu.uy/
http://eplessa.wordpress.com/




              6. Variación geográfica. Filogeografía.
             Divergencia en aislamiento estricto.




                                                        1
Variación geográfica

• desde la década de 1960, la electroforesis de proteínas
permitió determinar que:
        • la mayoría de las especies tiene poblaciones
        estructuradas geográficamente
        • el grado y escala en que se manifiesta esta
        subdivisión varía según habitat, modos de vida, etc.

 • las causas y procesos subyacentes pueden incluir:
          • aislamiento estricto (divergencia “pasiva”)
          • aislamiento parcial (con intercambios)
          • divergencia guiada por selección (no excluyente
          con las anteriores)

 • vamos a enfatizar en esta clase el primer caso

                                                               2
Variación geográfica

• en frecuencias alélicas (determinadas por electroforesis
para proteínas, o para microsatélites)

 • en secuencias de ADN (determinadas directa o
 indirectamente)

 • vamos a enfatizar el segundo abordaje


 • usaremos el marco de la filogeografía para
         • ilustrar la existencia de variación geográfica
         • comenzar a entender los procesos de divergencia
         en aislamiento estricto, por deriva genética



                                                             3
Filogeografía
Campo de estudio interesado en los principios y procesos que
gobiernan la distribución geográfica de los linajes, especialmente
aquellos dentro y entre especies cercanamente emparentadas

                                                 Avise et al., 1987.



                             Area A   Area B




                      FILO                 GEO



                                                                       4
ADN mitocondrial


• genoma compacto (~16 KB)
• numerosas copias por célula
• herencia materna
• no hay recombinación
• evolución rápida




                                5
Avise: variación en
el ADN mitocondrial
fuertemente
estructurada
geográficamente




                      6
Ejemplo: rata de pajonal (Scapteromys)
              monofilia recíproca




                                         7
Ejemplo: tucu-tucu (Ctenomys pearsoni)
                                                                                                                     A1

                  polifilia                                                                                     A2

                                                                                                                          A6
                                                                                                                                    70a
                                                                                                               A3

 R.                                                                                                                  A4
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                                                                                                                B1                  56,58,70b
        1

                                              ía




                                                                   e.
                                         Luc




                                                                Gd
                                                                                       11                           B2              56,58



                                                           olís
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                            2                                                               ?
                                                            S
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                                                                                                                     B3             56

                                                         Aº
                                   R.




                                                                                 10
                                   3                        6      7         9                                             B4       70b
                                                   4 5                  8
                         2n= 70a                                                      2n=70c                              B5        56,64

                                        2n=56- 58                                                                              B6   58,70b
                                                                            2n=64-66
                                                                                                     C1                             66,70c
                                                          2n=70b                                      C2                            70b
                                                                                                      C3                            66
                                                                                                      C4                            ?
                                                                                                      C5                            70a,70c
                                                                                                          C6                        64
                                                                                                           C7                       ?
                                                                                                                C8                  ?
                                                                                                D1                                  64,70b
                                                                                                                                          8
¿Cómo explicar el contraste?
                • monofilia recíproca en ratas de pajonal
                • polifilia en tucu-tucus




                        Polifilia           Parafilia       Monofilia recíproca


población
ancestral
(dos clases
alélicas
monofiléticas
recíprocas)
                  • la monofilia recíproca resulta de un proceso
                                                                              9
• la monofilia recíproca resulta de un proceso




                      Polifilia         Parafilia         Monofilia recíproca


población
ancestral
(dos clases
alélicas
monofiléticas
recíprocas)

                                                                           10
monofilia recíproca
resulta de un proceso
                                                     monofilia
                                                     recíproca




                                barrera geográfica
                             Barrera geográfica
                                                     parafilia



                                                     polifilia




                                                     población
                                                     ancestral

                        Historia previa
                                                            11
Cuatro tipos de concordancia
                           (según Avise 2000)

1. Fuerte apoyo para el árbol (por bootstrap, otros métodos)

                                     95




                                      99




2. Concordancia con una división
geográfica independiente
(e.g., provincias fitogeográficas)



                                                               12
3. Concordancia entre especies analizadas con el mismo gen

        Especie 1                             especie 2




4. Concordancia entre genes de una misma especie




            gen 1                            gen 2
                                                             13
Concordancia genealógica
                   Distintos genes de una misma especie



                                                          Burton y Lee, 1994.



 Pta. Concepción




Trigriopus californicus




                                                                 14
Concordancia genealógica
                Diferentes especies con el mismo gen
                               Eizirik et al. 1998




                     ocelote                         margay


Leopardus pardalis                                            Leopardus weidii




                                                                          15
Concordancia genealógica
     Diferentes especies en provincias biogeogáficas




                                               Avise 2000   16
17
Tiempo esperado de arribo a monofilia por deriva:
depende del tamaño efectivo


 A partir del modelo coalescente derivamos:

                                 ⎛ 1⎞
                E (TMRCA ) = 4 N ⎜1 − ⎟
                                 ⎝ n⎠

 Para un sistema diploide autosómico, E(TMRCA)
 tiende a 4N

 Si lo pensamos como 2x2N, es 2 x número
 efectivo de genes

 Para un sistema mitocondrial:
         2 x N = 2 x N/2 = N (1/4 del valor en
 un sistema dipliode autosómico)
                                                    18
Conclusiones

• las poblaciones naturales están estructuradas en el espacio

• la divergencia es la consecuencia inevitable del aislamiento
geográfico (deriva genética, mutación)

• la concordancia de patrones filogeográficos sugiere
historias comunes de aislamiento y divergencia

• la divergencia pasa por estados de polifilia y parafilia, hasta
llegar a la monofilia recíproca

• el “ritmo” de la divergencia pasiva es 1/2N

• el tiempo esperado de llegada a la monofilia es aprox. 4N
generaciones (para un locus diploide autosómico neutral)

• generalizando, el tiempo de llegada a la monofilia es 2 x
no. de genes en la población (ej., 2 veces N = N, para ADN
                                                                    19
mitocondrial)

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Variación Geográfica

  • 1. Curso de Evolución 2009 Facultad de Ciencias Montevideo, Uruguay http://evolucion.fcien.edu.uy/ http://eplessa.wordpress.com/ 6. Variación geográfica. Filogeografía. Divergencia en aislamiento estricto. 1
  • 2. Variación geográfica • desde la década de 1960, la electroforesis de proteínas permitió determinar que: • la mayoría de las especies tiene poblaciones estructuradas geográficamente • el grado y escala en que se manifiesta esta subdivisión varía según habitat, modos de vida, etc. • las causas y procesos subyacentes pueden incluir: • aislamiento estricto (divergencia “pasiva”) • aislamiento parcial (con intercambios) • divergencia guiada por selección (no excluyente con las anteriores) • vamos a enfatizar en esta clase el primer caso 2
  • 3. Variación geográfica • en frecuencias alélicas (determinadas por electroforesis para proteínas, o para microsatélites) • en secuencias de ADN (determinadas directa o indirectamente) • vamos a enfatizar el segundo abordaje • usaremos el marco de la filogeografía para • ilustrar la existencia de variación geográfica • comenzar a entender los procesos de divergencia en aislamiento estricto, por deriva genética 3
  • 4. Filogeografía Campo de estudio interesado en los principios y procesos que gobiernan la distribución geográfica de los linajes, especialmente aquellos dentro y entre especies cercanamente emparentadas Avise et al., 1987. Area A Area B FILO GEO 4
  • 5. ADN mitocondrial • genoma compacto (~16 KB) • numerosas copias por célula • herencia materna • no hay recombinación • evolución rápida 5
  • 6. Avise: variación en el ADN mitocondrial fuertemente estructurada geográficamente 6
  • 7. Ejemplo: rata de pajonal (Scapteromys) monofilia recíproca 7
  • 8. Ejemplo: tucu-tucu (Ctenomys pearsoni) A1 polifilia A2 A6 70a A3 R. A4 S an Sa lva d or A5 B1 56,58,70b 1 ía e. Luc Gd 11 B2 56,58 olís nta 2 ? S Sa B3 56 Aº R. 10 3 6 7 9 B4 70b 4 5 8 2n= 70a 2n=70c B5 56,64 2n=56- 58 B6 58,70b 2n=64-66 C1 66,70c 2n=70b C2 70b C3 66 C4 ? C5 70a,70c C6 64 C7 ? C8 ? D1 64,70b 8
  • 9. ¿Cómo explicar el contraste? • monofilia recíproca en ratas de pajonal • polifilia en tucu-tucus Polifilia Parafilia Monofilia recíproca población ancestral (dos clases alélicas monofiléticas recíprocas) • la monofilia recíproca resulta de un proceso 9
  • 10. • la monofilia recíproca resulta de un proceso Polifilia Parafilia Monofilia recíproca población ancestral (dos clases alélicas monofiléticas recíprocas) 10
  • 11. monofilia recíproca resulta de un proceso monofilia recíproca barrera geográfica Barrera geográfica parafilia polifilia población ancestral Historia previa 11
  • 12. Cuatro tipos de concordancia (según Avise 2000) 1. Fuerte apoyo para el árbol (por bootstrap, otros métodos) 95 99 2. Concordancia con una división geográfica independiente (e.g., provincias fitogeográficas) 12
  • 13. 3. Concordancia entre especies analizadas con el mismo gen Especie 1 especie 2 4. Concordancia entre genes de una misma especie gen 1 gen 2 13
  • 14. Concordancia genealógica Distintos genes de una misma especie Burton y Lee, 1994. Pta. Concepción Trigriopus californicus 14
  • 15. Concordancia genealógica Diferentes especies con el mismo gen Eizirik et al. 1998 ocelote margay Leopardus pardalis Leopardus weidii 15
  • 16. Concordancia genealógica Diferentes especies en provincias biogeogáficas Avise 2000 16
  • 17. 17
  • 18. Tiempo esperado de arribo a monofilia por deriva: depende del tamaño efectivo A partir del modelo coalescente derivamos: ⎛ 1⎞ E (TMRCA ) = 4 N ⎜1 − ⎟ ⎝ n⎠ Para un sistema diploide autosómico, E(TMRCA) tiende a 4N Si lo pensamos como 2x2N, es 2 x número efectivo de genes Para un sistema mitocondrial: 2 x N = 2 x N/2 = N (1/4 del valor en un sistema dipliode autosómico) 18
  • 19. Conclusiones • las poblaciones naturales están estructuradas en el espacio • la divergencia es la consecuencia inevitable del aislamiento geográfico (deriva genética, mutación) • la concordancia de patrones filogeográficos sugiere historias comunes de aislamiento y divergencia • la divergencia pasa por estados de polifilia y parafilia, hasta llegar a la monofilia recíproca • el “ritmo” de la divergencia pasiva es 1/2N • el tiempo esperado de llegada a la monofilia es aprox. 4N generaciones (para un locus diploide autosómico neutral) • generalizando, el tiempo de llegada a la monofilia es 2 x no. de genes en la población (ej., 2 veces N = N, para ADN 19 mitocondrial)