Este documento describe el desarrollo de investigación oncogénica en el Biobanco Plataforma DIO-B del Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas. Explica la misión, objetivos y logros del biobanco, incluida la infraestructura, capacitaciones de personal, publicaciones y redes de cooperación. También describe los protocolos de investigación vigentes y cómo el biobanco permite vincular muestras biológicas con datos clínicos para avanzar en la investigación traslacional y la medicina personalizada.
Sternhell & Sznajder & Asheri. - El nacimiento de la ideología fascista [ocr]...
Biobancos en investigación curso oncología
1. Desarrollo de investigación
oncogenética en Biobanco
Plataforma DIO-B
MC. MG SANDRO CASAVILCA ZAMBRANO.
PATÓLOGOY LABORATORISTA
PATÓLOGO ONCÓLOGO
JEFE DE BIOBANCO DEL INSTITUTO NACIONAL DE ENFERMEDADES NEOPLASICASJEFE DE BIOBANCO DEL INSTITUTO NACIONAL DE ENFERMEDADES NEOPLASICAS
2. TRASLACIÓN:
CONOCIMIENTO
BASADO EN
EVIDENCIA
“La transferencia del conocimiento basado en la evidencia
dentro de rutina o en la práctica
representativa”
SALUD
PÚBLICA
Y
PRÁCTICA
CLÍNICA
Glasgow, R SBM (2005) 26th
Annual SBM Meeting, Symposium #22:
Disseminating Behavioral Medicine Research: Making the Translational Leap.
INVESTIGACIÓN TRASLACIONAL
UNA PERSPECTIVA DESDE LA CIENCIA BÁSICA
• La investigación traslacional es un área de atención por parte de las agencias
de financiamiento “GRANTS”.
• Permite ampliar su base de investigación.
• Comprende nuevas colaboraciones con colegas clínicos.
• Puede comprometer ensayos clínicos o extenderse al uso de muestras de
pacientes o información.
3. “A los considerados debotos de
la ciencia, nada puede hacerlos
mas felices que incrementar sus
descubrimientos, pero su
felicidad es completa cuando los
resultados de sus estudios
encuentran una aplicación
práctica.”
~Louis Pasteur
Our goal is to turn knowledge into
applications that benefit people.
4. Variaciones a nivel de la secuencia del DNA (SNPs,
STRs, delecciones, inserciones...)
BIOMARKER
Característica que puede ser medida y evaluada de forma objetiva
como un indicador de un proceso biológico normal, proceso
patológico o respuesta farmacológica a una intervención
terapéutica
DNA
BIOMARKER
Presente en el tejido tumoral o en el suero e incluye
diferentes moléculas (DNA, RNA, proteínas...)CANCER
BIOMARKER
Evaluados en el tejido tumoral
Evaluados del tejido tumoral
¿QUÉ ES UN BIOMARCADOR?
6. AKERVALL, J., PRUETZ, B. L., GEDDES,T. J., LARSON, D., FELTEN, D. J., & WILSON, G. D. (2013). BEAUMONT HEALTH SYSTEM BIOBANK:A
MULTIDISCIPLINARY BIOREPOSITORY ANDTRANSLATIONAL RESEARCH FACILITY. BIOPRESERV.BIOBANK., 11(4), 221-228
Instalación multidisciplinaria
diseñada para proporcionar
acceso y oportunidad para
que los clínicos y científicos
orientados a la investigación
se involucren en ella sin
necesidad de crear su propia
infraestructura, aumentando
así los esfuerzos a través del
Sistema de Salud en
Investigación
MODELO DE BIOBANCO
7. MISIÓN
Ser un área sin fines de lucro que brinda y conserva
material biológico e información asociada a las
mismas, con los mayores estándares internacionales
de calidad en sus procesos; contribuyendo así en el
desarrollo de los proyectos científicos nacionales e
internacionales.
8. OBJETIVO:
Crear y mantener una colección de muestras
de tejidos normales y tumorales, recogidas en
óptimas condiciones, para ser utilizados en
proyectos de investigación y acercar la
investigación biomédica a resolver problemas
clínicos.
9. AKERVALL, J., PRUETZ, B. L., GEDDES,T. J., LARSON, D., FELTEN, D. J., & WILSON, G. D. (2013). BEAUMONT HEALTH SYSTEM BIOBANK:A MULTIDISCIPLINARY
BIOREPOSITORY AND TRANSLATIONAL RESEARCH FACILITY. BIOPRESERV.BIOBANK., 11(4), 221-228 (CONT)
La colección de muestras o “biobanking”
ha sido históricamente un esfuerzo
académico o comercial que refleja las
ambiciones científicas de la organización o
departamento que lo crea
COLECCIÓN DE MUESTRAS
El “biobanking” implica la recolección, procesamiento y almacenamiento de material
biológico, el desarrollo de métodos para preservar su integridad tisular y la
distribución de estas muestras biológicas junto con los datos clínicos relacionados de
una forma organizada y confiable para los científicos
10. AKERVALL, J., PRUETZ, B. L., GEDDES,T. J., LARSON, D., FELTEN, D. J., & WILSON, G. D. (2013). BEAUMONT HEALTH SYSTEM BIOBANK:A
MULTIDISCIPLINARY BIOREPOSITORY AND TRANSLATIONAL RESEARCH FACILITY. BIOPRESERV.BIOBANK., 11(4), 221-228 (CONT)
Modelo:
Cuando el análisis de bioespecímenes se debe realizar en instalaciones de
laboratorios especializados ubicados en otras partes de la organización, se
produce una desconexión entre el análisis y el proceso de “biobanking”.
Esta separación de las funciones de colección, conservación y analíticas
incrementa la complejidad y la burocracia de las operaciones y puede
resultar en un procesamiento subóptimo de muestras.
INVESTIGACIÓN BIOMÉDICA CON
BIOESPECÍMENES
12. La revista "Time" en 2009 publicó que "el biobanco es una
de las diez ideas que cambian el mundo". Con los
avances en tecnología, la demanda de bio-especímenes
adecuadamente almacenados y bien conservados ha
aumentado.
REVISTA “TIME”, MARZO 2009
"Los biobancos transformarán la forma en que
vemos la enfermedad en desarrollo”
Los médicos y los pacientes están empezando a acoger la idea de recoger muestras
de ADN y tejido como parte de los exámenes de rutina
(Rev Times, marzo 2009)
13. AKERVALL, J., PRUETZ, B. L., GEDDES,T. J., LARSON, D., FELTEN, D. J., & WILSON, G. D. (2013). BEAUMONT HEALTH SYSTEM BIOBANK:A MULTIDISCIPLINARY
BIOREPOSITORY AND TRANSLATIONAL RESEARCH FACILITY. BIOPRESERV.BIOBANK., 11(4), 221-228
El objetivo es desarrollar un consentimiento informado amplio donde
los donantes acepten cualquier número de estudios futuros que usen
sus muestras o datos, se basa principalmente en dos razones:
(i)simplificar y alentar a los clínicos a involucrarse en el Biobanco, (se
alivia la carga de desarrollar una logística), y
(ii)proporcionar la flexibilidad para incorporar nuevas ideas y tecnologías
a medida que se desarrollan los proyectos
CONSENTIMIENTO INFORMADO
16. Selección de zonas tumorales Diseño de TMA
Tinción HETinción Ki67
DISEÑO DE TMA
CD8
FOXP-3
6 Intraepith. TIL
0 Intraepith. TIL
2.5X 40X
CHANGING METHODOLOGY: ABSOLUTE NUMBER
COUNTING + LYMPHOCYTE SUBTYPES (IHC) IN 5 OR
3 HPF.
18. PROTOCOLOS ANEXOS AL BTT
NOMBRE INVESTIGADOR
11 001 HCC TJ IRD DR. BERTANI
11 002 NEURO DR. CASAVILCA
14 001 CITOMETRIA DRA. VIDAL
15 001 CTP6 DRA. NECIOSUP
15 002 MK042 DR. MAS
15 003 OLYMPIA DR. GOMEZ
15 004 MK045 DRA. NECIOSUP
15 005 MK024 DRA. NECIOSUP
15 006 ALIAGA DRA. NECIOSUP
15 007 HP INVEST DR. CASTAÑEDA
15 008 BP GASTRO INVEST DR. CASTAÑEDA
16 001 B3271002 DRA. NECIOSUP
16 002 MAMA INVEST DR. CASTAÑEDA
16 003 BP MAMA INVEST DR. CASTAÑEDA
16 004 G024436 DR. MAS
16 005 EMR100 DR. MAS
16 006 CTC INVEST DR. CASTAÑEDA
16 007 CBYL719 SOLAR DR. MAS
16 008 GINECO INVEST DR. CASTAÑEDA
16 009 GINECO BIOMARCA DR. LOPEZ
16 010 PULMON INVEST DR. CASTAÑEDA
16 011 CM PROTOCOLO DRA. VIDAURRE
16 012 D419AC00003 DRA. VALDIVIEZO
16 013 HP INVEST - SANGRE DR. CASTAÑEDA
16 014 MK3475-119 DR GOMEZ
16 015 COLON INVEST DR. CASTAÑEDA
17 001 Predictores CMTN DR. FUENTES
17 002 PVH INVEST DR. CASTAÑEDA
17 003 TUMORES RAROS BTT DR. CASAVILCA
17 004 CA209227 DR. MAS
Proyectos yProyectos y
protocolosprotocolos
vigentes a lavigentes a la
fechafecha
3030
24. Capacitaciones de personalCapacitaciones de personal
LOGROSLOGROS
Mg. Juan Pablo Cerapio Arroyo
Biología Molecular y Doctorado en Epidemiología
Instituto Pasteur - París, Francia. 2015Instituto Pasteur - París, Francia. 2015
Lic. Dany Córdova Mamani
Biobanco y cultivo celular
CHU - Centro Hospitalario Universitario de RennesCHU - Centro Hospitalario Universitario de Rennes - Francia. 2015- Francia. 2015
Lic. Mauricio Ramal Matute
Biología Molecular para detección de Micotoxinas
Instituto Nacional de Investigación agrónoma (INRA) -Bordeaux, Francia. 2016Instituto Nacional de Investigación agrónoma (INRA) -Bordeaux, Francia. 2016
Dr. Sandro Casavilca Zambrano
Banco de tumores cerebrales y neuropatología quirúrgica
Hospital de la Pitié-Salpêtrière – París, Francia. 2017Hospital de la Pitié-Salpêtrière – París, Francia. 2017
Srta. Macarena Farías LozaSrta. Macarena Farías Loza
Diplomado en Ética e InvestigaciónDiplomado en Ética e Investigación
Universidad Nacional de TrujilloUniversidad Nacional de Trujillo
Lima- 2016Lima- 2016
25. REDES COOPERATIVASREDES COOPERATIVAS
Red de Biobancos de Latinoamérica yRed de Biobancos de Latinoamérica y
Caribe (REBLAC)Caribe (REBLAC)
BTT miembro deBTT miembro de
la REBLACla REBLAC
26. SHANKAR, S. K. (2015). TIMELESS REVERBERATIONS LET US PROMOTE BIO ‑ BANKING IN INDIA FOR TRANSLATIONAL RESEARCH. NEUROLOGY INDIA /
VOLUME 63 / ISSUE 5
Vincular los datos clínicos con las muestras
archivadas y su utilización óptima por parte de
los investigadores.
Para comparar los datos científicos generados a
partir del tejido tumoral almacenado, existe la
necesidad de recolección simultánea de
tejido "relativamente normal" del mismo
órgano (preferiblemente pareados por edad y
género)
LA CLAVE DE LOS BIOBANCOS
27. FELMEISTER, A. S., MASINO, A. J., RIVERA, T. J., RESNICK, A. C., & PENNINGTON, J. W. (2016). THE BIOREPOSITORY PORTAL TOOLKIT: AN HONEST
BROKERED, MODULAR SERVICE ORIENTED SOFTWARE TOOL SET FOR BIOSPECIMEN-DRIVEN TRANSLATIONAL RESEARCH. BMC GENOMICS, 17 SUPPL
4(SUPPL 4), 434-434 (CONT)
Los requerimientos de información en las muestras de biorepositorio
van en incremento incluyendo cada vez más información clínica y
generándose la necesidad de incluir en el proceso mecanismos de
protección de la información de salud (PHI)
BIOBANCO
28. CANUEL,V., RANCE, B.,AVILLACH, P., DEGOULET, P., & BURGUN,A. (2015).TRANSLATIONAL RESEARCH PLATFORMS INTEGRATING
CLINICAL AND OMICS DATA:A REVIEW OF PUBLICLY AVAILABLE SOLUTIONS. BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 16(2), 280-290
Objetivo:
establecer vínculos entre
las caracterizaciones
biomoleculares, las
condiciones del
paciente, la efectividad
del tratamiento y los
efectos adversos,
proporcionando al paciente
el mejor tratamiento
individual
MEDICINA PERSONALIZADA
29. CANUEL,V., RANCE, B.,AVILLACH, P., DEGOULET, P., & BURGUN,A. (2015).TRANSLATIONAL RESEARCH PLATFORMS INTEGRATING CLINICAL AND
OMICS DATA:A REVIEW OF PUBLICLY AVAILABLE SOLUTIONS. BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 16(2), 280-290 (CONT)
Las plataformas de investigación traslacional deben ser capaces de combinar el flujo de
trabajo de los investigadores para un uso óptimo. Por lo tanto, deben proporcionar:
(i)el almacenamiento e integración de datos clínicos y de los ómicos;
(ii) un marco de análisis que permita a los científicos explorar sus datos y generar
hipótesis;
(iii)información cruzada adicional de bases de datos externas (por ejemplo, enlace a una
descripción de genes específica en la literatura publicada o bases de datos públicas)
MEDICINA PERSONALIZADA
30. CANUEL,V., RANCE, B.,AVILLACH, P., DEGOULET, P., & BURGUN,A. (2015).TRANSLATIONAL RESEARCH PLATFORMS
INTEGRATING CLINICAL AND OMICS DATA:A REVIEW OF PUBLICLY AVAILABLE SOLUTIONS. BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS,
16(2), 280-290 (CONT)
31. INVESTIGACIÓN PSIQUIATRICAY
NEUROLÓGICA
• Ejemplos
• Los estudios patológicos moleculares han identificado genes que son factores causales
o de riesgo, o ambos, en la enfermedad de Alzheimer, la enfermedad de Huntington y la
enfermedad de la motoneurona.
• La recolección sistemática de cerebros de pacientes que han muerto de SIDA ha
demostrado que la pérdida neuronal sólo se asocia con la fase sintomática de la
enfermedad.
Las nuevas técnicas desarrolladas los bancos cerebrales han
producido nuevos conocimientos sobre la comprensión de la
patogénesis de los transtornos psiquiátricos y neurológicos, así como
han generado una esperanza real de mejorar el tratamiento.
32. BALDO, C., CASARETO, L., RENIERI,A., MERLA, G., GARAVAGLIA, B., GOLDWURM, S., … FILOCAMO, M. (2016).THE ALLIANCE BETWEEN
GENETIC BIOBANKS AND PATIENT ORGANISATIONS:THE EXPERIENCE OF THE TELETHON NETWORK OF GENETIC BIOBANKS.
ORPHANET JOURNAL OF RARE DISEASES, 11
El término enfermedades raras (RD) se refiere a aproximadamente 5000-8000
enfermedades que afectan a un estimado de 350 a 400 millones de personas en
todo el mundo.
Debido a que las RD afectan a un número limitado de individuos (6-8% de la
población), a menudo se descuidan.
ENFERMEDADES RARAS
La participación de las organizaciones de pacientes (OP) de RD es esencial si se desea
obtener una masa crítica de muestras, ya que las OP pueden servir de enlace entre
los biobancos genéticos (GB) y los médicos, para recoger muestras y datos
clínicos para la investigación.
33. NNTC
• En 1998 se funda el “National NeuroAIDSTissue Consorcium”
(NNTC) en respuesta a la necesidad de la comunidad científica
de contar con tejido y fluidos del sistema nervioso central y
periférico, de individuos infectados por elVIH, compartiendo
protocolos y base de datos.
Morgello, S., Gelman, B. B., Kozlowski, P. B., Vinters, H. V., Masliah, E., Cornford, M., … Singer,
E. J. (2001). The National NeuroAIDS Tissue Consortium: A new paradigm in brain banking with
an emphasis on infectious disease. Neuropathology and Applied Neurobiology, 27(4), 326-335
34. OPEN SCIENCE
• El Instituto Neurológico de Montreal (Neuro) anunció en la
primavera de 2016 que está lanzando un experimento de cinco
años durante el cual adoptará la política de Ciencia Abierta -
datos abiertos, materiales abiertos y sin patentes.
Gold, E. R. (2016). Accelerating Translational Research through Open Science: The Neuro
Experiment. PLoS Biology, 14(12), 1-7
35. HUTTIN, C., & STUBBS,A. (2016).A CONTRIBUTION FOR COST MODELS IN BIOBANKING. TECHNOLOGY AND HEALTH CARE,
24(1), 93-98 (CONT)
La mayoría de los modelos de
costos convencionales utilizados
en los hospitales han sido modelos
de recuperación de costos,
basados en una personalización de
las tareas correspondientes a la
preparación y el uso de
bioespecímenes
ECONOMÍA DE LA SALUD
36. HUTTIN, C., & STUBBS,A. (2016).A CONTRIBUTION FOR COST MODELS IN BIOBANKING. TECHNOLOGY AND HEALTH CARE,
24(1), 93-98 (CONT)
Los tipos de costos suelen clasificarse como:
- costos de adquisición,
- costos de revisión de patología / histología,
- costos de documentación de consentimiento informado,
- costos de recolección de datos,
- costos de seguros,
- costos de equipo, manejo y transporte, o
- costos de mensajería y envio.
ECONOMÍA DE LA SALUD
37. HUTTIN, C., & STUBBS,A. (2016).A CONTRIBUTION FOR COST MODELS IN BIOBANKING. TECHNOLOGY AND HEALTH CARE,
24(1), 93-98 (CONT)
Este artículo destaca el desarrollo potencial de nuevos modelos
de costos, utilizando ejemplos de dos formas organizativas:
plataformas de tecnología adaptativa, con el fin de
establecer pasos en el traslado del procesamiento de
bioespecímenes de laboratorio a la práctica clínica y de nuevo al
laboratorio que requieren protocolos de calidad para que los
bioespecímenes puedan ser usados apropiadamente tanto por
investigadores como por clínicos.
ECONOMÍA DE LA SALUD
38. HUTTIN, C., & STUBBS,A. (2016).A CONTRIBUTION FOR COST MODELS IN BIOBANKING. TECHNOLOGY AND HEALTH CARE,
24(1), 93-98 (CONT)
ECONOMÍA DE LA SALUD
39. GRACIAS
Los bancos de tumores se han creado para
obtener, clasificar, conservar y distribuir
muestras de tejidos y muestras biológicas para
la investigación de enfermedades en contextos
éticos muy precisos, siendo un reto para
nuestra región el promover y desarrollar una
red de biobancos que permita contar con
material de estudio en diversos padecimientos
en nuestra población.
Notas del editor
The end goal of our research investments is to benefit people. That should not take away from the importance of basic science.
This administration places a very strong emphasis on achieving benefits to people. Pasteur said it quite eloquently. Results are what matter.